miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Ptr-MIR156a PmiREN017455 MIR156 Populus trichocarpa Ptr-Chr06 20084147 20084271 - GAGGGACACAAAAGAAAGACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACACGAAAGTATATGGTATGAAGGCATTCCATTGCAGGGTGTGTGCTCACATCTCTTCTGTCAGCTTCCACTTCCAAGTGTTTCC ..(((((((..(((.(((.(((((((((((((((((((((((((....(((.((((.(((....))).)))))))...)))))))))))).))))))))))))))))...)))....))).)))) 20084167 20084251 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACACGAAAGTATATGGTATGAAGGCATTCCATTGCAGGGTGTGTGCTCACATCTCTTCTGTCAGC ((((((((((((((((((((((((....(((.((((.(((....))).)))))))...)))))))))))).)))))))))))).. 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Ptr-miR157b 4939251 4939271 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Ptr-miR157b* 4939313 4939333 GCTCTCTATGCTTCTGCCATC 3 Ptr-MIR157c PmiREN017466 MIR157 Populus trichocarpa Ptr-Chr15 4226988 4227111 - AGGAGGCACTGGTGATGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGATATGCAATGGACTCTGCATCCCACTCCTTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCACTTTCAGCCCCGAGCCCCTC ..((((..(((((((...((.(((((((((((((((((((((((.((((..(((((........)))))..)).)).)))))))))))))).))))))))).))...))).))...))..)))) 4227008 4227091 TTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGATATGCAATGGACTCTGCATCCCACTCCTTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCA .(((((((((((((((((((((((.((((..(((((........)))))..)).)).)))))))))))))).)))))))))... 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Ptr-miR157e 34292489 34292511 TTGACAGAAGATGGAGAGCAC Ptr-miR157e* 34292561 34292581 GTTTTCTTTTCTTCTTTAAAC 2 Ptr-MIR159a PmiREN017468 MIR159 Populus trichocarpa Ptr-Chr12 4736152 4736351 - GGTGATGGATTAGGGAGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGTTCTTGCTGGGTAGATTAAGCTGCTAAGCTATGGATCCACAGTCCTATCTATCAACCGAAGGATAGGTTTGCGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTATTGCCTAATGTTAGATCCCTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTAAACCCATAACCCCTTCAAC .((((.((.((((((..(((((((((((..(((((((.(((((.(((.(((((((((...(((((.((.((.((((.(.((.(((.(((((((.((....)).))))))).))).))..).)))).)).)).)))))..)))))))..)).)))..))))))))))))..)))))))))))..))).))).))..)).)) 4736172 4736331 AGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGTTCTTGCTGGGTAGATTAAGCTGCTAAGCTATGGATCCACAGTCCTATCTATCAACCGAAGGATAGGTTTGCGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTATTGCCTAATGTTAGATCCCTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCT ((((((((..(((((((.(((((.(((.(((((((((...(((((.((.((.((((.(.((.(((.(((((((.((....)).))))))).))).))..).)))).)).)).)))))..)))))))..)).)))..))))))))))))..)))))))).. 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Ptr-miR169a 80810 80830 CAGCCAAGGATGACTTGCCGA Ptr-miR169a* 80682 80702 GGCAAGTTGTCCATGGCTACA 3 Ptr-MIR169b PmiREN017522 MIR169 Populus trichocarpa Ptr-Chr13 4599485 4599619 + AGGATCATAAAGATTGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGACGACTCGTTTTTGCTTTCATCAATATACGCATAATTAAGAAGAGATGAATCCGTTGGCAGGTTGTTCTTGGCTACATTTTTCTTTCTGCTCCTCA ((((.((.(((((..((((.(((((((((((((((((((((((.((((((((.(((....................))).)))))))).).)))))))))))))))))))))).))))..))))).)).)))).. 4599505 4599599 AGCCAAGGATGACTTGCCGACGACTCGTTTTTGCTTTCATCAATATACGCATAATTAAGAAGAGATGAATCCGTTGGCAGGTTGTTCTTGGCTAC (((((((((((((((((((((((.((((((((.(((....................))).)))))))).).)))))))))))))))))))))).. 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Ptr-miR169e 5569980 5570000 CAGCCAAGGATGACTTGCCGG Ptr-miR169e* 5570109 5570129 GGCAAGCTGTCCTTGGCTATG 3 Ptr-MIR169f PmiREN017526 MIR169 Populus trichocarpa Ptr-Chr17 10307084 10307346 + GGAATGGGGTTTATGTGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGAATAAGCTATGATCAATAGCTATAGCTATGGTATTTTTCATCCTAGGTTTGGCTATATATATATATATATATAGCCAGTTAATTGCTATAAATCTCAGCACATTTATGTTTTATATGTCTGCACACAGACACACACATCATTGAATGTTGATGTTCCACCTCCTATGATCAGTAGTCAATCGGCAAGTCATCTCTGGCTACTCAACT ......((((...........(((((.((((((((((((((.....(((((((((((((((....)))))((..........)).(((((((((((((((((....))))))))))))).....((((.........))))...............((((((....))))))...((((((........))))))...))))....)))))).))))...)))))))))))))).))))))))).... 10307104 10307326 CAGCCAAGGATGACTTGCCGGAATAAGCTATGATCAATAGCTATAGCTATGGTATTTTTCATCCTAGGTTTGGCTATATATATATATATATATAGCCAGTTAATTGCTATAAATCTCAGCACATTTATGTTTTATATGTCTGCACACAGACACACACATCATTGAATGTTGATGTTCCACCTCCTATGATCAGTAGTCAATCGGCAAGTCATCTCTGGCTACT .(((((.((((((((((((((.....(((((((((((((((....)))))((..........)).(((((((((((((((((....))))))))))))).....((((.........))))...............((((((....))))))...((((((........))))))...))))....)))))).))))...)))))))))))))).)))))... 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Ptr-miR172h 3423705 3423725 GGAATCTTGATGATGCTGCAG Ptr-miR172h* 3423604 3423624 GGAGCACCATCAAGATTCACA 3 Ptr-MIR319a PmiREN017564 MIR319 Populus trichocarpa Ptr-Chr01 7572687 7572893 + ATGATAATTAATAGCTAAGAGAGCTTTCTTCAGTCCACTCATGGGTGGTAGTAGGATTTAATTAGCTGCCGACTCATTCATCCAAATACTGAGTTAAAGGACAAGGAGATTACCCAGTAAATGAGTGAATGATGCGGGAGACAAATTGAATCCTAAGCTTCCTGTACTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTTCCTTTTATACTATGTAT ((((((..(((.((..(((.(((((((((((((((((...(((((.(((..((((((((((((.(((.(((..((((((((.((..(((((.((.................)).)))))..)).))))))))..))).)).).)))))))))))).))).)))))...))))))))))))))))).)))..)).)))...))).))) 7572707 7572873 GAGCTTTCTTCAGTCCACTCATGGGTGGTAGTAGGATTTAATTAGCTGCCGACTCATTCATCCAAATACTGAGTTAAAGGACAAGGAGATTACCCAGTAAATGAGTGAATGATGCGGGAGACAAATTGAATCCTAAGCTTCCTGTACTTGGACTGAAGGGAGCTCCC (((((((((((((((((...(((((.(((..((((((((((((.(((.(((..((((((((.((..(((((.((.................)).)))))..)).))))))))..))).)).).)))))))))))).))).)))))...))))))))))))))))).. 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Ptr-miR319b 15437973 15437992 TTGGACTGAAGGGAGCTCCC Ptr-miR319b* 15437829 15437849 GAGCTTTTTTCGGTCCACTTA 3 Ptr-MIR319c PmiREN017567 MIR319 Populus trichocarpa Ptr-Chr19 15787364 15787575 + TCATGAAAAATGGTTTAACAGAGCTTCCTTCAGTCCACTCATGGACGGGCGAAGGGTTTGGATTAGCTGCCGACTCATTCATTCAAACACAGTAGACAAGGAGTGGCAGCGGCTGCTATTGTGAATGTGTGAATGACGCGGGAGATTAATTTCATCCTTTTCTTCTCTGTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTTAATTGTTTATTCACGAT ((.((((((((((((.((..(((((((((((((((((..((((((.(((.(((((((..(((((((((.(((..((((((((.((..((((((((.((.(..((....))..)))))))))))..)).))))))))..))).)).))))))).))))))).))).))))))..)))))))))))))))))..)).)))))))).)))).)). 15787384 15787555 GAGCTTCCTTCAGTCCACTCATGGACGGGCGAAGGGTTTGGATTAGCTGCCGACTCATTCATTCAAACACAGTAGACAAGGAGTGGCAGCGGCTGCTATTGTGAATGTGTGAATGACGCGGGAGATTAATTTCATCCTTTTCTTCTCTGTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCC (((((((((((((((((..((((((.(((.(((((((..(((((((((.(((..((((((((.((..((((((((.((.(..((....))..)))))))))))..)).))))))))..))).)).))))))).))))))).))).))))))..))))))))))))))))).. Ptr-miR319c 15787536 15787555 TTGGACTGAAGGGAGCTCCC Ptr-miR319c* 15787384 15787404 GAGCTTCCTTCAGTCCACTCA 3 Ptr-MIR390a PmiREN017571 MIR390 Populus trichocarpa Ptr-Chr01 28885475 28885617 + CAAGTACGGGAGAATCTGTTAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGAGCATGACAAAGTCTATGTTTGAGTTAATCTCAACAAAATCAATCCAGTCATCAGTGGCGCTATCTATCCTGAGTTCTATGGGTTCTCCTTACTATTCT ..((((.((((((((((((..(((((((((.((((((((((((..(.(((((........((((.(((.....)))))))...........)))))).)))))))))))).)))))))))..))))))))))))))))..... 28885495 28885597 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGAGCATGACAAAGTCTATGTTTGAGTTAATCTCAACAAAATCAATCCAGTCATCAGTGGCGCTATCTATCCTGAGTTCTA .(((((((((.((((((((((((..(.(((((........((((.(((.....)))))))...........)))))).)))))))))))).)))))))))... 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Ptr-miR396d 4870874 4870894 TTCCACAGCTTTCTTGAACTT Ptr-miR396d* 4870769 4870789 GCTCAAGAAAGCCGTGGGAGA 3 Ptr-MIR396e PmiREN017591 MIR396 Populus trichocarpa Ptr-Chr18 14916692 14916860 - CGCAAGTCCTGGTCATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTTGCCTTGCTTAATCTGTGTATATATAGATCACTACATGTACAGCTCCTATATATATAAATATATGTATGTATAGCGCCATGGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAGAACATGGCAATTCAGGATTTT ....(((((((((((((.(((((((((((((((((((.(((((.((..............(((((((.(((....))).)))))))((..(((((((((((......))))))))))).)))).))))).))))))))))))))))))).))))))....))))))).. 14916712 14916840 TTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTTGCCTTGCTTAATCTGTGTATATATAGATCACTACATGTACAGCTCCTATATATATAAATATATGTATGTATAGCGCCATGGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAGA (((((((((((((((((.(((((.((..............(((((((.(((....))).)))))))((..(((((((((((......))))))))))).)))).))))).))))))))))))))))).. Ptr-miR396e 14916820 14916840 TTCCACAGCTTTCTTGAACTT Ptr-miR396e* 14916712 14916731 CTCAAGAAAGCTGTGGGAGA 3 Ptr-MIR396f PmiREN017592 MIR396 Populus trichocarpa Ptr-Chr06 26064831 26064983 - TATATGGGTCTCTTGGTGATTTTCCACGGCTTTCTTGAACTGTATATATTATCAATGGCTTTTTACAAGACTGGAAGATGGTTTCCATGGAGAAGAATTGTCACAAAAACAGTTCAAGAAAGCCCTGAAAAATTATTTAGAGGATCTAGTTTA ...............((((((((.((.((((((((((((((((.........((((..((((((.((....((((((....)))))))))))))).))))........)))))))))))))))).)).))))))))................. 26064851 26064963 TTTCCACGGCTTTCTTGAACTGTATATATTATCAATGGCTTTTTACAAGACTGGAAGATGGTTTCCATGGAGAAGAATTGTCACAAAAACAGTTCAAGAAAGCCCTGAAAAAT (((.((.((((((((((((((((.........((((..((((((.((....((((((....)))))))))))))).))))........)))))))))))))))).)).))).. Ptr-miR396f 26064943 26064963 TTTCCACGGCTTTCTTGAACT Ptr-miR396f* 26064851 26064871 TTCAAGAAAGCCCTGAAAAAT 3 Ptr-MIR396g PmiREN017593 MIR396 Populus trichocarpa Ptr-Chr07 9144001 9144192 + ACTAAGGTCGTTGCATGCTTTTCCACGGCTTTCTTGAACTTGGCACTCAAGAGACATGAGAGTAAAGGGCTAGGCTTTCTTTTCTATTCCTTTCGTTCTTTGAAATTTTCCTGTTCAAAGAATCCATACATATCAGTCTCTTTAGTACAAAGCTCAAGAAAGCCGTGGGAAAATATGAAAGGATTTTGTGGT ..(((((((.((.((((.(((((((((((((((((((.(((.(.(((.(((((((.(((..((((((((.((((........)))).)))))..((((((((((.........))))))))))...)))...)))))))))).))).).))).))))))))))))))))))).)))).)).))))))).... 9144021 9144172 TTCCACGGCTTTCTTGAACTTGGCACTCAAGAGACATGAGAGTAAAGGGCTAGGCTTTCTTTTCTATTCCTTTCGTTCTTTGAAATTTTCCTGTTCAAAGAATCCATACATATCAGTCTCTTTAGTACAAAGCTCAAGAAAGCCGTGGGAAA (((((((((((((((((.(((.(.(((.(((((((.(((..((((((((.((((........)))).)))))..((((((((((.........))))))))))...)))...)))))))))).))).).))).))))))))))))))))).. Ptr-miR396g 9144021 9144041 TTCCACGGCTTTCTTGAACTT Ptr-miR396g* 9144152 9144172 GCTCAAGAAAGCCGTGGGAAA 3 Ptr-MIR397a PmiREN017595 MIR397 Populus trichocarpa Ptr-Chr11 3507389 3507532 + CTTCCTGGATTGGAGAACCATCATTGAGTGCAGCGTTGATGAAATCCTCCATTTTGTGCTATTAAACTGTTACCAACCCTTTATGGGGCATGGCATCATTTCACCAGCGCTGCATTCAATCATGTTTTTCTAACTCTTCCGGGC ...((((((((((((((.(((.((((((((((((((((.((((((...(((...(((.((((.(((..(((...)))..))))))).))))))....)))))).)))))))))))))))).))).))))))))....)))))). 3507409 3507512 TCATTGAGTGCAGCGTTGATGAAATCCTCCATTTTGTGCTATTAAACTGTTACCAACCCTTTATGGGGCATGGCATCATTTCACCAGCGCTGCATTCAATCATG (.((((((((((((((((.((((((...(((...(((.((((.(((..(((...)))..))))))).))))))....)))))).)))))))))))))))).).. 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Ptr-miR397b 2366382 2366402 ATTGAGTGCAGCGTTGATG Ptr-miR397b* 2366455 2366475 CACCAGCGCTGCATTCAACCA 2 Ptr-MIR398 PmiREN017597 MIR398 Populus trichocarpa Ptr-Chr10 16666839 16666966 + GACAGCCGGTACACCCCAGAGGAGTGGCTCCAGAGAACACAGGGGGTTGGTTTTCTAGCTGTAAGCTACAAGATGGACAAAGCACTCTGTGTTCTCAGGTCACCCCTTTGGGGCACCCTGTGGAGATG .((((..(((...(((((((((.((((((...((((((((((((((((.(((((.(((((...))))).))))).)))....).)))))))))))).)))))).))))))))).)))))))....... 16666859 16666946 GGAGTGGCTCCAGAGAACACAGGGGGTTGGTTTTCTAGCTGTAAGCTACAAGATGGACAAAGCACTCTGTGTTCTCAGGTCACCCCTT ((.((((((...((((((((((((((((.(((((.(((((...))))).))))).)))....).)))))))))))).)))))).)).. 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Ptr-miR477a 13184583 13184603 ATCTCCCTCAGAGGCTTCCAA Ptr-miR477a* 13184521 13184541 GGATGCCTTTGGGGGAGATTG 3 Ptr-MIR477b PmiREN017614 MIR477 Populus trichocarpa Ptr-Chr12 13189157 13189279 - AATGGTTGGAGAAGCTCCCAATCTCCCTCAGAGGCTTCCAATATCTCAGTTTATAGTAATTGCTTCAAATAATGAGAATGTTGGATGCCTTTGGGTGAGATTGAGAGCTTACTCCCCATGACT .((((..((((((((((.(((((((.(((((((((.((((((((((((((((..(((....)))..))))..)))).)))))))).))))))))).))))))).)))))).)))))))).... 13189177 13189259 ATCTCCCTCAGAGGCTTCCAATATCTCAGTTTATAGTAATTGCTTCAAATAATGAGAATGTTGGATGCCTTTGGGTGAGATTG (((((.(((((((((.((((((((((((((((..(((....)))..))))..)))).)))))))).))))))))).))))).. Ptr-miR477b 13189239 13189259 ATCTCCCTCAGAGGCTTCCAA Ptr-miR477b* 13189177 13189197 GGATGCCTTTGGGTGAGATTG 3 Ptr-MIR477c PmiREN017615 MIR477 Populus trichocarpa Ptr-Chr15 12442192 12442305 - AATGGTTGGAGAAGCTCCCAACTCCCTCAAAGGTTTCCAGCATCACATAATTGCTTCAAGTAATGGGAATGTTGGAAACCTTTTGTGGGGGTTTGAGAGCTTACTCCCCATGAC .((((..(((((((((((.(((((((.((((((((((((((((..(...((((((...)))))).)..)))))))))))).)))).))))))).).)))))).))))))))... 12442212 12442285 ACTCCCTCAAAGGTTTCCAGCATCACATAATTGCTTCAAGTAATGGGAATGTTGGAAACCTTTTGTGGGGGTTT ((((((.((((((((((((((((..(...((((((...)))))).)..)))))))))))).)))).)))))).. Ptr-miR477c 12442265 12442285 ACTCCCTCAAAGGTTTCCAGC Ptr-miR477c* 12442212 12442232 GGAAACCTTTTGTGGGGGTTT 3 Ptr-MIR477d PmiREN017616 MIR477 Populus trichocarpa Ptr-Chr15 12599969 12600077 + CATGGATGGAGAAGCTTCCGATCTCCCTCAAAGGCTTCCTCTATAATTGCCTTACATGATGGCATTAGTGGACTCCTTTGGGGAGATGGAGAGCTTACTCCCCATAACT .((((..((((((((((.(.(((((((.((((((..(((.(((....((((.........)))).))).)))..))))))))))))).).)))))).)))))))).... 12599989 12600057 ATCTCCCTCAAAGGCTTCCTCTATAATTGCCTTACATGATGGCATTAGTGGACTCCTTTGGGGAGATGG (((((((.((((((..(((.(((....((((.........)))).))).)))..))))))))))))).. 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Ptr-miR477e 7573984 7574004 ACTCTCCCTCAAGGCTTCCAA Ptr-miR477e* 7574051 7574072 TGAGGCCTTTGGGGGAGAGTGG 3 Ptr-MIR482 PmiREN017619 MIR482 Populus trichocarpa Ptr-Chr17 13392511 13392621 + GAGACCTACTGGAAGTTGTGGGCATGAGGTGTTTGGCAAGAAAATGGATCTTTTCCTTATGATGATTTCTTACCAATACCTCTCATGCCAATGATTTCCAGCAGTTCCTCC (.......((((((((..(.(((((((((.((((((.((((((..(((.....))).........)))))).)))).)).))))))))).)..))))))))))))..)))) 13392531 13392601 GGCATGAGGTGTTTGGCAAGAAAATGGATCTTTTCCTTATGATGATTTCTTACCAATACCTCTCATGCCAA (((((((((.((((((.((((((..(((.....))).........)))))).)))).)).))))))))).) 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Ptr-miR1446b 13184379 13184399 TTCTGAACTCTCTCCCTCAAC Ptr-miR1446b* 13184311 13184331 CGAGGTGAGGGGTTCAGAACA 3 Ptr-MIR1446c PmiREN017450 MIR1446 Populus trichocarpa Ptr-Chr12 13298934 13299064 + AATGTTGGAAATCCAACTTTTTCTGAACTCTCTCCCTCAACTGCTATTCTAGAGCTTCCTGAGCTAACCCTTGTGTTTCTGTGTAGCAGTCAAGGTGGGAGGCTCAGAAAATGTTGGTTTCTTAGCTTTTC ((.((((((((.(((((.((((((((.(.((((((((..((((((((..((((((((...)))).............)))).))))))))..))).)))))).)))))))).))))))))).))))..)). 13298954 13299044 TTCTGAACTCTCTCCCTCAACTGCTATTCTAGAGCTTCCTGAGCTAACCCTTGTGTTTCTGTGTAGCAGTCAAGGTGGGAGGCTCAGAAAA ((((((.(.((((((((..((((((((..((((((((...)))).............)))).))))))))..))).)))))).)))))).. 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Ptr-miR1446d 12442055 12442075 TTCTGAACTCTCTCCCTCAAC Ptr-miR1446d* 12441985 12442005 CGAGGTGAGAGGTTCAGGAAA 3 Ptr-MIR1446e PmiREN017452 MIR1446 Populus trichocarpa Ptr-Chr15 12601739 12601871 + AATGTTGGTGATCCAACTTTTTCTGAACTCTCTCCCTCAACTGCTATTCTAGAGCTTGTTAATCCTTGTCAAGTGTTTCCCTGTAGCAGTCGAGGCGAGGGGGTTTCGGAAAATGTTGGCTCCTCAGCTCTTA ...(((((.((.(((((.((((((((((((((((((((.((((((((......(((((...........)))))........)))))))).)))).))))))).))))))))).))))).)).)))))..... 12601759 12601851 TTCTGAACTCTCTCCCTCAACTGCTATTCTAGAGCTTGTTAATCCTTGTCAAGTGTTTCCCTGTAGCAGTCGAGGCGAGGGGGTTTCGGAAAA ((((((((((((((((((.((((((((......(((((...........)))))........)))))))).)))).))))))).))))))).. Ptr-miR1446e 12601759 12601779 TTCTGAACTCTCTCCCTCAAC Ptr-miR1446e* 12601831 12601851 AGGCGAGGGGGTTTCGGAAAA 3 Ptr-MIR1447 PmiREN017453 MIR1447 Populus trichocarpa Ptr-Chr13 15189752 15189889 + GTGAACGAAGGAGGTCCTAATCAGGGCACTGCAATTCTAAATGTCTGTTGGCAAGTGGCGATGCCAGACGTTTGAAATTTACTTATCATTTATTAGTCAGAATTGCAGTGCCTTGATTTGGGCTTTGTCTGTTCCTGT ..........(((((((.((((((((((((((((((((((((((((...((((........)))))))))))).........................)))))))))))))))))))).)))))))............ 15189772 15189869 TCAGGGCACTGCAATTCTAAATGTCTGTTGGCAAGTGGCGATGCCAGACGTTTGAAATTTACTTATCATTTATTAGTCAGAATTGCAGTGCCTTGATT ((((((((((((((((((((((((((...((((........)))))))))))).........................)))))))))))))))))).. Ptr-miR1447 15189849 15189869 CAGAATTGCAGTGCCTTGATT Ptr-miR1447* 15189772 15189792 TCAGGGCACTGCAATTCTAAA 3 Ptr-MIR1450 PmiREN017454 MIR1450 Populus trichocarpa Ptr-Chr04 22273475 22273621 - TCAATTAGGTCAGTTGTGTAGTCTGACCCGAGCCATTGAAGACAATCATTTGTTGGTGTCTCATTGGATTTGTTACCTGACAGTGTTTATCCAACAAATGATTCTCTTCAATGGCTCGGTCAGGTTACACAAGCAATCTAGTTGGCT ((((((((((...(((((((..((((((.(((((((((((((.(((((((((((((.....(((((..............))))).....))))))))))))).)))))))))))))))))))..)))))))...)))))))))))) 22273495 22273601 GTCTGACCCGAGCCATTGAAGACAATCATTTGTTGGTGTCTCATTGGATTTGTTACCTGACAGTGTTTATCCAACAAATGATTCTCTTCAATGGCTCGGTCAGGTTA ..((((((.(((((((((((((.(((((((((((((.....(((((..............))))).....))))))))))))).)))))))))))))))))))..)) 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Ptr-miR6429 25404292 25404314 TAGTAGAAATGCATTGACTAG Ptr-miR6429* 25404371 25404391 AGTCAATGCATCACTGCTAGC 2 Ptr-MIR6431 PmiREN017629 MIR6431 Populus trichocarpa Ptr-Chr01 49797386 49797483 - GATTTTGATTCTTTTATGTGGCATAAAAGAATCAAAATCGAGTTGGAATCTACCAATTTGATTTTGATTCTTTTATGCCCATAATAAAATCAACGGTC ((((((((((...(((((.(((((((((((((((((((((((((((......))))))))))))))))))))))))))))))))...)))))).)))) 49797399 49797471 TTATGTGGCATAAAAGAATCAAAATCGAGTTGGAATCTACCAATTTGATTTTGATTCTTTTATGCCCATAATA (((((.(((((((((((((((((((((((((((......)))))))))))))))))))))))))))))))).. 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Ptr-miRN2838 16551894 16551914 CTTAGAAGTAGAGACAGGATT Ptr-miRN2838* 16551835 16551855 GCCTGTCTCTACTTCTAAGGC 3 Ptr-MIRN2839 PmiREN017710 MIRN2839 Populus trichocarpa Ptr-Chr06 27326848 27326989 + TTTGACAACTTTCATTTTTGAGCAAAAATCAAACACCACTTTAAACCATCAGCTCTGATACCAATTGTTGGGGATTTCCGACTCCCCCATGCGCGGACCGGTGGTGTACTGATAATTGCTCAAAGGAGGCTAAGCACACTGA ................(((((((((..((((.((((((((.......((((....)))).((...(((.(((((........)))))...))).))...))))))))..))))..))))))))).................. 27326868 27326969 AGCAAAAATCAAACACCACTTTAAACCATCAGCTCTGATACCAATTGTTGGGGATTTCCGACTCCCCCATGCGCGGACCGGTGGTGTACTGATAATTGCTCA (((((..((((.((((((((.......((((....)))).((...(((.(((((........)))))...))).))...))))))))..))))..))))).. Ptr-miRN2839 27326949 27326969 TGGTGTACTGATAATTGCTCA Ptr-miRN2839* 27326868 27326888 AGCAAAAATCAAACACCACTT 3 Ptr-MIRN2840 PmiREN017715 MIRN2840 Populus trichocarpa Ptr-Chr05 13909871 13910101 + GACTCCACGTAAAATTGCAGCTCGATCCAACGGTCGAATTGAGAATTATGACTGTTGCTGTAAAACTGGATGGTTATTATGGACATGAATGTCTCAGGTTAGTATCTCAAACTCAGAATTGAATACAGCTCATTTGGAAGTTCATTTGCTTGCTGGTTAGAGAGTGGTGTTGTCGAAGATAAATCTCCTTTGTTCACCGTTGGATCGTCACCATGTTTTAGTATGTTGTTC ......((.((((((.......((((((((((((.((((.((((.(((((((..(((((.(..((((((..(((....((((((.((((((.....((((.((((.((((........))))))))))))))))))...))))))..)))..))))))..).)))))....)))....)))).))))....)))))))))))))))).......))))))))......... 13909891 13910081 CTCGATCCAACGGTCGAATTGAGAATTATGACTGTTGCTGTAAAACTGGATGGTTATTATGGACATGAATGTCTCAGGTTAGTATCTCAAACTCAGAATTGAATACAGCTCATTTGGAAGTTCATTTGCTTGCTGGTTAGAGAGTGGTGTTGTCGAAGATAAATCTCCTTTGTTCACCGTTGGATCGTCAC ..((((((((((((.((((.((((.(((((((..(((((.(..((((((..(((....((((((.((((((.....((((.((((.((((........))))))))))))))))))...))))))..)))..))))))..).)))))....)))....)))).))))....)))))))))))))))).... Ptr-miRN2840 13910060 13910081 TTGTTCACCGTTGGATCGTCAC Ptr-miRN2840* 13909891 13909911 CTCGATCCAACGGTCGAATTG 3 Ptr-MIRN2841 PmiREN017717 MIRN2841 Populus trichocarpa Ptr-Chr08 8166105 8166215 + GGGTTGCTGGGAGTTACGGGTATGGGAGGATTGGACAGTACTGCTTGGTTTTAATTAACCAAAGTCTGTTCTTTCCAACGCCTCCCATACCGGTAATCTCCAGCTGTTTCC (((..((((((.(((((.(((((((((((.(((((.((.((.((((((((......)))).))))..)).)).)))))..))))))))))).))))).))))))....))) 8166125 8166195 TATGGGAGGATTGGACAGTACTGCTTGGTTTTAATTAACCAAAGTCTGTTCTTTCCAACGCCTCCCATACC (((((((((.(((((.((.((.((((((((......)))).))))..)).)).)))))..))))))))).. Ptr-miRN2841 8166125 8166145 TATGGGAGGATTGGACAGTAC Ptr-miRN2841* 8166175 8166195 CTTTCCAACGCCTCCCATACC 3