miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Spi-MIR156a PmiREN019697 MIR156 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01073876.1 2010 2142 - AAAAGGGTAATAAATGGTGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGTTTTCTTGCATGATGTTTATATATATATGCTTGAAACTATGTGTGCTTACTCTCTATCTGTCACCCCCACCACACAAACTCTCTA ...(((((......(((((((((((((((((((((((((((((((((...(((..(((((((((....)))).)))))..))))))))))))))))))))))).)))))))))...)))).....)))))... 2030 2122 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGTTTTCTTGCATGATGTTTATATATATATGCTTGAAACTATGTGTGCTTACTCTCTATCTGTCACC (((((((((((((((((((((((((((...(((..(((((((((....)))).)))))..))))))))))))))))))))))).))))))).. Spi-miR156a 2103 2122 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Spi-miR156a* 2030 2050 GCTTACTCTCTATCTGTCACC 3 Spi-MIR156b PmiREN019698 MIR156 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01212593.1 3255 3381 - CAAGGTAAATTAAGGATGGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTTCTTTCATGGATTATTCCCCATGTTTAAAAGCTCTGCGTGCTCACGCTCTATCTGTCACACACCAAAACTCTTTTATCTT .((((((((...((..(((((((((((((((.((((((((.((.((((....(((((........)))))......)))).)).)))))))).)))).))))))))...)))...))..)))))))) 3275 3361 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTTCTTTCATGGATTATTCCCCATGTTTAAAAGCTCTGCGTGCTCACGCTCTATCTGTCACA (((((((((((.((((((((.((.((((....(((((........)))))......)))).)).)))))))).)))).))))))).. Spi-miR156b 3342 3361 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Spi-miR156b* 3275 3295 GCTCACGCTCTATCTGTCACA 3 Spi-MIR156c PmiREN019699 MIR156 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01289389.1 14272 14400 + AGGTAAAATAAAAGGGGCGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGTTTTCTAGCATGATGTTTTACATGCTTGAAACTATGTGTGCTCACTGCTCTATCTGTCACCCCCCATCGCTTTCTATATCT ((((((((.....((((.(((((((((((((((((((((((((((((...(((.((((((........)))))).))))))))))))))))))).)))).))))))))))))).....)))...))))) 14292 14380 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGTTTTCTAGCATGATGTTTTACATGCTTGAAACTATGTGTGCTCACTGCTCTATCTGTCACC (((((((((((((((((((((((((((...(((.((((((........)))))).))))))))))))))))))).)))).))))))).. Spi-miR156c 14292 14311 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Spi-miR156c* 14360 14380 CTCACTGCTCTATCTGTCACC 3 Spi-MIR156d PmiREN019700 MIR156 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01293726.1 4001 4236 - ATATGCTTGAAATTATGCTTGCTCACTGCTCTATCTGTCACCCCACCACTTTCTCTATGTCTCTTTAGATCTCTTTATGTTTGATCATATTAATTGGATTAGTTCATGAGCTTATCTAGGCCTTTGACTTCGCTTGTTTCTATTTTTGTGTCAAGCATACAAGTCTAACTGAGTGGGATGTAAAACAAAAGGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGATGTTTTCTCGCATG .(((((..(((((((((..((((((((.((((.(((((((((...((.((((...(((((((((((((....((((((((((((.((((..(((.(((..((((((...((((....))))...)))....)))....))))))..))))))))))))).))).....))))).)))))))).....)))))).)))))))))))))))))))))..))))))...)))..))))) 4021 4216 GCTCACTGCTCTATCTGTCACCCCACCACTTTCTCTATGTCTCTTTAGATCTCTTTATGTTTGATCATATTAATTGGATTAGTTCATGAGCTTATCTAGGCCTTTGACTTCGCTTGTTTCTATTTTTGTGTCAAGCATACAAGTCTAACTGAGTGGGATGTAAAACAAAAGGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCAC (((((((.((((.(((((((((...((.((((...(((((((((((((....((((((((((((.((((..(((.(((..((((((...((((....))))...)))....)))....))))))..))))))))))))).))).....))))).)))))))).....)))))).)))))))))))))))))))).. Spi-miR156d 4021 4040 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Spi-miR156d* 4196 4216 GCTCACTGCTCTATCTGTCAC 3 Spi-MIR156e PmiREN019701 MIR156 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01026228.1 1620 1769 + CAATGGCCATGGAAGAGAGGGACTGACAGAAGAGAGTGAGCATACACATATAATTATATAAACATGTTTACATAATTCTTTTGATATATATATATATAATTTTGCGTGTGCTCACTTCTCTTTCTGTCAATCTCTCTTAGAAGAATCAAT ..............((((((((.((((((((((((((((((((((.((...(((((((((...((((.((((.........)).)).)))).))))))))).)).)))))))))).)))).)))))))).))))))))...(.......) 1640 1749 CTGACAGAAGAGAGTGAGCATACACATATAATTATATAAACATGTTTACATAATTCTTTTGATATATATATATATAATTTTGCGTGTGCTCACTTCTCTTTCTGTCAATC .((((((((((((((((((((((.((...(((((((((...((((.((((.........)).)).)))).))))))))).)).)))))))))).)))).)))))))).)) Spi-miR156e 1640 1659 CTGACAGAAGAGAGTGAGCA Spi-miR156e* 1729 1749 TCACTTCTCTTTCTGTCAATC 3 Spi-MIR157a PmiREN019702 MIR157 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01025525.1 837 978 + GGAAGAAAGAGTGATTATTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACTAATGATGATATGCTAATTTCATTCAATTTGGGCAGCAAAAGCATCTCAATTCATTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCACCTTCACCTCTTTCATAAAA ....((((((((((....((.((((((((((((((((((((.((((((((.(((((............((((.....))))))))).)))..))))).))))))))))).))))))))).))...))).)))))))...... 857 958 TTGACAGAAGATAGAGAGCACTAATGATGATATGCTAATTTCATTCAATTTGGGCAGCAAAAGCATCTCAATTCATTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCA .((((((((((((((((((((.((((((((.(((((............((((.....))))))))).)))..))))).))))))))))).)))))))))... Spi-miR157a 857 877 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Spi-miR157a* 938 958 CTCTCTATGCTTCTGTCATCA 3 Spi-MIR157b PmiREN019703 MIR157 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01031432.1 56 213 - AAATGGAATGGGTGATATTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACATATGATGGAATGCTGCTGCTGCTGCTAAATCTGGAGAGTCTTAACAATAAAAAAAAGCATTTCACTTCATTTGTGCTCTCTATGCTTCCGTCATCCCTTTCATCCTCTTCTCCTTC .....(((.((((((......((((.((((((((((((((((.(((((((((((((...(((.((.(.......).)))))................)))))))))..)))).)))))))))))).)))).))))......))))))........))) 76 193 TTGACAGAAGATAGAGAGCACATATGATGGAATGCTGCTGCTGCTGCTAAATCTGGAGAGTCTTAACAATAAAAAAAAGCATTTCACTTCATTTGTGCTCTCTATGCTTCCGTCATCC .((((.((((((((((((((((.(((((((((((((...(((.((.(.......).)))))................)))))))))..)))).)))))))))))).)))).))))... Spi-miR157b 173 193 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Spi-miR157b* 76 96 CTCTCTATGCTTCCGTCATCC 3 Spi-MIR157c PmiREN019704 MIR157 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01106276.1 4369 4506 - TTTGCTTAGAAATCCGGGAATTGACAGAAGATAGAGAGCATGCTTAACCCACATCTTGTTTATGTTGCTTCAGAAAGTAGGTTATTTGGCTGCCATTGATGCTGATGCTTCTTCAGCCCAAATTTTCTCCATGAGAGT .......(((((...(((..((((.(((((.((...(((((((((((((.((.(((.((.......))...)))..)).)))))...)))........)))))..))))))))))))))....))))).......... 4389 4486 TTGACAGAAGATAGAGAGCATGCTTAACCCACATCTTGTTTATGTTGCTTCAGAAAGTAGGTTATTTGGCTGCCATTGATGCTGATGCTTCTTCAGCC ((((.(((((.((...(((((((((((((.((.(((.((.......))...)))..)).)))))...)))........)))))..))))))))))).. Spi-miR157c 4467 4486 TTGACAGAAGATAGAGAGCA Spi-miR157c* 4389 4409 GATGCTGATGCTTCTTCAGCC 3 Spi-MIR157d PmiREN019705 MIR157 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01253610.1 1848 1973 - AAGTATTGGGTGAGATATTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACGAATAATGAGGTGCTAATTGGAAGCTGCACCTTAATTCTTTGTGCTCTCTATTCTTCTGTCATCATCTTCAGTCCCTCCCCGACC .....(((((.(((..((((.(((((((((((((((((((((((.((((((((((............))))))).))).))))))))))))).)))))))))).......))))..)))))))).. 1868 1953 TTGACAGAAGATAGAGAGCACGAATAATGAGGTGCTAATTGGAAGCTGCACCTTAATTCTTTGTGCTCTCTATTCTTCTGTCATCA .(((((((((((((((((((((((.((((((((((............))))))).))).))))))))))))).))))))))))... 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Spi-miR157e 4144 4164 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Spi-miR157e* 4210 4230 CTCTTTATTCTTCTGTCATCA 3 Spi-MIR159 PmiREN019707 MIR159 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01059629.1 6421 6636 - TTTTATGTGTTATGGGAGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAACAGAAGATCTAACAGGTTAGATTGAGCTGCTGACCTATGGATTCCTCAGCCCTATCTATTTATGATTTCAAACATATAGATAGGTTTGTGGGTTTGCATATGTCAGGAGCTTTATTTTACCCTTTGTTTGATCATTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATTCATTTCTTCTTACTAG ...........(((((.((((((((((((..(((((((.(((.((((.(((((((.((((.(((((.(((((.((((.(..((((((.((((((((..((((........)))))))))))).))).)))..).)))).))))).))))).)))).)))...)))).)))).))).)))))))..)))))))))))).)))))............. 6441 6616 GAGCTCCTTGAAGTCCAACAGAAGATCTAACAGGTTAGATTGAGCTGCTGACCTATGGATTCCTCAGCCCTATCTATTTATGATTTCAAACATATAGATAGGTTTGTGGGTTTGCATATGTCAGGAGCTTTATTTTACCCTTTGTTTGATCATTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA (((((((((..(((((((.(((.((((.(((((((.((((.(((((.(((((.((((.(..((((((.((((((((..((((........)))))))))))).))).)))..).)))).))))).))))).)))).)))...)))).)))).))).)))))))..))))))))).. Spi-miR159 6441 6461 TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA Spi-miR159* 6596 6616 GAGCTCCTTGAAGTCCAACAG 3 Spi-MIR160 PmiREN019708 MIR160 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01016753.1 80 204 + ACAAGTCGTGTACACGTATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCAAAGCTCACCGTAATATATCGATGGGCCTTGTTGAATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATATTCCGATATCGTGTATATGA .....(((((((((((.((((((.(((((((.((((((((((((((((.(((((.((........)).))))).))).))))))))))))).))))))).))))))........))))))))))) 100 184 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCAAAGCTCACCGTAATATATCGATGGGCCTTGTTGAATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATA (((.(((((((.((((((((((((((((.(((((.((........)).))))).))).))))))))))))).))))))).))).. 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Spi-miR162b 738 758 TCGATAAACCTCTGCATCCAG Spi-miR162b* 798 818 GGAGGCAGCGGTTCATCGATC 3 Spi-MIR164a PmiREN019711 MIR164 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01009818.1 166 299 + AATGGGTGGGTAACTCATGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAATTCTTGTATTCGACAATATATGCATTTCTAATGGTAATGCATGAATTTTGCACGTGTTCTCCTTCTCCAACCCGAATTTCCTACCTCCTCT ...(((((((.((.((..((((((((((.(((((((((((((((((((((.....))))...(((((((((....)).)))))))))).)))))))))))))).))))))))))..)).)).)))))))..... 186 279 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAATTCTTGTATTCGACAATATATGCATTTCTAATGGTAATGCATGAATTTTGCACGTGTTCTCCTTCTCCAAC ((((((((.(((((((((((((((((((((.....))))...(((((((((....)).)))))))))).)))))))))))))).)))))))).. Spi-miR164a 186 206 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Spi-miR164a* 259 279 CACGTGTTCTCCTTCTCCAAC 3 Spi-MIR164b PmiREN019712 MIR164 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01039887.1 1745 1834 + AAGGTGAGTTTTGGGCAAGATGGAGAAGCAGGGTACGTGCTTTACTAACTCATGTATTATAGTCTCTAAGATTAGTTAAAGTCGCGTGTA .(.((((.(((.........((((((.....((((((((...........))))))))....)))))).........))).)))).)... 1765 1814 TGGAGAAGCAGGGTACGTGCTTTACTAACTCATGTATTATAGTCTCTAAG ((((((.....((((((((...........))))))))....)))))).. Spi-miR164b 1765 1785 TGGAGAAGCAGGGTACGTGCT Spi-miR164b* 1794 1814 TCATGTATTATAGTCTCTAAG 3 Spi-MIR164c PmiREN019713 MIR164 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01081391.1 751 952 + TCTAGGTGAGTGACGATCGAGATGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTAACTCATACGCAAGATTTATCGATGTTTCGAAAATTCTGCTATCATAGTACTGTATTTTACAGCAAATAGTGTTTGTACTTTACATGTATGTGATAAAATGATGAGTTAGTTATTCATGTGCCTGTTTTCCCCATCATGACCACTCAACCTTAT ...(((((((((..(.(((.(((((.((((..(((((((((.((.((((((((((..(((.(((((.((((....))))))))).)))(((((((.(((((((...(((((((.....)).)))))...)))).)))))))))).....)))))))))).)).)))))))))..)))).))))).))))))))).))))... 771 932 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTAACTCATACGCAAGATTTATCGATGTTTCGAAAATTCTGCTATCATAGTACTGTATTTTACAGCAAATAGTGTTTGTACTTTACATGTATGTGATAAAATGATGAGTTAGTTATTCATGTGCCTGTTTTCCCCATC (((.((((..(((((((((.((.((((((((((..(((.(((((.((((....))))))))).)))(((((((.(((((((...(((((((.....)).)))))...)))).)))))))))).....)))))))))).)).)))))))))..)))).))))) 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Spi-miR166a 9128 9148 TCGGACCAGGCTTCATTCCTC Spi-miR166a* 9252 9272 GGGATGTTGTCTGGCTCGACA 3 Spi-MIR166b PmiREN019715 MIR166 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01000895.1 2268 2442 - AGTAGCTTCCAGATTTGAGGGGAATGTTGTTTGGCTCGAAGTCATTATCTCATTATAGATCGAACCAATCCAATTTTATATATTCAATCTAGTTTAAAATATATGTAAATTACGATGATGATGAGATAGTGTCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTTGGAAACAAAAATT ......(((((((((.(.((((((((..((((((.((((((.((((((((((((((..((((............(((((((((.................)))))))))...)))).)))))))))))))).)))))).))))))..))))))))).)))))))))......... 2288 2422 GGAATGTTGTTTGGCTCGAAGTCATTATCTCATTATAGATCGAACCAATCCAATTTTATATATTCAATCTAGTTTAAAATATATGTAAATTACGATGATGATGAGATAGTGTCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..((((((.((((((.((((((((((((((..((((............(((((((((.................)))))))))...)))).)))))))))))))).)))))).))))))..)))))).. Spi-miR166b 2288 2308 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Spi-miR166b* 2402 2422 GGAATGTTGTTTGGCTCGAAG 3 Spi-MIR166c PmiREN019716 MIR166 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01003038.1 3518 3652 - AAGAAAACATTTGTTGAGGGGAATGTTGTTTGGTTCGAAATCATTCAAACAAATTAAAATTCATGCATCTCGATGATCGATGAATTGAATAATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACTCAAGTTTTTGTTTTA ..((((((....((((.((((((((..((((((((((((((.(((((...........((((((..(((.....)))..))))))))))).))))))))))))))..)))))))).))))....))))))...... 3538 3633 GGAATGTTGTTTGGTTCGAAATCATTCAAACAAATTAAAATTCATGCATCTCGATGATCGATGAATTGAATAATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..((((((((((((((.(((((...........((((((..(((.....)))..))))))))))).))))))))))))))..)))))).. 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Spi-miR166e 1299 1319 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Spi-miR166e* 1492 1512 AGAATGTTGTCTGGTTCGAAA 3 Spi-MIR166f PmiREN019719 MIR166 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01036396.1 5003 5112 - TAAACAAGATCATGTTAAGGAGAATGTTGTCTGGTTCGTGACCATATATCTTTCTTCACATAAATGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAACTCATCAAGGTTATGT ..(((..(((...(((.(((.(((((..((((((((((.((.(((.(((..........))).))).)).))))))))))..))))).))).)))..)))...))).... 5023 5092 AGAATGTTGTCTGGTTCGTGACCATATATCTTTCTTCACATAAATGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC .(((((..((((((((((.((.(((.(((..........))).))).)).))))))))))..)))))... 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Spi-miR166i 345 365 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Spi-miR166i* 194 214 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG 3 Spi-MIR166j PmiREN019723 MIR166 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01045601.1 4057 4181 - TTTTTTGTTTAATTTTGAGGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGCCACCAACTTCATCTAATGTGAGCAAACTCTTTGTTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAAAATCTCGCTTCCTCTT ...........(((((((((((((((..((((((.((((.(.(((.((((((((.....)))))..........))).))).).)))).))))))..)))))))))))))))............. 4077 4161 GGAATGTTGTTTGGCTCGAGGCCACCAACTTCATCTAATGTGAGCAAACTCTTTGTTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..((((((.((((.(.(((.((((((((.....)))))..........))).))).).)))).))))))..)))))).. Spi-miR166j 4077 4097 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Spi-miR166j* 4141 4161 GGAATGTTGTTTGGCTCGAGG 3 Spi-MIR167a PmiREN019724 MIR167 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01010155.1 2112 2225 - GATCGTGAACCACTAGCAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTTTCTATTGCTCCGTACGAGGAAAGATCAGATCATGTGGCAGCATCACCTGTTGATGGTTTCGCGGAAT ...(((((((((.((((((.(((.(((((((.((((((((...(((((((..(((...)))..)))))))...))))))))))))))).))).)))))).))).)))))).... 2132 2205 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTTTCTATTGCTCCGTACGAGGAAAGATCAGATCATGTGGCAGCATCACC (((.(((((((.((((((((...(((((((..(((...)))..)))))))...))))))))))))))).))).. Spi-miR167a 2185 2205 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Spi-miR167a* 2132 2152 AGATCATGTGGCAGCATCACC 3 Spi-MIR167b PmiREN019725 MIR167 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01027275.1 3150 3264 + ATATTGATAGCGTAGACTACTATCAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTACCTATAAATTTATATTAAGGCAAGATCAGATCATGTGGTTGCTTCACCTGTTAGTTCGTAC ..............(((.((((.(((.((((((.((((.((((((((...(((.(((..............))).)))...)))))))))))).)))))).))).))))..)).) 3170 3244 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTACCTATAAATTTATATTAAGGCAAGATCAGATCATGTGGTTGCTTCACC ((((((.((((.((((((((...(((.(((..............))).)))...)))))))))))).)))))).) Spi-miR167b 3170 3190 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Spi-miR167b* 3224 3244 AGATCATGTGGTTGCTTCACC 3 Spi-MIR167c PmiREN019726 MIR167 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01035930.1 1752 1874 + AAAGGGTCTAGAGTGGAACAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTGGCCATTTATAAAGAAAATGGGTGACTAAGGTTAGGTCATGCTCGGACAGCCTCACTCCTTCCTTTCTTGATAAC .....(((.((((.((((..(((((.(((((((((((((((((..(((((.(((((((.......))))))).)))))..))))))))))).)).)))).)))))..)))).)))).)))... 1772 1854 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTGGCCATTTATAAAGAAAATGGGTGACTAAGGTTAGGTCATGCTCGGACAGCCTCACT (((.(((((((((((((((((..(((((.(((((((.......))))))).)))))..))))))))))).)).)))).))))) Spi-miR167c 1772 1792 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Spi-miR167c* 1834 1854 TCATGCTCGGACAGCCTCACT 3 Spi-MIR167d PmiREN019727 MIR167 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01043303.1 5803 5923 - CATCGTGCGGCACTAGCAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTTCCTTTTAGTTCAAATATAATACGAGGAAAGATCAGATCATGTGGCAGCCTCACCTGTCAATGCCATCATGAATT ..(((((.((((...((((.(((.(((((((.((((((((...((((((((.((............)).))))))))...))))))))))))))).))).))))...))))..)))))... 5823 5903 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTTCCTTTTAGTTCAAATATAATACGAGGAAAGATCAGATCATGTGGCAGCCTCACC (((.(((((((.((((((((...((((((((.((............)).))))))))...))))))))))))))).))).. Spi-miR167d 5883 5903 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Spi-miR167d* 5823 5843 AGATCATGTGGCAGCCTCACC 3 Spi-MIR169a PmiREN019728 MIR169 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01147412.1 1503 1648 - AAGAGTTTCTATTTGTTTAGTAGCCAAGGATGACTTGCCTTTCATCAATGCCTTTTGTAAAATGGAAATTGATTACAACACTTTCTATGGTATTGGGAAAATGAGTGGCAAGCATCTTTGGCGACTTGACAAACTCTTCTTTGTCA (((((((......((((.(((.((((((((((.((((((.((((((((((((.........(((((((.((.......)).)))))))))))))).....))))).)))))))))))))))).))).)))))))))))........ 1523 1628 TAGCCAAGGATGACTTGCCTTTCATCAATGCCTTTTGTAAAATGGAAATTGATTACAACACTTTCTATGGTATTGGGAAAATGAGTGGCAAGCATCTTTGGCGACT (.((((((((((.((((((.((((((((((((.........(((((((.((.......)).)))))))))))))).....))))).)))))))))))))))).).. Spi-miR169a 1608 1628 TAGCCAAGGATGACTTGCCTT Spi-miR169a* 1523 1543 TGGCAAGCATCTTTGGCGACT 3 Spi-MIR169b PmiREN019729 MIR169 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01073066.1 4461 4605 - ATTATTGTTTAGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCTCCAATATTACTTATAAGGTTTTTAATTATATCATTATTAATATAATGGTGACCTTTTATTGGTTGGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCTACCTTGACATGCTCTCCTCTTTCAT .....((((..(((((((((((.((((.(((((..(((((......((.((((((....(((((((........)))))))...)))))).))...)))))...))))))))))))))))))))...))))................ .-50. 4481 4593 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCTCCAATATTACTTATAAGGTTTTTAATTATATCATTATTAATATAATGGTGACCTTTTATTGGTTGGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCTACC ((((((((((.((((.(((((..(((((......((.((((((....(((((((........)))))))...)))))).))...)))))...))))))))))))))))))).. Spi-miR169b 4574 4593 TAGCCAAGGATGACTTGCCT Spi-miR169b* 4481 4501 CAGGCAGTCTCCTTGGCTACC 3 Spi-MIR169c PmiREN019730 MIR169 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01008947.1 571 738 + GAAGATAAAGTGCCTGCTCTGATAGCCAAGGATGACTTGCCTAAAATCATTTTTATGAAGGGTCTTAACTAATTAAACTTTAGTTACTAAAATTAAAGTTTATATTATATGATCTTAAAATTGGGATTTTAGGCGTTGTCTGAGGCTAATTGAGAGACACTTATCTTT ((((((((.(((.((.(((...(((((..(((((((..((((((((((..(((((....(((((.((..((((((((((((((((.....)))))))))))).)))))).))))))))))....)))))))))))))))))..)))))...))))).))))))))))) 591 718 TAGCCAAGGATGACTTGCCTAAAATCATTTTTATGAAGGGTCTTAACTAATTAAACTTTAGTTACTAAAATTAAAGTTTATATTATATGATCTTAAAATTGGGATTTTAGGCGTTGTCTGAGGCTAAT (((((..(((((((..((((((((((..(((((....(((((.((..((((((((((((((((.....)))))))))))).)))))).))))))))))....)))))))))))))))))..))))).. Spi-miR169c 591 610 TAGCCAAGGATGACTTGCCT Spi-miR169c* 698 718 TAGGCGTTGTCTGAGGCTAAT 3 Spi-MIR169d PmiREN019731 MIR169 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01073066.1 3987 4107 - ATGAAAAGAGTCTTATTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCACCATTTCCGAAATGTGTCCTTTCGTTCATGGGGTCAGGCAGGTCATCTTTAGCTAACTTGACAAGCTCTTCTCTTTCA (.((.(((((.(((.((.((((((.(((((((((((((((((.((((...(((((.......)))))...)))).).)))))))))))))))).))).))).)).)))))))).))..).. 4007 4087 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCACCATTTCCGAAATGTGTCCTTTCGTTCATGGGGTCAGGCAGGTCATCTTTAGCTAACT ((((.(((((((((((((((((.((((...(((((.......)))))...)))).).)))))))))))))))).))).).. Spi-miR169d 4068 4087 TAGCCAAGGATGACTTGCCT Spi-miR169d* 4007 4027 GCAGGTCATCTTTAGCTAACT 3 Spi-MIR169e PmiREN019732 MIR169 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01085432.1 740 902 + TGAAGGGTAAGTGCCTATTTGATAGCCAAGGATGACTTGCCTGCATCATTAATTAATTCTTGAGGCTAGCTTGTGATATATATCATGTATATGACATGTATACAAGCATTCTTCTTTGATGGCCAGGCAGTCTCCTTTGGCTACTCGAATAGGTTCCTCTCAT ............(((((((((((((((((((..((((.((((((((((.............((((...(((((((.(((((.((((....)))).))))))))))))...))))..)))))..)))))))))..))))))))).))))))))))......... 760 882 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCATCATTAATTAATTCTTGAGGCTAGCTTGTGATATATATCATGTATATGACATGTATACAAGCATTCTTCTTTGATGGCCAGGCAGTCTCCTTTGGCTACT (((((((((..((((.((((((((((.............((((...(((((((.(((((.((((....)))).))))))))))))...))))..)))))..)))))))))..))))))))).) Spi-miR169e 760 779 TAGCCAAGGATGACTTGCCT Spi-miR169e* 862 882 AGGCAGTCTCCTTTGGCTACT 3 Spi-MIR169f PmiREN019733 MIR169 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01092568.1 2037 2169 - AGGGAAGAGCCTTTGTTTATTAGCCAAGGATGACTTGCCTACATAATACTACTAATTTCGAGCTGAAATACTACTTGTTTGGTTGACATGTTAGGCAGTCATCTATGGCTTTGTTGACAGACTCTTCTCCATC .((((((((..((((((....(((((.((((((((.((((((((......(((((...((((..(.....)..)))).)))))....))).))))))))))))).))))).....)))))))))))))).... 2057 2149 TAGCCAAGGATGACTTGCCTACATAATACTACTAATTTCGAGCTGAAATACTACTTGTTTGGTTGACATGTTAGGCAGTCATCTATGGCTTTG .(((((.((((((((.((((((((......(((((...((((..(.....)..)))).)))))....))).))))))))))))).)))))... Spi-miR169f 2130 2149 TAGCCAAGGATGACTTGCCT Spi-miR169f* 2057 2077 AGGCAGTCATCTATGGCTTTG 3 Spi-MIR169g PmiREN019734 MIR169 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01119624.1 18 151 - AAAGAAAAGCCTTTGTTAATTAGCCAAGGATGACTTGCCTAATGCACCTACTATTTTCCTCCATTTTTTTTATGGAGTACTTAATAGTATACTAGGCAGTCATCTTTAGCTATATTGACACATTTTTCTTTATC (((((((((....(((((((((((.((((((((((.(((((.((....(((((((...((((((.......)))))).....))))))))).))))))))))))))).)))).)))))))..)))))))))... 38 131 TAGCCAAGGATGACTTGCCTAATGCACCTACTATTTTCCTCCATTTTTTTTATGGAGTACTTAATAGTATACTAGGCAGTCATCTTTAGCTATA ((((.((((((((((.(((((.((....(((((((...((((((.......)))))).....))))))))).))))))))))))))).)))).. Spi-miR169g 112 131 TAGCCAAGGATGACTTGCCT Spi-miR169g* 38 58 AGGCAGTCATCTTTAGCTATA 3 Spi-MIR169h PmiREN019735 MIR169 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01136968.1 6410 6534 + AGAGGAGAGTCATATTGTTTAGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCTCCATAGTCTAAAATGTGTTTAATCACATTTTAATTTGGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCTATCTTGACATGCTCTTTTCTT (((((((((.((...((((.((((((((((((.((((.(((((..(((.(((.(((((((((......)))))))))))))))...))))))))))))))))))).)).))))))))))))))). 6430 6514 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCTCCATAGTCTAAAATGTGTTTAATCACATTTTAATTTGGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCTATC ((((((((((.((((.(((((..(((.(((.(((((((((......)))))))))))))))...))))))))))))))))))).) Spi-miR169h 6430 6449 TAGCCAAGGATGACTTGCCT Spi-miR169h* 6494 6514 CAGGCAGTCTCCTTGGCTATC 3 Spi-MIR169i PmiREN019736 MIR169 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01136968.1 6630 6760 + ATGAGAAGAGTCTTATTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCACCGTACTTGAAAAGGTCTTTCATATGTCCTTTCGTTTTTGGGGTCAAGCAGGTCATCTTTAGCTAACTTGACAAGCTCTTCTTTTTCA (.((((((((.(((.((.((((((.(((((((((((((.((.(((.((..(((((.((.(........).)))))))....)).))))).))))))))))))).))).))).)).)))))))))))..).. 6650 6740 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCACCGTACTTGAAAAGGTCTTTCATATGTCCTTTCGTTTTTGGGGTCAAGCAGGTCATCTTTAGCTAACT ((((.(((((((((((((.((.(((.((..(((((.((.(........).)))))))....)).))))).))))))))))))).))).).. Spi-miR169i 6650 6669 TAGCCAAGGATGACTTGCCT Spi-miR169i* 6720 6740 GCAGGTCATCTTTAGCTAACT 3 Spi-MIR169j PmiREN019737 MIR169 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01136968.1 3524 3662 - AAGTTGAGAGTATTGTTTAGTAGCCAAGGATGACTTGCCTACTTCATTTGATATATAGTTTAAAATAATAATATTGACAATATTTGTCATTTGGTCGTAGGCAAGTTATCCTGGCTATCTTGACATGCTCGTAATTTTT ((((((.((((((.(((.((((((((.(((((((((((((((.(((..(((((.(((......((((....)))).....))).)))))..)))..))))))))))))))))))))).)).))))))))).)))))).. 3544 3642 TAGCCAAGGATGACTTGCCTACTTCATTTGATATATAGTTTAAAATAATAATATTGACAATATTTGTCATTTGGTCGTAGGCAAGTTATCCTGGCTATC ((((((.(((((((((((((((.(((..(((((.(((......((((....)))).....))).)))))..)))..))))))))))))))))))))).. Spi-miR169j 3623 3642 TAGCCAAGGATGACTTGCCT Spi-miR169j* 3544 3564 AGGCAAGTTATCCTGGCTATC 3 Spi-MIR169k PmiREN019738 MIR169 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01182268.1 2110 2249 + TGAAGTGAAGAGTCTTTGTTTGTTAGCCAAGGATGACTTGCCTACATACCCCTCCTCCCACAAGGTTATTATTTCTTAATTTTCCTTGTGGGGTTGCTATGCTAGGCAGTTATCCTGGCTATCTTGACAGGCTGTTCTTC ......((((((..((((((...((((((.((((((((.(((((((((...(..(.(((((((((..((((.....))))...))))))))))..).)))).)))))))))))))))))))....))))))...)))))) 2130 2229 TAGCCAAGGATGACTTGCCTACATACCCCTCCTCCCACAAGGTTATTATTTCTTAATTTTCCTTGTGGGGTTGCTATGCTAGGCAGTTATCCTGGCTATC ((((((.((((((((.(((((((((...(..(.(((((((((..((((.....))))...))))))))))..).)))).))))))))))))))))))).. Spi-miR169k 2130 2149 TAGCCAAGGATGACTTGCCT Spi-miR169k* 2209 2229 TAGGCAGTTATCCTGGCTATC 3 Spi-MIR169l PmiREN019739 MIR169 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01191099.1 998 1134 - AAAGAAAAACCTTTGTTAATTAGCCAAGGATGACTTGCCTAATGTACCCACTATTTATTTTCCTCCTATTTTTTATGGAGTATTTAATAGTATACTAGGCAGTCGTCTTTAGCTATATTGACACATTTTTCTTTATC (((((((((....(((((((((((.((((((((((.(((((..(((...((((((.......((((..........)))).....)))))).)))))))))))))))))).)))).)))))))..)))))))))... 1018 1114 TAGCCAAGGATGACTTGCCTAATGTACCCACTATTTATTTTCCTCCTATTTTTTATGGAGTATTTAATAGTATACTAGGCAGTCGTCTTTAGCTATA ((((.((((((((((.(((((..(((...((((((.......((((..........)))).....)))))).)))))))))))))))))).)))).. Spi-miR169l 1095 1114 TAGCCAAGGATGACTTGCCT Spi-miR169l* 1018 1038 AGGCAGTCGTCTTTAGCTATA 3 Spi-MIR169m PmiREN019740 MIR169 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01279569.1 2916 3069 + GAAGGGGAAGTGCCTAATTTGATAGCCAAGGATGACTTGCCTGCATCATTAGTTCTTGAGGTTTGTGATATATATCATGTATATGACATGTATACAAGCATTCTTCTTTGATGGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTACTCTAATAGGTTCCTCTCAT ..(.((((.(.(((((....((((((((((((.((((.(((((..(((((((.....((((((((((.(((((.((((....)))).)))))))))))).)))....))))))).))))))))))))))))))).))...))))).).)))).) 2936 3049 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCATCATTAGTTCTTGAGGTTTGTGATATATATCATGTATATGACATGTATACAAGCATTCTTCTTTGATGGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTACT ((((((((((.((((.(((((..(((((((.....((((((((((.(((((.((((....)))).)))))))))))).)))....))))))).))))))))))))))))))).) Spi-miR169m 2936 2955 TAGCCAAGGATGACTTGCCT Spi-miR169m* 3029 3049 CAGGCAGTCTCCTTGGCTACT 3 Spi-MIR170 PmiREN019741 MIR170 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01203736.1 4211 4320 - CTATGAAATAGTAACTCTGATATTGGCCTGGTTCACTCAGACACATATTATTTTGATTGATTTTACTTTTGATTGAGCCGTGTCAATATCTCAGTTCCTTTTCACTATAC ...(((((.((.((((..(((((((((.(((((((.(((((.....((((.......))))......))))).))))))).)))))))))..)))).)))))))...... 4231 4300 TATTGGCCTGGTTCACTCAGACACATATTATTTTGATTGATTTTACTTTTGATTGAGCCGTGTCAATATC (((((((.(((((((.(((((.....((((.......))))......))))).))))))).))))))).. Spi-miR170 4231 4251 TGATTGAGCCGTGTCAATATC Spi-miR170* 4280 4300 TATTGGCCTGGTTCACTCAGA 3 Spi-MIR171a PmiREN019742 MIR171 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01031483.1 278 407 + CTATGAAACAGTAACTTTGATATTGGCCTGGTTCACTCAGACAACAAAATGTAAACTATATTTGAATGGTTGAGTTTTCGTTTTTCGTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCTCAGTTTCTCTTTCACTTTC ...(((((.((.((((..(((((((((.(((((((.((((((...((((((.(((((..(((.....)))..))))).))))))..)))))).))))))).)))))))))..)))).)).)))))..... 298 387 TATTGGCCTGGTTCACTCAGACAACAAAATGTAAACTATATTTGAATGGTTGAGTTTTCGTTTTTCGTTTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((.(((((((.((((((...((((((.(((((..(((.....)))..))))).))))))..)))))).))))))).))))))).. Spi-miR171a 367 387 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Spi-miR171a* 298 318 TATTGGCCTGGTTCACTCAGA 3 Spi-MIR171b PmiREN019743 MIR171 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01103351.1 8508 8625 + TTTGATTGATCAACTTGCGATGTTGGTGTGGTTCAATTAGATAACAATCTCCACGTAAAATTATAGAGTTTGTTATTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACATGTAAAGAAAATAACAT ............((.((.(((((((((((((((((((((((((((((.(((...(((....))).))).))))))))))))))))))))))))))))).)).)).............. 8528 8605 TGTTGGTGTGGTTCAATTAGATAACAATCTCCACGTAAAATTATAGAGTTTGTTATTTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((((((((((((((((((((((.(((...(((....))).))).))))))))))))))))))))))))))).. Spi-miR171b 8585 8605 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Spi-miR171b* 8528 8548 TGTTGGTGTGGTTCAATTAGA 3 Spi-MIR171c PmiREN019744 MIR171 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01039629.1 1800 1922 + TTCAAATGGATGAATACACGAGATATTGGTGCGGTTCAATGAGAAAGCAGTACTTAAGAACATATTTGAGTCTACTTTTTGATTGAGCCGCGCCAATATCACGTGTAGCTAAATCTTTAGTTG ..........(...((((((.(((((((((((((((((((.((((((.((.((((((........)))))))).)))))).))))))))))))))))))).))))))(((((....))))).) 1820 1902 AGATATTGGTGCGGTTCAATGAGAAAGCAGTACTTAAGAACATATTTGAGTCTACTTTTTGATTGAGCCGCGCCAATATCACG .(((((((((((((((((((.((((((.((.((((((........)))))))).)))))).)))))))))))))))))))... Spi-miR171c 1882 1902 TTGAGCCGCGCCAATATCACG Spi-miR171c* 1820 1840 AGATATTGGTGCGGTTCAATG 3 Spi-MIR171d PmiREN019745 MIR171 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01088862.1 10830 10954 - TGGGATTAAAATGGAAGAAGCGATGTTGGTGAGGTTCAATCCGAAGACGAATTTATGCTTATTTTCGTAAAGAACGATCTCAGATTGAGCCGCGCCAATATCACTTCTTATTTTCATTCCGTTTT .......(((((((((((((.((((((((((.(((((((((.((.((((..((((((........))))))...)).)))).))))))))).)))))))))).))))).........)))))))) 10850 10934 CGATGTTGGTGAGGTTCAATCCGAAGACGAATTTATGCTTATTTTCGTAAAGAACGATCTCAGATTGAGCCGCGCCAATATCACT .((((((((((.(((((((((.((.((((..((((((........))))))...)).)))).))))))))).))))))))))... Spi-miR171d 10850 10870 TTGAGCCGCGCCAATATCACT Spi-miR171d* 10914 10934 CGATGTTGGTGAGGTTCAATC 3 Spi-MIR171e PmiREN019952 MIR171 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01172990.1 680 795 + ATTATGAGGAGTTGGTGTGATGTTGGAATGGCTCAATCTAATGAAAGTTTCCAAACATTTTTGGTCATTTTAATTTGATTGAGCCGTGCCAATATCATATCGTCTTTTGTACAAGA ....................((((((.(((((((((((.(((.(((((..(((((....)))))..))))).))).))))))))))).))))))...................... 700 775 TGTTGGAATGGCTCAATCTAATGAAAGTTTCCAAACATTTTTGGTCATTTTAATTTGATTGAGCCGTGCCAATATC ((((((.(((((((((((.(((.(((((..(((((....)))))..))))).))).))))))))))).)))))).. Spi-miR171e 755 775 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Spi-miR171e* 700 720 TGTTGGAATGGCTCAATCTAA 3 Spi-MIR172a PmiREN019746 MIR172 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01001432.1 9438 9581 - TACAGTCGTTGTTTGCATATGTGGCATAATCAAGATTCACGTGAAAAGTTGCAAATTGGTTATATAATTGATGAAATTAATGGCTGGCTATTTGAAACTCACGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCAATAAACGACTATTGC ...(((((((..((((..(((((((((.((((((((((.(((((...(((.((((((((((((.(((((.....))))))))))))...))))).)))))))).)))))))))).)))))))))..))))..)))))))..... 9458 9561 GTGGCATAATCAAGATTCACGTGAAAAGTTGCAAATTGGTTATATAATTGATGAAATTAATGGCTGGCTATTTGAAACTCACGAGAATCTTGATGATGCTGCAT (((((((.((((((((((.(((((...(((.((((((((((((.(((((.....))))))))))))...))))).)))))))).)))))))))).))))))).. Spi-miR172a 9458 9478 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Spi-miR172a* 9541 9561 GTGGCATAATCAAGATTCACG 3 Spi-MIR172b PmiREN019747 MIR172 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01027513.1 4351 4523 + AACACAGTTGTTGTTTGCAGATGTAGCATCATCAAGATTCATACATGAAAATTAAGAGGCAAGGTTAAATATGTAGCTTTAATTTGAAATGAAAAATATAATATATCATGACTATGTCTATTTATTTCAAAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCAATAAATAACTATC .....(((((((..((((.(((((((((((((((((((((.(((.(((((..(((((((((.(((((...(((((......((((........))))....)))))..))))).))))).)))))))))..))).))))))))))))))))))))).))))..)))))))... 4371 4503 GTAGCATCATCAAGATTCATACATGAAAATTAAGAGGCAAGGTTAAATATGTAGCTTTAATTTGAAATGAAAAATATAATATATCATGACTATGTCTATTTATTTCAAAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((((((((((((.(((.(((((..(((((((((.(((((...(((((......((((........))))....)))))..))))).))))).)))))))))..))).)))))))))))))))))))) Spi-miR172b 4483 4503 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Spi-miR172b* 4371 4391 GTAGCATCATCAAGATTCATA 3 Spi-MIR172c PmiREN019748 MIR172 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01251016.1 2063 2222 - TACAGTCGTTATTTGCAGCTGCAGCATCATCAAGATTCACATAAAATAGAAATAATATGGAGTAGGAAAAAAAATCAAGTTGCTTCTAAATTCCATATTATTATTTTTTTTCAAAAATGAGAATCTTGATGATGCTGCATCGACAAATTATGACTTTTTC ...((((((.(((((..(.(((((((((((((((((((.(((((((.((((((((((((((((.((((...............))))..))))))))))))).))).)))).....))).))))))))))))))))))).)..))))).))))))..... 2083 2202 GCAGCATCATCAAGATTCACATAAAATAGAAATAATATGGAGTAGGAAAAAAAATCAAGTTGCTTCTAAATTCCATATTATTATTTTTTTTCAAAAATGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((((((((((((.(((((((.((((((((((((((((.((((...............))))..))))))))))))).))).)))).....))).)))))))))))))))))).. Spi-miR172c 2083 2103 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Spi-miR172c* 2182 2202 GCAGCATCATCAAGATTCACA 3 Spi-MIR172d PmiREN019749 MIR172 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01044565.1 4201 4313 + CACAGTCGTTGTTTGCAAATGCAGCACTATTAAGATTCTCAAATATTCTGACATTTAAAATGCAATTAAATGTGAATCTTGATGATGCTGCATTAGCAATAAACGACTAAACA ...(((((((..((((.(((((((((.(((((((((((............((((((((.......))))))))))))))))))).))))))))).))))..)))))))..... 4221 4293 GCAGCACTATTAAGATTCTCAAATATTCTGACATTTAAAATGCAATTAAATGTGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((.(((((((((((............((((((((.......))))))))))))))))))).)))))).. Spi-miR172d 4273 4293 TGAATCTTGATGATGCTGCAT Spi-miR172d* 4221 4240 GCAGCACTATTAAGATTCTC 3 Spi-MIR172e PmiREN019750 MIR172 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01019618.1 2201 2333 + TTCAAGTCAATTTTTTGCGGGTGGAGCATCATCAAGATTCACATAGCTATATTAGGGCTTTTATAATTTTTAAAAACCCTATGGGCGATGTGTGGGAATCTTGATGATGCTGCAGCGGCAAATAATGGCTATT .........(((.(((((.(.((.((((((((((((((((((((((((....(((((.(((((.......))))).)))))..)))..)))))..)))))))))))))))).)).).))))).)))....... 2221 2313 GGAGCATCATCAAGATTCACATAGCTATATTAGGGCTTTTATAATTTTTAAAAACCCTATGGGCGATGTGTGGGAATCTTGATGATGCTGCAG (.((((((((((((((((((((((((....(((((.(((((.......))))).)))))..)))..)))))..)))))))))))))))).)). Spi-miR172e 2293 2313 GGAATCTTGATGATGCTGCAG Spi-miR172e* 2221 2241 GGAGCATCATCAAGATTCACA 3 Spi-MIR172f PmiREN019953 MIR172 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01010996.1 1530 1712 + TCAGTCAATTTTTGCAGATGCAGCATCTTCAAGATTCACATAGATTTATATAAAATATAGAGTTCCATGTTTGGGGTGAAAGTAATTAATTAATTAATTAATTTTCTCCTGTATATTGGCTCTATTGATTATTATTTGTTGTGAGAATCTTGATGATGCTGCAGCGGCAATGAATGGCTAATT ....................(((((((.(((((((((.(((((......((((...((((((((..((((.(((((.((((((((((((....)))))).))))))))))).)))).))))))))...))))......))))).))))))))).)))))))...................... 1550 1692 CAGCATCTTCAAGATTCACATAGATTTATATAAAATATAGAGTTCCATGTTTGGGGTGAAAGTAATTAATTAATTAATTAATTTTCTCCTGTATATTGGCTCTATTGATTATTATTTGTTGTGAGAATCTTGATGATGCTGCA (((((((.(((((((((.(((((......((((...((((((((..((((.(((((.((((((((((((....)))))).))))))))))).)))).))))))))...))))......))))).))))))))).))))))).. Spi-miR172f 1673 1692 AGAATCTTGATGATGCTGCA Spi-miR172f* 1550 1570 CAGCATCTTCAAGATTCACAT 3 Spi-MIR172g PmiREN019954 MIR172 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01013542.1 195 318 + TACAGTTGTTACTTGCTAGTGCAGCATCATTAAGATTCACATAGAAAATATGGAACGAAATTTGCTCAATTTTTCAATATATGAGAATCTTGATGATGCTGCATTGGCAAATCGATGACTTGAT ....................((((((((((((((((((.(((((((((....((.(((...))).))...)))))....)))).))))))))))))))))))...................... 215 298 GCAGCATCATTAAGATTCACATAGAAAATATGGAACGAAATTTGCTCAATTTTTCAATATATGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((((((((((((.(((((((((....((.(((...))).))...)))))....)))).)))))))))))))))))).. Spi-miR172g 278 298 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Spi-miR172g* 215 235 GCAGCATCATTAAGATTCACA 3 Spi-MIR319a PmiREN019751 MIR319 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01010773.1 1594 1805 - TTAGATATATATATATGAAGAGAGCTTTCTTTAGTCCACACATAGGGAACTATAGGGTTCAATTTGCTGCCGACTCATTCATCCAAATGTTGAGGTCTTGATAATCGAATGCCACCTCAGCAACTGAGTGAATGAAGCGGGAGTACAAGTTGAGTCTTGAGCTTCCTGTACTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTCTTACCTTTTTTTCATATCG ............((((((((((((((((((((((((((...(((((((.((.((((((((((((((((.(((..((((((((.((..(((((((((.((((...)))).....)))))))))..)).))))))))..))).))..)))))))))))))))).)))))))...)))))))))))))))))............))))))))).. 1614 1785 AGAGCTTTCTTTAGTCCACACATAGGGAACTATAGGGTTCAATTTGCTGCCGACTCATTCATCCAAATGTTGAGGTCTTGATAATCGAATGCCACCTCAGCAACTGAGTGAATGAAGCGGGAGTACAAGTTGAGTCTTGAGCTTCCTGTACTTGGACTGAAGGGAGCTCCCT .(((((((((((((((((...(((((((.((.((((((((((((((((.(((..((((((((.((..(((((((((.((((...)))).....)))))))))..)).))))))))..))).))..)))))))))))))))).)))))))...)))))))))))))))))... Spi-miR319a 1614 1634 TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT Spi-miR319a* 1765 1785 AGAGCTTTCTTTAGTCCACAC 3 Spi-MIR319b PmiREN019752 MIR319 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01020908.1 1674 1887 - GAATGTTTAGATGTAAGTAGGAGCTCCTTTCAGGCCAAGACCGAGGGACGAGGAGCGGCAAGAGCTGCCTAGTCATGCATATTGGTTAACCTTAACAAACAAATTATGTATAGTGTTAAGATTAACCAGTTGCATGGCAAGGGAGCAACTACTTCCGCTAACTTGTCTCACTTATTGGACTGAAGGGAGCTCCTATCCATTTATATATAGTTAA .......((((((...(((((((((((((((((.((((......((((((((.(((((.(((.(((.(((.((((((((.(((((((((.(((((((.(((.....)))....))))))).))))))))))))))))).))).))).....))))))))..)))))))).....)))).))))))))))))))))).))))))........... 1694 1867 GAGCTCCTTTCAGGCCAAGACCGAGGGACGAGGAGCGGCAAGAGCTGCCTAGTCATGCATATTGGTTAACCTTAACAAACAAATTATGTATAGTGTTAAGATTAACCAGTTGCATGGCAAGGGAGCAACTACTTCCGCTAACTTGTCTCACTTATTGGACTGAAGGGAGCTCCT (((((((((((((.((((......((((((((.(((((.(((.(((.(((.((((((((.(((((((((.(((((((.(((.....)))....))))))).))))))))))))))))).))).))).....))))))))..)))))))).....)))).))))))))))))).. Spi-miR319b 1694 1713 TTGGACTGAAGGGAGCTCCT Spi-miR319b* 1847 1867 GAGCTCCTTTCAGGCCAAGAC 3 Spi-MIR319c PmiREN019753 MIR319 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01038799.1 3685 3894 - AATGTGGAAGATGGTATAAGAGAGCTTCCTTTAGTCCACTCATAGGTAGACGAAGGATTTGAATTATCTCCCGACTCATTCATTCAAACGCAATAGGAAGTATGTAATCTTATACTATTGTGAATGTGTGAATGATGCGGGAGATAAATTCTCTCCTTTTTATCTGTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTTTACCTTCTTTCTTCGGTT .....((((((.((((.(((.(((((((((((((((((..((((((((((..(((((...(((((((((((((..((((((((.((..((((((((.(((........)))...))))))))..)).))))))))..)))))))).)))))..)))))))))))))))..))))))))))))))))).))).)))).))))))....... 3705 3874 AGAGCTTCCTTTAGTCCACTCATAGGTAGACGAAGGATTTGAATTATCTCCCGACTCATTCATTCAAACGCAATAGGAAGTATGTAATCTTATACTATTGTGAATGTGTGAATGATGCGGGAGATAAATTCTCTCCTTTTTATCTGTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCT .(((((((((((((((((..((((((((((..(((((...(((((((((((((..((((((((.((..((((((((.(((........)))...))))))))..)).))))))))..)))))))).)))))..)))))))))))))))..)))))))))))))))))... Spi-miR319c 3705 3725 TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT Spi-miR319c* 3854 3874 AGAGCTTCCTTTAGTCCACTC 3 Spi-MIR319d PmiREN019754 MIR319 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01219963.1 2826 3042 - ACTTTGTATAATATATGTAGAGAGCTTTCTTTAGTCCACATAAAGGGGGCAGTATGGTTCAATTAGCTGCTGACTCATTCACACAAATGCTAAGGCTTTGAGAATTATTAGGAGGAAAAACCTTAGTAACTGAGTGAATGATGCGGTAGGCTGACTGAATCTTAAGCTTTTTTTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTCTTCGTAATTACTTGATAAT ........((((.((((.((((((((((((((((((((..((((((((((.....((((((.((((((((((..((((((((.((..((((((((.(((.................))).))))))))..)).))))))))..))))).))))).))))))....))))))))))..)))))))))))))))))..))).))))))))......... 2846 3022 AGAGCTTTCTTTAGTCCACATAAAGGGGGCAGTATGGTTCAATTAGCTGCTGACTCATTCACACAAATGCTAAGGCTTTGAGAATTATTAGGAGGAAAAACCTTAGTAACTGAGTGAATGATGCGGTAGGCTGACTGAATCTTAAGCTTTTTTTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCT ((((((((((((((((((..((((((((((.....((((((.((((((((((..((((((((.((..((((((((.(((.................))).))))))))..)).))))))))..))))).))))).))))))....))))))))))..)))))))))))))))))..) Spi-miR319d 2846 2866 TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT Spi-miR319d* 3002 3022 AGAGCTTTCTTTAGTCCACAT 3 Spi-MIR319e PmiREN019755 MIR319 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01118313.1 437 650 - TGAATTGAGGAATGGTCCAAGAGAGCTTCCTTCAGCCCACTCACGGAGGAGAAATGGGGTTGAATTAGCTGCCGACTCATTCATCCAACCACTCAGTAGAAAGGATAGGTTTTGTGCTACTGTGATTGAGTGAATGATGCGGGAGATAGTTTTCTATCCCTCTCTTTCCTTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCTTTTCCCCATTCTCTTCATTTT .........((((((...(((.(((((((((((((.(((..((.((((((((...(((((.((((((.((.(((..((((((((.(((.(((..((((.((((......)))).))))...))).))).))))))))..))).)).))))))...))))))))).)))).))..))).))))))))))))))))....)))))).......... 457 630 GAGAGCTTCCTTCAGCCCACTCACGGAGGAGAAATGGGGTTGAATTAGCTGCCGACTCATTCATCCAACCACTCAGTAGAAAGGATAGGTTTTGTGCTACTGTGATTGAGTGAATGATGCGGGAGATAGTTTTCTATCCCTCTCTTTCCTTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCTT (.(((((((((((((.(((..((.((((((((...(((((.((((((.((.(((..((((((((.(((.(((..((((.((((......)))).))))...))).))).))))))))..))).)).))))))...))))))))).)))).))..))).)))))))))))))).. Spi-miR319e 457 477 TTGGACTGAAGGGAGCTCCTT Spi-miR319e* 610 630 GAGAGCTTCCTTCAGCCCACT 3 Spi-MIR319f PmiREN019756 MIR319 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01034921.1 1305 1518 - AGGTTTTGATGGGATAAGGAAGGAAATTCATCAGTCCAAACAAGGTGGTATATTTGGGCTGATCTTTGCTGCTGAATCATTGGTTCATCAACATATTATACACATACAAGGATGTATACATATGTTGTTGCATCAATGATGCAGGAGCTGAGTTCAGTTTTGGCTACCTTTTCTTGGACTGAAGGGTTTCCTTCTCAACCCCAACCATGCATCA .(((.....((((....((((((((((((.(((((((((..((((((((......(((((((.(((.(((.(((.(((((((((.((.(((((((((((((((.......).)))))).)))))))).)).))))))))).))).))).))).)))))))..))))))))...))))))))).))))))))))))....)))))))........ 1325 1498 AGGAAATTCATCAGTCCAAACAAGGTGGTATATTTGGGCTGATCTTTGCTGCTGAATCATTGGTTCATCAACATATTATACACATACAAGGATGTATACATATGTTGTTGCATCAATGATGCAGGAGCTGAGTTCAGTTTTGGCTACCTTTTCTTGGACTGAAGGGTTTCCTTC (((((((((.(((((((((..((((((((......(((((((.(((.(((.(((.(((((((((.((.(((((((((((((((.......).)))))).)))))))).)).))))))))).))).))).))).)))))))..))))))))...))))))))).))))))))).. Spi-miR319f 1325 1345 TTGGACTGAAGGGTTTCCTTC Spi-miR319f* 1478 1498 AGGAAATTCATCAGTCCAAAC 3 Spi-MIR390a PmiREN019758 MIR390 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01003499.1 967 1076 + AATGGCATGGGGAATCTATAAAGCTCAGGAGGGATAGCACCATGAATACATCTTAATGGCTATCTATAGCGCTATCCATCCTGAGTTTTATGGCTTCTTCATGCTCGCTT ...(((((((((((.(((((((((((((((.(((((((..(((............)))((((....))))))))))).))))))))))))))).)))))))))))..... 987 1056 AAGCTCAGGAGGGATAGCACCATGAATACATCTTAATGGCTATCTATAGCGCTATCCATCCTGAGTTTTA ((((((((((.(((((((..(((............)))((((....))))))))))).)))))))))).. Spi-miR390a 987 1007 AAGCTCAGGAGGGATAGCACC Spi-miR390a* 1036 1056 CGCTATCCATCCTGAGTTTTA 3 Spi-MIR390b PmiREN019759 MIR390 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01004102.1 158 345 + AAAGAGTGTCGAGGGATCTGTAAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGAAAAATAATATGATGTTTTCTTTTTAATTATTTTATTGGTACATAAATTCATCTTTTTAATTGTTATTATTTTCGGTATAATAAATTCATCAATTATATTTGGCGCTATCCATCCTGAGTTCTACGGCTCCTTCATACTTTT .((((((((.((((((.(((((.(((((((((.(((((((((((......(((((.(((((..((.........((((.((((((...((((...((..........))...))))..)))))).))))))..))))))))))...))))))))))).))))))))).))))).)))))))))))))) 178 325 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGAAAAATAATATGATGTTTTCTTTTTAATTATTTTATTGGTACATAAATTCATCTTTTTAATTGTTATTATTTTCGGTATAATAAATTCATCAATTATATTTGGCGCTATCCATCCTGAGTTCTA .(((((((((.(((((((((((......(((((.(((((..((.........((((.((((((...((((...((..........))...))))..)))))).))))))..))))))))))...))))))))))).))))))))).)) Spi-miR390b 178 198 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC Spi-miR390b* 305 325 CGCTATCCATCCTGAGTTCTA 3 Spi-MIR390c PmiREN019760 MIR390 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01067580.1 2686 2804 + ATATGCATGGAGAATCTGTAAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGATGACTCAATTCGATTTTTGTACACATCTTTAGCGCTATCCATCCTGAGTTTCACGGCTTTTTCATGCTTTTTT ....((((((((((.((((.((((((((((.(((((((((...(((((...(((........)))....)))))...))))))))).)))))))))).)))).))))))))))...... 2706 2784 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGATGACTCAATTCGATTTTTGTACACATCTTTAGCGCTATCCATCCTGAGTTTCA ((((((((((.(((((((((...(((((...(((........)))....)))))...))))))))).)))))))))).. Spi-miR390c 2706 2726 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC Spi-miR390c* 2764 2784 CGCTATCCATCCTGAGTTTCA 3 Spi-MIR391 PmiREN019761 MIR391 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01083877.1 721 834 + AAAGTATCAAAAGGCTTGCTACGCAGGAGAGATGATGCTGGACGATAGAGAAAATGGGATTTAATTTATTGGCCAGCATCATACTCCTGCATATTAAGCCTAAAAATGATGCTA ..(((((((..(((((((.((.(((((((..((((((((((.(((((((..((((...))))..))))))).)))))))))).))))))).)).))))))).....))))))). 741 814 ACGCAGGAGAGATGATGCTGGACGATAGAGAAAATGGGATTTAATTTATTGGCCAGCATCATACTCCTGCATAT (.(((((((..((((((((((.(((((((..((((...))))..))))))).)))))))))).))))))).).. Spi-miR391 741 762 ACGCAGGAGAGATGATGCTGGA Spi-miR391* 794 814 CAGCATCATACTCCTGCATAT 3 Spi-MIR393 PmiREN019762 MIR393 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01009598.1 887 1003 - TCATAGTGCTGGTGGATTATTCCAAAGGGATCGCATTGATCCTGTGTTCCAAATTAATTAACCATGGGACTATGGGATCATGCGATCTCTTCGGAATTCTCCACAATATTGGCTCTA ...........(((((..(((((.((((((((((((.((((((((((((((.............)))))).)))))))))))))))))))).)))))..)))))............. 907 983 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTGTGTTCCAAATTAATTAACCATGGGACTATGGGATCATGCGATCTCTTCGGAAT (((.((((((((((((.((((((((((((((.............)))))).)))))))))))))))))))).))).. Spi-miR393 963 983 TCCAAAGGGATCGCATTGATC Spi-miR393* 907 927 ATCATGCGATCTCTTCGGAAT 3 Spi-MIR394a PmiREN019763 MIR394 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01025334.1 1078 1223 - AGGGTTCCTTACATAGTTCTTTGGCATTCTGTCCACCTCCTTTACCTTCATAATCTTCTATTTTTTTAGAAAAATAATTTTTGTTATTCTTTTTTAAAAAAAATGGAGGTGGGCATACTGTCAACAGATTTGTGTTAGTTTCTCTT ((((...((.((((((.(((((((((...(((((((((((....................((((((((((((((((((....)))))..)))))))))))))..)))))))))))...)))))).))).)))))).))...)))). 1098 1203 TTGGCATTCTGTCCACCTCCTTTACCTTCATAATCTTCTATTTTTTTAGAAAAATAATTTTTGTTATTCTTTTTTAAAAAAAATGGAGGTGGGCATACTGTCAACA ((((((...(((((((((((....................((((((((((((((((((....)))))..)))))))))))))..)))))))))))...)))))).. Spi-miR394a 1184 1203 TTGGCATTCTGTCCACCTCC Spi-miR394a* 1098 1118 GAGGTGGGCATACTGTCAACA 3 Spi-MIR394b PmiREN019764 MIR394 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01078891.1 1927 2026 + AGTATCAGTGTAGAGCCATTTTGGCATTCTGTCCACCTCCCAGCTTGCTGAGGACTGAGGAGGGGGCCAAAGTGCCAAACTAGCTCTGCAGCTCTCTCTC ((....((((((((((...(((((((((..((((.(((((((((((....))).))).)))))))))...)))))))))...)))))))).))....)). 1947 2006 TTGGCATTCTGTCCACCTCCCAGCTTGCTGAGGACTGAGGAGGGGGCCAAAGTGCCAAAC ((((((((..((((.(((((((((((....))).))).)))))))))...)))))))).. Spi-miR394b 1947 1966 TTGGCATTCTGTCCACCTCC Spi-miR394b* 1986 2006 GAGGGGGCCAAAGTGCCAAAC 3 Spi-MIR396a PmiREN019765 MIR396 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01032239.1 1789 1928 - AAATGGTCCTTTTTGTGTTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCTACAATTTCAATTCATTATTGAAAAAGAAAAAATTGATTCATATTGTTGTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAGATAGGGTCAAATAG ...(((((((.(((((((((((((((((((((.((((((((((.(.(((((((((((.....))))))...(((........)))..))))).).)))))))))).))))))))))))))))))))).)))))))..... 1809 1908 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCTACAATTTCAATTCATTATTGAAAAAGAAAAAATTGATTCATATTGTTGTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAG ((((((((((((.((((((((((.(.(((((((((((.....))))))...(((........)))..))))).).)))))))))).)))))))))))).. Spi-miR396a 1888 1908 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Spi-miR396a* 1809 1829 GTTCAATAAAGCTGTGGGAAG 3 Spi-MIR396b PmiREN019766 MIR396 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01035576.1 713 855 - ACCAAGTCCTAGTCATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTCTTGCTAAATTTTGATCTCTAAATTGATAATTTTGAGATGAGATTTGAAGCTATGAAAGTCCAAGAAAGCTGTGGGAAAAGATGGCAAGCTTTGGACTT ...((((((..(((((..((((((((((((((((((.((((......(((.((.(((.(((((.(((((...))))).))))).))).))..))).....)))).))))))))))))))))))..))))).......)))))) 733 835 TTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTCTTGCTAAATTTTGATCTCTAAATTGATAATTTTGAGATGAGATTTGAAGCTATGAAAGTCCAAGAAAGCTGTGGGAAA ((((((((((((((((.((((......(((.((.(((.(((((.(((((...))))).))))).))).))..))).....)))).)))))))))))))))).. Spi-miR396b 815 835 TTCCACAGCTTTCTTGAACTT Spi-miR396b* 733 753 GTCCAAGAAAGCTGTGGGAAA 3 Spi-MIR396c PmiREN019767 MIR396 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01172922.1 3087 3259 + CAAAATGATTCTTTGTGTACTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATACATATAACAAAAAAATTTGATCTTTTTTTTGTTTTTTTTTTACCTTTATAAAGAAAAAATTTAGATGAAAAAAATTAAATTATTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACATATAGGATCAAGA .....(((((((.((((((.((((((((((((((.((((((((((.......((((((((((........))))))))))(((((((((......)))))))))(((((((.(......).)))))))..)))))))))).)))))))))))))).)))))).)))))))... 3107 3239 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATACATATAACAAAAAAATTTGATCTTTTTTTTGTTTTTTTTTTACCTTTATAAAGAAAAAATTTAGATGAAAAAAATTAAATTATTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAG ((((((((((((.((((((((((.......((((((((((........))))))))))(((((((((......)))))))))(((((((.(......).)))))))..)))))))))).)))))))))))))) Spi-miR396c 3107 3127 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Spi-miR396c* 3219 3239 GTTCAATAAAGCTGTGGGAAG 3 Spi-MIR397 PmiREN019768 MIR397 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01091081.1 131 361 + CAACTGAGAAGAAAAGTTGTTGATTGAGTGCAGCGTTGATCACCCTCAGGAGAACTGATTCTCCCGGATTCACAGAGTATTTCACAGTACCTGCATTTCAGTTCTGAATTAGTCATTTCACGAGTAATGTATATGAGTTAAATCGTTTATGTTTTATGTCGTAAGGACCTTGTGTAGAGCATCTGTATAGATCACCAGGTTGACCATTAATAGTATATGCATCAGAATTAT ...((((.........((((((((.(.((.((((.((((((..((...((((((....)))))).)).....(((.(((((....)))))))).......((((((.....(((.(((.((((..((((((.((((......)))).)))))).....))))))))))......)))))).........)))))..).)))))))))))))))........))))...... 151 341 TGATTGAGTGCAGCGTTGATCACCCTCAGGAGAACTGATTCTCCCGGATTCACAGAGTATTTCACAGTACCTGCATTTCAGTTCTGAATTAGTCATTTCACGAGTAATGTATATGAGTTAAATCGTTTATGTTTTATGTCGTAAGGACCTTGTGTAGAGCATCTGTATAGATCACCAGGTTGACCATTAAT ((((.(.((.((((.((((((..((...((((((....)))))).)).....(((.(((((....)))))))).......((((((.....(((.(((.((((..((((((.((((......)))).)))))).....))))))))))......)))))).........)))))..).))))))))))).. Spi-miR397 151 170 TGATTGAGTGCAGCGTTGAT Spi-miR397* 321 341 ATCACCAGGTTGACCATTAAT 3 Spi-MIR398 PmiREN019769 MIR398 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01037724.1 266 394 + TATGTGGATGTGTTCAATAGGGTTGATTTGAGAACATATGTATGTGCATATTTTGTTTGTAACAATTTACCGTTTATAAATATGACACATATGTTCTCAGGTCGCCCCTATAGACTATTCTTCATCATT .(((.(((.(((.((.((((((.((((((((((((((((((..((.(((((((.....((((....)))).......))))))))))))))))))))))))))).)))))).)).)))))).))).... 286 374 GGTTGATTTGAGAACATATGTATGTGCATATTTTGTTTGTAACAATTTACCGTTTATAAATATGACACATATGTTCTCAGGTCGCCCCT ((.((((((((((((((((((..((.(((((((.....((((....)))).......))))))))))))))))))))))))))).)).. Spi-miR398 355 374 TATGTTCTCAGGTCGCCCCT Spi-miR398* 286 306 GGTTGATTTGAGAACATATGT 3 Spi-MIR399a PmiREN019770 MIR399 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01195591.1 3829 3964 + AAATAAGGGAAATAGTGATAGGGCTACTCTCTATTGGCATGCGTTAATATATGTACAGTGACTCCAATTCACTGTATCGCATATTTTAACCGATACGCCAAAGGAGAGCTGCCCTGCTACTGTCTCTGCTTAATAT ...(((((((.((((((.((((((..((((((.(((((((..(((((.(((((((((((((.......)))))))...)))))).)))))..))..))))).))))))..)))))).)))))).))).)))).... 3849 3944 GGGCTACTCTCTATTGGCATGCGTTAATATATGTACAGTGACTCCAATTCACTGTATCGCATATTTTAACCGATACGCCAAAGGAGAGCTGCCCTG ((((..((((((.(((((((..(((((.(((((((((((((.......)))))))...)))))).)))))..))..))))).))))))..)))).. Spi-miR399a 3924 3944 CGCCAAAGGAGAGCTGCCCTG Spi-miR399a* 3849 3869 GGGCTACTCTCTATTGGCATG 3 Spi-MIR399b PmiREN019771 MIR399 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01136803.1 856 959 + ATATAAGCGAAATAGTGATAGGGCTACTCTCTATTGGCATGCAATTGTATATTTCAGCTGACACGCCAAAGGAGAGCTGTCCTGTTACTGTCTCAGCTTAATCT ...(((((((.(((((((((((((..((((((.(((((.((((.(((.......))).)).)).))))).))))))..))))))))))))).)).))))).... 876 939 GGGCTACTCTCTATTGGCATGCAATTGTATATTTCAGCTGACACGCCAAAGGAGAGCTGTCCTG ((((..((((((.(((((.((((.(((.......))).)).)).))))).))))))..)))).. Spi-miR399b 919 939 CGCCAAAGGAGAGCTGTCCTG Spi-miR399b* 876 896 GGGCTACTCTCTATTGGCATG 3 Spi-MIR399c PmiREN019772 MIR399 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01195591.1 2584 2692 - TTGTAAGGGAAACAGTGATAGGGCTACACTCTATTGGCATGCAACTTGATCAAATATTTGAGCTGAAATGCCAAAGGAGAGTTGCCCTATTACTGTCTCTACTTAATGT ...(((((((.(((((((((((((.((.((((.(((((((.((.(((((........))))).))..))))))).)))).)).))))))))))))).))).)))).... 2604 2672 GGGCTACACTCTATTGGCATGCAACTTGATCAAATATTTGAGCTGAAATGCCAAAGGAGAGTTGCCCTA ((((.((.((((.(((((((.((.(((((........))))).))..))))))).)))).)).)))).. Spi-miR399c 2604 2624 TGCCAAAGGAGAGTTGCCCTA Spi-miR399c* 2652 2672 GGGCTACACTCTATTGGCATG 3 Spi-MIR399d PmiREN019773 MIR399 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01208655.1 3012 3115 + TTATAAGGGAAACAGTGATAGGGCTACTCTCTATTGGCATGCAATTGTATATTTCAGCTGACACGCCAAAGGAGAGCTGCCCTGTTACTGTCTCTGCTTAATCT ...(((((((.(((((((((((((..((((((.(((((.((((.(((.......))).)).)).))))).))))))..))))))))))))).))).)))).... 3032 3095 GGGCTACTCTCTATTGGCATGCAATTGTATATTTCAGCTGACACGCCAAAGGAGAGCTGCCCTG ((((..((((((.(((((.((((.(((.......))).)).)).))))).))))))..)))).. Spi-miR399d 3075 3095 CGCCAAAGGAGAGCTGCCCTG Spi-miR399d* 3032 3052 GGGCTACTCTCTATTGGCATG 3 Spi-MIR399e PmiREN019774 MIR399 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01208655.1 7332 7435 + TTGTAAGGGAAACAGTGATAGGGCTACTCTCTATTGGCATGCAATTGTATATTTCAGCTGACACGCCAAAGGAGAGCTGCCCTGTTACTGTCTCTGCTTAATCT ...(((((((.(((((((((((((..((((((.(((((.((((.(((.......))).)).)).))))).))))))..))))))))))))).))).)))).... 7352 7415 GGGCTACTCTCTATTGGCATGCAATTGTATATTTCAGCTGACACGCCAAAGGAGAGCTGCCCTG ((((..((((((.(((((.((((.(((.......))).)).)).))))).))))))..)))).. Spi-miR399e 7395 7415 CGCCAAAGGAGAGCTGCCCTG Spi-miR399e* 7352 7372 GGGCTACTCTCTATTGGCATG 3 Spi-MIR399f PmiREN019775 MIR399 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01208655.1 9570 9673 - TTATAAGGGAAACAGTAGTAGGGCTACTCTCTATTGGCATGCAGTGATATATTCAAACTGATATGCCAAAGGAGAGCTGCCCTGTTACTGTCTCTGCTTAGTGT ...(((((((.(((((((((((((..((((((.((((((((((((...........)))).)))))))).))))))..))))))))))))).))).)))).... 9590 9653 GGGCTACTCTCTATTGGCATGCAGTGATATATTCAAACTGATATGCCAAAGGAGAGCTGCCCTG ((((..((((((.((((((((((((...........)))).)))))))).))))))..)))).. Spi-miR399f 9590 9610 TGCCAAAGGAGAGCTGCCCTG Spi-miR399f* 9633 9653 GGGCTACTCTCTATTGGCATG 3 Spi-MIR399g PmiREN019776 MIR399 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01208655.1 5979 6082 - TTATAAGGGAAACAGTGGTAGGGCTACTCTCTATTGGCATGCAGTGATATAGTTAAGCTGACATGCCAAAGGAGAGCTGCCCTGTTACTGTCTCTGCTTAGTGT ...(((((((.(((((((((((((..((((((.((((((((((((...........)))).)))))))).))))))..))))))))))))).))).)))).... 5999 6062 GGGCTACTCTCTATTGGCATGCAGTGATATAGTTAAGCTGACATGCCAAAGGAGAGCTGCCCTG ((((..((((((.((((((((((((...........)))).)))))))).))))))..)))).. Spi-miR399g 5999 6019 TGCCAAAGGAGAGCTGCCCTG Spi-miR399g* 6042 6062 GGGCTACTCTCTATTGGCATG 3 Spi-MIR399h PmiREN019777 MIR399 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01208655.1 1099 1202 - TTATAAGAGAAACAGTGGTAGGGCTACTCTCTATTGGCATGCACTTATATATTTAAACTGACATGCCAAAGGAGAGCTGCCCTGTTACTGTCTCTGCTTAATGT ...(((((((.(((((((((((((..((((((.((((((((((.(((......)))..)).)))))))).))))))..))))))))))))).))).)))).... 1119 1182 GGGCTACTCTCTATTGGCATGCACTTATATATTTAAACTGACATGCCAAAGGAGAGCTGCCCTG ((((..((((((.((((((((((.(((......)))..)).)))))))).))))))..)))).. 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Spi-miR399i 2974 2994 TGCCAAAGGAGAGTTGCCCTA Spi-miR399i* 2931 2951 GGGCAATTCTCCGTTTGGCAG 3 Spi-MIR403 PmiREN019778 MIR403 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01304110.1 76 189 + TCAGGAAGAGGCATATTTCACGTTTGTGCGTGAATCTAACAACTCTTTTCATCAGAAAAACTGTTATTGTTTGCTAGATTCACGCACAAGCTCGTAATATGGCTTTTCCAATCT ...(((((((.((((((....(((((((((((((((((.(((..(.......(((.....))).....).))).)))))))))))))))))....)))))).)))))))..... 96 169 CGTTTGTGCGTGAATCTAACAACTCTTTTCATCAGAAAAACTGTTATTGTTTGCTAGATTCACGCACAAGCTCG .(((((((((((((((((.(((..(.......(((.....))).....).))).)))))))))))))))))... Spi-miR403 149 169 CTAGATTCACGCACAAGCTCG Spi-miR403* 96 116 CGTTTGTGCGTGAATCTAACA 3 Spi-MIR408 PmiREN019779 MIR408 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01144501.1 704 815 - AATTGGTGTGGTATGGATAGACGGGGACGAGCCAGAGCATGAGATGTGCAATTTTTGCTTTGCCTATTCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCTCCTCTCCCCACAATCCTT ....(((((((...(((.((.((((((.(((.(((.(((((.((((.((((........)))).)))).))))).))).))).)))))).)).))).....)))))..)).. 724 795 ACGGGGACGAGCCAGAGCATGAGATGTGCAATTTTTGCTTTGCCTATTCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCT .((((((.(((.(((.(((((.((((.((((........)))).)))).))))).))).))).))))))... Spi-miR408 724 744 TGCACTGCCTCTTCCCTGGCT Spi-miR408* 775 795 ACGGGGACGAGCCAGAGCATG 3 Spi-MIR472 PmiREN019780 MIR472 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01003339.1 397 508 + GAGTATTGGGAAGTTGTTGGTTGTGGGTGGGGTGGAAAGATTTGATAAATCTAATTTTAAAGAGATTAAATCTTTCCTACTCCTCCCATACCCATGACTTCCACTAGCTTCT ((((....(((((((((.(((.(((((.((((((((((((((((((...(((........))).))))))))))))).))))).)))))))).)))))))))....)))).. 417 488 TTGTGGGTGGGGTGGAAAGATTTGATAAATCTAATTTTAAAGAGATTAAATCTTTCCTACTCCTCCCATACC (.(((((.((((((((((((((((((...(((........))).))))))))))))).))))).)))))).. 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Spi-miR477 4687 4707 CTCTCCCTCAAAGGCTTCTGG Spi-miR477* 4734 4755 AGAGGTCTTTCGAGTGAGAGTG 3 Spi-MIR482a PmiREN019782 MIR482 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01000217.1 2161 2272 - GATTTTTGGGAAGCTTTTGGCGTGAGCGGTGGGGAAAGATAGATCTATCATATTAGTATGATATGATAAATCTTGCCTACACCGCCCATGCCCATGGCTTCCAATGATTTCT ........(((((((...((((((.(((((((((.(((((..((((((((((....))))))).)))..))))).))).)))))).))))))...))))))).......... 2181 2252 CGTGAGCGGTGGGGAAAGATAGATCTATCATATTAGTATGATATGATAAATCTTGCCTACACCGCCCATGCC ((((.(((((((((.(((((..((((((((((....))))))).)))..))))).))).)))))).)))).. Spi-miR482a 2181 2202 TCTTGCCTACACCGCCCATGCC Spi-miR482a* 2232 2252 CGTGAGCGGTGGGGAAAGATA 3 Spi-MIR482b PmiREN019783 MIR482 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01000217.1 1846 1974 - GAGGGATTTGGGAATCTTTTGGAGTGGGTGGGATGGAAAAATATTGTATTTTTTTTTCTAACGGAAAAAAAGATGAGAATTGAGATTTTTCCTATTCCACCCATGCCAATGGCTTCCCATCATTTACTC ....((..((((((.((.((((.((((((((((((((((((((((.(((((((((((((...)))))))))))))..)))....)))))))).))))))))))).)))).)).))))))........)) 1866 1954 GGAGTGGGTGGGATGGAAAAATATTGTATTTTTTTTTCTAACGGAAAAAAAGATGAGAATTGAGATTTTTCCTATTCCACCCATGCCAA ((.((((((((((((((((((((((.(((((((((((((...)))))))))))))..)))....)))))))).))))))))))).)).. Spi-miR482b 1866 1887 TTTCCTATTCCACCCATGCCAA Spi-miR482b* 1934 1954 GGAGTGGGTGGGATGGAAAAA 3 Spi-MIR482c PmiREN019784 MIR482 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01165072.1 4930 5040 - GTGTTTCGAGGAGGTGTTGGAGTGGGTGGTGTGGTAAGATTTCATATTTATTTTCCATAAAAATTGAGATCTTGCCAATACCGCCCATTCCTATGGCTTCTGATCATTTCT .....((.(((((.(((.((((((((((((((((((((((((((..(((((.....)))))...)))))))))))).)))))))))))))).))).)))))))........ 4950 5020 AGTGGGTGGTGTGGTAAGATTTCATATTTATTTTCCATAAAAATTGAGATCTTGCCAATACCGCCCATTCC ((((((((((((((((((((((((..(((((.....)))))...)))))))))))).)))))))))))).. Spi-miR482c 4950 4971 TCTTGCCAATACCGCCCATTCC Spi-miR482c* 5000 5020 AGTGGGTGGTGTGGTAAGATT 3 Spi-MIR482d PmiREN019785 MIR482 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01187909.1 5205 5314 - GAGTTTTTCGAAAATCTATGGGGATTGGTGAGTTGGAAAGCTTTTCTTTTTCTTCTCTTGTGATTAGCTTTCCAATTCCACCCATTCCTATGGTTTTTCGGTATTCTCTC (((..(.(((((((.((((((((((.((((((((((((((((..((...............))..)))))))))))).)))).)))))))))).))))))).)..))).. 5225 5294 GGGATTGGTGAGTTGGAAAGCTTTTCTTTTTCTTCTCTTGTGATTAGCTTTCCAATTCCACCCATTCCTA (((((.((((((((((((((((..((...............))..)))))))))))).)))).))))).. Spi-miR482d 5225 5246 TTTCCAATTCCACCCATTCCTA Spi-miR482d* 5274 5294 GGGATTGGTGAGTTGGAAAGC 3 Spi-MIR530 PmiREN019786 MIR530 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01127210.1 3285 3401 - AAACAAGAGACATTTTTATCTGCATTTGCACCTGCACCTTAGTGAACGAATTAGTTCGCGTATAATTCGTGCAGAAAGGTGTAGGTGTTCATGCAGACAAAAATGGTATCTTGGCCT ...(((((..(((((((.(((((((..(((((((((((((..((.((((((((.........)))))))).))..)))))))))))))..))))))).)))))))...))))).... 3305 3381 TGCATTTGCACCTGCACCTTAGTGAACGAATTAGTTCGCGTATAATTCGTGCAGAAAGGTGTAGGTGTTCATGCAGA (((((..(((((((((((((..((.((((((((.........)))))))).))..)))))))))))))..))))).. Spi-miR530 3361 3381 TGCATTTGCACCTGCACCTTA Spi-miR530* 3305 3325 AGGTGTAGGTGTTCATGCAGA 3 Spi-MIR827 PmiREN019956 MIR827 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01158310.1 6952 7078 + ATTGTGTAGTTATGAATTTGTTTGTTGATGGTCATCTATTCATCATATCATTTGGCATAGTTTTTGGAACCATTAATATGCCATGATTAGATGAACATCAACAAACATCTTCATCACTTCATGTTAA ....................((((((((((.(((((((.(((..........(((((((.((..((....))..)))))))))))).))))))).))))))))))...................... 6972 7058 TTTGTTGATGGTCATCTATTCATCATATCATTTGGCATAGTTTTTGGAACCATTAATATGCCATGATTAGATGAACATCAACAAACA ((((((((((.(((((((.(((..........(((((((.((..((....))..)))))))))))).))))))).)))))))))).. Spi-miR827 7038 7058 TTAGATGAACATCAACAAACA Spi-miR827* 6972 6992 TTTGTTGATGGTCATCTATTC 3 Spi-MIR1446 PmiREN019696 MIR1446 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01043201.1 1879 2004 - GGAAACCCAGAGTTTTCTGAACTCTCTCCCTCAATGGCTGTTCATATAATATATGCTGCTACTTTGCAGCTTAATTAAATAACAGCTTTGGGGGTTTGAGTCCAGAAAACTCTTGCTTTCCTAGTTAAG (((((.(.(((((((((((.((((...(((((((.(((((((.((.((((.((.(((((......))))).)))))).))))))))))))))))...)))).))))))))))).).)))))........ 1899 1987 TGAACTCTCTCCCTCAATGGCTGTTCATATAATATATGCTGCTACTTTGCAGCTTAATTAAATAACAGCTTTGGGGGTTTGAGTCCAGA ((.((((...(((((((.(((((((.((.((((.((.(((((......))))).)))))).))))))))))))))))...)))).)).. Spi-miR1446 1966 1987 TGAACTCTCTCCCTCAATGGCT Spi-miR1446* 1899 1919 CTTTGGGGGTTTGAGTCCAGA 3 Spi-MIR3627 PmiREN019757 MIR3627 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01012120.1 4728 4850 - GAGAGATTGAGGGAATCTTGTCGCAGGAGAGATGGCACTTGCCATTCCTTTTAATTGGTACAATGCCTAAATGGAACCAATTAAGTGCCTCTGTCTTTCGACACGATGCTCACAATTTCTATT .((((((((.(((.(((.(((((.((((.(((.((((((((...((((.((((...((((...)))))))).)))).....))))))))))).)))).))))).))).))).))))))))... 4748 4830 TCGCAGGAGAGATGGCACTTGCCATTCCTTTTAATTGGTACAATGCCTAAATGGAACCAATTAAGTGCCTCTGTCTTTCGACA (((.((((.(((.((((((((...((((.((((...((((...)))))))).)))).....))))))))))).)))).))).. Spi-miR3627 4809 4830 TCGCAGGAGAGATGGCACTTGC Spi-miR3627* 4748 4768 AAGTGCCTCTGTCTTTCGACA 3 Spi-MIR5304 PmiREN019787 MIR5304 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01000114.1 5711 5832 - CCATGGTGCAGTTTGCTCATTCAATGCTACATACTCATCCCCACAACTTTCATCTCACGTTCAAAAGATGAAAGTTATAGAGATGAGTATGGTGCATTGGATGTGTGGCCATACCATGGGTG ((((((((..(((.((.((((((((((..((((((((((.(...(((((((((((..........)))))))))))...).))))))))))..)))))))))).)))))..))))))))... 5731 5812 TCAATGCTACATACTCATCCCCACAACTTTCATCTCACGTTCAAAAGATGAAAGTTATAGAGATGAGTATGGTGCATTGGAT (((((((..((((((((((.(...(((((((((((..........)))))))))))...).))))))))))..))))))).. Spi-miR5304 5792 5812 TCAATGCTACATACTCATCCC Spi-miR5304* 5731 5751 GATGAGTATGGTGCATTGGAT 3 Spi-MIR6024 PmiREN019788 MIR6024 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01016110.1 212 328 + CTAACTGGAAATGGGGAAGTGGAGAAACAACACTTGCTAAAGGAAGTTCACCAGTCATCTCTTTTCTTTTGGAGTTTTTTTAGCAAGAGTTGTTTTACCTCTTCTCAATTCCGTCTC .....(((((...((((((.((.((((((((.(((((((((((((.((((..((...........))..)))).))))))))))))).)))))))).)).))))))..))))).... 232 308 AGAAACAACACTTGCTAAAGGAAGTTCACCAGTCATCTCTTTTCTTTTGGAGTTTTTTTAGCAAGAGTTGTTTTACC .((((((((.(((((((((((((.((((..((...........))..)))).))))))))))))).)))))))).)) Spi-miR6024 288 308 TTTAGCAAGAGTTGTTTTACC Spi-miR6024* 232 252 AGAAACAACACTTGCTAAAGG 3 Spi-MIR6026 PmiREN019789 MIR6026 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01033678.1 2219 2466 + CAATTGACCACTTTGATTTGGTAATACAACTATAGCCAAGACAATGCTTCATTATAAGTGCATAACTTTTCACTTTATTGTTTGAGCATTGTGTTGATTTCTCTAAACTTGTTTTTCGTTGAACAAGATTGTTTTTTCATATACTCATGGAAAGCAACACCGTGCTCAGAAGTTAGAGTGAAATGTTATGCATTTGTGATTATATATTTTCTTGGCTAGAGTTGTATTGCCAAGTGAAGTGTTTTAAT ..(((((.((((((.((((((((((((((((.(((((((((.((((....((((((((((((((((.((((((((((...(((((((((.((((((...........(((((((......))))))).....((((((((......)))))))))))))).)))))))))...)))))))))).))))))))))))))))....)))).))))))))).))))))))))))))))))))))..))))) 2239 2446 AATACAACTATAGCCAAGACAATGCTTCATTATAAGTGCATAACTTTTCACTTTATTGTTTGAGCATTGTGTTGATTTCTCTAAACTTGTTTTTCGTTGAACAAGATTGTTTTTTCATATACTCATGGAAAGCAACACCGTGCTCAGAAGTTAGAGTGAAATGTTATGCATTTGTGATTATATATTTTCTTGGCTAGAGTTGTATTGC (((((((((.(((((((((.((((....((((((((((((((((.((((((((((...(((((((((.((((((...........(((((((......))))))).....((((((((......)))))))))))))).)))))))))...)))))))))).))))))))))))))))....)))).))))))))).))))))))))) Spi-miR6026 2239 2260 AATACAACTATAGCCAAGACAA Spi-miR6026* 2426 2446 TCTTGGCTAGAGTTGTATTGC 3 Spi-MIR6027 PmiREN019790 MIR6027 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01245331.1 6211 6373 + TTTCGTAATTTTACATGATTATGGGTAGCACAAGGATTAATGTGAAACAGAAAAGTGATATGCAAAGAAGATGGAGATTCAATTGTTTATTGTTACGAAGAAAACACTTTTGTGTTTCTCGTGAATCCTTCGGCTATCCATAATCATGTTGAATGTGTTATTT ............(((((((((((((((((..(((((((.(((.((((((.(((((((............((((((.(......).)))))).............))))))).)))))).))).)))))))..))))))))))))))))).............. 6231 6353 ATGGGTAGCACAAGGATTAATGTGAAACAGAAAAGTGATATGCAAAGAAGATGGAGATTCAATTGTTTATTGTTACGAAGAAAACACTTTTGTGTTTCTCGTGAATCCTTCGGCTATCCATAA (((((((((..(((((((.(((.((((((.(((((((............((((((.(......).)))))).............))))))).)))))).))).)))))))..))))))))).. Spi-miR6027 6332 6353 TGAATCCTTCGGCTATCCATAA Spi-miR6027* 6231 6251 ATGGGTAGCACAAGGATTAAT 3 Spi-MIR6149 PmiREN019791 MIR6149 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01289668.1 125 299 + TATAGCCTTTGTATGTCAAAGCTTCGATACGCACCTGAATCGACAAATACATATATTATTCAGACTTTTTAAGAATATCACGCGTTTATTATTTTTATAAGTCTGAATAACATAAATCATATATAACATATATGTCGATTCGGGTTCGTATGAAAACTATGGCATACCTCAAAGG ..........((((((((.((.((..(((((.(((((((((((((.(((.(((((((((((((((((..((((((((............)))))))).))))))))))).........))))))....))).))))))))))))).)))))..)).)).))))))))........ 145 279 TTCGATACGCACCTGAATCGACAAATACATATATTATTCAGACTTTTTAAGAATATCACGCGTTTATTATTTTTATAAGTCTGAATAACATAAATCATATATAACATATATGTCGATTCGGGTTCGTATGAAAAC ((..(((((.(((((((((((((.(((.(((((((((((((((((..((((((((............)))))))).))))))))))).........))))))....))).))))))))))))).)))))..)).) 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Spi-miR9470 1934 1953 TTTGGCTCATGGATTTTAGC Spi-miR9470* 1761 1781 TGAAATCCATGAGCCTAAACT 3 Spi-MIR9473 PmiREN019793 MIR9473 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01272323.1 5952 6094 - GTGAGTGAACTAGCAGATATTGGCTGTAAATCTAAACTCGTTCTACTCCACTAGTCATCATGTAATGACATTTACTAGAAGAAGAGACTATTGGGGTAAAACGAGTTCAGATTTACAGCCAATATTGTTTTGCTTGCACGCAT ...........((((((((((((((((((((((.((((((((.(((((((.(((((.((..((((......)))).....))...))))).))))))).)))))))).))))))))))))))))))....))))......... 5972 6074 TGGCTGTAAATCTAAACTCGTTCTACTCCACTAGTCATCATGTAATGACATTTACTAGAAGAAGAGACTATTGGGGTAAAACGAGTTCAGATTTACAGCCAAT (((((((((((((.((((((((.(((((((.(((((.((..((((......)))).....))...))))).))))))).)))))))).))))))))))))).. Spi-miR9473 6054 6074 TGGCTGTAAATCTAAACTCGT Spi-miR9473* 5972 5992 GAGTTCAGATTTACAGCCAAT 3 Spi-MIR9479 PmiREN019794 MIR9479 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01021941.1 1057 1257 + ATATGATCGGTTTATAATAAGTCCAGTCCTCTACCCTTCTCCACTTAAAAGACCAAGCTTGTCTACAACAAGGTTCCAACTCATGACAAACATATGATGTGTGAGTTAGGCACGTGTCACGGGTTCAAATGCTACCACCGACAAAAGTATGGTATTTAAGTGGAGAATGGTAGAGGGTCGGACCCATTATCTACCGAGTTT .....((((((..(((((..((((.((((((((((.(((((((((((((..((((.(((((((.........(((..(((((.(((((.........(((((.......)))))))))).)))))..))).........))))..))).)))).))))))))))))).)))))))))).))))..)))))..)))))...) 1077 1237 CCAGTCCTCTACCCTTCTCCACTTAAAAGACCAAGCTTGTCTACAACAAGGTTCCAACTCATGACAAACATATGATGTGTGAGTTAGGCACGTGTCACGGGTTCAAATGCTACCACCGACAAAAGTATGGTATTTAAGTGGAGAATGGTAGAGGGTCGGAC ((.((((((((((.(((((((((((((..((((.(((((((.........(((..(((((.(((((.........(((((.......)))))))))).)))))..))).........))))..))).)))).))))))))))))).)))))))))).)))) Spi-miR9479 1217 1237 GAGAATGGTAGAGGGTCGGAC Spi-miR9479* 1077 1097 CCAGTCCTCTACCCTTCTCCA 3 Spi-MIR10534 PmiREN019693 MIR10534 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01293892.1 359 493 - TTTCATTCACCTAATGGCTCCAAAATACCCTTGTCATCCAACATTGGATTCAAAATTGACCACTTATTTAACGGTCCATTTTGAACAAAAAGGTGGATGACAAGGGTATTTTGGAGCCAACAGATGGATAAAAGG (((.(((((.((..((((((((((((((((((((((((((........((((((((.((((...........)))).))))))))........))))))))))))))))))))))))))..)).))))))))... 379 473 CAAAATACCCTTGTCATCCAACATTGGATTCAAAATTGACCACTTATTTAACGGTCCATTTTGAACAAAAAGGTGGATGACAAGGGTATTTTGGA ((((((((((((((((((((........((((((((.((((...........)))).))))))))........)))))))))))))))))))).. Spi-miR10534 453 473 CAAAATACCCTTGTCATCCAA Spi-miR10534* 379 399 GGATGACAAGGGTATTTTGGA 3 Spi-MIR10537 PmiREN019694 MIR10537 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01143610.1 3997 4262 + TACAACGTACGTAGGGTAAGTGGATGGCTGAAATTCGTTAGCCTAACCGTGGCCCTGGAAATACTTCTCTGCAGGACAAGCTTCATTTCCATTACCGGATATCAACAGAAAGGTTGAAAAAGACAACAATGTAGAGGATTTGGTGGAGTGTGGAAAGATTTGAATGCAAACTTATCGAAGATTGATCATCATGGATTTAAGCCATCCATTTACCCCAAGTTCGTTGTCAAACGCCTTTGTAAGTGCGCGC .((((((.((...((((((((((((((((.((((((((..(((.......)))((((.(..........).))))....(((((((((((((((((((((.((.(((.....(((......))).....))).))..))))))))....)))))))....)))).))......(((((...)))))....)))))))).))))))))))))))))...)).))))))....((((((...))).)))... 4017 4242 CAACGTACGTAGGGTAAGTGGATGGCTGAAATTCGTTAGCCTAACCGTGGCCCTGGAAATACTTCTCTGCAGGACAAGCTTCATTTCCATTACCGGATATCAACAGAAAGGTTGAAAAAGACAACAATGTAGAGGATTTGGTGGAGTGTGGAAAGATTTGAATGCAAACTTATCGAAGATTGATCATCATGGATTTAAGCCATCCATTTACCCCAAGTTCGTTGTC (((((.((...((((((((((((((((.((((((((..(((.......)))((((.(..........).))))....(((((((((((((((((((((.((.(((.....(((......))).....))).))..))))))))....)))))))....)))).))......(((((...)))))....)))))))).))))))))))))))))...)).))))).. Spi-miR10537 4222 4242 ATTTACCCCAAGTTCGTTGTC Spi-miR10537* 4017 4037 CAACGTACGTAGGGTAAGTGG 3 Spi-MIR10539 PmiREN019695 MIR10539 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01277968.1 131 366 - AGAAGAAGATGGTAGTTTGTTGGTGATTGTGGTTCGAAAATTGATGTTGATTATCCCTTTATATTAGTCTGGTATTTCCTCTGTTTCAATTTATTTATTCTATTTATTTTTATAATCTGTTTCAAATTTTTATATATTTAAATTCTGAACTCGCATACACGTGATGTACAAAATGTATAGACACAACATTACAATCTTGGAACCACAGTTACCACCATACTATCAAATTTCTCAGC .((.(((..(((((((.((.(((((((((((((((.((.((((((((((.....................((.....))..((...((..((((.................))))..))...))....(((((((((((......((.((((((......)))).)).)))))))))))))..))))))..)))).)).))))))))))))))).)).)))))))..))).))... 151 346 TGGTGATTGTGGTTCGAAAATTGATGTTGATTATCCCTTTATATTAGTCTGGTATTTCCTCTGTTTCAATTTATTTATTCTATTTATTTTTATAATCTGTTTCAAATTTTTATATATTTAAATTCTGAACTCGCATACACGTGATGTACAAAATGTATAGACACAACATTACAATCTTGGAACCACAGTTACCACC (((((((((((((((.((.((((((((((.....................((.....))..((...((..((((.................))))..))...))....(((((((((((......((.((((((......)))).)).)))))))))))))..))))))..)))).)).))))))))))))))).. Spi-miR10539 151 171 CTTGGAACCACAGTTACCACC Spi-miR10539* 326 346 TGGTGATTGTGGTTCGAAAAT 3 Spi-MIRN2114 PmiREN019799 MIRN2114 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01198566.1 3643 3773 - CTTGGTGGAGGTATTCAACAGGGGCAACTTGAGATCACATGTTGTCATTTTTTTCTTTTTGGTTTGATTCGATGAATCAGTATCTCAACATGTGTTCTCAGGTTACCCCTGTTGAATTAGTTTCACTTAAT ....((((((.(((((((((((((.(((((((((.(((((((((................((((((((((...))))))).))).))))))))).))))))))).))))))))))).)).))))))..... 3663 3753 GGGGCAACTTGAGATCACATGTTGTCATTTTTTTCTTTTTGGTTTGATTCGATGAATCAGTATCTCAACATGTGTTCTCAGGTTACCCCTG ((((.(((((((((.(((((((((................((((((((((...))))))).))).))))))))).))))))))).)))).. Spi-miRN2114 3733 3753 GGGGCAACTTGAGATCACATG Spi-miRN2114* 3663 3683 TGTGTTCTCAGGTTACCCCTG 3 Spi-MIRN3070a PmiREN019809 MIRN3070 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01151355.1 349 568 + TCATACTTTTATGACATTGATGTTCCTGCATCCAAAAACTAGAGCGTATATGTCCTTCACTCTAACGGAAGAATATATAGGGACAGGTGGCGCAACCTTATTCGTCGATAAGTATCGGATCAATGGATAAAATTATGGCACGTGCATATCCGTTACTATATAGGATATATGTACTATAGTTTTTGGACGGCAGGGGCACCAATGTCGCAAAAGTATGATG ((((((((((.((((((((.(((((((((.(((((((((((.((..((((((((((......(((((((............(.((.(((.((.((..((((((((.(((..(...)..))).))))))))..)).)).))).)))...)))))))......))))))))))..)).)))))))))))..))))))))).)))))))).)))))))))).. 369 548 TGTTCCTGCATCCAAAAACTAGAGCGTATATGTCCTTCACTCTAACGGAAGAATATATAGGGACAGGTGGCGCAACCTTATTCGTCGATAAGTATCGGATCAATGGATAAAATTATGGCACGTGCATATCCGTTACTATATAGGATATATGTACTATAGTTTTTGGACGGCAGGGGCACC (((((((((.(((((((((((.((..((((((((((......(((((((............(.((.(((.((.((..((((((((.(((..(...)..))).))))))))..)).)).))).)))...)))))))......))))))))))..)).)))))))))))..))))))))).. Spi-miRN3070a 528 548 TTTTTGGACGGCAGGGGCACC Spi-miRN3070a* 369 389 TGTTCCTGCATCCAAAAACTA 3 Spi-MIRN3070b PmiREN019814 MIRN3070 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01207271.1 1552 1766 - TCACATTTTTGGGATATTGGTGACCTTGTCGTCCATAAACTAGAGCATATATGCCCTTCACTCTAACTAAACAGGGATATGTGGCGCAATCTCATCTGTCGATAAATGTCAGCTCGGTGGATAAGATTATAACACATGTACGTTCGTTAGTATAAAGGGTATATATGCTCTAGTTTTTTGGACGGCAGGGGCACCAATGTCCCAACAGTATGACG (((.(((.((((((((((((((.((((((((((((.((((((((((((((((((((((....(((((..(((....(((((((..(.(((((.(((((((((...........))))))))).))))).)..)))))))..))).)))))....))))))))))))))))))))))..)))))))))))).)))))))))))))).))).))).. 1572 1746 TGACCTTGTCGTCCATAAACTAGAGCATATATGCCCTTCACTCTAACTAAACAGGGATATGTGGCGCAATCTCATCTGTCGATAAATGTCAGCTCGGTGGATAAGATTATAACACATGTACGTTCGTTAGTATAAAGGGTATATATGCTCTAGTTTTTTGGACGGCAGGGGCACC ((.((((((((((((.((((((((((((((((((((((....(((((..(((....(((((((..(.(((((.(((((((((...........))))))))).))))).)..)))))))..))).)))))....))))))))))))))))))))))..)))))))))))).)).. Spi-miRN3070b 1572 1592 TTTTTGGACGGCAGGGGCACC Spi-miRN3070b* 1726 1746 TGACCTTGTCGTCCATAAACT 3 Spi-MIRN3070c PmiREN019817 MIRN3070 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01273187.1 723 943 - TCGTACTTTTGAGACATTAATCCCTCTGTCGTCTAAAAACTAGAGCATATACACCCTTTATACTAACGGACATACATATATCATAATATTATCCACTGATCCGATATTTATCGACGGATAAGATTGTGTCACGTGTCCCTAGTTAGTCTTTCGTTAGAGTGAAGGACATATATACTCTAGTTTTTGGACGGCAGGGGCACCAATGTCCCAAAAGTATGACG (((((((((((.((((((....(((((((((((((((((((((((.(((((...(((((((.((((((((.............((((......(((((((.((((.((((((....)))))))))).)))).)))......))))....)))))))).)))))))...))))).)))))))))))))))))))))))....)))))).))))))))))).. 743 923 TCCCTCTGTCGTCTAAAAACTAGAGCATATACACCCTTTATACTAACGGACATACATATATCATAATATTATCCACTGATCCGATATTTATCGACGGATAAGATTGTGTCACGTGTCCCTAGTTAGTCTTTCGTTAGAGTGAAGGACATATATACTCTAGTTTTTGGACGGCAGGGGCACC ..(((((((((((((((((((((((.(((((...(((((((.((((((((.............((((......(((((((.((((.((((((....)))))))))).)))).)))......))))....)))))))).)))))))...))))).))))))))))))))))))))))).... Spi-miRN3070c 743 763 TTTTTGGACGGCAGGGGCACC Spi-miRN3070c* 903 923 TCCCTCTGTCGTCTAAAAACT 3 Spi-MIRN3070d PmiREN019819 MIRN3070 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01306842.1 446 670 - TCATACTTTTGAGACATTGATCCCCCTGTCGTCCAAAAACTAGAGTATATATATATACCCTTTATAATAACGGACATAAATGTATCATAATATTATCCACTGATCCGATATTTATTGACGCATAAGATTGTGTCACGTGTCCCTAGTTAGTGTTTCGTTAGACTGAAGGGCATATCTGCTTTAGTTTTTGGACGGCAGGGGCACCAATGTCCCAAAAGTATGAAG (((((((((((.(((((((...(((((((((((((((((((((((((...((((...(((((((...(((((((....(((((......)))))...(((((((..(((((....(((((((......))))))).)))))....))))))).)))))))...))))))).)))).)))))))))))))))))))))))))...))))))).))))))))))).. 466 650 TCCCCCTGTCGTCCAAAAACTAGAGTATATATATATACCCTTTATAATAACGGACATAAATGTATCATAATATTATCCACTGATCCGATATTTATTGACGCATAAGATTGTGTCACGTGTCCCTAGTTAGTGTTTCGTTAGACTGAAGGGCATATCTGCTTTAGTTTTTGGACGGCAGGGGCACC ..(((((((((((((((((((((((((...((((...(((((((...(((((((....(((((......)))))...(((((((..(((((....(((((((......))))))).)))))....))))))).)))))))...))))))).)))).))))))))))))))))))))))))).... 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Spi-miRN3139 14386 14407 ATATACAAATTTCTGCTCATTT Spi-miRN3139* 14520 14540 CTTAGCAGGTTTGTATGTGGG 3 Spi-MIRN3142 PmiREN019800 MIRN3142 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01231550.1 3424 3509 - TTTGTAAAAAGTATGGGGATGAAGTCTAATCCAACCTAGACTTCTCTAGACCTTGGGTGGACTCATTTAGACTTCTTATACTCACG .........(((((((((((((.(((((.(((((.(((((....)))))...))))))))))))))).......)))))))).... 3444 3489 GAAGTCTAATCCAACCTAGACTTCTCTAGACCTTGGGTGGACTCAT ((.(((((.(((((.(((((....)))))...)))))))))))).. Spi-miRN3142 3444 3465 TCTAGACCTTGGGTGGACTCAT Spi-miRN3142* 3469 3489 GAAGTCTAATCCAACCTAGAC 3 Spi-MIRN3148a PmiREN019796 MIRN3148 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01109374.1 59 146 - TGTGTATAGAGGTCTGAAGGGTAGGAGATTCCTAATTGTCATAGATGATATTTGGAGTACTGAGGCATGGGACCAAATGCAAAGAATA ..........(((((.(...((...(((((((.((.(((((....))))).))))))).))...)).).))))).............. 79 126 GTAGGAGATTCCTAATTGTCATAGATGATATTTGGAGTACTGAGGCAT ((...(((((((.((.(((((....))))).))))))).))...)).. Spi-miRN3148a 79 99 ATATTTGGAGTACTGAGGCAT Spi-miRN3148a* 106 126 GTAGGAGATTCCTAATTGTCA 3 Spi-MIRN3148b PmiREN019824 MIRN3148 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01095813.1 397 484 - TGTGTATAGAGGTCTGAAGGGTAGGAGATTCCTAATTGTCATAGATGATATTTGGAGTACTGAGGCATGGGACCAAATGCAAAGAATA ..(((((...(((((.(...((...(((((((.((.(((((....))))).))))))).))...)).).)))))..)))))....... 417 464 GTAGGAGATTCCTAATTGTCATAGATGATATTTGGAGTACTGAGGCAT ((...(((((((.((.(((((....))))).))))))).))...)).. Spi-miRN3148b 417 437 ATATTTGGAGTACTGAGGCAT Spi-miRN3148b* 444 464 GTAGGAGATTCCTAATTGTCA 3 Spi-MIRN3152a PmiREN019801 MIRN3152 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01287344.1 780 1045 + GGTGTCTATGGGGCCCACTGATGTTGAGAAGGCAGAGCTGGCTTTCTACCAGCTCAAGGATGTTGCACAGACTTGGTGCAAGATGTGGCAAGATAGACGTGTCTTAGGTGGAGTGAGAGTCACATGAGAGCTGCTCAAGACAACATTTCTGGAGAGATTCTTCCCAAGAGAGATGAGGAAGGCCAAGGTTCAGGAGTTCATCAACCTTAAACAAGGCTCTATGACGGTAAATGAGTATTCCTTGAAGTTT (.((((.((((((((...(((.((((((((..(.(((((((((((((..((((((.......((((((.......)))))).(((((((((((((....)))))).............)))))))..))))))..........(((((((((((......))))....))))))).))))))))..)))))..)..))).))))).))).....)))))))))))).)...................... 800 1025 TGTCTATGGGGCCCACTGATGTTGAGAAGGCAGAGCTGGCTTTCTACCAGCTCAAGGATGTTGCACAGACTTGGTGCAAGATGTGGCAAGATAGACGTGTCTTAGGTGGAGTGAGAGTCACATGAGAGCTGCTCAAGACAACATTTCTGGAGAGATTCTTCCCAAGAGAGATGAGGAAGGCCAAGGTTCAGGAGTTCATCAACCTTAAACAAGGCTCTATGACGGT ((((.((((((((...(((.((((((((..(.(((((((((((((..((((((.......((((((.......)))))).(((((((((((((....)))))).............)))))))..))))))..........(((((((((((......))))....))))))).))))))))..)))))..)..))).))))).))).....)))))))))))).) 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Spi-miRN3152b 717 738 TTAAACAAGGCTCTATGACGGT Spi-miRN3152b* 628 648 TGTCACATGGGAGCTGTTTAA 3 Spi-MIRN3246 PmiREN019797 MIRN3246 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01160274.1 4574 4796 - ACTTATTGACTGTGAATTGTGATGCTCCTTGTTCCCCAATTTTCCTGGATGCCAACATTATCATTCTGCAGAGCATCTCTTTTTGTCTCATCTTTACCTGAATTTTGATACCATCCAGATATGTGCGCTTTCTCAAGATACAACGACATACCCGAGAACAGTGTAACCTCACAAGTGGGGTATGGGGAGGGTGGTGTGTACGCAACCTTACCCCTACATTTAT ...........((((.(((((((((.((.(.(((((((......(((((((.....((((..((((....(((((........)).)))..........))))..))))..))))))).....(((((((((((...................))))).))))))((((((....)))))).))))))).).)).)))).)))))..))))............ 4594 4776 GATGCTCCTTGTTCCCCAATTTTCCTGGATGCCAACATTATCATTCTGCAGAGCATCTCTTTTTGTCTCATCTTTACCTGAATTTTGATACCATCCAGATATGTGCGCTTTCTCAAGATACAACGACATACCCGAGAACAGTGTAACCTCACAAGTGGGGTATGGGGAGGGTGGTGTGTACGC (((((.((.(.(((((((......(((((((.....((((..((((....(((((........)).)))..........))))..))))..))))))).....(((((((((((...................))))).))))))((((((....)))))).))))))).).)).)))).).. 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Spi-miRN3247 3049 3069 ACACGTAGGATACCCTTGGGA Spi-miRN3247* 2871 2891 CCAAGGGTATCCTACATGTTG 3 Spi-MIRN3248 PmiREN019803 MIRN3248 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01013578.1 7937 8060 + ATCTTTGTAATGAGTTCCAATTCCCTACCATATTGCCAAATATTTGCCTTTATCTTTGTGTTCATCTAGCTAAAGACAAATGTTTGGCAATATGGTAGGGGATTCTGGTCTTCTGTACACAGGG .(((.((((..(((..((((((((((((((((((((((((((((((.(((((.((.((....))...)).))))).)))))))))))))))))))))))))))..)))..)))..)))).))). 7957 8040 TTCCCTACCATATTGCCAAATATTTGCCTTTATCTTTGTGTTCATCTAGCTAAAGACAAATGTTTGGCAATATGGTAGGGGATT ((((((((((((((((((((((((((.(((((.((.((....))...)).))))).)))))))))))))))))))))))))).. 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Spi-miRN3249 161 181 TTGGATCACAATACTAAGTCC Spi-miRN3249* 340 360 ACTTAGTATTGTGATTTAAAA 3 Spi-MIRN3250 PmiREN019806 MIRN3250 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01136380.1 4445 4563 - AAAACAGATGCCTAATCTGAACTCATCTACCCCAAATAAAGCAAGCAGTTTTACTAGGTCCTAGTAAAGCTGCTTGCTTTATTTGGGGTAGATGAGCTCAGGTTGGTGTTTTTATTTGA ((((((.....(((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))....... 4465 4543 ACTCATCTACCCCAAATAAAGCAAGCAGTTTTACTAGGTCCTAGTAAAGCTGCTTGCTTTATTTGGGGTAGATGAGCTC .((((((((((((((((((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))))))))))))))))))... Spi-miRN3250 4465 4485 TTATTTGGGGTAGATGAGCTC Spi-miRN3250* 4523 4543 ACTCATCTACCCCAAATAAAG 3 Spi-MIRN3251a PmiREN019807 MIRN3251 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01148863.1 3 125 - CATACTCAGGTATTGTCTCTGCCATGGGCGTCCATTCGCTCTTTTAATCCCCTCTTGTTGGCTCGCAGCCTCAAGAGAGAATCGAACCCGTGACCTATGGCTCCTTTACATCCCTCCCAAGGA ....................((((((((((....((((.(((.........((((((..((((...)))).)))))))))..))))....)).)))))))).............(((...))) 23 105 GCCATGGGCGTCCATTCGCTCTTTTAATCCCCTCTTGTTGGCTCGCAGCCTCAAGAGAGAATCGAACCCGTGACCTATGGCTC ((((((((((....((((.(((.........((((((..((((...)))).)))))))))..))))....)).)))))))).. 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Spi-miRN3251b 2936 2956 CGAACCCGTGACCTATGGCTC Spi-miRN3251b* 2873 2893 GCCATGGGTGGCCATTCGCTC 3 Spi-MIRN3252 PmiREN019808 MIRN3252 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01149811.1 1535 1721 - CTTCAAAACTTTGTATTAGGTTGGAAGAGAACAAAGGATCTCATATGTTGGATCAAAGTATATTTAATAGGGAAAATACACAAGTACCCCTAGACTATGACCGGAATCTCAGAGACACACCTTAACTATTTTAAGGTCCTATTATCCTTCTGAACTTTTTTTTAATTTAGTGCACCTTTTTGGCTTA ..((((((...(((((((((((((((((((.(((((((((((.....((((.(((.(((........(((((....(((....))).))))).))).))))))).......)))....(((((((.....)))))))......)))))).))...)))))))))))))))))))...)))))).... 1555 1701 TTGGAAGAGAACAAAGGATCTCATATGTTGGATCAAAGTATATTTAATAGGGAAAATACACAAGTACCCCTAGACTATGACCGGAATCTCAGAGACACACCTTAACTATTTTAAGGTCCTATTATCCTTCTGAACTTTTTTTTAATT ((((((((((.(((((((((((.....((((.(((.(((........(((((....(((....))).))))).))).))))))).......)))....(((((((.....)))))))......)))))).))...)))))))))).. Spi-miRN3252 1681 1701 TTGGAAGAGAACAAAGGATCT Spi-miRN3252* 1555 1575 CTTCTGAACTTTTTTTTAATT 3 Spi-MIRN3253 PmiREN019811 MIRN3253 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01190545.1 1374 1589 + TTGAAGGGAACTTTGTGAAGAGAAAATGGATTATGGGAGTGTGTGAGTTGAACTATCGATTGGTCTGTGTAGATATACGCCTTCCACATGGGAATTCACAATCAAATGTGTCTCTTTGTTCCAATCGCCGTGTAACCCTATACAGAGGATAGGCTGGTTCGCTTAAAGAGAATCTTTTCTATAATCCGAATCATGTTGCACATGAGCAGGTTCCAT ......(((((((((((((.(.....(((((((((((((.(..(((((.((((((((.(((..(((((((((.(((((((.....(((.((((...((((......))))))))..))).......).))))))...))))))))).))).)).)))))))))))........).))))))))))))).....).)).)))).....))))))).. 1394 1569 AGAAAATGGATTATGGGAGTGTGTGAGTTGAACTATCGATTGGTCTGTGTAGATATACGCCTTCCACATGGGAATTCACAATCAAATGTGTCTCTTTGTTCCAATCGCCGTGTAACCCTATACAGAGGATAGGCTGGTTCGCTTAAAGAGAATCTTTTCTATAATCCGAATCATGT (.....(((((((((((((.(..(((((.((((((((.(((..(((((((((.(((((((.....(((.((((...((((......))))))))..))).......).))))))...))))))))).))).)).)))))))))))........).))))))))))))).....).. Spi-miRN3253 1394 1413 AGAAAATGGATTATGGGAGT Spi-miRN3253* 1549 1569 TTTCTATAATCCGAATCATGT 3 Spi-MIRN3254 PmiREN019813 MIRN3254 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01026678.1 11 186 - GTCTATGATGTGAGGAACCAAACAAGTAGAGTTGAACTGGTAATGAGAATACTGAATGTCATGCGACCTGTTTCTCTTCATTCTTCATGTGAGACCTGGGCCTGGTTTTCATGACATTCAGTATTCTCTTTACCAGTTCAACTCTACTTTTTTTTAGTTCCTCACATCATAGACTT ((((((((((((((((((.(((.((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((.((((.(((((((..(((.....))).))))....)))..))))..))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))...))).)))))))))))))))))).. 31 166 AACAAGTAGAGTTGAACTGGTAATGAGAATACTGAATGTCATGCGACCTGTTTCTCTTCATTCTTCATGTGAGACCTGGGCCTGGTTTTCATGACATTCAGTATTCTCTTTACCAGTTCAACTCTACTTTTTTTTA ((.((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((.((((.(((((((..(((.....))).))))....)))..))))..))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))...)).. Spi-miRN3254 146 166 AACAAGTAGAGTTGAACTGGT Spi-miRN3254* 31 51 GTTCAACTCTACTTTTTTTTA 3 Spi-MIRN3255 PmiREN019815 MIRN3255 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01218909.1 269 394 + GTCATATCTTTACATGGTGTCATAAGATATGACATCTGAGCCCAACTCATCCCAAGAGTTAGCTTTTGCCTTTTAGGGTTGAGTTAGGCCCAAGTGTCATATCTTTACAACACCCACTTCACGCCC .......................((((((((((((.((.(((.((((((.((((((((...((....))))))).))).)))))).))).)).))))))))))))..................... 289 374 TAAGATATGACATCTGAGCCCAACTCATCCCAAGAGTTAGCTTTTGCCTTTTAGGGTTGAGTTAGGCCCAAGTGTCATATCTTTAC .((((((((((((.((.(((.((((((.((((((((...((....))))))).))).)))))).))).)).))))))))))))... Spi-miRN3255 289 309 TAAGATATGACATCTGAGCCC Spi-miRN3255* 354 374 GCCCAAGTGTCATATCTTTAC 3 Spi-MIRN3256 PmiREN019821 MIRN3256 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01061594.1 208 317 - TACTGGTTGTTTTTCTGGTGTTAGTAGATTGTTAACATATAAATTGATTGATTATATTGAAGGTTTAGATGGTATTAATGATCACTCAACAGAGCATGAAGTGCAACATT .............((((.((..(((.((((((((((((.((((((..(((((...))))).)))))).)))...)))))))))))))).))))((((...))))...... 228 297 TTAGTAGATTGTTAACATATAAATTGATTGATTATATTGAAGGTTTAGATGGTATTAATGATCACTCAAC ..(((.((((((((((((.((((((..(((((...))))).)))))).)))...)))))))))))).... Spi-miRN3256 277 297 TTAGTAGATTGTTAACATATA Spi-miRN3256* 228 248 TGGTATTAATGATCACTCAAC 3 Spi-MIRN3257 PmiREN019823 MIRN3257 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01070890.1 1577 1698 + TTCTGAGATTCAGTTGATTTCTCAGGTGCTCACTCAGCTAATAGTTATTATTTAAGAAACTCAATAATATTGGCAGCAAGGAGAATGGTGACTTTCAGGATGATAACTATTGGCTGAGTGAGCATCAC ..((((((.((....))..))))))((((((((((((((((((((((((((((..((((.(((......(((....))).........))).)))).))))))))))))))))))))))))))))... 1597 1696 TGCTCACTCAGCTAATAGTTATTATTTAAGAAACTCAATAATATTGGCAGCAAGGAGAATGGTGACTTTCAGGATGATAACTATTGGCTGAGTGAGCATC (((((((((((((((((((((((((((..((((.(((......(((....))).........))).)))).)))))))))))))))))))))))))))). Spi-miRN3257 1676 1696 ACTATTGGCTGAGTGAGCATC Spi-miRN3257* 1597 1617 TGCTCACTCAGCTAATAGTTA 3 Spi-MIRN3258 PmiREN019960 MIRN3258 Solanum pimpinellifolium Spi-AGFK01158013.1 176 343 + CACCTGGTGGTTGTTTTCTTGGAGAGTTTGTTGTTTCATTTTTATTACTTTGTTGGCGTTTTCAGTTTTGTTTGGTCTGATTTTAATGTAGAGAACAATCAATGGAGCCAACTGATGTTGCAGTCTCTGAAGACCAACAGCTCTCTGCTGACCCTCTGCCTTTTGCAA ....................((((((((.(((((((((........((((.((((((...((((...((((((..((((.........))))))))))....)))))))))).)).)).........)))))..))))))))))))...................... 196 323 GGAGAGTTTGTTGTTTCATTTTTATTACTTTGTTGGCGTTTTCAGTTTTGTTTGGTCTGATTTTAATGTAGAGAACAATCAATGGAGCCAACTGATGTTGCAGTCTCTGAAGACCAACAGCTCTCTGC ((((((((.(((((((((........((((.((((((...((((...((((((..((((.........))))))))))....)))))))))).)).)).........)))))..)))))))))))).. Spi-miRN3258 303 323 TGAAGACCAACAGCTCTCTGC Spi-miRN3258* 196 216 GGAGAGTTTGTTGTTTCATTT 3