miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Zma-MIR156a PmiREN023279 MIR156 Zea mays Zma-4 83913941 83914098 - GTTTTCGTTCCGTGGCTAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGGGCAGACTGCATCGATCGATCTGCATCCGAGACGGCGCACGTACGAATGATGATGCAGCTGCTGCTGCGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCAGTCCTCTAGCTGCTACGGCCTC .........(((((((..((((((((((((((((((((((.((((((.(((.(((((((.((((.(((((..(((...))).))).....)).)))))))))))))))))))).)))))))).))))).))))))))).........))))))).... 83913961 83914078 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGGGCAGACTGCATCGATCGATCTGCATCCGAGACGGCGCACGTACGAATGATGATGCAGCTGCTGCTGCGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCAGT ((((((((((((((((((((.((((((.(((.(((((((.((((.(((((..(((...))).))).....)).)))))))))))))))))))).)))))))).))))).))))))).. Zma-miR156a 83914059 83914078 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Zma-miR156a* 83913961 83913981 CTCACTTCTCTCTCTGTCAGT 3 Zma-MIR156b PmiREN023280 MIR156 Zea mays Zma-3 7775488 7775613 - AGATGAGTTTTTTGAAGGTTTGACAGAAGAGAGTGAGCACACACGGTGGTTTCTTACCATGAGTGTCATGCTAGGAGCTGTGCGTGCTCACCCTCTATCTGTCAGTCACTCATCAAGCCCATCTGT (((((.((((..(((..(.((((((((((((.((((((((.((((((....(((((.(((((...))))).))))))))))).)))))))).)))).)))))))).)..)))..)))).))))).. 7775508 7775593 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACACGGTGGTTTCTTACCATGAGTGTCATGCTAGGAGCTGTGCGTGCTCACCCTCTATCTGTCAGT (((((((((((.((((((((.((((((....(((((.(((((...))))).))))))))))).)))))))).)))).))))))).. 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Zma-miR156j 130685543 130685563 ATGACAGAAGAGAGAGAGCAC Zma-miR156j* 130685474 130685494 TCTCTGCTCTCACTGTCATCG 3 Zma-MIR156k PmiREN023289 MIR156 Zea mays Zma-6 96290911 96291036 - GGCTTAGGCCCCGAAGAGATTGACAGAAGAGAGCGAGCACCTGGCGCGGCGACCGGCATGGAACGCATGCCGTCCCCGCCGCGTGCTCGCTTCTCTTTCTGTCAGCCTCTCCCTCGTCCTGAGCCG ((((((((...(((((((.(((((((((((((((((((((.(((((.((.(((.((((((.....)))))))))))))))).)))))))).)))).))))))))).))))...))).)))))))). 96290931 96291016 TGACAGAAGAGAGCGAGCACCTGGCGCGGCGACCGGCATGGAACGCATGCCGTCCCCGCCGCGTGCTCGCTTCTCTTTCTGTCAGC ((((((((((((((((((((.(((((.((.(((.((((((.....)))))))))))))))).)))))))).)))).)))))))).. 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Zma-miR166e 223371679 223371699 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Zma-miR166e* 223371770 223371790 GAAATGTTGTCTGGTTCAAGG 3 Zma-MIR166f PmiREN023330 MIR166 Zea mays Zma-4 178166815 178166967 + TTCGTCATGGGGGTTTGTGGGGAATGTTGGCTGGCTCGAGGCAGCATCCGCGTCCTAGCCTGCTGTTGCCGGTCGTTTTGCCTGCTACCGGTCGGCCGGACAGATCGAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCTCGCAAACCGGTGCATCCATGG ....((((((((((((((((((((((..(.((((.((((.((..((((...((((..(((.((((..((.(((......))).))...)))).))).)))).))).)..)).)))).)))).)..)))))))))))))))......))))))) 178166835 178166947 GGAATGTTGGCTGGCTCGAGGCAGCATCCGCGTCCTAGCCTGCTGTTGCCGGTCGTTTTGCCTGCTACCGGTCGGCCGGACAGATCGAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCTC ((((((..(.((((.((((.((..((((...((((..(((.((((..((.(((......))).))...)))).))).)))).))).)..)).)))).)))).)..)))))).. 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Zma-miR166g 13558900 13558920 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Zma-miR166g* 13558797 13558817 GGAATGTTGTCTGGTTGGAGA 3 Zma-MIR166h PmiREN023324 MIR166 Zea mays Zma-1 274783691 274783804 - TAGCTTCATGTCTGTCGAGGGGAATGACGTCCGGTCCGAACGAGCCACGGCTGCTGCTGCGCCGCCGCGGGCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCGTGACTCATGGAGACGGCAG (..(((((((...((((.(((((((((.(((.(((((((...((((.((((.((......)).))))..))))))))))).))).))))))))).)))).)))))))..).... 274783711 274783784 GGAATGACGTCCGGTCCGAACGAGCCACGGCTGCTGCTGCGCCGCCGCGGGCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCC (((((((.(((.(((((((...((((.((((.((......)).))))..))))))))))).))).))))))).. 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Zma-miR166i 241357125 241357145 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Zma-miR166i* 241357065 241357085 GGAATGTCGTCTGGCGCGAGA 3 Zma-MIR166j PmiREN023326 MIR166 Zea mays Zma-7 124574858 124575010 + AGTTGAAGATTAGGTTAAGGGGTTTGTTTGTCTGGTTCAAGGTCGCCACACAGCAGGGAAAACCCATTTCGCCTTGAAGCATGCACCATGATGGGTGTACCTGTTGGTGATCTCGGACCAGGCTTCAATCCCTTTAACTAGCGTCTGCATATA ............((((((((((.(((...(((((((((.(((((((((....(((((....(((((((..((..((...)).)).....)))))))...)))))))))))))).)))))))))..))).)))))))))).............. 124574878 124574990 GGTTTGTTTGTCTGGTTCAAGGTCGCCACACAGCAGGGAAAACCCATTTCGCCTTGAAGCATGCACCATGATGGGTGTACCTGTTGGTGATCTCGGACCAGGCTTCAATCCCT ((.(((...(((((((((.(((((((((....(((((....(((((((..((..((...)).)).....)))))))...)))))))))))))).)))))))))..))).)).. 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Zma-miR167e 9835455 9835476 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Zma-miR167e* 9835395 9835415 ATCATGCTGTGCAGTTTCATC 3 Zma-MIR167f PmiREN023336 MIR167 Zea mays Zma-3 192151750 192151871 + CGTGCACCTTATTAAGCAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATCTTTCGTTTACTGGCAACTTTGGATACCTAAGATCCAGATCGTGCTGCGCAGTTTCACCTGCTAATTGGAGCACAGAAA .((((.((..((((.((((.((((((((((((((((((((((((((..(((((..(....)..)))))....))))).)))))))))))).))))))))).)))))))).)).))))..... 192151770 192151851 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGATCTTTCGTTTACTGGCAACTTTGGATACCTAAGATCCAGATCGTGCTGCGCAGTTTCACC ((((((((((((((((((((((((((..(((((..(....)..)))))....))))).)))))))))))).))))))))).. Zma-miR167f 192151770 192151791 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Zma-miR167f* 192151831 192151851 ATCGTGCTGCGCAGTTTCACC 3 Zma-MIR167g PmiREN023337 MIR167 Zea mays Zma-3 119196667 119196912 + AGTGGTGCACCACGAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTTATGATGGTGGTGGTATATGTAAGATGGATGTAATCTATACTACTACCGGCCCCTGTCACTCTCTCTCTCTCCCCCGTCCCTGACTGTCATATATGGATCGACGAATCCAAGATGAGAGGGGAAGGGAGAGAGAGAGAGGGTAATTAATGAGCACCAGGACCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGCCGCACATCGA ....((((.((((.(((.(((((((((((.((((((((((((((.((..(((((((((((.....((((.......)))))))))))))))(((....)))((((((((((((((.(((.((((...((.((((...(((((......)))))..)))).)))))).))).)))))))))))))).............)).))))))))))))))))))))))))).))).))))..))))..... 119196687 119196892 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTTATGATGGTGGTGGTATATGTAAGATGGATGTAATCTATACTACTACCGGCCCCTGTCACTCTCTCTCTCTCCCCCGTCCCTGACTGTCATATATGGATCGACGAATCCAAGATGAGAGGGGAAGGGAGAGAGAGAGAGGGTAATTAATGAGCACCAGGACCAGGTCATGCTGTAGTTTCATC (((((((((.((((((((((((((.((..(((((((((((.....((((.......)))))))))))))))(((....)))((((((((((((((.(((.((((...((.((((...(((((......)))))..)))).)))))).))).)))))))))))))).............)).))))))))))))))))))))))).. 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Zma-miR167j 12594024 12594045 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Zma-miR167j* 12594110 12594130 AGATCATGTGGCAGTTTCATT 3 Zma-MIR168a PmiREN023341 MIR168 Zea mays Zma-5 74370576 74370682 - GAAGCCGCGCCGCCTCGGGCTCGCTTGGTGCAGATCGGGACCCGCCGCCCGGCCGACGGGACGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAATCGGAGCCGGCGGAGCGATAC ...((..(((((.(((.((.(((((((((((((..(((((.(((...((((.....)))).))).)))))..))))))))))))).)).))).)))))..))..... 74370596 74370662 TCGCTTGGTGCAGATCGGGACCCGCCGCCCGGCCGACGGGACGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAAT (((((((((((((..(((((.(((...((((.....)))).))).)))))..))))))))))))).. 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Zma-miR169k 206845412 206845432 TAGCCAAGGATGACTTGCCGG Zma-miR169k* 206845304 206845324 AGGTTCTTCTCTTTGGCTACA 3 Zma-MIR169l PmiREN023353 MIR169 Zea mays Zma-1 298356347 298356473 + AAGTAAGAGGCCATCTTTGGTAGCCAGGGATGATTTGCCTGTGGTTCCTGTCGTTGCCATGCCAATGCCTGTACTGTTCGATCTACGGGCAAATCATCCCTGCTACCGGAGTGTCTCTTACTCTTCT (((((((((((...((((((((((.(((((((((((((((((((.....((((..((..(((........)))..)).))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))).)... 298356367 298356453 TAGCCAGGGATGATTTGCCTGTGGTTCCTGTCGTTGCCATGCCAATGCCTGTACTGTTCGATCTACGGGCAAATCATCCCTGCTACC ((((.(((((((((((((((((((.....((((..((..(((........)))..)).))))))))))))))))))))))))))).. 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Zma-miR169n 230075436 230075457 CTTAGCCAAGAATGGCTTGCCT Zma-miR169n* 230075521 230075541 GCAGGCCTTCTTGGCTAAGCG 3 Zma-MIR169o PmiREN023356 MIR169 Zea mays Zma-4 12923727 12923902 + AGATGGAGAGCCCCTTTTGGTAGCCAAGAATGACTTGCCTATGCACGCCCTCTGTTGGCAGTTCCGTCCGGCAGCCATGGCGACGGTTGCACAAGGTGAGTTTTTGCGGCGTGGATGATGCAATGTGGCTGCATCGGCAGGTCTTCTTGGCTAGCCAGTGGGCTCTCGTCCACCAT .((((.(((((((...((((((((((((((.((((((((.((.((((((((((.(((((((..(((((.(.((....)).)))))))))).))).).))).......)))))).))((((((.......))))))))))))))))))))))).))))).)))))))))))...... 12923747 12923882 TAGCCAAGAATGACTTGCCTATGCACGCCCTCTGTTGGCAGTTCCGTCCGGCAGCCATGGCGACGGTTGCACAAGGTGAGTTTTTGCGGCGTGGATGATGCAATGTGGCTGCATCGGCAGGTCTTCTTGGCTAGCC ((((((((((.((((((((.((.((((((((((.(((((((..(((((.(.((....)).)))))))))).))).).))).......)))))).))((((((.......))))))))))))))))))))))).).. 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Zma-miR171e 7950283 7950303 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Zma-miR171e* 7950219 7950239 TGTTGGCTCGGCTCACTCAGA 3 Zma-MIR171f PmiREN023368 MIR171 Zea mays Zma-5 8552128 8552277 - TGTTGGCTGAGAGAGTGCGATGTTGGCATGGCTCAATCAACTCGCCGGCCGCGGGTGGCTTATAGCTTAATTCTGCGCATTCGATCGAGGTGCGGGCGCAGTGTTTAATTGATTGAGCCGTGCCAATATCACAACCTTCTCTAGCCTATA ....(((((((((.(((.(((((((((((((((((((((((((((.....))))))((((...)))).(((.((((((..(((..(...)..))))))))).)))....))))))))))))))))))))).).)).))))).)))).... 8552148 8552257 TGTTGGCATGGCTCAATCAACTCGCCGGCCGCGGGTGGCTTATAGCTTAATTCTGCGCATTCGATCGAGGTGCGGGCGCAGTGTTTAATTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((((((((((((((((((((.....))))))((((...)))).(((.((((((..(((..(...)..))))))))).)))....))))))))))))))))))).. Zma-miR171f 8552148 8552168 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Zma-miR171f* 8552237 8552257 TGTTGGCATGGCTCAATCAAC 3 Zma-MIR171g PmiREN023369 MIR171 Zea mays Zma-7 42496614 42496734 - CAAAGAACGAGGCGACATGGCATGGTATTGACTTGGCTCATCTCTCGCCCACACCAGAATCCACAAGTGCCGGAGGAGGTGAGCCGAGCCAATATCACTTCATGTCATCTAGCGTTCTGCG ...(((((((((.(((((((..((((((((.(((((((((((((.(.((..(((..(......)..)))..)).)))))))))))))).))))))))..))))))).)))..))))))... 42496634 42496714 CATGGTATTGACTTGGCTCATCTCTCGCCCACACCAGAATCCACAAGTGCCGGAGGAGGTGAGCCGAGCCAATATCACTTC ..((((((((.(((((((((((((.(.((..(((..(......)..)))..)).)))))))))))))).)))))))).... Zma-miR171g 42496634 42496655 TGAGCCGAGCCAATATCACTTC Zma-miR171g* 42496694 42496714 CATGGTATTGACTTGGCTCAT 3 Zma-MIR171h PmiREN023370 MIR171 Zea mays Zma-1 152274616 152274739 + GAGGAAGGAGACGACATGGCGTGGTATTGTTTCGGCTCATGTCCTTCTTCGATCGAGTCTTGCCGTTGGATTTGGATGTGATGTGAGCCGAACCAATATCACTCATGTACTCTTCATTCCCAAG (((..(((((...((((((.(((((((((.((((((((((((((.(((..((((.((........)).)))).))).).))))))))))))).))))))))))))))).)))))..)))..... 152274636 152274719 GTGGTATTGTTTCGGCTCATGTCCTTCTTCGATCGAGTCTTGCCGTTGGATTTGGATGTGATGTGAGCCGAACCAATATCACTC (((((((((.((((((((((((((.(((..((((.((........)).)))).))).).))))))))))))).))))))))).. 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Zma-miR171i 273359937 273359957 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Zma-miR171i* 273359895 273359915 TGTTGGCACGGTTCAATCAAA 3 Zma-MIR171j PmiREN023372 MIR171 Zea mays Zma-10 59887654 59887781 + TGGCCGCGAGCTAGACGGGGTATTGACGCGGTTCAATTCGAGAGCTCGAGCCCTAGCAGAGGCCAGGGGGGGTGGGGCTCTGCTCTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCACGTCCCACTCGCCCTCGCG .....(((((...((((.(((((((.((((((((((((.((((((..((((((((.(.....((....))).)))))))).)))))).)))))))))))).))))))).))))...)))))....... 59887674 59887761 TATTGACGCGGTTCAATTCGAGAGCTCGAGCCCTAGCAGAGGCCAGGGGGGGTGGGGCTCTGCTCTCTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((.((((((((((((.((((((..((((((((.(.....((....))).)))))))).)))))).)))))))))))).))))).. Zma-miR171j 59887741 59887761 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Zma-miR171j* 59887674 59887694 TATTGACGCGGTTCAATTCGA 3 Zma-MIR171k PmiREN023373 MIR171 Zea mays Zma-10 137341930 137342033 - GAGGAAGAAGACGACATGGCGTGGTATTGTTTCGGCTCATGTCCTTCTTGACTGGATGTGATGTGAGCCGAACCAATATCACTCATGTATTCTTCATTCTGAAA .((((.(((((..((((((.(((((((((.((((((((((((((.(((.....))).).))))))))))))).)))))))))))))))..))))).)))).... 137341950 137342013 GTGGTATTGTTTCGGCTCATGTCCTTCTTGACTGGATGTGATGTGAGCCGAACCAATATCACTC (((((((((.((((((((((((((.(((.....))).).))))))))))))).))))))))).. Zma-miR171k 137341950 137341970 TGAGCCGAACCAATATCACTC Zma-miR171k* 137341993 137342013 GTGGTATTGTTTCGGCTCATG 3 Zma-MIR171l PmiREN023374 MIR171 Zea mays Zma-2 19771354 19771579 + CGATTGGGGGAAGCTGCTGATTGAGCCGCGCCAATATCTCTCGCGCGCCGATGGAGTTGCCGACCTCAGCCGCCATTGCCGCCGCAGCAAGCTCGTCCAGGAGCTGTTGATGTTGCTGCGCCGCCGGGGTTGTTTTCATCGCTCCCCGCGGCGGTTGCAGTGGTGGCTGGAGCTGGAAGGGCGTGGTGGTATGCAGTGGCGGGAATGGTAGACCCTGCGACGGCGG (......).....((((((.((..(((((((..(((((.(.(((((.((..........(((.(.((((((((((((((.((((((((((((((......)))))........))))))(((((.((((..((.......)).)))))))))))).)))))))))))))).).)))..)))))))).))))))).)))))..)).))))))............... 19771374 19771559 TTGAGCCGCGCCAATATCTCTCGCGCGCCGATGGAGTTGCCGACCTCAGCCGCCATTGCCGCCGCAGCAAGCTCGTCCAGGAGCTGTTGATGTTGCTGCGCCGCCGGGGTTGTTTTCATCGCTCCCCGCGGCGGTTGCAGTGGTGGCTGGAGCTGGAAGGGCGTGGTGGTATGCAGTGGCGGGAAT ((..(((((((..(((((.(.(((((.((..........(((.(.((((((((((((((.((((((((((((((......)))))........))))))(((((.((((..((.......)).)))))))))))).)))))))))))))).).)))..)))))))).))))))).)))))..)).. Zma-miR171l 19771374 19771394 TTGAGCCGCGCCAATATCTCT Zma-miR171l* 19771539 19771559 GTGGTATGCAGTGGCGGGAAT 3 Zma-MIR171m PmiREN023375 MIR171 Zea mays Zma-2 17430167 17430290 - GAGGAAGGAGACGACATGGCGTGGTATTGTTTCGGCTCATGTCCTTCTTCGATCGAGTCTTGCCGTTGGATTTGGATGTGATGTGAGCCGAACCAATATCACTCATGTACTCTTCATTCCCAAG (((..(((((...((((((.(((((((((.((((((((((((((.(((..((((.((........)).)))).))).).))))))))))))).))))))))))))))).)))))..)))..... 17430187 17430270 GTGGTATTGTTTCGGCTCATGTCCTTCTTCGATCGAGTCTTGCCGTTGGATTTGGATGTGATGTGAGCCGAACCAATATCACTC (((((((((.((((((((((((((.(((..((((.((........)).)))).))).).))))))))))))).))))))))).. 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Zma-miR172b 215901574 215901594 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Zma-miR172b* 215901677 215901697 GCAGCACCATCAAGATTCACA 3 Zma-MIR172c PmiREN023378 MIR172 Zea mays Zma-4 171155868 171156028 + GACAGTGGGTGCTTGCAGGTGCAGCACCACCAAGATTCACATCCAACTCTCACGCATCTTCAGTGATGCATGCATGCTCTGTGATGTCTCGCAGCAGCTATATGCATATGTGATGAGATGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCAGACACTCACTCATCA ((.((((((((.((((.(((((((((.((.((((((((.((((((....(((((((((......)))))(((((((((((((((....)))))).)))...))))))..)))))).)))).)))))))).)).))))))))).)))).))))))))..)). 171155888 171156008 GCAGCACCACCAAGATTCACATCCAACTCTCACGCATCTTCAGTGATGCATGCATGCTCTGTGATGTCTCGCAGCAGCTATATGCATATGTGATGAGATGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((.((.((((((((.((((((....(((((((((......)))))(((((((((((((((....)))))).)))...))))))..)))))).)))).)))))))).)).)))))).. 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Zma-miR393b 18647141 18647161 TCCAAAGGGATCGCATTGATC Zma-miR393b* 18647226 18647246 TCAATGCGATCCTTTTGGAGG 3 Zma-MIR393c PmiREN023403 MIR393 Zea mays Zma-10 148152633 148152767 - GCAGGAAGCTAGTGGAGGACTCCAAAGGGATCGCATTGATCTAACCTGCCGATCGACGCCGACGTACGTACGTGCCCGAGGACAAGCAGATCAGTCAGTGCAATCCCTTTGGAATTCTCCACTTAGCGCCTCCAG ...(((.((((((((((((.(((((((((((.(((((((.((...((((...((..((...((((....))))...))..))...))))...))))))))).))))))))))).)))))))).))))...))).. 148152653 148152747 TCCAAAGGGATCGCATTGATCTAACCTGCCGATCGACGCCGACGTACGTACGTGCCCGAGGACAAGCAGATCAGTCAGTGCAATCCCTTTGGAAT (((((((((((.(((((((.((...((((...((..((...((((....))))...))..))...))))...))))))))).))))))))))).. Zma-miR393c 148152727 148152747 TCCAAAGGGATCGCATTGATC Zma-miR393c* 148152653 148152673 TCAGTGCAATCCCTTTGGAAT 3 Zma-MIR394a PmiREN023404 MIR394 Zea mays Zma-5 193872007 193872135 + GGCGCTTACTGAAGAGTTCCTTGGCATTCTGTCCACCTCCTCTCGCCGATCTTGCAGAAAGTTTACCAGTTCTGTTGCATTTTTTTTGGAGGTGGGCATACTGCCAATGGAGCTGTGTAGGCCTCCCTT ((.((((((...(.((((((((((((...(((((((((((.............((((((..........))))))............)))))))))))...)))))).)))))).))))))).)).... 193872027 193872115 TTGGCATTCTGTCCACCTCCTCTCGCCGATCTTGCAGAAAGTTTACCAGTTCTGTTGCATTTTTTTTGGAGGTGGGCATACTGCCAATG ((((((...(((((((((((.............((((((..........))))))............)))))))))))...)))))).. 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Zma-miR394b 154193725 154193744 TTGGCATTCTGTCCACCTCC Zma-miR394b* 154193789 154193809 GAGGTGGGCATACTGCCAATG 3 Zma-MIR395a PmiREN023406 MIR395 Zea mays Zma-2 6334642 6334789 - TTGGTTGGTTGTCACCTGGAGTTCTCCTCAAACCACTTCAGTTGCTGCACCTAGCTAGTTTAATGGCACTGTGCTTGCGTGCAAGCGGCCGGAGCTGTGTGTAGCTAGTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTGGGTGTCAATCAGCAATTT ...((((((((.(((((((((((((((.(((((.((((((.(.(((((((.(((((.......((((....((((((....)))))))))).))))).))))))).).)))))))))))))))))))))))))).))))))))..... 6334662 6334769 GTTCTCCTCAAACCACTTCAGTTGCTGCACCTAGCTAGTTTAATGGCACTGTGCTTGCGTGCAAGCGGCCGGAGCTGTGTGTAGCTAGTGAAGTGTTTGGGGGAACTC (((((((.(((((.((((((.(.(((((((.(((((.......((((....((((((....)))))))))).))))).))))))).).)))))))))))))))))).. 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Zma-miR395o 144171418 144171437 TGAAGTGTTTGGGGGAACTC Zma-miR395o* 144171530 144171550 GTTCCCTACAAGCACTTCATG 3 Zma-MIR395p PmiREN023419 MIR395 Zea mays Zma-10 144171672 144171798 + AATGTTTGGTGTTACCATGAGTTCCCTTCAAGCACTTCACATGAGGCACCATTCAAATGACAACTCCATTTAAGATTATGTGTAATGTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGGTGGTACTCAACATCCA .(((((.((((((((((.(((((((((.((((((((((((((.(.(((..(((.(((((.......)))))..)))..))).).))))))))))))))))))))))).)))))))))).)))))... 144171692 144171778 GTTCCCTTCAAGCACTTCACATGAGGCACCATTCAAATGACAACTCCATTTAAGATTATGTGTAATGTGAAGTGTTTGGGGGAACTC (((((((.((((((((((((((.(.(((..(((.(((((.......)))))..)))..))).).))))))))))))))))))))).. 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Zma-miR396e 173329628 173329648 TTCCACAGCTTTCTTGAACTT Zma-miR396e* 173329485 173329505 GGTCAAGAAAGCCGTGGGAAG 3 Zma-MIR396f PmiREN023427 MIR396 Zea mays Zma-5 214389058 214389212 + TTCAAGTCCATGCCATGCCTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTCTTCTTCTTCTCTCTTGGAACGGCAGCTTTCTTCGAATCTGTCTCTCTCTCTCTCATCTCCGAAGACGAAGGTCAAGAAAGCTGTGGGAAGAAATGACATAACAGGGACTC ....((((((((.(((..(((((((((((((((((((.((((.(((((............(((..(((((..(((...))).)))))..))).............))))).)))).)))))))))))))))))))..))).))).....))))). 214389078 214389192 TTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTCTTCTTCTTCTCTCTTGGAACGGCAGCTTTCTTCGAATCTGTCTCTCTCTCTCTCATCTCCGAAGACGAAGGTCAAGAAAGCTGTGGGAAG (((((((((((((((((.((((.(((((............(((..(((((..(((...))).)))))..))).............))))).)))).))))))))))))))))).. Zma-miR396f 214389078 214389098 TTCCACAGCTTTCTTGAACTT Zma-miR396f* 214389172 214389192 GGTCAAGAAAGCTGTGGGAAG 3 Zma-MIR396g PmiREN023428 MIR396 Zea mays Zma-5 214399551 214399702 - TAATGGCCCTCCCTGCCATCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCATGCATGCAGCAGGCTGTGCTGTGGACCTGATCGAGTTTCAATTGATCCAAGCAAGCAAGAGGGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAATTGCAGAGAGAGAGAGACCA ...(((((((((((((.((.((((((((((((.(((((((((.((.(((..((((((.....))))))......((((((.......)))))).......))).))..))))))))).)))))))))))).)).)))).).))).).).))) 214399571 214399682 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCATGCATGCAGCAGGCTGTGCTGTGGACCTGATCGAGTTTCAATTGATCCAAGCAAGCAAGAGGGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAA ((((((((((((.(((((((((.((.(((..((((((.....))))))......((((((.......)))))).......))).))..))))))))).)))))))))))).. 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Zma-miR528b 153752396 153752416 TGGAAGGGGCATGCAGAGGAG Zma-miR528b* 153752340 153752360 CCTGTGCCTGCCTCTTCCATT 3 Zma-MIR529 PmiREN023458 MIR529 Zea mays Zma-5 160612956 160613119 + ATTTCATCAAGGCTAAAGGGAGAAGAGAGAGAGTACAGCCTTGTTGCCATGTACACACTCAGATATCAACAGTCTCTTATATTTGCTGTTACTACCTGTTATTAGTGTCCAGTGATGATGAAGGCTGTACCCTCTCTCTTCTTCTCTTAGCTTCTTGATGCAAA .(((((((((((((((.((((((((((((((.((((((((((((((.(((....((((((((.((..((((((...........))))))..)).))).....)))))...))).)))).)))))))))).)))))))))))))).)))))..))))))).))) 160612976 160613099 AGAAGAGAGAGAGTACAGCCTTGTTGCCATGTACACACTCAGATATCAACAGTCTCTTATATTTGCTGTTACTACCTGTTATTAGTGTCCAGTGATGATGAAGGCTGTACCCTCTCTCTTCTTC (((((((((((.((((((((((((((.(((....((((((((.((..((((((...........))))))..)).))).....)))))...))).)))).)))))))))).))))))))))).. Zma-miR529 160612976 160612996 AGAAGAGAGAGAGTACAGCCT Zma-miR529* 160613079 160613099 GCTGTACCCTCTCTCTTCTTC 3 Zma-MIR827 PmiREN023463 MIR827 Zea mays Zma-5 167388768 167388927 - CTAATGCAGCTCCGAACCTGTTTTGTTGGTGGTCATTTAACCATGCATGCTTCGATCGATGGATTGGTGCATGCATGGATTATTGCATAGTGTGATGCATGTGGCGCATCAGTGCATGGTTAGATGACCATCAGCAAACATGTTCTTGAGGCATGCAAGT .............((((.(((((.((((((((((((((((((((((((((.((((((....)))))).))(((((........)))))....((((((.......))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))............... 167388788 167388907 TTTTGTTGGTGGTCATTTAACCATGCATGCTTCGATCGATGGATTGGTGCATGCATGGATTATTGCATAGTGTGATGCATGTGGCGCATCAGTGCATGGTTAGATGACCATCAGCAAACA (((.((((((((((((((((((((((((((.((((((....)))))).))(((((........)))))....((((((.......))))))))))))))))))))))))))))))))).. Zma-miR827 167388788 167388808 TTAGATGACCATCAGCAAACA Zma-miR827* 167388887 167388907 TTTTGTTGGTGGTCATTTAAC 3 Zma-MIR1432 PmiREN023278 MIR1432 Zea mays Zma-7 160484739 160484864 - TGTGGGTGTGCGTCCTACGCTCAGGAGAGATGACACCGACGCCAGACGGACCGGTCCATCCGCGCCGTGTCTGTCCGTCTGAAGTGGGTGTCATCTCGCCTGAAGCATAGGGCGGGCTCTCGCTGG .(((((.((.(((((((.(((((((.(((((((((((.((..(((((((((((((.(....).)))).....)))))))))..)).))))))))))).)))).))).))))))).)).)))))... 160484759 160484844 TCAGGAGAGATGACACCGACGCCAGACGGACCGGTCCATCCGCGCCGTGTCTGTCCGTCTGAAGTGGGTGTCATCTCGCCTGAAGC (((((.(((((((((((.((..(((((((((((((.(....).)))).....)))))))))..)).))))))))))).)))).).. Zma-miR1432 160484824 160484844 TCAGGAGAGATGACACCGACG Zma-miR1432* 160484759 160484779 GGGTGTCATCTCGCCTGAAGC 3 Zma-MIR2118a PmiREN023382 MIR2118 Zea mays Zma-10 117749876 117750009 - GAGAGGTCCTAAGGGCAGTAGGGATGAGAACATGAAGGAACGCGAGTGCTCTGAATTTCTCGTCTCGCACGGAGGACATGTGCACTGTCGTGTTCCTGATGCCTCTCATTCCTATGGTTCTTAGGTGCTCCTTC (.(((..(((((((((.((((((((((((.(((..((((((((((((((.(((...(((((..........))))))).).))))..)))))))))).)))..)))))))))))).)))))))))..))))... 117749896 117749989 GGGATGAGAACATGAAGGAACGCGAGTGCTCTGAATTTCTCGTCTCGCACGGAGGACATGTGCACTGTCGTGTTCCTGATGCCTCTCATTCCTA (((((((((.(((..((((((((((((((.(((...(((((..........))))))).).))))..)))))))))).)))..))))))))).. Zma-miR2118a 117749896 117749917 TTCCTGATGCCTCTCATTCCTA Zma-miR2118a* 117749969 117749989 GGGATGAGAACATGAAGGAAC 3 Zma-MIR2118b PmiREN023383 MIR2118 Zea mays Zma-2 49919291 49919428 + GAGAGGGCCTAAGAGCAGTGGGAATGGGAACATGGAGGAAAGCCCATCCTGTTGGTTTCCTCCTCCAGAAACCGAGGTGGAAGCTTGGTTCGGTGTTTCCCGATGCCTCCCATTCCTATTGTTCTTAAGCACTTCATC ..((((((.((((((((((((((((((((.(((.(.((((((((...((....(((((((.((((........)))).))))))).))...))).)))))).)))..)))))))))))))))))))).)).))))... 49919311 49919408 GGAATGGGAACATGGAGGAAAGCCCATCCTGTTGGTTTCCTCCTCCAGAAACCGAGGTGGAAGCTTGGTTCGGTGTTTCCCGATGCCTCCCATTCCTA (((((((((.(((.(.((((((((...((....(((((((.((((........)))).))))))).))...))).)))))).)))..))))))))).. Zma-miR2118b 49919387 49919408 TTCCCGATGCCTCCCATTCCTA Zma-miR2118b* 49919311 49919331 GGAATGGGAACATGGAGGAAA 3 Zma-MIR2118c PmiREN023384 MIR2118 Zea mays Zma-10 117773264 117773376 - AAGATGATCTAAGAGCAGTGGGCATGGGAACATGGAGGAAGGCCTATGAGGTTGAAACCTCATTTTGTGTCTTCCTAATGCCTCCCATTCCTATCGTTCTTAGGTGATCCTTC ..(((.((((((((((.(((((.((((((.(((..(((((((((.(((((((....)))))))...).)))))))).)))..)))))).))))).)))))))))).))).... 117773284 117773356 GGCATGGGAACATGGAGGAAGGCCTATGAGGTTGAAACCTCATTTTGTGTCTTCCTAATGCCTCCCATTCCTA ((.((((((.(((..(((((((((.(((((((....)))))))...).)))))))).)))..)))))).)).. Zma-miR2118c 117773284 117773305 TTCCTAATGCCTCCCATTCCTA Zma-miR2118c* 117773336 117773356 GGCATGGGAACATGGAGGAAG 3 Zma-MIR2118d PmiREN023388 MIR2118 Zea mays Zma-2 49919510 49919621 + GAGAGGGTCTAAGAGCAGTGGGCATGGGAACACGGAGGAAGGCCTATGAGTGGAAAGCTCATTTTGGGTCTTCCTGATGCCTCCCATGCCTATCGTTGTTAGGTGCTCCTTC (.(((.((((((.(((.((((((((((((...((.((((((((((((((((.....))))))...))))))))))..))..)))))))))))).))).)))))).))))))) 49919530 49919601 GGCATGGGAACACGGAGGAAGGCCTATGAGTGGAAAGCTCATTTTGGGTCTTCCTGATGCCTCCCATGCCTA (((((((((...((.((((((((((((((((.....))))))...))))))))))..))..))))))))))) Zma-miR2118d 49919580 49919601 TTCCTGATGCCTCCCATGCC Zma-miR2118d* 49919530 49919550 GGCATGGGAACACGGAGGAAG 3 Zma-MIR2118e PmiREN023386 MIR2118 Zea mays Zma-10 117699637 117699864 - TGTTCTTTTTTCTGAATGTTTTCCTGATGTCTCCCATTCCTACGGTTCTTAGGTGCTCCTTCCTCTTCCTTTGGCCTGTGAAATTAGTTCTAGTGAAGAAAACATTATACACCCACATTTAAGTTTAAATGGTGAGGCCTTGAGAGTGGGTCAGGAAGAGGAAGAAACGAGTGTCTAAGAGCAGTGGGCATGGGAACATAGGGGAAAGCCAAACTTTCTTTACCTGTA .((((........))))((((((((.((((.((((((.(((((.((((((((((((((((((((((((((.......(((.(((...((((.....))))...))).)))((((((.(((((((((........))).)))))).)))))).))))))))))))....)))))))))))))).))))).))))))))))..))))))))................... 117699657 117699844 TTCCTGATGTCTCCCATTCCTACGGTTCTTAGGTGCTCCTTCCTCTTCCTTTGGCCTGTGAAATTAGTTCTAGTGAAGAAAACATTATACACCCACATTTAAGTTTAAATGGTGAGGCCTTGAGAGTGGGTCAGGAAGAGGAAGAAACGAGTGTCTAAGAGCAGTGGGCATGGGAACATAGGGGAAAG (((((.((((.((((((.(((((.((((((((((((((((((((((((((.......(((.(((...((((.....))))...))).)))((((((.(((((((((........))).)))))).)))))).))))))))))))....)))))))))))))).))))).))))))))))..))))).. Zma-miR2118e 117699823 117699844 TTCCTGATGTCTCCCATTCCTA Zma-miR2118e* 117699657 117699677 GCATGGGAACATAGGGGAAAG 3 Zma-MIR2118f PmiREN023385 MIR2118 Zea mays Zma-10 117700019 117700129 - GAGAATATCTAAGAGCGGTGGGAATGGGAACATGGAGGAAAGCATCATGCAGACATTTGTCTCAGTGTTTTTCTGATGCCTCCCATTCCTACGGTTCTTAGGTACTCCTTC ..((.(((((((((((.((((((((((((.(((..((((((((((..((.((((....)))))))))))))))).)))..)))))))))))).))))))))))).)).... 117700039 117700109 GGAATGGGAACATGGAGGAAAGCATCATGCAGACATTTGTCTCAGTGTTTTTCTGATGCCTCCCATTCCTA (((((((((.(((..((((((((((..((.((((....)))))))))))))))).)))..))))))))).. Zma-miR2118f 117700039 117700060 TTTCTGATGCCTCCCATTCCTA Zma-miR2118f* 117700089 117700109 GGAATGGGAACATGGAGGAAA 3 Zma-MIR2118g PmiREN023387 MIR2118 Zea mays Zma-2 49985411 49985646 + GGAGATTTAGGCCTGATGTTTTCCTGATGCCTCCTATTCCTAAGGCTCTTAGGTTCTCCTTCCCTTTCCTTATGGCTTGCGAAATCAATGTTAATCAGATCAAAAGAGATGGGGTCAGGGTACACTATGCTGGTTGCAAGCAAGCAAGAGAAAGAATGAGAGAGGGACTGAGAACAGTGGCTAGTGGGAAACTGGGAATGGGAACATGGAGGAAAGCTAAGTTAAATTTCTTCGTT ((((((((((..((...((((((((.(((..(((((((((((...(((((((((((((..(((((((((((.((((((((((...........(((..(((......)))..)))(((.(((...))).))).))))))))...)).))).........))))))))..)))))).....)))).)))....))))))))))).)))..))))))))..))))))))))))..... 49985431 49985626 TTCCTGATGCCTCCTATTCCTAAGGCTCTTAGGTTCTCCTTCCCTTTCCTTATGGCTTGCGAAATCAATGTTAATCAGATCAAAAGAGATGGGGTCAGGGTACACTATGCTGGTTGCAAGCAAGCAAGAGAAAGAATGAGAGAGGGACTGAGAACAGTGGCTAGTGGGAAACTGGGAATGGGAACATGGAGGAAAG (((((.(((..(((((((((((...(((((((((((((..(((((((((((.((((((((((...........(((..(((......)))..)))(((.(((...))).))).))))))))...)).))).........))))))))..)))))).....)))).)))....))))))))))).)))..))))).. Zma-miR2118g 49985431 49985452 TTCCTGATGCCTCCTATTCCTA Zma-miR2118g* 49985606 49985626 GAATGGGAACATGGAGGAAAG 3 Zma-MIR2275a PmiREN023389 MIR2275 Zea mays Zma-4 30231068 30231192 + AGTGTCAGGCACTGAAAGTGAGAGTTGGAGGAAAGCAAACCGGCTGGGTATCGGATTCAGCAACGGAGGGTGCTGCCGGTCGGTTTGTTTTCCTCCAATATCTCACCTTCAGTCGATAGTCTGAT ...(((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((..........(((((.(....).))))))))))))))))))))))))))))).)))))).)))))).....))))))) 30231088 30231172 AGAGTTGGAGGAAAGCAAACCGGCTGGGTATCGGATTCAGCAACGGAGGGTGCTGCCGGTCGGTTTGTTTTCCTCCAATATCTCA (((((((((((((((((((((((((((..........(((((.(....).))))))))))))))))))))))))))))).))).. Zma-miR2275a 30231151 30231172 TTTGTTTTCCTCCAATATCTCA Zma-miR2275a* 30231088 30231108 AGAGTTGGAGGAAAGCAAACC 3 Zma-MIR2275b PmiREN023390 MIR2275 Zea mays Zma-4 30231219 30231318 + CATTTGTGCCATCTGAAGTGAGGATTAGAGGCAACTGAACCATCATCTATTGCAAAGGTTCAGTTTCCTCTAATATCTCATCTCGAATGGGCCCATC ........((((.(((.((((((((((((((.(((((((((...............))))))))).)))))))).)))))).))).))))....... .- 30231239 30231298 AGGATTAGAGGCAACTGAACCATCATCTATTGCAAAGGTTCAGTTTCCTCTAATATCTCA (((((((((((.(((((((((...............))))))))).)))))))).))).. 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Zma-miR2275d 202064559 202064580 TTTGTTTTCCTCTAATATCTCA Zma-miR2275d* 202064484 202064504 AGAGTTGGAGGAAAGAAAACT 3 Zma-MIR2275e PmiREN023393 MIR2275 Zea mays Zma-1 234281508 234281614 + AGAATTTGAAGCTGAAGGTGAGTGTTGGAGGGAACCAAATCTCCAGCTGCATGCACAGCACAAGGTTTGGTTTCCTCCAATGTCTCATCTTCAACTGTCTCAAATCA ...((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((...((((......))))...)))))))))))))))))))).))))))))))...)).)))))).. 234281528 234281594 AGTGTTGGAGGGAACCAAATCTCCAGCTGCATGCACAGCACAAGGTTTGGTTTCCTCCAATGTCTCA ((((((((((((((((((((((...((((......))))...)))))))))))))))))))).)).. 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Zma-miR5139a 73309112 73309131 GTAACCTGGCTCCGATACCA Zma-miR5139a* 73309047 73309067 GTTTCTAAGCAGGTTTTATAT 3 Zma-MIR5139b PmiREN023450 MIR5139 Zea mays Zma-4 63532882 63532971 + TTTTAGATTTTTGAAAGTTGGTATTCATGGTTTATTGCTTCCTCTATGGGGTAACCTGGCTCCGATACCAGCTGTGGCAGAACCGCCCAA ...............((((((((((...((((..(((((((......)))))))...))))..))))))))))(.(((......)))).. 63532902 63532951 GTATTCATGGTTTATTGCTTCCTCTATGGGGTAACCTGGCTCCGATACCA (((((...((((..(((((((......)))))))...))))..))))).. 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Zma-miR5169a 7567142 7567162 TTTGACCAAGTTTGTAGAAAA Zma-miR5169a* 7567051 7567071 TTCTATAAATTTCGTCAAAAT 3 Zma-MIR5169b PmiREN023452 MIR5169 Zea mays Zma-1 53173353 53173531 - GTTCTAAGTCAAACTTTTACTTTGACCAAGTTTGTAGAAAAAGATATTAATATCTCCAGTACCTAATAAATGTATTATCAAGAGATTTCATGGTGGATCTAATGAAACTAATTTGACGATGTAGATATTGATACACTTTTCTATAAACTTTGTTAAAGTTAGATAAGTCTGACTTAAGA .((.(((((((.((((..((((((((.((((((((((((((...(((((((((((.((........(((((......(((..((((((......))))))..))).....)))))....)).)))))))))))...)))))))))))))).)))))))).....)))).))))))).)) 53173373 53173511 TTTGACCAAGTTTGTAGAAAAAGATATTAATATCTCCAGTACCTAATAAATGTATTATCAAGAGATTTCATGGTGGATCTAATGAAACTAATTTGACGATGTAGATATTGATACACTTTTCTATAAACTTTGTTAAAGT ((((((.((((((((((((((...(((((((((((.((........(((((......(((..((((((......))))))..))).....)))))....)).)))))))))))...)))))))))))))).)))))).. 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Zma-miRN4103c 6849585 6849605 ATGGAGAGTAGAAGACAAACT Zma-miRN4103c* 6849563 6849583 TTTGTTTTGGCACCGTACTCC 3 Zma-MIRN4104 PmiREN023475 MIRN4104 Zea mays Zma-6 166763862 166764035 + CACCGGCATGAGTACGCCGCCGAGAACGCTCATCGAACGCCTTGAGACGTCCGAGCGCCTCCTCGAACGGCATCGTCTCGACGTCGCAGAACTGCTCGATGCCCGCGACGACGGGGAAGAGCCGATCTGGAACGGTGTCGAGGAGCTTCTTCACCATGGCAGCGTCGTCGAGCG .....................(((((.((((.((((.((((((((((((.(((..((......))..)))...)))))))).((..((((.(.((((..(.((((......)))).).)))).).))))..)))))))))).)))))))))....................... 166763882 166764015 CGAGAACGCTCATCGAACGCCTTGAGACGTCCGAGCGCCTCCTCGAACGGCATCGTCTCGACGTCGCAGAACTGCTCGATGCCCGCGACGACGGGGAAGAGCCGATCTGGAACGGTGTCGAGGAGCTTCTTCAC .(((((.((((.((((.((((((((((((.(((..((......))..)))...)))))))).((..((((.(.((((..(.((((......)))).).)))).).))))..)))))))))).)))))))))... Zma-miRN4104 166763882 166763903 CGAGAACGCTCATCGAACGCCT Zma-miRN4104* 166763995 166764015 GGTGTCGAGGAGCTTCTTCAC 3 Zma-MIRN4105 PmiREN023477 MIRN4105 Zea mays Zma-7 18054750 18054924 + TTTGAGGATCATGGCCAATGTCAAAGTTAGACAAGTGGAGCGAAGTGCAGTGGAGGCTGTCAACATCCGATGGTGAGGTTGTCTTCCTTGTCGGAGATATATGGTGATCTCGAGCTGCATACAAGGTTTTGTCACTTCTCACGTGTTGACGGACAATTGGCTATCATCTGATTCT ....((((((((((((((((((...(((((.((.(((((((((((((((((.((((((((.....((((((((.((((....)))).)))))))).....)))))...)))..))))))).......)))))....)).))).))))))).))).)))))))).....))))))) 18054770 18054904 TCAAAGTTAGACAAGTGGAGCGAAGTGCAGTGGAGGCTGTCAACATCCGATGGTGAGGTTGTCTTCCTTGTCGGAGATATATGGTGATCTCGAGCTGCATACAAGGTTTTGTCACTTCTCACGTGTTGACGGACA ((...(((((.((.(((((((((((((((((.((((((((.....((((((((.((((....)))).)))))))).....)))))...)))..))))))).......)))))....)).))).))))))).)).. 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Zma-miRN4107 49937944 49937964 CTACTCCTCTTTCTTCCTCTT Zma-miRN4107* 49938073 49938093 GCGGAAGTAAGAGGAAGGAGA 3 Zma-MIRN4108 PmiREN023483 MIRN4108 Zea mays Zma-10 27471506 27471697 - GATAAATATTGGATTAGATTAGATATAAGATTGAGTTAGTTATTTGGGATTAGATTAAATAAGATTGAGTTAGTTACATGGCATTAGATTAGATTGAGTTAGTTACTTTGGGGGGCAAGTTTTCTTATCTATATAATACTATCTCCAGCAGCTTACCCATTCTCATACCTATATTCAAACTCCACTCTGCAA ((((...............(((.(((.(((.((.((.((((..(((((..(((((((.(((.((((((.((((((..((........))..)))))).))))))....(((((((.....)))))))..))).)))).)))..))))).)))).)).)).))).))).)))))))................. 27471526 27471677 AGATATAAGATTGAGTTAGTTATTTGGGATTAGATTAAATAAGATTGAGTTAGTTACATGGCATTAGATTAGATTGAGTTAGTTACTTTGGGGGGCAAGTTTTCTTATCTATATAATACTATCTCCAGCAGCTTACCCATTCTCATACCTAT ((.(((.(((.((.((.((((..(((((..(((((((.(((.((((((.((((((..((........))..)))))).))))))....(((((((.....)))))))..))).)))).)))..))))).)))).)).)).))).))).)).. 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Zma-miRN4110d 55665258 55665278 TATCACAAGCGGTTTTAGATT Zma-miRN4110d* 55665145 55665165 TTTAAAACCGTCTGTGATATG 3 Zma-MIRN4110e PmiREN023501 MIRN4110 Zea mays Zma-6 26959679 26959764 + TATCGCAGGCGGTTCCTTTAGCTAGAACCGCCTGTGATGTGTGTCTATCACAAGCGGTTTTAGATTGACCGCCTGTGATGTTGTTT ((((((((((((((.......((((((((((.(((((((......))))))).))))))))))...))))))))))))))...... 26959699 26959744 GCTAGAACCGCCTGTGATGTGTGTCTATCACAAGCGGTTTTAGATT .((((((((((.(((((((......))))))).))))))))))... 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Zma-miRN4111b 29252996 29253016 TTGCTCGGCTGGCACACCGGA Zma-miRN4111b* 29252949 29252969 GTGAATTTTAGCGGAGCGGCT 3 Zma-MIRN4111c PmiREN023742 MIRN4111 Zea mays Zma-9 140082394 140082650 + ACCGGACAGTCCGGTGCGCCAGCCACGTCAGCGGGCCGTTAGGGTTTGACCGTTGGAGCTCTGATAGGTGGGGCCTCTGAGCTGTCCGGTGGTGCACCAGACAGGTCCTGTAGACTGTCCAGTGCGCCAACTGCGCGTGCTCTGTCCTCTGCGCGCGCAGGCGCGCATTAAATGCGTTGCAGTCGACCGTTGCGCGCGAAGTAGCCGTTGCTCGGCTGGCACACCGGACAGTCTGGTGAATTATAGCGGA (((((((.((((((((.(((((((..(.(((((((((.....)))...((((..(.(((((....((((...))))..))))).).))))(((((((..(((((.((.....)))))))..)))))))..((((((((((..........))))))))))(((((((....(((.((((....)))))))))))))).......)))))))..))))))).)))))))).)))))))............. .-129. 140082414 140082630 CGGTGCGCCAGCCACGTCAGCGGGCCGTTAGGGTTTGACCGTTGGAGCTCTGATAGGTGGGGCCTCTGAGCTGTCCGGTGGTGCACCAGACAGGTCCTGTAGACTGTCCAGTGCGCCAACTGCGCGTGCTCTGTCCTCTGCGCGCGCAGGCGCGCATTAAATGCGTTGCAGTCGACCGTTGCGCGCGAAGTAGCCGTTGCTCGGCTGGCACACCGGA (((((.(((((((..(.(((((((((.....)))...((((..(.(((((....((((...))))..))))).).))))(((((((..(((((.((.....)))))))..)))))))..((((((((((..........))))))))))(((((((....(((.((((....)))))))))))))).......)))))))..))))))).))))).. 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Zma-miRN4143k 78616210 78616231 TTGACCATCGGGACGATGCAAC Zma-miRN4143k* 78616173 78616193 TGATTTCCGGGTAGGCAATAA 3 Zma-MIRN4144 PmiREN023653 MIRN4144 Zea mays Zma-7 150449810 150449978 - TCTTGTAAATATATCGATTCCTGCCAACGATGACACTATGACTTCAATTCGATTAATTCTCAACAAATTACTATTTGCAATTTCTAAAGGGCCGTTCTCTCTATATAAGAAATCGTTGATTAAGAAGAATAGTGAATTCTTGAGCAACTGCGTAGATTTATAGGATTAA ((((((((((....((.....((((((.((...((((((..((((...(((((...((((...(((((....)))))..........((((.....)))).......))))...)))))....)))).))))))...))))).)))....))...)))))))))).... 150449830 150449958 CTGCCAACGATGACACTATGACTTCAATTCGATTAATTCTCAACAAATTACTATTTGCAATTTCTAAAGGGCCGTTCTCTCTATATAAGAAATCGTTGATTAAGAAGAATAGTGAATTCTTGAGCAACT .((((((.((...((((((..((((...(((((...((((...(((((....)))))..........((((.....)))).......))))...)))))....)))).))))))...))))).)))... 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Zma-miRN4145b 175331473 175331493 CGGAGGGAATTGGAGGGGCTA Zma-miRN4145b* 175331536 175331556 GACCCTCCAATCCTCTCCAGT 3 Zma-MIRN4145c PmiREN023759 MIRN4145 Zea mays Zma-5 163295435 163295558 + TAGTTTGGGAGTCACAAAACCGGAGGGAATTGGAGGGGCTAAAATCCCCTCCTTATTCAATTTTCAATAAGAAGGGGATTTTTTCCCCTCTAATTCCCTCCGGGTTTGGAACTCCCAAACTAGC ((((((((((((..(((..(((((((((((((((((((..((((((((((.((((((........)))))).))))))))))..)))))))))))))))))))..)))..)))))))))))).. 163295455 163295538 CGGAGGGAATTGGAGGGGCTAAAATCCCCTCCTTATTCAATTTTCAATAAGAAGGGGATTTTTTCCCCTCTAATTCCCTCCGGG ((((((((((((((((((..((((((((((.((((((........)))))).))))))))))..)))))))))))))))))).. 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Zma-miRN4153 55117519 55117539 AAATAAAAAAGAATGACTGCA Zma-miRN4153* 55117620 55117640 CCCAGTTTTCTTCATATTTTT 3 Zma-MIRN4154a PmiREN023694 MIRN4154 Zea mays Zma-9 130924779 130925009 - GAAATTTTGTCTGCTATACATAATGTGTTCCATGTGTCACAATTGAAGAAGTGTCTTCGGGTACCAGACCGAACCATTGAAGTGACAGATGTTGTCCTTGAACCAGACTTGACATACTCTGAGCATCCTATTCGAGTCTTGGATCAAAAGGACACGGTTACCCGGAGGAAAACTCTCAAGTTCTATAAGATACAGTGGAACCAACATTCTAAAGAAGAGGCTACATGGGAA (.......((((.........(((((((((((((((((..((((..(((.((.((((((((((....((((...((((.........)))).(((((((((.((((((((((...................))))))).))).)))..))))))))))))))))))))...)))))..))))......)))))).))))))..))))).........))))....)..... 130924799 130924989 TAATGTGTTCCATGTGTCACAATTGAAGAAGTGTCTTCGGGTACCAGACCGAACCATTGAAGTGACAGATGTTGTCCTTGAACCAGACTTGACATACTCTGAGCATCCTATTCGAGTCTTGGATCAAAAGGACACGGTTACCCGGAGGAAAACTCTCAAGTTCTATAAGATACAGTGGAACCAACATTCTA .(((((((((((((((((..((((..(((.((.((((((((((....((((...((((.........)))).(((((((((.((((((((((...................))))))).))).)))..))))))))))))))))))))...)))))..))))......)))))).))))))..)))))... 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Zma-miRN4168 203188738 203188759 ATCATAATTCAGACTGTTGGCA Zma-miRN4168* 203188846 203188866 GGCTAGGAATTGCTTGACTGC 3 Zma-MIRN4169 PmiREN023798 MIRN4169 Zea mays Zma-1 22222990 22223135 - TTATCTCTAGCCGGGGGTGCATTCTGTTGTTGCTGCTGGTGCTGTTGATTCTGCTGGTTTTGCTGAATCTGTTGCACAGATGCAGTGAGTCCCTGCAGAAGCTGCATCTGAGCGGCGATAAACTGCTCCATGTTAGGGTTTGGTGG ...............((.(((.....((((((((((((((((.((...((((((.((.(((((((.((((((...)))))).)))))))..)).)))))))).)))))..)))))))))))..))).))................. 22223010 22223115 ATTCTGTTGTTGCTGCTGGTGCTGTTGATTCTGCTGGTTTTGCTGAATCTGTTGCACAGATGCAGTGAGTCCCTGCAGAAGCTGCATCTGAGCGGCGATAAACTGC (.....((((((((((((((((.((...((((((.((.(((((((.((((((...)))))).)))))))..)).)))))))).)))))..)))))))))))..).. 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Zma-miRN4170 275284973 275284994 TTGCATAGGATTGTTGGCTAGT Zma-miRN4170* 275285076 275285096 TAGTTGATTTTCTGTGTTAAC 3 Zma-MIRN4171 PmiREN023806 MIRN4171 Zea mays Zma-2 15235247 15235342 - GAATTTTGGTTTTACGTTGCTGAGGGTACTGTCGAAGACCACGAGGGACTCCCCGTGTCTGAGATGTGCTCTCATTATTACTTTGCGTATCCGCCC ....................(((((((((.(((..((((.(((.(((...))))))))))..))))))))))))...................... 15235267 15235322 TGAGGGTACTGTCGAAGACCACGAGGGACTCCCCGTGTCTGAGATGTGCTCTCATT (((((((((.(((..((((.(((.(((...))))))))))..)))))))))))).. 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Zma-miRN4172c 32398861 32398881 GAGAATCATGTAGAGCTTTAT Zma-miRN4172c* 32398685 32398705 GAACCTAAGGTGATTTTCGTG 3 Zma-MIRN4173 PmiREN023810 MIRN4173 Zea mays Zma-3 210196486 210196657 - ATGGTGTCTTATATCTATGTGTTTAGTTCTAGAATGTTGCACAGGATTGTTGGCTAGTTTAATGGCGCTCTCATTGTCACAAAGTAGTGTGATTCTTTTAAATTCATAGTCAAAATCTCTCAAAGTTTGCTTCATACATAGCAACTGAGCACAACAAGCACCAGCAGCTATG ..((((.(((.......(((((((((((((((.(((..(((..(((((.(((((((((((((.((...((.(((((........))))).))..)).))))))...)))))))))))).........)))..))).).))).)))))))))))..))))))).......... 210196506 210196637 GTTTAGTTCTAGAATGTTGCACAGGATTGTTGGCTAGTTTAATGGCGCTCTCATTGTCACAAAGTAGTGTGATTCTTTTAAATTCATAGTCAAAATCTCTCAAAGTTTGCTTCATACATAGCAACTGAGCAC ((((((((((((.(((..(((..(((((.(((((((((((((.((...((.(((((........))))).))..)).))))))...)))))))))))).........)))..))).).))).)))))))).. 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Zma-miRN4190b 103558501 103558521 TCCAGACGTAACCGAACAAGC Zma-miRN4190b* 103558401 103558421 TTGTTCGGTTGCGTCTGGATC 3 Zma-MIRN4190c PmiREN023930 MIRN4190 Zea mays Zma-3 45423718 45423857 - AGATCCAATTCTCTTAGGGCTTGTTCGATTGCATATGAATCGATGGGAATCTATTCAATTTTGACTAGGGAGGGATTTAATAACCACCAATCCCTTCGATCCAGACGTAACCGAACAAGCCTTTAGATCGGATAATATTT ...........(((.((((((((((((.((((...((.(((((.((((..(((.(((....))).)))((.((..........)).))..)))).))))).))...)))).)))))))))))).)))............. 45423738 45423837 TTGTTCGATTGCATATGAATCGATGGGAATCTATTCAATTTTGACTAGGGAGGGATTTAATAACCACCAATCCCTTCGATCCAGACGTAACCGAACAAGC (((((((.((((...((.(((((.((((..(((.(((....))).)))((.((..........)).))..)))).))))).))...)))).))))))).. Zma-miRN4190c 45423738 45423758 TCCAGACGTAACCGAACAAGC Zma-miRN4190c* 45423817 45423837 TTGTTCGATTGCATATGAATC 3 Zma-MIRN4191a PmiREN023931 MIRN4191 Zea mays Zma-2 195160989 195161160 + TTGCAATAGAAAATTTCTTTTGAATGATTGTATGTAGATGACTCCCCCTAAATGTGTGCACGATTGTGAATCCAACGTTTTGACATAATATGTCATGTGAGCAACACATTTAGAGATAGTGACAAAAACCATACTAAATACAATCATCCGAGGGGTGCAAGAGTGTCATAAC (((((..........(((((((.((((((((((.(((((((((..(.(((((((((((((((.(((......))))))..((((((...)))))).....)).)))))))))).)..))).........))).))).)))))))))).))))))))))))............ 195161009 195161140 TGAATGATTGTATGTAGATGACTCCCCCTAAATGTGTGCACGATTGTGAATCCAACGTTTTGACATAATATGTCATGTGAGCAACACATTTAGAGATAGTGACAAAAACCATACTAAATACAATCATCCGAG ((.((((((((((.(((((((((..(.(((((((((((((((.(((......))))))..((((((...)))))).....)).)))))))))).)..))).........))).))).)))))))))).)).. 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Zma-miRN4222 24235081 24235101 TCCTCTGCGTACGTGTGGACG Zma-miRN4222* 24235036 24235056 CCGTGATGACGTAGATGGTCT 3 Zma-MIRN4223 PmiREN024119 MIRN4223 Zea mays Zma-9 81502808 81503061 + AGCCTCACGTCAGACACTGTTGATTTGGTCGATCTCGAGGAGTCCGCAAAAAAGGCTGAGGCAATAGCCGCAAAGATAAAGAATCCAACTAAGGCAGATTATAAAAACGTGCCTAAAAAATATGTGCCGGGCAGACCACTACTCACTTTTGAGAAACTAAGGAAGGTCCCAGCTAATATTAAAAGGTTGCATGATTGGTACATGCGGGCATCTTCAGTTGGCATCGACATCATTAGTGTTAATATACC ............(((((((.((((...((((((((.(((((((((((......(((((......))))).....(((.....)))......(((((..((.....))..))))).......(((((((((((...((....((((....)))).......))...))))(((((..........))))).......))))))))))))).)))))....)).)))))))))).)))))))........ .-62. 81502828 81503041 TGATTTGGTCGATCTCGAGGAGTCCGCAAAAAAGGCTGAGGCAATAGCCGCAAAGATAAAGAATCCAACTAAGGCAGATTATAAAAACGTGCCTAAAAAATATGTGCCGGGCAGACCACTACTCACTTTTGAGAAACTAAGGAAGGTCCCAGCTAATATTAAAAGGTTGCATGATTGGTACATGCGGGCATCTTCAGTTGGCATCGACATCATT ((((...((((((((.(((((((((((......(((((......))))).....(((.....)))......(((((..((.....))..))))).......(((((((((((...((....((((....)))).......))...))))(((((..........))))).......))))))))))))).)))))....)).)))))))))).. 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Zma-miRN4227 4692970 4692990 TCATTCCTAGCTTCATCCGTC Zma-miRN4227* 4692992 4693012 CTAATGAAACTAGGATAGAAC 3 Zma-MIRN4228 PmiREN024127 MIRN4228 Zea mays Zma-5 3991366 3991514 + GTACTGTTAATTAATTTTGTTTCATCAATCGTGCCTAGACCTGCTAGATAGCGTTCATTATTTAACTGATAGGTTAATCAATTTTTATAGCCTCCTTCACCAATTATTTATTAGGTTTGTTGATAAAATTATTTTTTATATTAATAGGG ...(((((((((((....((((.(((((.((.(((((....((((....)))).............(((.((((((...........))))))...)))............))))).))))))).))))......))).)))))))).. 3991386 3991494 TTCATCAATCGTGCCTAGACCTGCTAGATAGCGTTCATTATTTAACTGATAGGTTAATCAATTTTTATAGCCTCCTTCACCAATTATTTATTAGGTTTGTTGATAAAAT ((.(((((.((.(((((....((((....)))).............(((.((((((...........))))))...)))............))))).))))))).)).. 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Zma-miRN4243 224428832 224428853 TCTCATGGACCTCGCGGACGAA Zma-miRN4243* 224428804 224428824 TGTCATGCCAGGTGGTGAGGC 3 Zma-MIRN4244a PmiREN024230 MIRN4244 Zea mays Zma-1 26352486 26352629 - TCGGGGCGTTACAAACACCCCCGCTCGTGGATCTGCTCAGAACAAGACTCCTCAGAACTAGAGCAGAGGAAGGGTCAATCACGTCACTGTGGAATCAGTGCCTGAGGATGTCGACGTAGTGTATGGTATGTTCCTTGTTAACTC ................(((..(((((((.(((.(.(((((.....((((((((.(........).)))))...)))......(.(((((......))))))))))).).))).))).))))...)))................. 26352506 26352609 CCGCTCGTGGATCTGCTCAGAACAAGACTCCTCAGAACTAGAGCAGAGGAAGGGTCAATCACGTCACTGTGGAATCAGTGCCTGAGGATGTCGACGTAGTGTAT .(((((((.(((.(.(((((.....((((((((.(........).)))))...)))......(.(((((......))))))))))).).))).))).))))... Zma-miRN4244a 26352506 26352527 TGAGGATGTCGACGTAGTGTAT Zma-miRN4244a* 26352589 26352609 CCGCTCGTGGATCTGCTCAGA 3 Zma-MIRN4244b PmiREN024258 MIRN4244 Zea mays Zma-5 118674484 118674735 + GTTCACTGATCATTATACACTATTCAAGTATGTTCATCATACTGAATTTCCTGTTCAACACTTAGCAAACTCGTTAGACCTTTAAATGTGTTGTTATCCAAATCACCAAAACTCACAAAAGGATGTATGCACTTTCATGCACAGAACAAGACTCCGCAGAACCAGAGTAGAGGAAGAGTTAACCATGTGACAGCAGAATCAGTTCCTGAGGATGTCGACGTAGTGTATGGTATGTTTCTTATTAACTCCA ...........((((((((((((....((((.((((....(((((.(((.((((....(((......(((((......((((((...((((...(((((.....................)))))...)))).(((.(((..((.......))..))))))......))))))..)))))......))))))).))).)))))...)))).))).)...))))))))))))................... . 118674504 118674715 ACACTATTCAAGTATGTTCATCATACTGAATTTCCTGTTCAACACTTAGCAAACTCGTTAGACCTTTAAATGTGTTGTTATCCAAATCACCAAAACTCACAAAAGGATGTATGCACTTTCATGCACAGAACAAGACTCCGCAGAACCAGAGTAGAGGAAGAGTTAACCATGTGACAGCAGAATCAGTTCCTGAGGATGTCGACGTAGTGTAT (((((((....((((.((((....(((((.(((.((((....(((......(((((......((((((...((((...(((((.....................)))))...)))).(((.(((..((.......))..))))))......))))))..)))))......))))))).))).)))))...)))).))).)...))))))).. Zma-miRN4244b 118674694 118674715 TGAGGATGTCGACGTAGTGTAT Zma-miRN4244b* 118674504 118674524 ACACTATTCAAGTATGTTCAT 3 Zma-MIRN4245 PmiREN024245 MIRN4245 Zea mays Zma-4 232600913 232601031 + CGGAGATGGCCGGCCTGAGCCGCCTCGCATCCCCATCCCGCCGACGTGCGCGTCCCTTCGGGTGGGCGCGCCGTCGTCGGATGGGTGCTGCGCGGTGGTCGAGGCCCAGTCCGACGAGT ...........(((((..((((((.((((.((((((((.(.(((((.((((((((((...)).))))))))))))).)))))))).).)))).))))))..)))))............. 232600933 232601011 CGCCTCGCATCCCCATCCCGCCGACGTGCGCGTCCCTTCGGGTGGGCGCGCCGTCGTCGGATGGGTGCTGCGCGGTGGT ((((.((((.((((((((.(.(((((.((((((((((...)).))))))))))))).)))))))).).)))).)))).. Zma-miRN4245 232600990 232601011 CGGATGGGTGCTGCGCGGTGGT Zma-miRN4245* 232600933 232600953 CGCCTCGCATCCCCATCCCGC 3 Zma-MIRN4246 PmiREN024246 MIRN4246 Zea mays Zma-4 136397498 136397676 - TGAGTTGGAGTAAGCAGGTCCTGATGGCTTCAGCTGGGGACAGTTGTTCTTGAAGTGACTGGGATCTCCGCAGTGCCAACACACATTCGCTGGTGGTTGGTTGCTTGCAACTGAGGGGACATGAAAGGAGCTCTGACTCTACTGACTGAACCGTGACGGGGTGGGTCCAGCTGGTCTAC ...................(((.((((.(((((((((((.(((..((((((...(((.......(((((.((((((((((.(((........)))))))))........)))).))))))))...)))))).))).)))))..).))))))))).).)).(((((.((....))))))) 136397518 136397656 CTGATGGCTTCAGCTGGGGACAGTTGTTCTTGAAGTGACTGGGATCTCCGCAGTGCCAACACACATTCGCTGGTGGTTGGTTGCTTGCAACTGAGGGGACATGAAAGGAGCTCTGACTCTACTGACTGAACCGTGACGG ((.((((.(((((((((((.(((..((((((...(((.......(((((.((((((((((.(((........)))))))))........)))).))))))))...)))))).))).)))))..).))))))))).).). Zma-miRN4246 136397518 136397539 TCTACTGACTGAACCGTGACGG Zma-miRN4246* 136397636 136397656 CTGATGGCTTCAGCTGGGGAC 3 Zma-MIRN4247 PmiREN024247 MIRN4247 Zea mays Zma-5 166558337 166558487 + AGACACAAGGCATGTCATAGACGGAGTGGTAGTGGAGGGTATGCGCGAGGGTGAGGTCCACGGTTCGATTACTAACAACCGCGTAGCGCGCGAATTTTGCGCGAAAAATACCGCGACTTGCGACTTCGACGGACGGGTGGGGTGGTCCTAA .........((.((((.....((((((.(((((.(..((((((((((((((((.(.(.(.(((((.(........)))))).).).).)))...)))))))).....))))).).)).))).))))))...)))).))............. 166558357 166558467 ACGGAGTGGTAGTGGAGGGTATGCGCGAGGGTGAGGTCCACGGTTCGATTACTAACAACCGCGTAGCGCGCGAATTTTGCGCGAAAAATACCGCGACTTGCGACTTCGACG .((((((.(((((.(..((((((((((((((((.(.(.(.(((((.(........)))))).).).).)))...)))))))).....))))).).)).))).))))))... Zma-miRN4247 166558357 166558378 ACGGAGTGGTAGTGGAGGGTAT Zma-miRN4247* 166558447 166558467 CCGCGACTTGCGACTTCGACG 3 Zma-MIRN4248 PmiREN024255 MIRN4248 Zea mays Zma-2 137608074 137608176 - CTGGTACAAAAGCTTTGACATTAGTACTGATTGGAACCACCAACCGGTACTAAATCTCATGGTAGTTAAAATCGGTGCTGAAACGATTAGGATGGTTTCCTTC ....................((((((((((((..(((.((((...(((.....)))...)))).)))..))))))))))))...................... 137608094 137608156 TTAGTACTGATTGGAACCACCAACCGGTACTAAATCTCATGGTAGTTAAAATCGGTGCTGAAA ((((((((((((..(((.((((...(((.....)))...)))).)))..)))))))))))).. Zma-miRN4248 137608136 137608156 TTAGTACTGATTGGAACCACC Zma-miRN4248* 137608094 137608114 TAGTTAAAATCGGTGCTGAAA 3 Zma-MIRN4249 PmiREN024257 MIRN4249 Zea mays Zma-4 2991132 2991277 - AGCAACCATTAGGTATGAGAGGTACCAGGAGCTACCAATGGAGTATGAGGTTCACAATGCCAAAAAGCATCAAGGTGCTCTTGAACTTTGTACAACACTCAAAGTTCCATATGGTCTGGTGACTTCCTGCTGTCTTCCAAGCATCT (((((((....)))....((((((((((.....((((((((((..(((((((.((((.....((.(((((....))))).)).....))))..))).))))...)))))).))))))))).))))).))))............... 2991152 2991257 GGTACCAGGAGCTACCAATGGAGTATGAGGTTCACAATGCCAAAAAGCATCAAGGTGCTCTTGAACTTTGTACAACACTCAAAGTTCCATATGGTCTGGTGACTTC ((((((((.....((((((((((..(((((((.((((.....((.(((((....))))).)).....))))..))).))))...)))))).))))))))).))).. Zma-miRN4249 2991152 2991172 TCCATATGGTCTGGTGACTTC Zma-miRN4249* 2991237 2991257 GGTACCAGGAGCTACCAATGG 3 Zma-MIRN4250 PmiREN024263 MIRN4250 Zea mays Zma-9 11581135 11581290 + ACTAGAAGGGATCGAGCATGGCGGAAGCGGACCGGGTGTCCTTTAGTTACCGCCGTTGTAGGAGAAGATTGGACACAAGCAACAACATGCATCCAGTGAAGCACAACTGAGCAGACCCGTCTCCGTTTTCTTGCTCTGCTCCTCCGTATCTCTCAC ......(.(((..(((((.((((((((((((.(((((((((...((((..(.((......)).)..))))))))....(((......)))...((((........)))).....)))))..)))))))))..))).))))).))).)......... 11581155 11581270 GCGGAAGCGGACCGGGTGTCCTTTAGTTACCGCCGTTGTAGGAGAAGATTGGACACAAGCAACAACATGCATCCAGTGAAGCACAACTGAGCAGACCCGTCTCCGTTTTCTTGCTC (((((((((((.(((((((((...((((..(.((......)).)..))))))))....(((......)))...((((........)))).....)))))..)))))))))..)).. Zma-miRN4250 11581250 11581270 CCCGTCTCCGTTTTCTTGCTC Zma-miRN4250* 11581155 11581175 GCGGAAGCGGACCGGGTGTCC 3 Zma-MIRN4251 PmiREN024268 MIRN4251 Zea mays Zma-3 187100950 187101162 - CTGGCTGTGGGGAGAAGCTGATGGTTAGAATCTGGGTGTTTGGTTCGGCTGCTGTGGAGAGAAGCTGGTGGGTAGAATCTGGGTGTTTGGATACGCAGATTATGAGATTGTAGATTCTGATTGAAAAAAGAAAACAGATAAATACAGACAACCAACTAGTGCTTTACGGGACTAATCAGATTATTAAATATCAGTGTCTGGAGTCTATATGCT ..((((((((..(((.(((((((.(((((((((((..((((.((((.((....)).))(((..((((((.(((..((((((.((((....)))).)))))).......((((...((((.((.........)).))))....))))....))).)))))).))).)).))))...))))))).)))).))))))).))).....))))).))) 187100970 187101142 ATGGTTAGAATCTGGGTGTTTGGTTCGGCTGCTGTGGAGAGAAGCTGGTGGGTAGAATCTGGGTGTTTGGATACGCAGATTATGAGATTGTAGATTCTGATTGAAAAAAGAAAACAGATAAATACAGACAACCAACTAGTGCTTTACGGGACTAATCAGATTATTAAATATCA (((.(((((((((((..((((.((((.((....)).))(((..((((((.(((..((((((.((((....)))).)))))).......((((...((((.((.........)).))))....))))....))).)))))).))).)).))))...))))))).)))).))).. Zma-miRN4251 187101123 187101142 ATGGTTAGAATCTGGGTGTT Zma-miRN4251* 187100970 187100990 TAATCAGATTATTAAATATCA 3 Zma-MIRN4252 PmiREN024271 MIRN4252 Zea mays Zma-4 13883324 13883420 - ACTGGATCATCTGTGGTAGGGGGCGGATTGTCCGCGGCCACGTAGAGAGCCCTTGGTTGGACTTGGATCTCGCCCCCAAAGGGACCTCACTAGGAAA ..................((((((((((((((((..((((.((.....))...)))))))))...)))).))))))).................... 13883344 13883400 GGGCGGATTGTCCGCGGCCACGTAGAGAGCCCTTGGTTGGACTTGGATCTCGCCCCC ((((((((((((((..((((.((.....))...)))))))))...)))).))))).. Zma-miRN4252 13883344 13883364 TTGGACTTGGATCTCGCCCCC Zma-miRN4252* 13883380 13883400 GGGCGGATTGTCCGCGGCCAC 3 Zma-MIRN4424a PmiREN023507 MIRN4424 Zea mays Zma-1 285805102 285805185 - GCGTGGAGAACAGATTAGAGTTCCGAGTTTTTTTGCTGTGTTTGTTGGCTAGATTCTCGGAATTAGCTCGGGGAGTTTGTTTGT ....................(((((((..(((..((((.......)))).)))..)))))))...................... 285805122 285805165 TTCCGAGTTTTTTTGCTGTGTTTGTTGGCTAGATTCTCGGAATT (((((((..(((..((((.......)))).)))..))))))).. Zma-miRN4424a 285805145 285805165 TTCCGAGTTTTTTTGCTGTGT Zma-miRN4424a* 285805122 285805142 GTTGGCTAGATTCTCGGAATT 3 Zma-MIRN4424b PmiREN023510 MIRN4424 Zea mays Zma-3 6491743 6491826 - GCGTGGAGAACAGATTAGAGTTCCGAGTTTTTTTGCTGTGTTTGTTGGCTAGATTCTCGGAATTAGCTCGGGGAGTTTGTTTGT ....................(((((((..(((..((((.......)))).)))..)))))))...................... 6491763 6491806 TTCCGAGTTTTTTTGCTGTGTTTGTTGGCTAGATTCTCGGAATT (((((((..(((..((((.......)))).)))..))))))).. Zma-miRN4424b 6491786 6491806 TTCCGAGTTTTTTTGCTGTGT Zma-miRN4424b* 6491763 6491783 GTTGGCTAGATTCTCGGAATT 3