miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Oru-MIR156a PmiREN013861 MIR156 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 4149490 4149617 - ACGGAGAAGCTCTCATGAGATTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCGTGATGGCCGGCATAAAATCTATCCCGTCCTCGCCGCGTGCTCACTCCTCTTTCTGTCACCCTCTTTCTCTCAGGGCTCAAC .....(.((((((...((((.((((((((((((((((((((.(((((.(((((..((........))...)))))..))))).))))))))).))).)))))))).......))))..))))))...) 4149510 4149597 TTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCGTGATGGCCGGCATAAAATCTATCCCGTCCTCGCCGCGTGCTCACTCCTCTTTCTGTCACCC .((((((((((((((((((((.(((((.(((((..((........))...)))))..))))).))))))))).))).))))))))... Oru-miR156a 4149577 4149597 TTGACAGAAGAGAGTGAGCAC Oru-miR156a* 4149510 4149530 TCACTCCTCTTTCTGTCACCC 3 Oru-MIR156b PmiREN013862 MIR156 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 23596083 23596212 + CGAGCATATGAAAGGCGAGATTGTTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCGCGGCGGCTAGCCATCGGCGGGATGCCTGCCCCCGCCGCGTGCTCGCTCCTCTTTCTGTCAGCATCTCTCATCACTCCCTC ................(((((.((((((((((((((((((((((.(((((.((.(((.((.((((.....)))).)))))))))))).))))))))).))).)))))))))))))))............. 23596103 23596192 TTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCGCGGCGGCTAGCCATCGGCGGGATGCCTGCCCCCGCCGCGTGCTCGCTCCTCTTTCTGTCAGCA (((((((((((((((((((((.(((((.((.(((.((.((((.....)))).)))))))))))).))))))))).))).))))))))))) Oru-miR156b 23596103 23596123 TTGACAGAAGAGAGTGAGCAC Oru-miR156b* 23596172 23596192 TCGCTCCTCTTTCTGTCAGCA 3 Oru-MIR156c PmiREN013863 MIR156 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 24397237 24397330 + GTCAAACCCCTTGAACTAGCTGACAGAAGAGAGAGAGCACGCTGAACATCTAGTGCTCCATCTAGTTTTGAAGCAGTTTCAGATGCATCTGCAC .............((((.(((..(((((.(((..((((((............))))))..)))..))))).)))))))................ 24397257 24397310 TGACAGAAGAGAGAGAGCACGCTGAACATCTAGTGCTCCATCTAGTTTTGAAGC (..(((((.(((..((((((............))))))..)))..))))).).. Oru-miR156c 24397257 24397276 TGACAGAAGAGAGAGAGCAC Oru-miR156c* 24397290 24397310 TGCTCCATCTAGTTTTGAAGC 3 Oru-MIR156d PmiREN013864 MIR156 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 19357208 19357431 + TTCTTGGTTTTGGGTGGTGGCAGTTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGGCCAGACTGCATCGATCTATCAATCTTCCCTTCGACAGGATAGCTAGATAGAAAGAAAGAGAGGCCGTCGGCGGCCATGGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGAAATGATGATGATGATACAGCTGCCGCTGCGTGCTCACTTCTCTTTCTGTCAGCTCTCCCTGCAGCATGCAC .....................(((((((((((((((((((((((.(((((((.((.(((((((..(((.((..((((..((((...((.....)).................(((((....)))))...)))).))))..)).)))..))))..((.((....)).)).)))))))))))).)))))))).)))).)))))))))))................. 19357228 19357411 TTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGGCCAGACTGCATCGATCTATCAATCTTCCCTTCGACAGGATAGCTAGATAGAAAGAAAGAGAGGCCGTCGGCGGCCATGGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGAAATGATGATGATGATACAGCTGCCGCTGCGTGCTCACTTCTCTTTCTGTCAGCT (((((((((((((((((((((.(((((((.((.(((((((..(((.((..((((..((((...((.....)).................(((((....)))))...)))).))))..)).)))..))))..((.((....)).)).)))))))))))).)))))))).)))).))))))))))) Oru-miR156d 19357228 19357248 TTGACAGAAGAGAGTGAGCAC Oru-miR156d* 19357391 19357411 TCACTTCTCTTTCTGTCAGCT 3 Oru-MIR156e PmiREN013865 MIR156 Oryza rufipogon Oru-HG417173.1 15870588 15870715 - CAGTTGAGACTTGAGAGTGATGACAGAAGAGAGAGAGCACAACCCGGCAGCAGCGACGACGGCGGTCGCTTCTGCCAGGGCCGTGTGCTCTCTGATCTATCTGTCATTGCCGTCCATCTCGCCACCCC ..(.(((((...((..((((((((((((((.((((((((((.((((((((.((((((.......)))))).))))).)))...))))))))))..))).)))))))))))..))..))))).)..... 15870608 15870695 TGACAGAAGAGAGAGAGCACAACCCGGCAGCAGCGACGACGGCGGTCGCTTCTGCCAGGGCCGTGTGCTCTCTGATCTATCTGTCATT ((((((((((.((((((((((.((((((((.((((((.......)))))).))))).)))...))))))))))..))).))))))).. Oru-miR156e 15870676 15870695 TGACAGAAGAGAGAGAGCAC Oru-miR156e* 15870608 15870628 CTCTCTGATCTATCTGTCATT 3 Oru-MIR156f PmiREN013866 MIR156 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 4275522 4275654 + AGAGGGGTGAGAGGTGAGGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGACTTTCTTGCATGCTGAATGGACTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCAGCCATTTGATCTCTCTTTCTCT .................((((((((((((((((((((((((((((((....(((..(((((..(......).)))))..)))))))))))))))))).))))).))))))))))................... 4275542 4275634 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGACTTTCTTGCATGCTGAATGGACTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCAGC (((((((((((((((((((((((((((....(((..(((((..(......).)))))..)))))))))))))))))).))))).))))))).. Oru-miR156f 4275542 4275561 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Oru-miR156f* 4275614 4275634 CTCACTTCTCTCTCTGTCAGC 3 Oru-MIR156g PmiREN013867 MIR156 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 4275914 4276041 + CTCTATGGGTTTTGGAGGTCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACACGGTGCTTTCTTAGCATGCAAGAGCCATGCTGGGAGCTGTGCGTGCTCACTCTCTATCTGTCAGCCGTTCACCATGCCCAATATG (....(((((..((((((.(((((((((((((((((((((.((((((....(((((((((((....).)))))))))))))))).))))))))))))).)))))))))).))))....)))))....) 4275934 4276021 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACACGGTGCTTTCTTAGCATGCAAGAGCCATGCTGGGAGCTGTGCGTGCTCACTCTCTATCTGTCAGC ((((((((((((((((((((.((((((....(((((((((((....).)))))))))))))))).))))))))))))).))))))).. Oru-miR156g 4275934 4275953 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Oru-miR156g* 4276001 4276021 GCTCACTCTCTATCTGTCAGC 3 Oru-MIR156h PmiREN013868 MIR156 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 20366509 20366639 - ATCTACTCGTACTAGGAGGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGTGGTTGTTTCCTTGCATAAATGATGCCTATGCTTGGAGCTACGCGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCACCTCCACCCCTTTTATCTCTCT ..............(((((.((((((((((((((((((((.((((((....(((..(((((.........)))))..))))))))).)))))))).))))).))))))))))))................. 20366529 20366619 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACGTGGTTGTTTCCTTGCATAAATGATGCCTATGCTTGGAGCTACGCGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCACC ((((((((((((((((((((.((((((....(((..(((((.........)))))..))))))))).)))))))).))))).))))))).. Oru-miR156h 20366600 20366619 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Oru-miR156h* 20366529 20366549 CTCACTTCTCTCTCTGTCACC 3 Oru-MIR156i PmiREN013869 MIR156 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 22621599 22621726 - CCGGTGCGGGCGCTGGGCGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCCGGGCGGAACGGCACCGGCGGATGTGCCGTCGCGGCCGCGTGCTCACTGCTCTGTCTGTCATCCACTCCTCTCCCACCCCCTT ..................((((((((((((((((((((((.((((((.(....(((((((........)))))))).)))))).))))))))).)))).))))))))).................... 22621619 22621706 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCCGGGCGGAACGGCACCGGCGGATGTGCCGTCGCGGCCGCGTGCTCACTGCTCTGTCTGTCATC ((((((((((((((((((((.((((((.(....(((((((........)))))))).)))))).))))))))).)))).))))))).. Oru-miR156i 22621687 22621706 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Oru-miR156i* 22621619 22621639 CTCACTGCTCTGTCTGTCATC 3 Oru-MIR156j PmiREN013870 MIR156 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 20906767 20906894 - GGCGGGCCGGTGGCGCGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCCGGGCGTGACGGCACCGGCGGGCGTGCCGTCGCGGCCGCGTGCTCACTGCTCTTTCTGTCATCCGGTGCCGGCCGTTTTCTCC .......(((((((((..((((((((((((((((((((((.(((((....(((((((((((.....).))))))))))))))).))))))))).))).))))))))))..))))).))))........ 20906787 20906874 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCCGGGCGTGACGGCACCGGCGGGCGTGCCGTCGCGGCCGCGTGCTCACTGCTCTTTCTGTCATC ((((((((((((((((((((.(((((....(((((((((((.....).))))))))))))))).))))))))).))).)))))))).. Oru-miR156j 20906855 20906874 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Oru-miR156j* 20906787 20906807 CTCACTGCTCTTTCTGTCATC 3 Oru-MIR156k PmiREN013871 MIR156 Oryza rufipogon Oru-HG417173.1 12888346 12888497 + CGATGGCGGTGGCCGCGGCTGGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGGGCAGACTGCATCTGAATTACCTGTTGCGACGAAGAAGACGACGGACGCAGCTTGCCGTTGCGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCAGCTCTCTCTCTCTCTCTCT ....................(((((((((((((((((((((((.((((((..((.((((.((((.........(((...))).........)))).))))))..)))))).)))))))).))))).))))))))))................ 12888366 12888477 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGGGCAGACTGCATCTGAATTACCTGTTGCGACGAAGAAGACGACGGACGCAGCTTGCCGTTGCGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCAGC ((((((((((((((((((((.((((((..((.((((.((((.........(((...))).........)))).))))))..)))))).)))))))).))))).))))))))) Oru-miR156k 12888366 12888385 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Oru-miR156k* 12888457 12888477 CTCACTTCTCTCTCTGTCAGC 3 Oru-MIR156l PmiREN016159 MIR156 Oryza rufipogon Oru-HG417169.1 4675959 4676136 + GAACAAAAGAGCTAGGGAGCCGACAGAAGAGAGTGAGCATATATAGTTCTTTCCTTGCATATGTGGTCATATGTGTGTTGACTGAAGAGATACATATATATAGAGAGAGAGAGTTCATGTGCTTGAAGCTATATGTGCTCACTTCTCTTTCTGTCAGCAAATTATCTCCCTCCCTCTC .....................((((((((((((((((((((((((((...(((...(((((((.(.(((((((((((((.........)))))))))))...........)).).)))))))..)))))))))))))))))).)))).)))))))....................... 4675979 4676116 CGACAGAAGAGAGTGAGCATATATAGTTCTTTCCTTGCATATGTGGTCATATGTGTGTTGACTGAAGAGATACATATATATAGAGAGAGAGAGTTCATGTGCTTGAAGCTATATGTGCTCACTTCTCTTTCTGTCAGC .((((((((((((((((((((((((((...(((...(((((((.(.(((((((((((((.........)))))))))))...........)).).)))))))..)))))))))))))))))).)))).)))))))... Oru-miR156l 4675979 4675999 CGACAGAAGAGAGTGAGCATA Oru-miR156l* 4676095 4676116 GCTCACTTCTCTTTCTGTCAGC 3 Oru-MIR159a PmiREN013872 MIR159 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 6201390 6201606 - GAAGCGATCGATGGATGGAAGAGAGCGTCCTTCAGTCCACTCATGGGCGGTGCTAGGGTCGAATTAGCTGCCGACTCATTCACCCACATGCCAAGCAAGAAACGCTTGAGATAGCGAAGCTTAGCAGATGAGTGAATGAAGCGGGAGGTAACGTTCCGATCTCGCGCCGTCTTTGCTTGGACTGAAGGGTGCTCCCTCCTCCTCGATCTCTTCGATC ((((.((((((.(((.(((.(.(((((((((((((((((..((.(((((((((..(((((((((((.((.(((..((((((((.((..(((.((((......((((......))))..)))).)))..)).))))))))..))).)).))..))).)))))).))))))))).))..)))))))))))))))))).)))))))))))).)))).... 6201410 6201586 GAGAGCGTCCTTCAGTCCACTCATGGGCGGTGCTAGGGTCGAATTAGCTGCCGACTCATTCACCCACATGCCAAGCAAGAAACGCTTGAGATAGCGAAGCTTAGCAGATGAGTGAATGAAGCGGGAGGTAACGTTCCGATCTCGCGCCGTCTTTGCTTGGACTGAAGGGTGCTCCCT (.(((((((((((((((((..((.(((((((((..(((((((((((.((.(((..((((((((.((..(((.((((......((((......))))..)))).)))..)).))))))))..))).)).))..))).)))))).))))))))).))..)))))))))))))))))).. Oru-miR159a 6201410 6201430 TTGGACTGAAGGGTGCTCCCT Oru-miR159a* 6201566 6201586 GAGAGCGTCCTTCAGTCCACT 3 Oru-MIR159b PmiREN013873 MIR159 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 6216932 6217135 + AGGGGAGAAGAAGAAGAAGACGAGCTCCCTTCGATCCAATCCAGGAGAGGAAGTGGTAGGATGCAGCTGCCGGTTCATGGATACCTCTGCAGTGCATGTCGTAGGCTTGCACTTGCATGGGTTTGCATGACCCGGGAGATGAACCCACCATTGTCTTCCTCTTATGCTTGGATTGAAGGGAGCTCTACACCTCTCTCTCTCTCT ..........((((((((((.((((((((((((((((((..((.(((((((((((((.((...((.((.((((.(((((.(.((((.(((((((((.(((...))).))))).)))).)))).).))))).)))).)).))...))))))....))))))))).)).))))))))))))))))))......))).))).))).) 6216952 6217115 AGCTCCCTTCGATCCAATCCAGGAGAGGAAGTGGTAGGATGCAGCTGCCGGTTCATGGATACCTCTGCAGTGCATGTCGTAGGCTTGCACTTGCATGGGTTTGCATGACCCGGGAGATGAACCCACCATTGTCTTCCTCTTATGCTTGGATTGAAGGGAGCTCT (((((((((((((((((..((.(((((((((((((.((...((.((.((((.(((((.(.((((.(((((((((.(((...))).))))).)))).)))).).))))).)))).)).))...))))))....))))))))).)).)))))))))))))))))). Oru-miR159b 6217096 6217115 CTTGGATTGAAGGGAGCTCT Oru-miR159b* 6216952 6216972 AGCTCCCTTCGATCCAATCCA 3 Oru-MIR159c PmiREN013874 MIR159 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 6086794 6086998 - CTTGCTGTGATGTGAGGAGGAGCTCCTTTCGATCCAATTCAGGAGAGGAAGTGGTGGGATGCAGCTGCCGGTTCATGGATACCTCTGCAGTTCATGCCGGTAGGCCTGCACTTGCATGGGTTTGCATGACCTGGGAGATGAACCTGCCATTGTGTTCCTCTATTGATTGGATTGAAGGGAGCTCCGGCTACACCTATCTCTCTCA (.......)..(((((..((((((((((((((((((((.(((.(((((((((((((((.(.((.((.((((.(((((.(.((((.((((((.((.(((....))).)).)).)))).)))).).))))).)))).)).))).))))))))....))))))).)))))))))))))))))))))))..)).)))............ 6086814 6086978 AGCTCCTTTCGATCCAATTCAGGAGAGGAAGTGGTGGGATGCAGCTGCCGGTTCATGGATACCTCTGCAGTTCATGCCGGTAGGCCTGCACTTGCATGGGTTTGCATGACCTGGGAGATGAACCTGCCATTGTGTTCCTCTATTGATTGGATTGAAGGGAGCTCC ((((((((((((((((((.(((.(((((((((((((((.(.((.((.((((.(((((.(.((((.((((((.((.(((....))).)).)).)))).)))).).))))).)))).)).))).))))))))....))))))).))))))))))))))))))))).. Oru-miR159c 6086814 6086833 ATTGGATTGAAGGGAGCTCC Oru-miR159c* 6086958 6086978 AGCTCCTTTCGATCCAATTCA 3 Oru-MIR159d PmiREN013875 MIR159 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 1098503 1098708 + TGCGTTTTGGTTATGAAGTGGAGCTCCTTTCGTTCCAATGAAAGGTTTATCTGAAGGGTGATACAGCTGCTTGTTCATGGTTCCCACTATTCTATCTCATAGGAAAAGAGATAGGCTTGTGGTTTGCATGACCAAGGAGCCGAATCAACTCCTTGCTAACCACTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCATCTTGATCCCATATAGTA ........(((((.((.(((((((((((((((.(((((.((..((((......(((((((((.(.(((.((((.(((((....((((...((((((((.........))))))))...))))....))))).)))).))).).))).)).))))...))))..)).))))).))))))))))))))).)).))))).......... 1098523 1098688 GAGCTCCTTTCGTTCCAATGAAAGGTTTATCTGAAGGGTGATACAGCTGCTTGTTCATGGTTCCCACTATTCTATCTCATAGGAAAAGAGATAGGCTTGTGGTTTGCATGACCAAGGAGCCGAATCAACTCCTTGCTAACCACTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTG ((((((((((((.(((((.((..((((......(((((((((.(.(((.((((.(((((....((((...((((((((.........))))))))...))))....))))).)))).))).).))).)).))))...))))..)).))))).)))))))))))).. Oru-miR159d 1098668 1098688 TTTGGATTGAAGGGAGCTCTG Oru-miR159d* 1098523 1098543 GAGCTCCTTTCGTTCCAATGA 3 Oru-MIR160a PmiREN013876 MIR160 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 3235380 3235503 - TTCAGAAGCTGTGTAGTGTGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACACATGTAGACCAACCCATGGTGTCTGGTTGCCTACTGGGTGGCGTGCAAGGAGCCAAGCATGCATGCCTGCCTGCATATGGT ...............((((((((.(((((((.((((((((((.(..((((..(((((..........))))).))))..))))))))))).))))))).))))))))....(((.......))) 3235400 3235483 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACACATGTAGACCAACCCATGGTGTCTGGTTGCCTACTGGGTGGCGTGCAAGGAGCCAAGCATG (((.(((((((.((((((((((.(..((((..(((((..........))))).))))..))))))))))).))))))).))).. Oru-miR160a 3235463 3235483 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Oru-miR160a* 3235400 3235420 GCGTGCAAGGAGCCAAGCATG 3 Oru-MIR160b PmiREN013877 MIR160 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 30774193 30774364 + GAGGTGAAAAAAAGGGGATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTCGCGTAGCTGCCAAACTCAGTTGAAACAACTGCCTTCTCCCGGCGAGATTCAGGCATTGTGTTCGTACGTTTGGCTCTACTGCGGATGGCGTGCGAGGAGCCAAGCATGACCGTCTCTCTCTGTCTCTA ....(((.....(((((((((((.(((((((.(((((((((.((((((((..(((((((...((((((((((.(((((((((.....))))...))))))))).)))).))))))))).)))).)))).))))))))).))))))).))))....))).)))).....)).) 30774213 30774344 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTCGCGTAGCTGCCAAACTCAGTTGAAACAACTGCCTTCTCCCGGCGAGATTCAGGCATTGTGTTCGTACGTTTGGCTCTACTGCGGATGGCGTGCGAGGAGCCAAGCATG (((.(((((((.(((((((((.((((((((..(((((((...((((((((((.(((((((((.....))))...))))))))).)))).))))))))).)))).)))).))))))))).))))))).))).. Oru-miR160b 30774213 30774233 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Oru-miR160b* 30774324 30774344 GCGTGCGAGGAGCCAAGCATG 3 Oru-MIR160c PmiREN013878 MIR160 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 25109756 25109879 + TTTTGATCGGCTTGAGAGCGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTCATGTAGCCCAATCCATGGTGTGTTTGGATGCTGTGGGTGGCGTGCAAGGAGCCAAGCATGCGTGCCATGATCTCTCTTTC .................((((((.(((((((.((((((((((((((..(((...(((((.........)))))))))))))))))))))).))))))).))))))................... 25109776 25109859 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTCATGTAGCCCAATCCATGGTGTGTTTGGATGCTGTGGGTGGCGTGCAAGGAGCCAAGCATG (((.(((((((.((((((((((((((..(((...(((((.........)))))))))))))))))))))).))))))).))).. Oru-miR160c 25109776 25109796 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Oru-miR160c* 25109839 25109859 GCGTGCAAGGAGCCAAGCATG 3 Oru-MIR160d PmiREN013879 MIR160 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 1565309 1565437 + AGGTGATGATATTGGGAATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTCATCTAGAGCAACAAACTTCTGCGAGAGGTTGCCTATGATGGATGGCGTGCACGGAGCCAAGCATATTCCCTCCTATTTTCCAACC .(((((.((((..((((((((((.(((((((.(((((((((.((((((((.(((((...(((....)))..)))))))).))))).))))))))).))))))).))))))))))...)))).))..))) 1565329 1565417 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTCATCTAGAGCAACAAACTTCTGCGAGAGGTTGCCTATGATGGATGGCGTGCACGGAGCCAAGCATA (((.(((((((.(((((((((.((((((((.(((((...(((....)))..)))))))).))))).))))))))).))))))).))).. Oru-miR160d 1565329 1565349 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Oru-miR160d* 1565397 1565417 GCGTGCACGGAGCCAAGCATA 3 Oru-MIR160e PmiREN013880 MIR160 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 22051084 22051205 + GTAGGAGATGGGATTAACGCTGCCTGGCTCCCTGAATGCCATCCGAGAAGCGTGCCGCTGTGGCCGGCTGCTTCCTGGTTGGCATTGAGGGAGTCATGCAGGGTTTGCTCATTTCCATCTAC ((.(((((((((...(((.((((.(((((((((.(((((((.(((.((((((.(((((....).)))))))))).))).))))))).))))))))).)))).)))..))))))))))).... 22051104 22051185 TGCCTGGCTCCCTGAATGCCATCCGAGAAGCGTGCCGCTGTGGCCGGCTGCTTCCTGGTTGGCATTGAGGGAGTCATGCAGG (((.(((((((((.(((((((.(((.((((((.(((((....).)))))))))).))).))))))).))))))))).))).. Oru-miR160e 22051104 22051124 TGCCTGGCTCCCTGAATGCCA Oru-miR160e* 22051165 22051185 GCATTGAGGGAGTCATGCAGG 3 Oru-MIR160f PmiREN013881 MIR160 Oryza rufipogon Oru-HG417171.1 1950957 1951092 - TGATGAAAAGGTAGGGGATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCGCTCGCATGGCTGCCAACCCAATGAACTCGATCTCGTTGTTGGCCGCTGCGTACGGCGTGCGAGGTGCCAAGCATGGCCCTCTTCCCTTCTCTCTT .((.((.((((.(((((.(((((.((((.((.(((((((((..((((..((.((((((..(((((........))))))))))).))))))..))))))))).)).)))).)))))..)))))..)))).)))).. 1950977 1951072 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCGCTCGCATGGCTGCCAACCCAATGAACTCGATCTCGTTGTTGGCCGCTGCGTACGGCGTGCGAGGTGCCAAGCATG (((.((((.((.(((((((((..((((..((.((((((..(((((........))))))))))).))))))..))))))))).)).)))).))).. Oru-miR160f 1951052 1951072 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCG Oru-miR160f* 1950977 1950997 GCGTGCGAGGTGCCAAGCATG 3 Oru-MIR162a PmiREN013882 MIR162 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 20312466 20312617 + GATTTGTTTGGGTGATGCCTGGGCGCAGTGGTTTATCGATCTCTTCCCTGCCTTGTGCTGCTCCGATCGATGCCCGTGCTGATTCTTGATAATATACAACGCAGGAATCGATCGATAAGCCTCTGCATCCAGATCTCACTTTTTGTTTATGC (((......((((((...(((((.((((.((((((((((((..((((.(((.(((((....((.(((((..((....)))))))...)).....))))).)))))))..)))))))))))).)))).)))))...))))))...)))..... 20312486 20312597 GGGCGCAGTGGTTTATCGATCTCTTCCCTGCCTTGTGCTGCTCCGATCGATGCCCGTGCTGATTCTTGATAATATACAACGCAGGAATCGATCGATAAGCCTCTGCATCCAG (((.((((.((((((((((((..((((.(((.(((((....((.(((((..((....)))))))...)).....))))).)))))))..)))))))))))).)))).))).. Oru-miR162a 20312577 20312597 TCGATAAGCCTCTGCATCCAG Oru-miR162a* 20312486 20312506 GGGCGCAGTGGTTTATCGATC 3 Oru-MIR162b PmiREN016160 MIR162 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 22139609 22139801 + GGGGGTTGGTGGTGATGCCTGGGCGCAGTGGTTTATCGATCCCTTCCCTGCCTTGTGGCGCTGATCCAGGAGCGGCGAATTTCTTTGAGAGGGTGTTCTTTTTTTTTCTTCTTTTTGGTCCTTGTTGCAGCCAACGACAACGCGGGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAGTTCTCGCCTTTTTGTGTTCA ....................(((.((((.((((((((((((..(((((.((.((((.(.((((...(((((.(((.(((.......(((((....)))))........)))...))).))).))...))))...).)))).)))))))..)))))))))))).)))).)))...................... 22139629 22139781 GGGCGCAGTGGTTTATCGATCCCTTCCCTGCCTTGTGGCGCTGATCCAGGAGCGGCGAATTTCTTTGAGAGGGTGTTCTTTTTTTTTCTTCTTTTTGGTCCTTGTTGCAGCCAACGACAACGCGGGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAG (((.((((.((((((((((((..(((((.((.((((.(.((((...(((((.(((.(((.......(((((....)))))........)))...))).))).))...))))...).)))).)))))))..)))))))))))).)))).))).. Oru-miR162b 22139761 22139781 TCGATAAACCTCTGCATCCAG Oru-miR162b* 22139629 22139649 GGGCGCAGTGGTTTATCGATC 3 Oru-MIR164a PmiREN013883 MIR164 Oryza rufipogon Oru-HG417169.1 13517379 13517513 - TAGACGGTGGCCGTGCACGGTGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACCATCCACTCGCCTGCCGGCCGCCGGCCGCCATTGCCATGGATGGTTCTTCATGTGCCCGTCTTCTCCACCGAGCACCAACTGTCTCGATC .(((((((....((((.(((((((((((..(((((((((....((((((((...((.((.(((((...))))).))..))..))))))))....)))))))))..))))))))))).))))..)))))))..... 13517399 13517493 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACCATCCACTCGCCTGCCGGCCGCCGGCCGCCATTGCCATGGATGGTTCTTCATGTGCCCGTCTTCTCCACC ((((((((..(((((((((....((((((((...((.((.(((((...))))).))..))..))))))))....)))))))))..)))))))).. Oru-miR164a 13517473 13517493 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Oru-miR164a* 13517399 13517419 CATGTGCCCGTCTTCTCCACC 3 Oru-MIR164b PmiREN013884 MIR164 Oryza rufipogon Oru-HG417169.1 20392925 20393123 + GAGGATGGCGAGGCGCGCGAGGTGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTCCTAGAGCTTCCGTCCAGCTCCCCGGCGGGCTAGCTAGCTCACTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGCGCACGGCTGGCTGGCTCCGGCCGGCTGAGATGCATGCACGGATGCATGTGCCCTTCTTCTCCACCGTGCACGCCTCGCCTGCA ......(((((((((.(((.((((((((((.(((((((((((((((.....((...(((((((((..((((..((((((((((((.....(((.((.((.((....)).)).)))))...))))))))))))))))..))))).))))...))..))))))))))))))).)))))))))).))).))))))))).... 20392945 20393103 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTCCTAGAGCTTCCGTCCAGCTCCCCGGCGGGCTAGCTAGCTCACTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGCGCACGGCTGGCTGGCTCCGGCCGGCTGAGATGCATGCACGGATGCATGTGCCCTTCTTCTCCACC ((((((((.(((((((((((((((.....((...(((((((((..((((..((((((((((((.....(((.((.((.((....)).)).)))))...))))))))))))))))..))))).))))...))..))))))))))))))).)))))))))) Oru-miR164b 20392945 20392965 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Oru-miR164b* 20393083 20393103 CATGTGCCCTTCTTCTCCACC 3 Oru-MIR164c PmiREN013885 MIR164 Oryza rufipogon Oru-HG417171.1 25009730 25009893 - AGCAGTGAGAAGGACCGCGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCATGCATATGTTCATCATCATCTTCTTCCTCCTCCTCTAGCTCCAGCCTTGTGTGGGTTGGAAGTTTAGATAGAACTCGCACTGCACGTGGTCTCCTTCTCCATCCCGGTCTTTTTCTCACTTTG ..(((((((((((((((.(.((((((((.(((.(((((((((((....(((((((......................(((((((((((.....))))))).))))..))).))))..))).)))))))).))).)))))))).).))))))..)))))))..)) 25009750 25009873 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCATGCATATGTTCATCATCATCTTCTTCCTCCTCCTCTAGCTCCAGCCTTGTGTGGGTTGGAAGTTTAGATAGAACTCGCACTGCACGTGGTCTCCTTCTCCATC ((((((((.(((.(((((((((((....(((((((......................(((((((((((.....))))))).))))..))).))))..))).)))))))).))).)))))))).. Oru-miR164c 25009853 25009873 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Oru-miR164c* 25009750 25009770 CACGTGGTCTCCTTCTCCATC 3 Oru-MIR164d PmiREN013886 MIR164 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 31296478 31296593 - GAGGGGTGAGCAAACCGTGCTGGAGAAGCAGGGCACGTGCTCGACGGCGGGGCTGGCTGGCCGGCCGGCTTGCAGCATGTGCGCTCCTTCTCCAGCATGGCTTCTCGCCCCGTCGA ..((((((((.((.((((((((((((((.((.((((((((((((((((.((.(.....).)).))))..))).))))))))).)).)))))))))))))).))))))))))..... 31296498 31296573 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCTCGACGGCGGGGCTGGCTGGCCGGCCGGCTTGCAGCATGTGCGCTCCTTCTCCAGC ((((((((.((.((((((((((((((((.((.(.....).)).))))..))).))))))))).)).)))))))).. Oru-miR164d 31296553 31296573 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCT Oru-miR164d* 31296498 31296518 CATGTGCGCTCCTTCTCCAGC 3 Oru-MIR164e PmiREN013887 MIR164 Oryza rufipogon Oru-HG417169.1 14850950 14851090 + ACAGGTGAGTAGGTTCTTGTTGGAGAAGCAGGGTACGTGCAAAATGCACACCGGTTGGTCGAGCTAATTAACAAGCTCTGACGACCATGGTGATCGAATGCACGTGCTCCCCTTCTCCACCATGGCCTTCTCACCTTCTTC ..(((((((.(((((..((.((((((((..(((((((((((...((..(((((((((.(((((((........))))).)))))))..))))..))..)))))))))))..)))))))).)).))))).)))))))..... 14850970 14851070 TGGAGAAGCAGGGTACGTGCAAAATGCACACCGGTTGGTCGAGCTAATTAACAAGCTCTGACGACCATGGTGATCGAATGCACGTGCTCCCCTTCTCCACC ((((((((..(((((((((((...((..(((((((((.(((((((........))))).)))))))..))))..))..)))))))))))..)))))))).. Oru-miR164e 14850970 14850990 TGGAGAAGCAGGGTACGTGCA Oru-miR164e* 14851050 14851070 CACGTGCTCCCCTTCTCCACC 3 Oru-MIR164f PmiREN013888 MIR164 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 10214167 10214320 + GTTGGTGTACTTGTGCAGGGTGGAGAAGCAGGGCACGTGAGCGGCCATCCAGTGTAGCTTCGCTGCGCGTCCATGGCGGCGAACGCGCGTGATCTGGAGTTTGGATGGTCGTTCATGTGTCCGTCTTCTCCACCGAGCACTGGCATATCCAAGA .(((((((.((.((((..((((((((((..((((((((((((((((((((((..(((..((((.((((((((.....))...)))))))))).)))....))))))))))))))))))))))..))))))))))..)))).)).))).)))).. 10214187 10214300 TGGAGAAGCAGGGCACGTGAGCGGCCATCCAGTGTAGCTTCGCTGCGCGTCCATGGCGGCGAACGCGCGTGATCTGGAGTTTGGATGGTCGTTCATGTGTCCGTCTTCTCCACC ((((((((..((((((((((((((((((((((..(((..((((.((((((((.....))...)))))))))).)))....))))))))))))))))))))))..)))))))).. Oru-miR164f 10214187 10214207 TGGAGAAGCAGGGCACGTGAG Oru-miR164f* 10214280 10214300 CATGTGTCCGTCTTCTCCACC 3 Oru-MIR166a PmiREN013889 MIR166 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 24467037 24467167 + GAAGCTTTTTCACTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTGCATGGAGAAACCTCTGATCGATCAGGTTTGATCTGTAGAGACTGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAAGTAAAGCTCCCATATT (.((((((...((((.((((((((((..((((((.(((((((.((.((((....))))((((((......)))))).........))))))))).))))))..)))))))))))))))))))).)...... 24467057 24467147 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTGCATGGAGAAACCTCTGATCGATCAGGTTTGATCTGTAGAGACTGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..((((((.(((((((.((.((((....))))((((((......)))))).........))))))))).))))))..)))))).. Oru-miR166a 24467127 24467147 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Oru-miR166a* 24467057 24467077 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG 3 Oru-MIR166b PmiREN013890 MIR166 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 28820432 28820536 - ATGATCCATGGCTGTTGAGAGGAATGACGTCCGGTCTGAAGATCGCCGTCCCCAGGCGGTGGCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCATGACTCATGGAACCCACAC ....(((((((..((((.(.(((((((.(((.(((((((((.((((((((....))))))))))))))))).))).))))))).).)))))))))))........ 28820452 28820516 GGAATGACGTCCGGTCTGAAGATCGCCGTCCCCAGGCGGTGGCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCC (((((((.(((.(((((((((.((((((((....))))))))))))))))).))).))))))).. Oru-miR166b 28820452 28820472 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Oru-miR166b* 28820496 28820516 GGAATGACGTCCGGTCTGAAG 3 Oru-MIR166c PmiREN013891 MIR166 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 3132905 3133044 + CATTTTTATGGCAGTTGAGGGGAATGTTGTCTGGTCCGAGACCTAACACCGGGCGGAATGGCGGATTCAGCTGCAGCTAAGCAAGCTAGGTGGGGGGTTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACTCAACTGTTTAGTTC ..........((((((((((((((((..((((((((((((((((..((((.(((.(..((((.............))))..)..))).))))..))))))))))))))))..)))))))).....))))))))....... 3132925 3133024 GGAATGTTGTCTGGTCCGAGACCTAACACCGGGCGGAATGGCGGATTCAGCTGCAGCTAAGCAAGCTAGGTGGGGGGTTTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..((((((((((((((((..((((.(((.(..((((.............))))..)..))).))))..))))))))))))))))..)))))).. Oru-miR166c 3133004 3133024 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Oru-miR166c* 3132925 3132945 GGAATGTTGTCTGGTCCGAGA 3 Oru-MIR166d PmiREN013892 MIR166 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 27113551 27113757 - GGAGCCTTTTCATTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGGGGCTACTTTTAATTTCTCTCTCTTTTGATATCTTCTTTTCTCGATCTCCTAGCTTGATCTTTTGATCTCTCAAATCGATCTTAAGAAAAAGATCAGTCAAAGAGATGAGAGTAGATGTCTGTAGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAAACAGAAGGGCTCCCAT ((((((((((...((((.((((((((..((((((.((((((((((.....(((((((((((((((((((((((..(((((.((((.........((((....)))).........))))...))))))))))..))).)))))).))))).))))....)))).)))))).))))))..)))))))).))))..))))))))))... 27113571 27113737 GGAATGTTGTCTGGCTCGGGGCTACTTTTAATTTCTCTCTCTTTTGATATCTTCTTTTCTCGATCTCCTAGCTTGATCTTTTGATCTCTCAAATCGATCTTAAGAAAAAGATCAGTCAAAGAGATGAGAGTAGATGTCTGTAGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..((((((.((((((((((.....(((((((((((((((((((((((..(((((.((((.........((((....)))).........))))...))))))))))..))).)))))).))))).))))....)))).)))))).))))))..)))))).. Oru-miR166d 27113571 27113591 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Oru-miR166d* 27113717 27113737 GGAATGTTGTCTGGCTCGGGG 3 Oru-MIR166e PmiREN013893 MIR166 Oryza rufipogon Oru-HG417174.1 17769322 17769470 + GAAGCTATTTGCTTCTGAGTGGAATGTTGTCTGGTTCAAGGTCTCATGCACCTTGCGGTTTTGAGGATGATCTGTGCAAGGTTTTTCATTCCTCTCATCCGTGGGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAGAGATAGCTTCAAAACA (((((((((....((((((.((((((..(((((((((.((((((((((((...)))((....(((((((((((.....)))....))).)))))....))))))))))).)))))))))..)))))).)))))))))))))))...... 17769342 17769450 GGAATGTTGTCTGGTTCAAGGTCTCATGCACCTTGCGGTTTTGAGGATGATCTGTGCAAGGTTTTTCATTCCTCTCATCCGTGGGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..(((((((((.((((((((((((...)))((....(((((((((((.....)))....))).)))))....))))))))))).)))))))))..)))))).. Oru-miR166e 17769430 17769450 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Oru-miR166e* 17769342 17769362 GGAATGTTGTCTGGTTCAAGG 3 Oru-MIR166f PmiREN013894 MIR166 Oryza rufipogon Oru-HG417176.1 15331349 15331507 + GGAAGGGAAGCATGGTGTCTGGAATGGAGGCTGATCCAAGATCCTTGCTTGGTGCAAAATACTAGGGCATTGTTGTAAGTGCCATTAGTTCTTTTTTGTTTCCGAGTTTGTTATCGAGGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCTCACACCGTGCTTCCCGT ...(((((((((((((((..(((((((((.(((.(((.((((((((((((((.((((((.(((((((((((......)))))).)))))....))))))..))))))........)))))))).))).))).)))))))))..)))))))))))))).) 15331369 15331487 AATGGAGGCTGATCCAAGATCCTTGCTTGGTGCAAAATACTAGGGCATTGTTGTAAGTGCCATTAGTTCTTTTTTGTTTCCGAGTTTGTTATCGAGGATCTCGGACCAGGCTTCATTCC (((((((.(((.(((.((((((((((((((.((((((.(((((((((((......)))))).)))))....))))))..))))))........)))))))).))).))).))))))))) Oru-miR166f 15331467 15331487 TCTCGGACCAGGCTTCATTCC Oru-miR166f* 15331369 15331389 AATGGAGGCTGATCCAAGATC 3 Oru-MIR166g PmiREN013895 MIR166 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 30519867 30520003 - TTGGCCATGGTGGCTTGTGGGGAATGTTGGCTGGCTCGAGGCATCCACATCTTAATTCCTCTCCGGCGATCGAGCCGGCTCGGGCGTGTGGAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCTCGCAAGCCGATGCATCCATGG ....((((((((((((((((((((((..(.((((.((((.((.(((((((......(((...(((((......)))))...))).))))))).)).)))).)))).)..))))))))))))))))......)))))) 30519887 30519983 GGAATGTTGGCTGGCTCGAGGCATCCACATCTTAATTCCTCTCCGGCGATCGAGCCGGCTCGGGCGTGTGGAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCTC ((((((..(.((((.((((.((.(((((((......(((...(((((......)))))...))).))))))).)).)))).)))).)..)))))).. Oru-miR166g 30519887 30519907 TCGGACCAGGCTTCATTCCTC Oru-miR166g* 30519963 30519983 GGAATGTTGGCTGGCTCGAGG 3 Oru-MIR166h PmiREN013896 MIR166 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 30519684 30519828 - TTGCTTGGATTAGGTTAAGGGGTTTGTTGTCTGGCTCGAGGCATCCGGGACTCCGGTTTCTCCTTTCCTACTGGAGGCGCCTAGCTTCCGGCGAACTCGGAGCCTCGGACCAGGCTTCAATCCCTTTAACCATGCGGCATATTGT ............((((((((((.(((..((((((.(((((((.((((((.(((((((............))))))).((((........))))..))))))))))))).))))))..))).)))))))))).............. 30519704 30519808 GGTTTGTTGTCTGGCTCGAGGCATCCGGGACTCCGGTTTCTCCTTTCCTACTGGAGGCGCCTAGCTTCCGGCGAACTCGGAGCCTCGGACCAGGCTTCAATCCCT ((.(((..((((((.(((((((.((((((.(((((((............))))))).((((........))))..))))))))))))).))))))..))).)).. Oru-miR166h 30519704 30519724 TCGGACCAGGCTTCAATCCCT Oru-miR166h* 30519788 30519808 GGTTTGTTGTCTGGCTCGAGG 3 Oru-MIR166i PmiREN013897 MIR166 Oryza rufipogon Oru-HG417173.1 14643254 14643388 + AGGCTGAAGTTAGGTTAAGGGGATTGTTGTCTGGTTCAAGGTCTCCACATTGTGCAAAATGTTCATTCATGGAGGCACAGGATGCTTGGTGATCTCGGACCAGGCTTCAATCCCTTTAACCAGCATCTGCACAAT ..((.((.(((.((((((((((((((..(((((((((.(((((.(((((((((((...(((......)))....)))))..)))..))).))))).)))))))))..))))))))))))))))).)).))..... 14643274 14643368 GGATTGTTGTCTGGTTCAAGGTCTCCACATTGTGCAAAATGTTCATTCATGGAGGCACAGGATGCTTGGTGATCTCGGACCAGGCTTCAATCCCT ((((((..(((((((((.(((((.(((((((((((...(((......)))....)))))..)))..))).))))).)))))))))..)))))).. Oru-miR166i 14643348 14643368 TCGGACCAGGCTTCAATCCCT Oru-miR166i* 14643274 14643294 GGATTGTTGTCTGGTTCAAGG 3 Oru-MIR166j PmiREN013898 MIR166 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 512408 512564 + GGAAGCTATTGTTTCTGGGTGGAATGTTGTCTGGTTCAAGGCCCCTTAGGATGTGTGATTTTTGATGGTTTATGCATTCATCTTGATGCGAACATCTATCTCGGATCTTTGGGTTCTCGAACCAGGCTTCATTCCCCTCAGAGATAGCTTTTCCATG .(((((((((...((((((.((((((..(((((((((.(((.(((..(((((.((.(((....((((.....((((((......))))))..)))).))).)).))))).))).))).)))))))))..)))))).)))))))))))))))...... 512428 512544 GGAATGTTGTCTGGTTCAAGGCCCCTTAGGATGTGTGATTTTTGATGGTTTATGCATTCATCTTGATGCGAACATCTATCTCGGATCTTTGGGTTCTCGAACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..(((((((((.(((.(((..(((((.((.(((....((((.....((((((......))))))..)))).))).)).))))).))).))).)))))))))..)))))).. Oru-miR166j 512524 512544 TCGAACCAGGCTTCATTCCCC Oru-miR166j* 512428 512448 GGAATGTTGTCTGGTTCAAGG 3 Oru-MIR166k PmiREN013899 MIR166 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 23878633 23878791 + TGAGAGAGATAGGTGTTTGGAATGCAGTTTGATCCAAGATCTGCCTATATATATGGTGTGTATATCATATCTTGTGATATGGGGGATATGCAACAGGTGTGTGACAGGGGTAGGTAGATCTCGGATCAGGCTTCATTCCTCACACCAATACTCTCTGTT ...(((((((.(((((..((((((.((((((((((.((((((((((((((((((....(((((((((((((....)))))....))))))))....)))))).......)))))))))))).)))))))))).))))))..))))).)).))))).... 23878653 23878771 AATGCAGTTTGATCCAAGATCTGCCTATATATATGGTGTGTATATCATATCTTGTGATATGGGGGATATGCAACAGGTGTGTGACAGGGGTAGGTAGATCTCGGATCAGGCTTCATTCC ((((.((((((((((.((((((((((((((((((....(((((((((((((....)))))....))))))))....)))))).......)))))))))))).)))))))))).)))).. Oru-miR166k 23878751 23878771 TCTCGGATCAGGCTTCATTCC Oru-miR166k* 23878653 23878673 AATGCAGTTTGATCCAAGATC 3 Oru-MIR166l PmiREN016161 MIR166 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 20833962 20834129 + CTGATGTTCTCGGTTAAGGGGTTTGTTGTCTGGTTCAAGGCCTCCTGCTGTCCTACATCACATTTTTTTTTCTTTGTTCTGAATTTCTGATGGATGTGTGTGTGCATGATGCATGGCTGGTGGTGACCTCGGACCAGGCTTCATTCCCTTTAACCAGCATTTGCGTTA ....................(..((..(((((((((.(((((.((.(((....((((((.((((.....(((........))).....))))))))))...(((((...)))))))).)).))...))).)))))))))..))..)...................... 20833982 20834109 GTTTGTTGTCTGGTTCAAGGCCTCCTGCTGTCCTACATCACATTTTTTTTTCTTTGTTCTGAATTTCTGATGGATGTGTGTGTGCATGATGCATGGCTGGTGGTGACCTCGGACCAGGCTTCATTCCC (..((..(((((((((.(((((.((.(((....((((((.((((.....(((........))).....))))))))))...(((((...)))))))).)).))...))).)))))))))..))..).. Oru-miR166l 20834090 20834109 TCGGACCAGGCTTCATTCCC Oru-miR166l* 20833982 20834002 GTTTGTTGTCTGGTTCAAGGC 3 Oru-MIR167a PmiREN013900 MIR167 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 30084599 30084744 - ATGTGTGCACCTTAAGCAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATCTTTTGCGATCTCTTTTTTTATCTGAATAAGTTGATGGAAATATTGGGTTCCTAAGATTCAGATCGTGCTGCGCAGTTTCATCTGCTAATCGATGCACTACAC .(((((((((..(.(((((.((((((((((((((((((((((((((..(.((.(((..((((((((..........))))))))....))).))).)))).))))))))))))).))))))))).))))).)..).))))).))). 30084619 30084724 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGATCTTTTGCGATCTCTTTTTTTATCTGAATAAGTTGATGGAAATATTGGGTTCCTAAGATTCAGATCGTGCTGCGCAGTTTCATC ((((((((((((((((((((((((((..(.((.(((..((((((((..........))))))))....))).))).)))).))))))))))))).))))))))).. Oru-miR167a 30084703 30084724 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Oru-miR167a* 30084619 30084639 ATCGTGCTGCGCAGTTTCATC 3 Oru-MIR167b PmiREN013901 MIR167 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 3457198 3457279 - GAGTGATTGGAATTTGGCTCCATCAGATCATGTTGCAGCTTCACTCTCTCACCACCAACAAAAGATCCGAAGGAGATTGTGC (((((((((.(((.(((.((.....))))).))).)))..)))))).................................... 3457218 3457259 TGATTGGAATTTGGCTCCATCAGATCATGTTGCAGCTTCACT ((((((.(((.(((.((.....))))).))).)))..))).. Oru-miR167b 3457218 3457238 AGATCATGTTGCAGCTTCACT Oru-miR167b* 3457239 3457259 TGATTGGAATTTGGCTCCATC 3 Oru-MIR167c PmiREN013902 MIR167 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 31436414 31436582 + GAACTGTCCAAGGGAACGAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTCTGAATGATCAACAAGATGTGCTCCCACACTGCCTTCCTGTGGATCTTGAGCTGTTGCTAGTCTTGTGGTCATGCCTTGCTAGGTCATGCTGCGGCAGCCTCACTTCTTCCCATTGTTGGGCACA ....((((((((((((.((((((.(((((((((((((((((((.....(((((((.((((((..(((((((((.........))))).....))))........))))))))))))).....)))))))))))))..)))))).)))))).)))))....))))))).. 31436434 31436562 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTCTGAATGATCAACAAGATGTGCTCCCACACTGCCTTCCTGTGGATCTTGAGCTGTTGCTAGTCTTGTGGTCATGCCTTGCTAGGTCATGCTGCGGCAGCCTCACT (((.(((((((((((((((((((.....(((((((.((((((..(((((((((.........))))).....))))........))))))))))))).....)))))))))))))..)))))).))).. Oru-miR167c 31436434 31436453 TGAAGCTGCCAGCATGATCT Oru-miR167c* 31436542 31436562 TCATGCTGCGGCAGCCTCACT 3 Oru-MIR167d PmiREN013903 MIR167 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 28967336 28967504 - CCGGTGCCCAAGAGAAAGCGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAACTTGCAGACAAGAAATCAGCTCAGCTCGCTGGTTTCGAACAGGAAGGCGGCTAGCTGAGGCTTCTTCTGAGTACGTGATGGTTAGATCATGCTGTGACAGTTTCACTCCTTCCCTGTTGGGCACACA ...((((((((.((.(((.(((((((((((((((((((((((((..(((((.((((.....(((((((.((((.((((......)))).)))).))))))).....))))..)).).))..))))))))))))))).).)))))))))..)))..)).))))))))... 28967356 28967484 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAACTTGCAGACAAGAAATCAGCTCAGCTCGCTGGTTTCGAACAGGAAGGCGGCTAGCTGAGGCTTCTTCTGAGTACGTGATGGTTAGATCATGCTGTGACAGTTTCACT ((((((((((((((((((((((((..(((((.((((.....(((((((.((((.((((......)))).)))).))))))).....))))..)).).))..))))))))))))))).).)))))))).. Oru-miR167d 28967465 28967484 TGAAGCTGCCAGCATGATCT Oru-miR167d* 28967356 28967376 TCATGCTGTGACAGTTTCACT 3 Oru-MIR167e PmiREN013904 MIR167 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 2994737 2994840 + GTTTGTGCGCCATAAGCAGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGAAAGCATCTCAAACCAGCGATCAGATCATCCGGCAGCTTCATCTTCTCATGGCAGCACACCAG ...((((((((((.((.(((((((((((((.(.(((((((((..((...........))..)))))))))).))))))))))))).)).))))).))))).... 2994757 2994820 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGAAAGCATCTCAAACCAGCGATCAGATCATCCGGCAGCTTCATC ((((((((((.(.(((((((((..((...........))..)))))))))).)))))))))).. Oru-miR167e 2994757 2994778 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Oru-miR167e* 2994800 2994820 AGATCATCCGGCAGCTTCATC 3 Oru-MIR167f PmiREN013905 MIR167 Oryza rufipogon Oru-HG417171.1 3829174 3829305 - GAGGTGCAACCATTAGGAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGAGTGCTTATTAGGTGAGGGCAGAATTGACTGCCAAAACAAAGATCAGATCATGCTGTGCAGTTTCATCTGCTTGTGGCTGCACAAAAT ...(((((.((((.((.((.(((((((((((((((((((((((...(((((((...)))))(((((......)))))....))...)))))))))))))).))))))))).)).)).)))).)))))..... 3829194 3829285 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGAGTGCTTATTAGGTGAGGGCAGAATTGACTGCCAAAACAAAGATCAGATCATGCTGTGCAGTTTCATC (((((((((((((((((((((((...(((((((...)))))(((((......)))))....))...)))))))))))))).))))))))).. Oru-miR167f 3829264 3829285 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Oru-miR167f* 3829194 3829214 ATCATGCTGTGCAGTTTCATC 3 Oru-MIR167g PmiREN013906 MIR167 Oryza rufipogon Oru-HG417174.1 12880968 12881102 - TATGGTGCACCACAAGTGGATGAAGCTGCCAGCATGATCTGATCACAGTAGTTCTCTAGCTGATGATGATTTACAAAACCTAGAGACATGCATCAGATCATCTGGCAGTTTCATCTTCTCATGGCAGCACAAAAA ....((((.(((..((.(((((((((((((((.((((((((((....(((..(((((((.(..((........))..).)))))))..)))))))))))))))))))))))))))).))..)))..))))..... 12880988 12881082 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGATCACAGTAGTTCTCTAGCTGATGATGATTTACAAAACCTAGAGACATGCATCAGATCATCTGGCAGTTTCATC ((((((((((((.((((((((((....(((..(((((((.(..((........))..).)))))))..))))))))))))))))))))))))).. Oru-miR167g 12881061 12881082 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Oru-miR167g* 12880988 12881008 AGATCATCTGGCAGTTTCATC 3 Oru-MIR167h PmiREN013907 MIR167 Oryza rufipogon Oru-HG417176.1 21542102 21542258 + ATGGTGCTAGTGTGAATGAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTCTGATTAATCGGCACTGTTGGCGTACAGTCGATTGACTAATCGTCAGATCTGTGTGTGTAAATCACTGTTAGATCATGCATGACAGCCTCATTTCTTCACACTGTTGGGCATG ...(((((((((((((.((((((.((((.((((((((((((((..(((((.((..((((..((((((...((((....))))...))))))....))))..)).)))))..)))))))))))).)).)))).)))))).))))))))....))))). 21542122 21542238 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTCTGATTAATCGGCACTGTTGGCGTACAGTCGATTGACTAATCGTCAGATCTGTGTGTGTAAATCACTGTTAGATCATGCATGACAGCCTCATT (((.((((.((((((((((((((..(((((.((..((((..((((((...((((....))))...))))))....))))..)).)))))..)))))))))))).)).)))).))).. Oru-miR167h 21542122 21542141 TGAAGCTGCCAGCATGATCT Oru-miR167h* 21542218 21542238 ATCATGCATGACAGCCTCATT 3 Oru-MIR167i PmiREN013908 MIR167 Oryza rufipogon Oru-HG417176.1 21545895 21546036 + GCAGTGGTGCACCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGATGATGATGATCCACCTCTCTCATCTGTGTTCTTGATTAATTACGGATCAATCGATCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTTGGGAGCACAG ....(.((((.((((.(((.(((((((((((.(((((((((((((..((((..((((((.......(((..........)))........)))))))))))))))))))))))))))))))))).))).).)))..)))).) 21545915 21546016 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGATGATGATGATCCACCTCTCTCATCTGTGTTCTTGATTAATTACGGATCAATCGATCAGGTCATGCTGTAGTTTCATC (((((((((.(((((((((((((..((((..((((((.......(((..........)))........)))))))))))))))))))))))))))))))))) Oru-miR167i 21545915 21545936 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Oru-miR167i* 21545996 21546016 AGGTCATGCTGTAGTTTCATC 3 Oru-MIR167j PmiREN013909 MIR167 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 24675670 24675892 + TTCTTGCTGGTGTGAGAGGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTCCATGAGTTGCACTGCTGAATATATTGAATTCAGCCAGGAGCTGCTACTGCAGTTCTGATCTCGATCTGCATTCGTTGTTCTGAGCTATGTATGGATTTGATCGGTTTGAAGGCATCCATGTCTTTAATTTCATCGATCAGATCATGTTGCAGCTTCACTCTCTCACTACCAGCAAAACC ((.((((((((((((((((.(((((((((.((((((((((((((.(((((.....(((((((((.......)))))).)))(((((((....)))))))(((((..(((((((((..(((......))).))))..))))).)))))..(((((((((....))))))))).))))).))))))))))))))))))))))).)))))))).)))))))))).. 24675690 24675872 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTCCATGAGTTGCACTGCTGAATATATTGAATTCAGCCAGGAGCTGCTACTGCAGTTCTGATCTCGATCTGCATTCGTTGTTCTGAGCTATGTATGGATTTGATCGGTTTGAAGGCATCCATGTCTTTAATTTCATCGATCAGATCATGTTGCAGCTTCACT (((((((((.((((((((((((((.(((((.....(((((((((.......)))))).)))(((((((....)))))))(((((..(((((((((..(((......))).))))..))))).)))))..(((((((((....))))))))).))))).))))))))))))))))))))))).. Oru-miR167j 24675690 24675710 TGAAGCTGCCAGCATGATCTG Oru-miR167j* 24675852 24675872 AGATCATGTTGCAGCTTCACT 3 Oru-MIR168 PmiREN013910 MIR168 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 1435948 1436056 - ATGGCGCCGCCGCCTCGGGCTCGCTTGGTGCAGATCGGGACCCGCCGCCGCCGCTGCCGGGGCCGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAATCGGAGCCGGCGTAGCGCCCT ..((((((((((.(((.((.(((((((((((((..(((((.(((..(((.(((....))))))))).)))))..))))))))))))).)).))).)))))..))))).. 1435968 1436036 TCGCTTGGTGCAGATCGGGACCCGCCGCCGCCGCTGCCGGGGCCGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAAT (((((((((((((..(((((.(((..(((.(((....))))))))).)))))..))))))))))))).. Oru-miR168 1436016 1436036 TCGCTTGGTGCAGATCGGGAC Oru-miR168* 1435968 1435988 CCCGCCTTGCACCAAGTGAAT 3 Oru-MIR169a PmiREN013911 MIR169 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 29267403 29267554 - AGGTGTATTGCTGGTTGTGTAGCCAAGGATGACTTGCCGGCCTGGTTTGTGTTCATCAGCAATCCAGCATATGCTGTATTGCCGTGTGTGATCGATCGATGCATGGACCGGCAAGTTATTTTCTTTGGCTACATTACAACCTCGTCTTCTCA ............((((((((((((((((((((((((((((((..(((((((.(((((((((((.((((....)))).)))))..)).)))).))..))).))..)).)))))))))))...)))))))))))...))))))........... 29267423 29267534 AGCCAAGGATGACTTGCCGGCCTGGTTTGTGTTCATCAGCAATCCAGCATATGCTGTATTGCCGTGTGTGATCGATCGATGCATGGACCGGCAAGTTATTTTCTTTGGCTAC ((((((((((((((((((((((..(((((((.(((((((((((.((((....)))).)))))..)).)))).))..))).))..)).)))))))))))...))))))))).. Oru-miR169a 29267514 29267534 AGCCAAGGATGACTTGCCGGC Oru-miR169a* 29267423 29267443 CAAGTTATTTTCTTTGGCTAC 3 Oru-MIR169b PmiREN013912 MIR169 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 33861691 33861823 + AAGTAAGAGGCCATCTTCGATAGCCAAGGATGATTTGCCTGTAGCCCCATTGTCATCAGCTCTCTCCGTCGAGAGCGACAACCGGGCTCTACTGGCAAGTCTCCTCGGCTACCCGAGTACCTCTTATGCTATC ((((((((((....(((.(.(((((.((((.((((((((.(((((((..(((((....((((((......)))))))))))..)))))..)).)))))))))))).))))).).)))..)))))..)))).). 33861711 33861803 TAGCCAAGGATGATTTGCCTGTAGCCCCATTGTCATCAGCTCTCTCCGTCGAGAGCGACAACCGGGCTCTACTGGCAAGTCTCCTCGGCTACC (((((.((((.((((((((.(((((((..(((((....((((((......)))))))))))..)))))..)).)))))))))))).))))).. Oru-miR169b 33861711 33861731 TAGCCAAGGATGATTTGCCTG Oru-miR169b* 33861783 33861803 TGGCAAGTCTCCTCGGCTACC 3 Oru-MIR169c PmiREN013913 MIR169 Oryza rufipogon Oru-HG417173.1 17371847 17372024 + ATGATAAGAGTCTGTCTAGATAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGGCCTCTTGGAGAGAGAGGTGTAGCTTAATTAGCAGCATGGTTTGAGCATTGCTTGATCGGTTGATCGCTTCGCTTGCTCTGCATGAGATCTTACAGGCAGTCTCCTTGGCTAGTCTGGGCGGCTCTTATCCGTTC ..((((((((.(((((((((((((((((((.((((.((((((((.(((.((.((((..(((((.(((...((((((((((..((....))..))))......)))))).))).))))).)))).)).)))...))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))..... 17371867 17372004 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGGCCTCTTGGAGAGAGAGGTGTAGCTTAATTAGCAGCATGGTTTGAGCATTGCTTGATCGGTTGATCGCTTCGCTTGCTCTGCATGAGATCTTACAGGCAGTCTCCTTGGCTAGTC ((((((((((.((((.((((((((.(((.((.((((..(((((.(((...((((((((((..((....))..))))......)))))).))).))))).)))).)).)))...))))))))))))))))))))).).. Oru-miR169c 17371867 17371887 TAGCCAAGGATGACTTGCCTG Oru-miR169c* 17371984 17372004 AGGCAGTCTCCTTGGCTAGTC 3 Oru-MIR169d PmiREN013914 MIR169 Oryza rufipogon Oru-HG417175.1 5623496 5623693 - GGAGAGGCTACTCCCTTTGGTAGCCAAGAATGACTTGCCTATGCGTTTTGCCTTGTGTTGGCTCATCCATCCGTCTATCAGCCGTTGCAGATTTGCAGTGACAGATTAAAGGGTTTCTGAAAGAAATTCTTGTGATGGATGTGCAATGTGGCTGCATGGGCCGGTCTTCTTGGCTAGCCAGAGTGGCTCTCATCCACC ..............((((((((((((((((.((((.(((((((((....(((...(((((.(.(((((((((((((.(((....(((((....)))))))).))))..((((((((((...))))))))))).)))))))).)))))).)))))))))))).))))))))))))).)))))))............... 5623516 5623673 TAGCCAAGAATGACTTGCCTATGCGTTTTGCCTTGTGTTGGCTCATCCATCCGTCTATCAGCCGTTGCAGATTTGCAGTGACAGATTAAAGGGTTTCTGAAAGAAATTCTTGTGATGGATGTGCAATGTGGCTGCATGGGCCGGTCTTCTTGGCTAGC ((((((((((.((((.(((((((((....(((...(((((.(.(((((((((((((.(((....(((((....)))))))).))))..((((((((((...))))))))))).)))))))).)))))).)))))))))))).))))))))))))).). Oru-miR169d 5623653 5623673 TAGCCAAGAATGACTTGCCTA Oru-miR169d* 5623516 5623535 GGCCGGTCTTCTTGGCTAGC 3 Oru-MIR169e PmiREN013915 MIR169 Oryza rufipogon Oru-HG417175.1 5620308 5620494 - TGAGAGGCTACTCCCTTTGGTAGCCAAGAATGACTTGCCTATGCTTTTGCCCTGTGTTGGCTCATCCATCCATCTATCTATCTGCCATGGCAGATTAAGGGTTTTTGAAAGAAATTCTTGTGATAGGATGTGCAATGTGGCTGCATGGGCCGGTCTTCTTGGCTAGCCAGAGTGGCTCTCATCCACC ((((((.((((((....(((((((((((((.((((.((((((((....(((...(((((.(.((((((((.........((((((....))))))(((((((((((...))))))))))).))).))))).)))))).))).)))))))).))))))))))))).))))))))))))))))...... 5620328 5620474 TAGCCAAGAATGACTTGCCTATGCTTTTGCCCTGTGTTGGCTCATCCATCCATCTATCTATCTGCCATGGCAGATTAAGGGTTTTTGAAAGAAATTCTTGTGATAGGATGTGCAATGTGGCTGCATGGGCCGGTCTTCTTGGCTAGC ((((((((((.((((.((((((((....(((...(((((.(.((((((((.........((((((....))))))(((((((((((...))))))))))).))).))))).)))))).))).)))))))).))))))))))))).). Oru-miR169e 5620454 5620474 TAGCCAAGAATGACTTGCCTA Oru-miR169e* 5620328 5620347 GGCCGGTCTTCTTGGCTAGC 3 Oru-MIR169f PmiREN013916 MIR169 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 24332536 24332665 + TGATAAGGGTGTAGCTCTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGTCCTTGTGTAGAGGATCATTCAGAAAATGAGCCTTGAACTGGTTCATAGGCAGTCTCCTTGGCTAGTCTGAGTCGCTCTTATCACTC (((((((((((..((((.((((((((((((.((((.(((((((..((.((...((((.(((((.....))))).))))..)).))..))))))))))))))))))))).)).)))))))))))))))... 24332556 24332645 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGTCCTTGTGTAGAGGATCATTCAGAAAATGAGCCTTGAACTGGTTCATAGGCAGTCTCCTTGGCTAGT ((((((((((.((((.(((((((..((.((...((((.(((((.....))))).))))..)).))..))))))))))))))))))))).. Oru-miR169f 24332556 24332576 TAGCCAAGGATGACTTGCCTG Oru-miR169f* 24332625 24332645 TAGGCAGTCTCCTTGGCTAGT 3 Oru-MIR169g PmiREN013917 MIR169 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 26126741 26126872 - TGAGGAGGAGAACGGGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCTCCTGGTATTGGGGGAATCTCAGCTTTGCTGAAGCGCCTTGGAGTTAGCCGGCAAGTCTGTCCTTGGCTACACCTAGCTCTCTTCTTCTAG .((((((((((.((((.((.((((((((((((((((((((((.......((.((((....(((((...)))))....)))).))...)))))))))))).)))))))))).))))).).))))))))))... 26126761 26126852 AGCCAAGGATGACTTGCCGGCTCCTGGTATTGGGGGAATCTCAGCTTTGCTGAAGCGCCTTGGAGTTAGCCGGCAAGTCTGTCCTTGGCTAC ((((((((((((((((((((((.......((.((((....(((((...)))))....)))).))...)))))))))))).)))))))))).. Oru-miR169g 26126832 26126852 AGCCAAGGATGACTTGCCGGC Oru-miR169g* 26126761 26126781 GGCAAGTCTGTCCTTGGCTAC 3 Oru-MIR169h PmiREN013918 MIR169 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 17389500 17389735 - AGTAGAGGAGGGGCCTTCCATGAGGACAAGAGCTGATTCGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTAATGCCTATGTGCATGTGTTTATACGCTGCTCATCTGCATTTTGATTATCCCCTGATCAGTCCTGTCGTCAATTATATGTGTGTGTAGTACTCTGTACTCATACATATATAGGCATGTCTTCCTTGGCTATTCGGAGCGGCTCTTGTCTCTCGTGGAAGGCTGCATGCTGCACTC .........((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((.(((.((((.(((((..(((.(((.((((....))))))).)))..)))))(((((((.....))))))).............((((((((((((.(((((...))))))))))))))))))))).))).)))))))))).))))).))))))))))).))))))))))))((((...))))))) 17389520 17389715 TGAGGACAAGAGCTGATTCGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTAATGCCTATGTGCATGTGTTTATACGCTGCTCATCTGCATTTTGATTATCCCCTGATCAGTCCTGTCGTCAATTATATGTGTGTGTAGTACTCTGTACTCATACATATATAGGCATGTCTTCCTTGGCTATTCGGAGCGGCTCTTGTCTCTCGTG (((((((((((((((.(((((((((((((((.(((.((((.(((((..(((.(((.((((....))))))).)))..)))))(((((((.....))))))).............((((((((((((.(((((...))))))))))))))))))))).))).)))))))))).))))).))))))))))).)))).. Oru-miR169h 17389695 17389715 TGAGGACAAGAGCTGATTCGG Oru-miR169h* 17389520 17389540 GAGCGGCTCTTGTCTCTCGTG 3 Oru-MIR169i PmiREN013919 MIR169 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 24336737 24336880 + AGACAAGGGTTTAGCTCTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGTCCTTGTGTGTAAGGATCATTAATTATTATTCAGAAAATGATCCTTTCAGCAGGTTTCATGGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCTGAGTGATTCTTGTCACTTA ..................((((((((((((.((((.(((((((..(((((.((.((((((((((...............)))))))))).)))))))...)))))))))))))))))))).)))((((((((....)))))))) 24336757 24336860 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGTCCTTGTGTGTAAGGATCATTAATTATTATTCAGAAAATGATCCTTTCAGCAGGTTTCATGGGCAGTCTCCTTGGCTAGCC ((((((((((.((((.(((((((..(((((.((.((((((((((...............)))))))))).)))))))...)))))))))))))))))))).).. Oru-miR169i 24336757 24336777 TAGCCAAGGATGACTTGCCTG Oru-miR169i* 24336840 24336860 GGGCAGTCTCCTTGGCTAGCC 3 Oru-MIR169j PmiREN013920 MIR169 Oryza rufipogon Oru-HG417173.1 17368575 17368721 + CGATGAGAGCTCGCATCTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGTCTCTGCTCATGTGCAGTAGAAGAAGATGCATTTCTAGCTGCTTTCTGCATATGTGATCTCACAGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCTGAGCGGCTCTCATCCTTCA .(((((((((.(((.((.((((((((((((.((((.(((((((......(.(((((((((.((.((.(((......)))..)).))..))))))))).)....)))))))))))))))))))).))).))))))))))))))..... 17368595 17368701 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGTCTCTGCTCATGTGCAGTAGAAGAAGATGCATTTCTAGCTGCTTTCTGCATATGTGATCTCACAGGCAGTCTCCTTGGCTAGCC ((((((((((.((((.(((((((......(.(((((((((.((.((.(((......)))..)).))..))))))))).)....)))))))))))))))))))).).. Oru-miR169j 17368595 17368615 TAGCCAAGGATGACTTGCCTG Oru-miR169j* 17368681 17368701 AGGCAGTCTCCTTGGCTAGCC 3 Oru-MIR169k PmiREN013921 MIR169 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 24267444 24267593 - ATGAGATAGAGAACGGAATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGTACGTGTATGCATGTTTCAAGGTACTATATGTGCCCCCAACTGTTTTAGATCCATGCTGACATTTTCCGGCAAGTTGTCCTTGGCTACGTCTTGTTCTTTTTCTCTCAC ..((((.(((((((((.(((.((((((((((((((((((((...((((..(((((..((..(((((.....))))).............))..)))))..))))...)))))))))))))))))))).))).))))))))).)))).... 24267464 24267573 CAGCCAAGGATGACTTGCCGGTACGTGTATGCATGTTTCAAGGTACTATATGTGCCCCCAACTGTTTTAGATCCATGCTGACATTTTCCGGCAAGTTGTCCTTGGCTACG .((((((((((((((((((((...((((..(((((..((..(((((.....))))).............))..)))))..))))...))))))))))))))))))))... Oru-miR169k 24267553 24267573 CAGCCAAGGATGACTTGCCGG Oru-miR169k* 24267464 24267484 GGCAAGTTGTCCTTGGCTACG 3 Oru-MIR169l PmiREN016162 MIR169 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 24342971 24343130 + GTGATGAGAGTGAGTCCTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTATATTTATATATATATGTGTGTGTGATCAATGGATGGATTGATCAAGCTGCTTGCAGGCTCATGCATATATATGTACAGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCCGGCTACCTCTTATCCTCCA ....................((((((((((.((((.((((((((......(((((((((((((..((((((((......))))))))((((.......)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))....................... 24342991 24343110 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGTATATTTATATATATATGTGTGTGTGATCAATGGATGGATTGATCAAGCTGCTTGCAGGCTCATGCATATATATGTACAGGCAGTCTCCTTGGCTAGCC ((((((((((.((((.((((((((......(((((((((((((..((((((((......))))))))((((.......)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))... Oru-miR169l 24342991 24343011 TAGCCAAGGATGACTTGCCTG Oru-miR169l* 24343090 24343110 AGGCAGTCTCCTTGGCTAGCC 3 Oru-MIR170 PmiREN013922 MIR170 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 19950054 19950197 + CTTTTTGCTTGGGTAAAAAGAGGTATTGGCGTGCCTCAATCCGAAGGCATGGCTGATTACAGGCACCTCGACCGATCTAGCGCATGCAGCCATGTTTCTTGGATTGAGCCGCGTCAATATCTCTCCTTGCTTCCTTACTTCATG ((((((((....))))))))(((((((((((((.(((((((((((((((((((((....((.((..((.((....)).)).)).))))))))))))).)))))))))).)))))))))))))...................... 19950074 19950177 AGGTATTGGCGTGCCTCAATCCGAAGGCATGGCTGATTACAGGCACCTCGACCGATCTAGCGCATGCAGCCATGTTTCTTGGATTGAGCCGCGTCAATATCTCT (((((((((((((.(((((((((((((((((((((....((.((..((.((....)).)).)).))))))))))))).)))))))))).))))))))))))).. Oru-miR170 19950157 19950177 TTGAGCCGCGTCAATATCTCT Oru-miR170* 19950074 19950094 AGGTATTGGCGTGCCTCAATC 3 Oru-MIR171a PmiREN013923 MIR171 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 27096417 27096533 - CTCTCTATGTGGGAACGGGATATTGGTGCGGTTCAATCAGAAAGCTTGTGCTCCGAAGGCGAGGGGCTCCACTCTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACGTCGCCTTTGCAGCTGCT ..........((..(((.(((((((((((((((((((((((.((.....(((((........)))))....)).))))))))))))))))))))))).)))..))............ 27096437 27096513 TATTGGTGCGGTTCAATCAGAAAGCTTGTGCTCCGAAGGCGAGGGGCTCCACTCTTTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((((((((((((((((.((.....(((((........)))))....)).))))))))))))))))))))).. Oru-miR171a 27096437 27096457 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Oru-miR171a* 27096493 27096513 TATTGGTGCGGTTCAATCAGA 3 Oru-MIR171b PmiREN013924 MIR171 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 4781242 4781359 + ACGGCCTTGCGACGACGGGATATTGGGGCGGTTCAATCAGAAAGCTTGTGCTCCGGAAGCGAGGAGCTCTACTCTTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACGTCGCATCCATCACTTTG ..................((((((((.(((((((((((((((.....(.(((((........))))).).....))))))))))))))).))))))))..........((......)) 4781262 4781339 TATTGGGGCGGTTCAATCAGAAAGCTTGTGCTCCGGAAGCGAGGAGCTCTACTCTTTTGATTGAGCCGTGCCAATATC ((((((.(((((((((((((((.....(.(((((........))))).).....))))))))))))))).)))))).. Oru-miR171b 4781319 4781339 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Oru-miR171b* 4781262 4781282 TATTGGGGCGGTTCAATCAGA 3 Oru-MIR171c PmiREN013925 MIR171 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 28471234 28471378 + CTTGGGCTGGGAGAGTGCGATGTTGGCATGGTTCAATCAAACCGGGCAAACTTATGCACTAGCTAAGCAAGATGCAGGGATATGCAGTATGGTTTTGTTTGGTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCACAAGCTTGCCTGGCTTAAT .((((((((((.(((((.(((((((((((((((((((((.((((((((((.((((((.((.((...)).)).((((......)))))))))).)))))))))).))))))))))))))))))))).)..)))).)))))))))). 28471254 28471358 TGTTGGCATGGTTCAATCAAACCGGGCAAACTTATGCACTAGCTAAGCAAGATGCAGGGATATGCAGTATGGTTTTGTTTGGTCTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((((((((((((((.((((((((((.((((((.((.((...)).)).((((......)))))))))).)))))))))).))))))))))))))))))).. Oru-miR171c 28471338 28471358 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Oru-miR171c* 28471254 28471274 TGTTGGCATGGTTCAATCAAA 3 Oru-MIR171d PmiREN013926 MIR171 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 1699281 1699417 + GAATGAAATGGTAGCTATGATGTTGGCTCGGCTCACTCAGACGGCATTGGCGTGATGCAAAGCATGCATGCGTGCTTGCTAGCTCACTTGTGTTTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCTTAGTGCTCTTTCATGTGTA .............((((.(((((((((.(((((((.(((((.(((((....((((.((..((((.(((....))).)))).))))))..)))))))))).))))))).))))))))).))))............... 1699301 1699397 TGTTGGCTCGGCTCACTCAGACGGCATTGGCGTGATGCAAAGCATGCATGCGTGCTTGCTAGCTCACTTGTGTTTCTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((.(((((((.(((((.(((((....((((.((..((((.(((....))).)))).))))))..)))))))))).))))))).))))))).. Oru-miR171d 1699377 1699397 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Oru-miR171d* 1699301 1699321 TGTTGGCTCGGCTCACTCAGA 3 Oru-MIR171e PmiREN013927 MIR171 Oryza rufipogon Oru-HG417174.1 18882148 18882300 + AAATGAAATTGTAGCTATGATGTTGGCCCGGCTCACTCAGATGGATCATCGGTGCAGAAGAGTGCATGAATCTGATGCAGTCTCAGTGTAGTATGCTCCATGCTGGAACTTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCTCAGCACCATTTTTATGCAA ..((((((.((..(((..(((((((((.(((((((.(((((((((.(((.(.((((..(((.(((((.......))))).)))...)))).)))).))))..........))))).))))))).)))))))))..)))..)).)))))).... 18882168 18882280 TGTTGGCCCGGCTCACTCAGATGGATCATCGGTGCAGAAGAGTGCATGAATCTGATGCAGTCTCAGTGTAGTATGCTCCATGCTGGAACTTCTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((.(((((((.(((((((((.(((.(.((((..(((.(((((.......))))).)))...)))).)))).))))..........))))).))))))).))))))).. Oru-miR171e 18882260 18882280 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Oru-miR171e* 18882168 18882188 TGTTGGCCCGGCTCACTCAGA 3 Oru-MIR171f PmiREN013928 MIR171 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 24069018 24069116 + GAAAGAAGAAGAGGACATGGTTTGGTATTGTTTCGGCTCATGTCGTTCACACAGTTGTGAGCCGAACCAATATCACTCATGTATTCTTCATTCAGAGAA ....(((((((((.((((((..((((((((.((((((((((..(.........)..)))))))))).)))))))).)))))).)))))).)))...... 24069038 24069096 TTTGGTATTGTTTCGGCTCATGTCGTTCACACAGTTGTGAGCCGAACCAATATCACTCA ..((((((((.((((((((((..(.........)..)))))))))).)))))))).... Oru-miR171f 24069076 24069096 GAGCCGAACCAATATCACTCA Oru-miR171f* 24069038 24069059 TTTGGTATTGTTTCGGCTCATG 3 Oru-MIR171g PmiREN013929 MIR171 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 22953466 22953587 + CATGGTTGATCAATGGAAAGAGCGATATTGGTGAGGTTCAATCCGATGATTGGTTTTACAGCAGTGGTAAAATCAGTATCTGATTGAGCCGCGCCAATATCTCTTCCTCTCCTATATCCTGC .......(((....(((.((((.((((((((((.(((((((((.(((.(((((((((((.......)))))))))))))).))))))))).)))))))))).))..)).)))...))).... 22953486 22953567 CGATATTGGTGAGGTTCAATCCGATGATTGGTTTTACAGCAGTGGTAAAATCAGTATCTGATTGAGCCGCGCCAATATCTCT .((((((((((.(((((((((.(((.(((((((((((.......)))))))))))))).))))))))).)))))))))).)) Oru-miR171g 22953547 22953567 TTGAGCCGCGCCAATATCTCT Oru-miR171g* 22953486 22953506 CGATATTGGTGAGGTTCAATC 3 Oru-MIR172a PmiREN013930 MIR172 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 33182611 33182740 - AACAGTCGGTGCTTGCAGGTGCAGCACCATCAAGATTCACATCGAGTTCATCCCTAAACGAGATCGAGGTTGGCTGACTATATGTGATGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCAAACGCTCGACTACTC ...((((((((.((((.(((((((((.(((((((((((.((((((((.((.((.....((....)).....)).))))).....))))).))))))))))).))))))))).)))).))).))))).... 33182631 33182720 GCAGCACCATCAAGATTCACATCGAGTTCATCCCTAAACGAGATCGAGGTTGGCTGACTATATGTGATGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((.(((((((((((.((((((((.((.((.....((....)).....)).))))).....))))).))))))))))).)))))).. Oru-miR172a 33182631 33182651 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Oru-miR172a* 33182700 33182720 GCAGCACCATCAAGATTCACA 3 Oru-MIR172b PmiREN013931 MIR172 Oryza rufipogon Oru-HG417173.1 20416998 20417124 + TAGAGTCGGTGTTTGCGGGCGTGGCATCATCAAGATTCACATCCATGCATATATCACAAGACGCACATATACATCCGATTTGGCTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCCGCAGACAAGCGCCTTTTT .((((.((.((((((((((.((((((((((((((((((.((.((((((..............)))...............))).)).)))))))))))))))))).))))))))))..)).)))).. 20417018 20417104 GTGGCATCATCAAGATTCACATCCATGCATATATCACAAGACGCACATATACATCCGATTTGGCTGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((((((((((((.((.((((((..............)))...............))).)).)))))))))))))))))).. Oru-miR172b 20417084 20417104 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Oru-miR172b* 20417018 20417038 GTGGCATCATCAAGATTCACA 3 Oru-MIR319 PmiREN013963 MIR319 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 24434148 24434358 - TTGACTACATGTGTAAGAAGAGAGCTCTCTTCAGTCCACTCTCAGATGGCTGTAGGGTTTTATTAGCTGCCGAATCATCCATTCACCTACCAAGAAAGTTGCAGGAGTGTATCTCTTGGTAGCGGACTGGATGACGCGGGAGCTAAAATTTAGCTCTGCGCCGTTTGTGGTTGGACTGAAGGGTGCTCCCTTGCTCAAGCACTCGCGCATA ..........((((.(((((.((((.((((((((((((.((.((((((((.((((((((...((((((.(((..(((((((.((..(((((((((....((((....))))..)))))))))..)).)))))))..))).)))))).....)))))))))))))))).)).)))))))))))).)))).))).))...))))......... 24434168 24434338 AGAGCTCTCTTCAGTCCACTCTCAGATGGCTGTAGGGTTTTATTAGCTGCCGAATCATCCATTCACCTACCAAGAAAGTTGCAGGAGTGTATCTCTTGGTAGCGGACTGGATGACGCGGGAGCTAAAATTTAGCTCTGCGCCGTTTGTGGTTGGACTGAAGGGTGCTCCCT .((((.((((((((((((.((.((((((((.((((((((...((((((.(((..(((((((.((..(((((((((....((((....))))..)))))))))..)).)))))))..))).)))))).....)))))))))))))))).)).)))))))))))).))))... Oru-miR319 24434168 24434188 TTGGACTGAAGGGTGCTCCCT Oru-miR319* 24434318 24434338 AGAGCTCTCTTCAGTCCACTC 3 Oru-MIR390 PmiREN013964 MIR390 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 32485994 32486091 - AGGGTATGGAACAATCCTTGAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCTCGAAATCAAACTAGGCGCTATCTATCCTGAGCTCCATGGTTTGTTCTTACCACACG ..((((.(((((((.((.((.(((((((((.(((((((((((.(........).))))))))))).))))))))).)).)).)))))))))))..... 32486014 32486071 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCTCGAAATCAAACTAGGCGCTATCTATCCTGAGCTCCA .(((((((((.(((((((((((.(........).))))))))))).)))))))))... Oru-miR390 32486051 32486071 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC Oru-miR390* 32486014 32486034 CGCTATCTATCCTGAGCTCCA 3 Oru-MIR393a PmiREN013965 MIR393 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 2072275 2072411 - AGCAATGTCTTGGGGAAGCATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTTCATCGCTCTCGCTCGCTTCCATGGCGGTCGTCGTCTACAAGCAGCTTGACGGATCATGCGATCCTTTTGGAGGCTTCCTCTAGCCATTAAAAC ...........((((((((.((((((((((((((((.(((((.(((..(((((((.(((((.....))))).)).........)).))).))).))))))))))))))))))))).))))))))............. 2072295 2072391 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTTCATCGCTCTCGCTCGCTTCCATGGCGGTCGTCGTCTACAAGCAGCTTGACGGATCATGCGATCCTTTTGGAGG ((((((((((((((((.(((((.(((..(((((((.(((((.....))))).)).........)).))).))).))))))))))))))))))))).. Oru-miR393a 2072371 2072391 TCCAAAGGGATCGCATTGATC Oru-miR393a* 2072295 2072315 ATCATGCGATCCTTTTGGAGG 3 Oru-MIR393b PmiREN013966 MIR393 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 29950058 29950194 - TGAGGAAACTAGTGGAGGACTCCAAAGGGATCGCATTGATCTGGCTAGCTATCTCGATCGATCGCCTCATCGATCGACGACGACGTGCGTGATCGATCAGTGCAATCCCTTTGGAATTTTCCTCTTGCTTCCGCCTC ....((....(((((((((.(((((((((((.(((((((((.(((..((..(((((.(((((((......)))))))))).))...))..).))))))))))).)))))))))))....))))).))))......)) 29950078 29950174 TCCAAAGGGATCGCATTGATCTGGCTAGCTATCTCGATCGATCGCCTCATCGATCGACGACGACGTGCGTGATCGATCAGTGCAATCCCTTTGGAAT (((((((((((.(((((((((.(((..((..(((((.(((((((......)))))))))).))...))..).))))))))))).))))))))))).. Oru-miR393b 29950154 29950174 TCCAAAGGGATCGCATTGATC Oru-miR393b* 29950078 29950098 TCAGTGCAATCCCTTTGGAAT 3 Oru-MIR394 PmiREN013967 MIR394 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 25390798 25390922 + GGGCGCTTACTGAGAGTTCTTTGGCATTCTGTCCACCTCCTTGTCGAATCCTCAGAGACAGAAATCTCATATCTGTTGATCTTGGAGGTGGGCATACTGCCAATGGAGCTGTGTAGGCCTCCCTT (((.((((((....((((((((((((...(((((((((((..(((((.......((((......)))).......)))).)..)))))))))))...)))))).))))))..)))))).)))... 25390818 25390902 TTGGCATTCTGTCCACCTCCTTGTCGAATCCTCAGAGACAGAAATCTCATATCTGTTGATCTTGGAGGTGGGCATACTGCCAATG ((((((...(((((((((((..(((((.......((((......)))).......)))).)..)))))))))))...)))))).. Oru-miR394 25390818 25390837 TTGGCATTCTGTCCACCTCC Oru-miR394* 25390882 25390902 GAGGTGGGCATACTGCCAATG 3 Oru-MIR395 PmiREN013968 MIR395 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 27177090 27177251 - TTTGGTTGGTTGTCCACTGGAGTTCTCCTCAATCCACTTCAGTAGATAGCTATGGCTAGGCCTCATTGCATTGCACTGTTACATAACTGTGATCATGGGGCCAAAAGCTAGCTATGTATAGTGAAGTGCTTGGGGGAACTCCAGTTGACACTCAGCATTTTC ....(((((.((((.(((((((((((((.(((..((((((((((.((((((..((((.((((((((.(.((((((..(((....))))))))))))))))))...)))))))))).)))..))))))).)))))))))))))))).)))).)))))...... 27177110 27177231 AGTTCTCCTCAATCCACTTCAGTAGATAGCTATGGCTAGGCCTCATTGCATTGCACTGTTACATAACTGTGATCATGGGGCCAAAAGCTAGCTATGTATAGTGAAGTGCTTGGGGGAACTCC ((((((((.(((..((((((((((.((((((..((((.((((((((.(.((((((..(((....))))))))))))))))))...)))))))))).)))..))))))).))))))))))).. Oru-miR395 27177110 27177130 TGAAGTGCTTGGGGGAACTCC Oru-miR395* 27177211 27177231 AGTTCTCCTCAATCCACTTCA 3 Oru-MIR396a PmiREN013969 MIR396 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 33678962 33679160 - GAAAGATTGCGGCCATGCTCTCCACAGGCTTTCTTGAACTGTGAACTCGTGTGTGCATGCTCCTCATATATTGTTCTAGATCCCATGCATGATGCATATCGATCGATCTGATCTGAATTAGGTCATCGATGCGCATCTGGATCCCCATCTTGTTGATAGTTCAAGAAAGTCCTTGGAAAACATGGTGCCCTCGATCTTA ..(((((((.(((((((...((((..((((((((((((((((.(((......(((((((.((..((.....)).....))...)))))))(((((.(((((((.((((((((....))))))))))))))).)))))(((....)))....))).))))))))))))))))..))))...)))))...)).))))))). 33678982 33679140 TCCACAGGCTTTCTTGAACTGTGAACTCGTGTGTGCATGCTCCTCATATATTGTTCTAGATCCCATGCATGATGCATATCGATCGATCTGATCTGAATTAGGTCATCGATGCGCATCTGGATCCCCATCTTGTTGATAGTTCAAGAAAGTCCTTGGAAA ((((..((((((((((((((((.(((......(((((((.((..((.....)).....))...)))))))(((((.(((((((.((((((((....))))))))))))))).)))))(((....)))....))).))))))))))))))))..)))).. Oru-miR396a 33679120 33679140 TCCACAGGCTTTCTTGAACTG Oru-miR396a* 33678982 33679002 GTTCAAGAAAGTCCTTGGAAA 3 Oru-MIR396b PmiREN013970 MIR396 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 32425247 32425409 - TTCAAGTCCATGCCATGCCTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTCTTGTGCCTCACTCACTTTCATTACTGGAGAGATATGCATCATCAGTGGAAGCTTATAGGGAGAGGAGTGCAAGAAGAGGGTCAAGAAAGCTGTGGGAAGAAATGGCATTACAAGGACTT ....((((((((((((..(((((((((((((((((((.((((((((((.((((.(((.(((((...(((((.((........)).))))))))))......))).))))...))))).))))).)))))))))))))))))))..))))))).....)))).) 32425267 32425389 TTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTCTTGTGCCTCACTCACTTTCATTACTGGAGAGATATGCATCATCAGTGGAAGCTTATAGGGAGAGGAGTGCAAGAAGAGGGTCAAGAAAGCTGTGGGAAG (((((((((((((((((.((((((((((.((((.(((.(((((...(((((.((........)).))))))))))......))).))))...))))).))))).))))))))))))))))).. Oru-miR396b 32425369 32425389 TTCCACAGCTTTCTTGAACTT Oru-miR396b* 32425267 32425287 GGTCAAGAAAGCTGTGGGAAG 3 Oru-MIR396c PmiREN013971 MIR396 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 29465100 29465302 + AAAGATGTGCGGGCATGCTTTCCACAGGCTTTCTTGAACTGTGAACTCGTGGGGGTGTATGTGCTCATGTTGGGATTGTGGTCGGTGGCCTCCAATTCTCTGAAAAGAAAGCTGAATTGTCGAGCTCCCCGTTCTGTCTTTGGTCGTCTCTACCTGTTGATGGTTCAAGAAAGCCCATGGAAACCATGCCGCGTCTTTGTGTG .(((((((...((((((.((((((..((((((((((((((((.(((..(((((((((.....((.((....(((((...((.(((.((.(((((((((.((........))..))))))..)))..))))).)).))))))))))))))))))..))).))))))))))))))))..)))))).)))))))))))))...... 29465120 29465282 TCCACAGGCTTTCTTGAACTGTGAACTCGTGGGGGTGTATGTGCTCATGTTGGGATTGTGGTCGGTGGCCTCCAATTCTCTGAAAAGAAAGCTGAATTGTCGAGCTCCCCGTTCTGTCTTTGGTCGTCTCTACCTGTTGATGGTTCAAGAAAGCCCATGGAAA ((((..((((((((((((((((.(((..(((((((((.....((.((....(((((...((.(((.((.(((((((((.((........))..))))))..)))..))))).)).))))))))))))))))))..))).))))))))))))))))..)))).. Oru-miR396c 29465120 29465140 TCCACAGGCTTTCTTGAACTG Oru-miR396c* 29465262 29465282 GTTCAAGAAAGCCCATGGAAA 3 Oru-MIR396d PmiREN013972 MIR396 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 32417488 32417663 + ATCTGGCCCTCTTTGTGATCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCACGCATGATGAATAATCCCTTTGGTTAATTGTGATCTGGTCTCTGAGAGATCGTAGTTAGACTCGATCGGTTGCATTGGCATCAGAGAGAGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAATTGCAGAGAGAGACCAAATC ........(((((((((((.((((((((((((.(((((((((.((((((((.((........)).))))..))))......(((((((..(((((.(((...))))))))...(((....))))))))))..))))))))).)))))))))))).))))))))))).......... 32417508 32417643 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCACGCATGATGAATAATCCCTTTGGTTAATTGTGATCTGGTCTCTGAGAGATCGTAGTTAGACTCGATCGGTTGCATTGGCATCAGAGAGAGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAA ((((((((((((.(((((((((.((((((((.((........)).))))..))))......(((((((..(((((.(((...))))))))...(((....))))))))))..))))))))).)))))))))))).. Oru-miR396d 32417508 32417528 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Oru-miR396d* 32417623 32417643 GTTCAATAAAGCTGTGGGAAA 3 Oru-MIR396e PmiREN013973 MIR396 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 3309395 3309532 + AGATGGTCCTCTTTGTGGTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCTTTGAGAGAGATTAGCATCCCTATGTGTGGATTTTGCTTGCACGAGTGTGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAATTACAGAGAGAGGTCAATTG ........(((((((((((.((((((((((((.((((((((((((((((((.((((((.((((......)))).)))))).))))...))).))))))))))).)))))))))))).))))))))))).......... 3309415 3309512 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCTTTGAGAGAGATTAGCATCCCTATGTGTGGATTTTGCTTGCACGAGTGTGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAA ((((((((((((.((((((((((((((((((.((((((.((((......)))).)))))).))))...))).))))))))))).)))))))))))).. Oru-miR396e 3309415 3309435 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Oru-miR396e* 3309492 3309512 GTTCAATAAAGCTGTGGGAAA 3 Oru-MIR397a PmiREN013974 MIR397 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 3005949 3006082 - GAAGAGAAGGGAAGGCATTATTGAGTGCAGCGTTGATGAACCTGCCGGCCGGCTAAATTAATTAGCAAGAAAGTCTGAAACTGGCTCAAAGGTTCACCAGCACTGCACCCAATCACGCCTTTGCTCTCTCTGAG ..(((((((.((((((...((((.((((((.((((.(((((((...((((((((((.....))))).(((...))).....)))))...))))))).)))).)))))).))))...)))))).)).)))))... 3005969 3006062 TTGAGTGCAGCGTTGATGAACCTGCCGGCCGGCTAAATTAATTAGCAAGAAAGTCTGAAACTGGCTCAAAGGTTCACCAGCACTGCACCCAATC (((.((((((.((((.(((((((...((((((((((.....))))).(((...))).....)))))...))))))).)))).)))))).))).. Oru-miR397a 3006041 3006062 TTGAGTGCAGCGTTGATGAACC Oru-miR397a* 3005969 3005989 TCACCAGCACTGCACCCAATC 3 Oru-MIR397b PmiREN013975 MIR397 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 25548442 25548580 + ACAGAGAATCAAATGCATCATTGAGTGCAGCGTTGATGAACAACGGTAACCGGTCCATGTTGAGGCACATTTTGGTCGGTGATCCGATGATCAATTGATCATCAGCGCTTCACTCAATCATGCGTTTGACATCTCTGCC .((((((.((((((((((.((((((((.(((((((((((.((((((..(((((.(((...((.....))...))))))))...)))........))).))))))))))).)))))))).))))))))))..)))))).. 25548462 25548560 TTGAGTGCAGCGTTGATGAACAACGGTAACCGGTCCATGTTGAGGCACATTTTGGTCGGTGATCCGATGATCAATTGATCATCAGCGCTTCACTCAATC (((((((.(((((((((((.((((((..(((((.(((...((.....))...))))))))...)))........))).))))))))))).))))))).. Oru-miR397b 25548462 25548482 TTGAGTGCAGCGTTGATGAAC Oru-miR397b* 25548540 25548560 TCATCAGCGCTTCACTCAATC 3 Oru-MIR398 PmiREN013977 MIR398 Oryza rufipogon Oru-HG417171.1 12434663 12434768 - AACGCGAGGGAGTTCCTACAGGGGCGAGCTGGGAACACACGGTGATGAGGCGGTCTGGTCTTTCGTGTGTTCTCAGGTCGCCCCTGCCGGGACTCTCTGGTTGATT ...((.((((((((((..(((((((((.((((((((((((((.(((.((.....)).)))..)))))))))))))).)))))))))..)))))))))).))..... 12434683 12434748 GGGGCGAGCTGGGAACACACGGTGATGAGGCGGTCTGGTCTTTCGTGTGTTCTCAGGTCGCCCCTG (((((((.((((((((((((((.(((.((.....)).)))..)))))))))))))).))))))).. Oru-miR398 12434683 12434703 TGTGTTCTCAGGTCGCCCCTG Oru-miR398* 12434728 12434748 GGGGCGAGCTGGGAACACACG 3 Oru-MIR399a PmiREN013978 MIR399 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 7139362 7139495 + TTGTCAGGGTGAGAATCACAGTGCAGTTCTCCTCTGGCATGGAGGGCAAGAGGAGCTGAATAGCTAATGGATGATAAACTGCTAGCCTTTCCCTGCCAAAGGAGAGCTGCCCTGCCATTCAGTGACCCTGAATT ...(((((((.(((((..(((.(((((((((((.(((((.(((((((.((.((((((....)))).............)).)).))).)))).))))).))))))))))).)))..))))..).)))))))... 7139382 7139475 GTGCAGTTCTCCTCTGGCATGGAGGGCAAGAGGAGCTGAATAGCTAATGGATGATAAACTGCTAGCCTTTCCCTGCCAAAGGAGAGCTGCCCTG (.(((((((((((.(((((.(((((((.((.((((((....)))).............)).)).))).)))).))))).))))))))))).).. Oru-miR399a 7139455 7139475 TGCCAAAGGAGAGCTGCCCTG Oru-miR399a* 7139382 7139402 GTGCAGTTCTCCTCTGGCATG 3 Oru-MIR399b PmiREN013979 MIR399 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 7149191 7149305 - TGATGAGGGTGAGAATCACAGTGCGATTCTCCTCTGGCATGGCATGAGAGGCCTAAAAAAGAGACGCACTGCCGTGCCAAAGGAGAATTGCCCTGCCATTCAGAAAATCCTCTAG ((..((((((..((((..(((.(((((((((((.((((((((((((.....(........).....)).)))))))))).))))))))))).)))..)))).....)))))))). 7149211 7149285 GTGCGATTCTCCTCTGGCATGGCATGAGAGGCCTAAAAAAGAGACGCACTGCCGTGCCAAAGGAGAATTGCCCTG (.(((((((((((.((((((((((((.....(........).....)).)))))))))).))))))))))).).. Oru-miR399b 7149211 7149231 TGCCAAAGGAGAATTGCCCTG Oru-miR399b* 7149265 7149285 GTGCGATTCTCCTCTGGCATG 3 Oru-MIR399c PmiREN013980 MIR399 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 24418626 24418747 + AATAAGCAGTCCAGTTTCAGGGCTCCTCTCTCTTGGCAGGGAGCATGTGAAGTCTTTTGTAGCTCACTCATTTTCAGCCCTCTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTAAAACTGGACTCAGCTTAAG ........(((((((((.(((((..((((((.(((((((((.((..((((.((........)))))).........)).))))))))).))))))..))))).))))))))).......... 24418646 24418727 GGCTCCTCTCTCTTGGCAGGGAGCATGTGAAGTCTTTTGTAGCTCACTCATTTTCAGCCCTCTGCCAAAGGAGAGTTGCCCT (((..((((((.(((((((((.((..((((.((........)))))).........)).))))))))).))))))..))).. Oru-miR399c 24418708 24418727 TGCCAAAGGAGAGTTGCCCT Oru-miR399c* 24418646 24418666 GGCTCCTCTCTCTTGGCAGGG 3 Oru-MIR399d PmiREN013981 MIR399 Oryza rufipogon Oru-HG417169.1 23097391 23097518 - TGTGCGACCGGCGAATTACAGGGCGGTTTCTCCTTTGGCACGTACGGAGGCAAGGCATGCGGTGAAAAATCTCTAGCTAGCCATGCGTGCCAAAGGAGAATTGCCCTGCGATTCACCAACACAGCCAT ((((.....((.(((((.((((((((((.(((((((((((((((....(((..(((..(.(((.....))).)..))).))).))))))))))))))))))))))))).))))).))..))))..... 23097411 23097498 GGGCGGTTTCTCCTTTGGCACGTACGGAGGCAAGGCATGCGGTGAAAAATCTCTAGCTAGCCATGCGTGCCAAAGGAGAATTGCCCTG ((((((((.(((((((((((((((....(((..(((..(.(((.....))).)..))).))).))))))))))))))))))))))).. Oru-miR399d 23097411 23097431 TGCCAAAGGAGAATTGCCCTG Oru-miR399d* 23097478 23097498 GGGCGGTTTCTCCTTTGGCAC 3 Oru-MIR399e PmiREN013982 MIR399 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 18627868 18627998 + TTTTCAGGGTGAGAATCACAGTGCAGTTCTCCTCTGGCATGGATGCCAACGTAGCAGGCGTTAGACTACGTACATTGCTATTGTCATCCCTGCCAAAGGAGAATTGCCCTGCCATTCAGCATAAACCCTGC ....((((((..((((..(((.(((((((((((.(((((.(((((.((..(((((((((((......))))...))))))))).))))).))))).))))))))))).)))..)))).......)))))). 18627888 18627978 GTGCAGTTCTCCTCTGGCATGGATGCCAACGTAGCAGGCGTTAGACTACGTACATTGCTATTGTCATCCCTGCCAAAGGAGAATTGCCCTG (.(((((((((((.(((((.(((((.((..(((((((((((......))))...))))))))).))))).))))).))))))))))).).. Oru-miR399e 18627958 18627978 TGCCAAAGGAGAATTGCCCTG Oru-miR399e* 18627888 18627908 GTGCAGTTCTCCTCTGGCATG 3 Oru-MIR399f PmiREN013983 MIR399 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 27968558 27968724 + GGCGCCGGCTGTGAATTACAGGGCAGTTCACCTTTGGCACAAGGGCAAGCAGTAGAAACCATGCGTGCTTGCTAGAGCTGGAAATGATGCTGGTAGCATTGCATGGTTCAGGGATCACAGATCTCGTGCCAAAGGAGAATTGCCCTGCGATTTTGTCTGCGCAGTAC .((((.(((...(((((.(((((((((((.((((((((((...(((((((((((.......))).)))))))).((((((....(((((((...)))))))..)))))).((((((...)))))))))))))))).))))))))))).))))).))).))))..... 27968578 27968704 GGGCAGTTCACCTTTGGCACAAGGGCAAGCAGTAGAAACCATGCGTGCTTGCTAGAGCTGGAAATGATGCTGGTAGCATTGCATGGTTCAGGGATCACAGATCTCGTGCCAAAGGAGAATTGCCCTG (((((((((.((((((((((...(((((((((((.......))).)))))))).((((((....(((((((...)))))))..)))))).((((((...)))))))))))))))).))))))))).. Oru-miR399f 27968684 27968704 TGCCAAAGGAGAATTGCCCTG Oru-miR399f* 27968578 27968598 GGGCAGTTCACCTTTGGCACA 3 Oru-MIR408 PmiREN013984 MIR408 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 11386807 11386989 + TGATTGGAGAGGAGAGGAGACAGGGATGAGGCAGAGCATGGGATGGGGCTATCAACAGATGTAGATTATTCCTTGCACAAGAGATGATGATGAGCTGTGAATGAGTTCTGAGAGATGGCTGGTGTTGTTGTTGCTCCCTCCCCTGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCCCCTGCACACCTCTCTCT ..........(.((.((((.((((((.(((((((.(((.((((.(((((...((((((...(((((((((.(((....))).))))))...(((((.......)))))..........)))...))))))..))))).)))).))).))))))).)))))).)))).)).)............ 11386827 11386969 CAGGGATGAGGCAGAGCATGGGATGGGGCTATCAACAGATGTAGATTATTCCTTGCACAAGAGATGATGATGAGCTGTGAATGAGTTCTGAGAGATGGCTGGTGTTGTTGTTGCTCCCTCCCCTGCACTGCCTCTTCCCTGGC ((((((.(((((((.(((.((((.(((((...((((((...(((((((((.(((....))).))))))...(((((.......)))))..........)))...))))))..))))).)))).))).))))))).)))))).. Oru-miR408 11386949 11386969 CTGCACTGCCTCTTCCCTGGC Oru-miR408* 11386827 11386847 CAGGGATGAGGCAGAGCATGG 3 Oru-MIR482 PmiREN013985 MIR482 Oryza rufipogon Oru-HG417175.1 6919098 6919233 - AAGAGGGTCTAAGAGCAGTGGGCATGGGAACATGGAGGAAGAACATGTACTTTTCTTCCCTCTAAATTTAGAGGTTGAGATTTGCTAAGCATTTTTCCCAATGCCTCCCATGCCTACAGTTCTTAGGTACTCCTTC ..(((..(((((((((.((((((((((((.((((((((((......(((..((((...((((((....))))))..))))..)))......)))))))..)))..)))))))))))).)))))))))..))).... 6919118 6919213 GGCATGGGAACATGGAGGAAGAACATGTACTTTTCTTCCCTCTAAATTTAGAGGTTGAGATTTGCTAAGCATTTTTCCCAATGCCTCCCATGCCTA (((((((((.((((((((((......(((..((((...((((((....))))))..))))..)))......)))))))..)))..))))))))).. Oru-miR482 6919118 6919139 TTCCCAATGCCTCCCATGCCTA Oru-miR482* 6919193 6919213 GGCATGGGAACATGGAGGAAG 3 Oru-MIR528 PmiREN013986 MIR528 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 1412714 1412839 + TTTTTGGCTGTAGCAGCAGCAGTGGAAGGGGCATGCAGAGGAGCAGGAGATTCAGTTTGAAGCTGGACTTCACTTTTGCCTCTCTCTCCTGTGCTTGCCTCTTCCATTCCTGCTGCTAGGCTGTTC .....((((.(((((((((.(((((((((((((.(((.(((((..(((((..(((..(((((.....)))))...)))..)))))))))).))).))))))))))))).))))))))))))).... 1412734 1412819 TGGAAGGGGCATGCAGAGGAGCAGGAGATTCAGTTTGAAGCTGGACTTCACTTTTGCCTCTCTCTCCTGTGCTTGCCTCTTCCATT (((((((((((.(((.(((((..(((((..(((..(((((.....)))))...)))..)))))))))).))).))))))))))))) Oru-miR528 1412734 1412754 TGGAAGGGGCATGCAGAGGAG Oru-miR528* 1412799 1412819 CCTGTGCTTGCCTCTTCCATT 3 Oru-MIR529a PmiREN013987 MIR529 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 15221578 15221714 + GATGTACATCGAGGCTAAAGGAAGAAGAGAGAGAGTACAGCCTTAGTTCAGATCACATATGACTATCTTTTGCGAGTCTGATCGATACTCTGATGAAGGCTGTACCCTCTCTCTTCTTCTCTTAGCTTCTTGATGCT ..........((((((((.((((((((((((((.((((((((((...(((((((..((..((((..(....)..))))..)).))...)))))..)))))))))).)))))))))))))).))))))))........ 15221598 15221694 AGAAGAGAGAGAGTACAGCCTTAGTTCAGATCACATATGACTATCTTTTGCGAGTCTGATCGATACTCTGATGAAGGCTGTACCCTCTCTCTTCTTC (((((((((((.((((((((((...(((((((..((..((((..(....)..))))..)).))...)))))..)))))))))).))))))))))))) Oru-miR529a 15221598 15221618 AGAAGAGAGAGAGTACAGCCT Oru-miR529a* 15221674 15221694 GCTGTACCCTCTCTCTTCTTC 3 Oru-MIR529b PmiREN013988 MIR529 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 12382681 12382821 + TCATATCGTGAAGGCTAAATGGAGAAGAGAGAGAGTACAGCTTTGGGCGGTTTAGTTGTTAGATGGTGGAAGTACTTGCGACGCCTACTACCCTTTTCACCAAGGCTGTACGCTCCCTCTTCTTCTCTTAGCTTTTTATGA .....(((((((((((((..(((((((((.(((.((((((((((((..(((.(((.((((.(..((((....))))..))))).)))..))).......)))))))))))).))).)))))))))..))))).)))))))) 12382701 12382801 GAAGAGAGAGAGTACAGCTTTGGGCGGTTTAGTTGTTAGATGGTGGAAGTACTTGCGACGCCTACTACCCTTTTCACCAAGGCTGTACGCTCCCTCTTCTT ((((((.(((.((((((((((((..(((.(((.((((.(..((((....))))..))))).)))..))).......)))))))))))).))).)))))))) Oru-miR529b 12382701 12382721 GAAGAGAGAGAGTACAGCTTT Oru-miR529b* 12382780 12382801 AGGCTGTACGCTCCCTCTTCTT 3 Oru-MIR530 PmiREN013989 MIR530 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 6596859 6597037 - CAAGTGATGTGTGATAGAGCTGCATTTGCACCTGCACCTACAGAGAGGAAGATGAAGCAGCAAGCTAGCAATACGTGCTTGATCGCTATACGCTAGCTTCTTGCACACAATGTTGTTCCTGGTCTCTTCCTGATCCCTAGGTGCAGAGGCAGATGCAACTATGTCATAGACTTCACATC .....(((((((((((.((.(((((((((..(((((((((..((.(((((((.((..(((..(((.((((....((((..((..((((.....)))).))..))))....))))))).))).)))))))))..))..)))))))))..))))))))).)).))))).......)))))) 6596879 6597017 TGCATTTGCACCTGCACCTACAGAGAGGAAGATGAAGCAGCAAGCTAGCAATACGTGCTTGATCGCTATACGCTAGCTTCTTGCACACAATGTTGTTCCTGGTCTCTTCCTGATCCCTAGGTGCAGAGGCAGATGCAAC (((((((((..(((((((((..((.(((((((.((..(((..(((.((((....((((..((..((((.....)))).))..))))....))))))).))).)))))))))..))..)))))))))..))))))))).. Oru-miR530 6596997 6597017 TGCATTTGCACCTGCACCTAC Oru-miR530* 6596879 6596899 AGGTGCAGAGGCAGATGCAAC 3 Oru-MIR531 PmiREN013990 MIR531 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 17268874 17268960 + ATGGCGCCGCCGAGCCTTGCTCGCCGGGGCTGCGTGCCGCCATATCCGGCGCGCATCCCCGTCGAGCGTTGCTCGACGGTGCCCTAA ..(((((((.(((((..((((((.(((((.(((((((((.......))))))))).))))).))))))..))))).))))))).... 17268894 17268940 TCGCCGGGGCTGCGTGCCGCCATATCCGGCGCGCATCCCCGTCGAGC (((.(((((.(((((((((.......))))))))).))))).))).. Oru-miR531 17268894 17268915 TCGCCGGGGCTGCGTGCCGCCA Oru-miR531* 17268920 17268940 CGGCGCGCATCCCCGTCGAGC 3 Oru-MIR535 PmiREN013991 MIR535 Oryza rufipogon Oru-HG417175.1 16109988 16110113 - ATTTGCTCGCCGGCCGGCGGTGACAACGAGAGAGAGCACGCCGGTGCGGCGGTCACGGTGAGCCGGCCCGCGGCGGCGTACCTGCGTGCTTTCTCCCGTTGTCACTGCCATACACACATATATGCT ...............(((((((((((((.((((((((((((.((((((.(.(((.(((.(......)))).))).))))))).)))))))))))).)))))))))))))................. 16110008 16110093 TGACAACGAGAGAGAGCACGCCGGTGCGGCGGTCACGGTGAGCCGGCCCGCGGCGGCGTACCTGCGTGCTTTCTCCCGTTGTCACT ((((((((.((((((((((((.((((((.(.(((.(((.(......)))).))).))))))).)))))))))))).)))))))).. Oru-miR535 16110073 16110093 TGACAACGAGAGAGAGCACGC Oru-miR535* 16110008 16110028 GTGCTTTCTCCCGTTGTCACT 3 Oru-MIR820 PmiREN013996 MIR820 Oryza rufipogon Oru-HG417171.1 11452278 11452502 - ACCTCTGACTCGTACATGCGTCGGCCTCGTGGATGGACCAGGAGCTCGACGTTCCTTAAGGCCGTTCTTTCCGACCCATACAAGGTTCCGTCGCCTGCATTGTTCCAAGAGTGTCTTGGACGAAAGCAGGAAGTGGAACCTTGTTAAGGTCGGAACGAACTGCCTTAAGGAAGTCGATGCTCCAGGTCCGTCCACGAGGACGACGCAGCTAGGAGTTAGAGGTTT (((((((((((.((..(((((((.(((((((((((((((.((((((((((.(((((((((((.((((.((((((((...(((((((((((...(((((.((..(((((((...)))))))..)).)))))...)))))))))))...)))))))).)))).)))))))))))))))).))))).))))))))))))))).)))))))..)).))))))))))).. 11452298 11452482 TCGGCCTCGTGGATGGACCAGGAGCTCGACGTTCCTTAAGGCCGTTCTTTCCGACCCATACAAGGTTCCGTCGCCTGCATTGTTCCAAGAGTGTCTTGGACGAAAGCAGGAAGTGGAACCTTGTTAAGGTCGGAACGAACTGCCTTAAGGAAGTCGATGCTCCAGGTCCGTCCACGAGGACGACG (((.(((((((((((((((.((((((((((.(((((((((((.((((.((((((((...(((((((((((...(((((.((..(((((((...)))))))..)).)))))...)))))))))))...)))))))).)))).)))))))))))))))).))))).))))))))))))))).))).. Oru-miR820 11452461 11452482 TCGGCCTCGTGGATGGACCAGG Oru-miR820* 11452298 11452318 GGTCCGTCCACGAGGACGACG 3 Oru-MIR827 PmiREN013997 MIR827 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 22423747 22423903 - TATTGCTACCCATGAACCTGTTTTGTTGCTGGTCATCTAGCTACCCGTGCATGCCTGGAGATTGGAGAATAATTGACGATGCAGCAGTCGGCTTATTGGCTCTTGGGCACGCGTGGTTAGATGACCATCAGCAAACAAGTTCGTGAGACGCATGCAT .............((((.(((((.((((.(((((((((((((((.(((((...((.((((.......((((((((((.........))))).)))))..)))).))))))).))))))))))))))).))))))))).))))............... 22423767 22423883 TTTTGTTGCTGGTCATCTAGCTACCCGTGCATGCCTGGAGATTGGAGAATAATTGACGATGCAGCAGTCGGCTTATTGGCTCTTGGGCACGCGTGGTTAGATGACCATCAGCAAACA (((.((((.(((((((((((((((.(((((...((.((((.......((((((((((.........))))).)))))..)))).))))))).))))))))))))))).))))))).. Oru-miR827 22423767 22423787 TTAGATGACCATCAGCAAACA Oru-miR827* 22423863 22423883 TTTTGTTGCTGGTCATCTAGC 3 Oru-MIR1425 PmiREN013857 MIR1425 Oryza rufipogon Oru-HG417169.1 8137705 8137822 + TGCTCCACTGTTGACTGCATTAGGATTCAATCCTTGCTGCTAAATGTATTGCTTATATTCAGCAATATAATGTTCAGCAGCAAGAACTGGATCTTAATATAGTCGATAGTGGAAGAAC ...((((((((((((((.(((((((((((...(((((((((.(((((((((((.......))))))))...))).)))))))))...))))))))))).))))))))))))))..... 8137725 8137802 TAGGATTCAATCCTTGCTGCTAAATGTATTGCTTATATTCAGCAATATAATGTTCAGCAGCAAGAACTGGATCTTAAT (((((((((...(((((((((.(((((((((((.......))))))))...))).)))))))))...))))))))).. Oru-miR1425 8137725 8137745 TAGGATTCAATCCTTGCTGCT Oru-miR1425* 8137782 8137802 CAGCAAGAACTGGATCTTAAT 3 Oru-MIR1428a PmiREN013858 MIR1428 Oryza rufipogon Oru-HG417171.1 5001928 5002059 - ATAGGTTAGTGCGCTTTGCGAATTCACAGGCCCTATCTTGTGGTATGAACTGAGTACGTGATAATTTCTGATGCGTATTGAGGGCTTACCATAAGATAATGCCGTGAATTCGTAAAGCGTTCAAACCCACTA ...((((.(.(((((((((((((((((.(((..((((((((((((.(..((.(((((((((.....))....))))))).))..).))))))))))))..)))))))))))))))))))).).))))..... 5001948 5002039 AATTCACAGGCCCTATCTTGTGGTATGAACTGAGTACGTGATAATTTCTGATGCGTATTGAGGGCTTACCATAAGATAATGCCGTGAATTCG (((((((.(((..((((((((((((.(..((.(((((((((.....))....))))))).))..).))))))))))))..)))))))))).. Oru-miR1428a 5002018 5002039 AATTCACAGGCCCTATCTTGTG Oru-miR1428a* 5001948 5001968 TAAGATAATGCCGTGAATTCG 3 Oru-MIR1428b PmiREN013859 MIR1428 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 21860283 21860414 + ATAGGTTAGTGCGCTTGGCGAATTCACAGGCCCTATCTTGTGGTATGAACTGGGTACGCGATGATTTGCACTGCGTATTGGGGGCTTACCATAAGATAATGCCATGAATTTGTCAAGCGTTCAAACCCACTG ...((((.(.((((((((((((((((..(((..((((((((((((.(..((.((((((((.((.....)).)))))))).))..).))))))))))))..))).)))))))))))))))).).))))..... 21860303 21860394 AATTCACAGGCCCTATCTTGTGGTATGAACTGGGTACGCGATGATTTGCACTGCGTATTGGGGGCTTACCATAAGATAATGCCATGAATTTG ((((((..(((..((((((((((((.(..((.((((((((.((.....)).)))))))).))..).))))))))))))..))).)))))).. Oru-miR1428b 21860374 21860394 TAAGATAATGCCATGAATTTG Oru-miR1428b* 21860303 21860323 AATTCACAGGCCCTATCTTGT 3 Oru-MIR1432 PmiREN013860 MIR1432 Oryza rufipogon Oru-HG417171.1 20310971 20311109 - TGGGGGGTTTGGGCCCTGTGATCAGGAGAGATGACACCGACATCGCCGGAATTCGTTCTTGGTCTTGTGCCATGATGAATTGATGGTCCGTTTGATGCAGGTGTCATCTCCCCTGAACATAGGACTGACTGACCCTGAA ...((((((..((.((((((.(((((.(((((((((((..(((((.(((((((((((..((((.....)))).)))))))......))))..)))))..))))))))))).))))).)))))).))....))))))... 20310991 20311089 ATCAGGAGAGATGACACCGACATCGCCGGAATTCGTTCTTGGTCTTGTGCCATGATGAATTGATGGTCCGTTTGATGCAGGTGTCATCTCCCCTGAACA .(((((.(((((((((((..(((((.(((((((((((..((((.....)))).)))))))......))))..)))))..))))))))))).)))))... Oru-miR1432 20311069 20311089 ATCAGGAGAGATGACACCGAC Oru-miR1432* 20310991 20311011 AGGTGTCATCTCCCCTGAACA 3 Oru-MIR1846a PmiREN013932 MIR1846 Oryza rufipogon Oru-HG417174.1 481344 481433 + CCAATGAGCCGCCGGATCTCCCAGTGAGGAGGCCGGGGCCGCTGGATCCGGTGACCCCGTTCTCCTCGCCGGCGGATCCGGCGCTCCAGA .....((((.(((((((((.((.(((((((((.(((((.(((((....))))).))))).))))))))).)).))))))))))))).... 481364 481413 AGTGAGGAGGCCGGGGCCGCTGGATCCGGTGACCCCGTTCTCCTCGCCGG .(((((((((.(((((.(((((....))))).))))).))))))))).)) Oru-miR1846a 481364 481384 AGTGAGGAGGCCGGGGCCGCT Oru-miR1846a* 481393 481413 TGACCCCGTTCTCCTCGCCGG 3 Oru-MIR1846b PmiREN013933 MIR1846 Oryza rufipogon Oru-HG417176.1 279255 279344 + AATGAGCCGCCGGATCTCCCAGTGAGGAGGCCGGGGCCGCTGAATCCGGTGACCCCGGTCTCCTCGCTGGCGGATCCGGCGCAAAGACGC .......((((((((((.((((((((((((((((((.(((((....))))).)))))))))))))))))).))))))))))......... 279275 279324 AGTGAGGAGGCCGGGGCCGCTGAATCCGGTGACCCCGGTCTCCTCGCTGG ((((((((((((((((.(((((....))))).)))))))))))))))).. Oru-miR1846b 279275 279295 AGTGAGGAGGCCGGGGCCGCT Oru-miR1846b* 279304 279324 TGACCCCGGTCTCCTCGCTGG 3 Oru-MIR1846c PmiREN013934 MIR1846 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 36508522 36508657 + CTCCAGCTGCTGCCTGTCCCTCCCACCGAGCAGCCGGATCTCCCAGTGAGTAGGCCCGGGCCGCCAGATCCGGTGACCCCGGTCTCCTCGCCGGTGTATCCGGCGCCGCAGGGAGGGACGAGAGCCGCCGGCGCTG .....((.(((.(.((((((((((..((.((.(((((((..(((.(((((.(((((.(((.((((......)))).))).))))).))))).)).).)))))))))))..)))))))))).)))).))........ 36508542 36508637 TCCCACCGAGCAGCCGGATCTCCCAGTGAGTAGGCCCGGGCCGCCAGATCCGGTGACCCCGGTCTCCTCGCCGGTGTATCCGGCGCCGCAGGGAGG ((((..((.((.(((((((..(((.(((((.(((((.(((.((((......)))).))).))))).))))).)).).)))))))))))..)))).. Oru-miR1846c 36508542 36508563 TCCCACCGAGCAGCCGGATCTC Oru-miR1846c* 36508617 36508637 GTATCCGGCGCCGCAGGGAGG 3 Oru-MIR1850 PmiREN013935 MIR1850 Oryza rufipogon Oru-HG417169.1 23066683 23066823 - ATGATGTGATGGAGATGCGATGGAAAGTTGGGAGATTGGGGGAAGTTGTGTGTGAACTAAACGTGGATTGGGGCCCTGTTTAGTTCACATCAATCTTCCTCCAAATTCCCAACTTTTCATCACATCACAATCACATAAACT ...(((((((...((((.((((((((((((((((.(((((((((((((.((((((((((((((.((........))))))))))))))))))).)))))))))).)))))))))))))))).))))...)))))))..... 23066703 23066803 TGGAAAGTTGGGAGATTGGGGGAAGTTGTGTGTGAACTAAACGTGGATTGGGGCCCTGTTTAGTTCACATCAATCTTCCTCCAAATTCCCAACTTTTCATC ((((((((((((((.(((((((((((((.((((((((((((((.((........))))))))))))))))))).)))))))))).)))))))))))))).. Oru-miR1850 23066783 23066803 TGGAAAGTTGGGAGATTGGGG Oru-miR1850* 23066703 23066723 CCAAATTCCCAACTTTTCATC 3 Oru-MIR1861a PmiREN013936 MIR1861 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 19531463 19531566 + GTGTTGCATATTCTTAGACCCGATCTTGTAGCAAGAACTGAGTAGTTCGTTAACTCGCTACGCGGTTCTTGTCACAAGACCGAGCCTGTGAATATGCAAAGGTG ....(((((((((.(((.(.((.((((((.((((((((((.(((((..........))))).)))))))))).)))))).)).).))).)))))))))...... 19531483 19531546 CGATCTTGTAGCAAGAACTGAGTAGTTCGTTAACTCGCTACGCGGTTCTTGTCACAAGACCGAG ((.((((((.((((((((((.(((((..........))))).)))))))))).)))))).)).. Oru-miR1861a 19531483 19531504 CGATCTTGTAGCAAGAACTGAG Oru-miR1861a* 19531526 19531546 GGTTCTTGTCACAAGACCGAG 3 Oru-MIR1861b PmiREN013937 MIR1861 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 24323062 24323187 - GTGTTGCATATTCTTAGGCTCGGTCTTGAGGCAGGAACTGAGTAGTTGTTGAACTCGCTCTATGTTGTTCGTTCACTCGCGACGCGGTTCCTGTCCCAAGATTGAGTCTATGAATATACAAATGTG ....((.((((((.((((((((((((((.(((((((((((.((.((...(((((..((........))..)))))...)).)).))))))))))).)))))))))))))).)))))).))...... 24323082 24323167 CGGTCTTGAGGCAGGAACTGAGTAGTTGTTGAACTCGCTCTATGTTGTTCGTTCACTCGCGACGCGGTTCCTGTCCCAAGATTGAG ((((((((.(((((((((((.((.((...(((((..((........))..)))))...)).)).))))))))))).)))))))).. Oru-miR1861b 24323146 24323167 CGGTCTTGAGGCAGGAACTGAG Oru-miR1861b* 24323082 24323102 GGTTCCTGTCCCAAGATTGAG 3 Oru-MIR1861c PmiREN013938 MIR1861 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 24209417 24209542 - GTGTTGCATATTCTTAGGCCCGGTCTTGAGGCAGGAACTGAGTAGTTGGTGAACTCGCTCTATGTTGTTCGTTCACTCGCGACACGGTTCCTGTCCCAAGACTGAGTCTGTGAATATACAAATGTG .......((((((.(((((.((((((((.(((((((((((.((.((.(((((((..((........))..))))))).)).)).))))))))))).)))))))).))))).))))))......... 24209437 24209522 CGGTCTTGAGGCAGGAACTGAGTAGTTGGTGAACTCGCTCTATGTTGTTCGTTCACTCGCGACACGGTTCCTGTCCCAAGACTGAG ((((((((.(((((((((((.((.((.(((((((..((........))..))))))).)).)).))))))))))).)))))))).. Oru-miR1861c 24209501 24209522 CGGTCTTGAGGCAGGAACTGAG Oru-miR1861c* 24209437 24209457 GGTTCCTGTCCCAAGACTGAG 3 Oru-MIR1861d PmiREN013939 MIR1861 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 13345804 13345929 - GTGTTGCATATTCTTAGGCCCGGTCTTGAGGCAGGAACTGAGTAGTTGGTGAACTCGCTCTATGTTGTTCGTTCACTCGCGACACAGTTCCTGTCCCAAGGCTAAGTCTGTGAATATATAAATGTG .......((((((.(((((..(((((((.(((((((((((.((.((.(((((((..((........))..))))))).)).)).))))))))))).)))))))..))))).))))))......... 13345824 13345909 CGGTCTTGAGGCAGGAACTGAGTAGTTGGTGAACTCGCTCTATGTTGTTCGTTCACTCGCGACACAGTTCCTGTCCCAAGGCTAAG .(((((((.(((((((((((.((.((.(((((((..((........))..))))))).)).)).))))))))))).)))))))... Oru-miR1861d 13345888 13345909 CGGTCTTGAGGCAGGAACTGAG Oru-miR1861d* 13345824 13345844 AGTTCCTGTCCCAAGGCTAAG 3 Oru-MIR1861e PmiREN013940 MIR1861 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 19531246 19531371 + GTCTTGCATATTCTTAGGCCCGATCTTGAGGCAGGAACTGAGTAGTTCGTGAACTCGCTCTATGTTGTTCGTTCACCCACTATTCGGTTCCTGTCCCAAGATCGAGTCTGTGAATATACAAATATG ((.(((.((((((.(((((.((((((((.(((((((((((((((((..((((((..((........))..))))))..))))))))))))))))).)))))))).))))).)))))).)))..)). 19531266 19531351 CGATCTTGAGGCAGGAACTGAGTAGTTCGTGAACTCGCTCTATGTTGTTCGTTCACCCACTATTCGGTTCCTGTCCCAAGATCGAG ((((((((.(((((((((((((((((..((((((..((........))..))))))..))))))))))))))))).)))))))).. Oru-miR1861e 19531266 19531287 CGATCTTGAGGCAGGAACTGAG Oru-miR1861e* 19531331 19531351 GGTTCCTGTCCCAAGATCGAG 3 Oru-MIR1861f PmiREN013941 MIR1861 Oryza rufipogon Oru-HG417169.1 16036328 16036453 + GTCTTGCGTATTCTTAGGCCCGATCTTGAGGCAGGAACTGAGTAGTTGTTGAACTTGCTCTATGTTGTTCGTTCACCCACTATTCGGTTCCTGTCCCAAGATCGAGTCTATGAATATACAAATGTG ...(((.((((((.(((((.((((((((.(((((((((((((((((.(.(((((..((........))..))))).).))))))))))))))))).)))))))).))))).)))))).)))..... 16036348 16036433 CGATCTTGAGGCAGGAACTGAGTAGTTGTTGAACTTGCTCTATGTTGTTCGTTCACCCACTATTCGGTTCCTGTCCCAAGATCGAG ((((((((.(((((((((((((((((.(.(((((..((........))..))))).).))))))))))))))))).)))))))).. Oru-miR1861f 16036348 16036369 CGATCTTGAGGCAGGAACTGAG Oru-miR1861f* 16036413 16036433 GGTTCCTGTCCCAAGATCGAG 3 Oru-MIR1861g PmiREN013942 MIR1861 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 13692854 13692979 + GTGTTGCATATTCTTAGACCCGATCTTGAGGCAGGAACTGAGTAGTTGGTGAACTCGCTCTATGTTGTTCGTTCACTTGCTACACGGTTCCTGTCCCAAGATCGAGTCCGTTAATATGCAAAGGTG ...(((((((((....(((.((((((((.(((((((((((.(((((.(((((((..((........))..))))))).))))).))))))))))).)))))))).)))....)))))))))..... 13692874 13692959 CGATCTTGAGGCAGGAACTGAGTAGTTGGTGAACTCGCTCTATGTTGTTCGTTCACTTGCTACACGGTTCCTGTCCCAAGATCGAG ((((((((.(((((((((((.(((((.(((((((..((........))..))))))).))))).))))))))))).)))))))).. Oru-miR1861g 13692874 13692895 CGATCTTGAGGCAGGAACTGAG Oru-miR1861g* 13692939 13692959 GGTTCCTGTCCCAAGATCGAG 3 Oru-MIR1861h PmiREN013943 MIR1861 Oryza rufipogon Oru-HG417173.1 11525006 11525131 + GTGTTGCATATTCTTAGGCCCGATCTTGAGGCAGGAACTGAGTAGTTGGTGAACTCGCTCTATGTTGTTCATTCACTCGCGACACGGTTCCTGTCCCAAGATCGGGTCTGTGAATATACAAATGTG ....((.((((((.((((((((((((((.(((((((((((.((.((.((((((...((........))...)))))).)).)).))))))))))).)))))))))))))).)))))).))...... 11525026 11525111 CGATCTTGAGGCAGGAACTGAGTAGTTGGTGAACTCGCTCTATGTTGTTCATTCACTCGCGACACGGTTCCTGTCCCAAGATCGGG ((((((((.(((((((((((.((.((.((((((...((........))...)))))).)).)).))))))))))).)))))))).. Oru-miR1861h 11525026 11525047 CGATCTTGAGGCAGGAACTGAG Oru-miR1861h* 11525091 11525111 GGTTCCTGTCCCAAGATCGGG 3 Oru-MIR1862a PmiREN013944 MIR1862 Oryza rufipogon Oru-HG417174.1 4521877 4521990 + AGCTTGCTAGGTACTCCCTCTATCCCAAAATAAACAAAGCTAGTACGGGGATGTGGCACTTCCTAGTCCTGTACTAGGTTTGTTTATTTTGGGACGGAGGGAGTATCATAGTTT .....((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((.((..((.....))..)))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))).)))).. 4521897 4521970 TCCCAAAATAAACAAAGCTAGTACGGGGATGTGGCACTTCCTAGTCCTGTACTAGGTTTGTTTATTTTGGGACG ((((((((((((((((.((((((((((.((..((.....))..)))))))))))).)))))))))))))))).) Oru-miR1862a 4521947 4521970 ACTAGGTTTGTTTATTTTGGGACG Oru-miR1862a* 4521897 4521917 TCCCAAAATAAACAAAGCTAG 3 Oru-MIR1862b PmiREN013945 MIR1862 Oryza rufipogon Oru-HG417174.1 3091286 3091433 - GTTAAGACATACTCCCTCCGTCCCAAAATAAAAAAAAACTAGGATAGGATGGGACATAACCTAGTACAACGAATCTGGGCAGGTTAGGTTATGTCCCATCCAATCCTAGGTTTGTTTATTTTGGGACGGAGGGAGTAAGGTACAATGC .......(.(((((((((((((((((((((((..((..(((((((.((((((((((((((((((.....(.......).....)))))))))))))))))).)))))))..)).))))))))))))))))))))))).)......... 3091306 3091413 TCCCAAAATAAAAAAAAACTAGGATAGGATGGGACATAACCTAGTACAACGAATCTGGGCAGGTTAGGTTATGTCCCATCCAATCCTAGGTTTGTTTATTTTGGGACG ((((((((((((..((..(((((((.((((((((((((((((((.....(.......).....)))))))))))))))))).)))))))..)).)))))))))))).. Oru-miR1862b 3091306 3091327 TAGGTTTGTTTATTTTGGGACG Oru-miR1862b* 3091393 3091413 TCCCAAAATAAAAAAAAACTA 3 Oru-MIR1862c PmiREN013946 MIR1862 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 7425301 7425445 - AGTGCGCCTACTCCCTTAGTCCCAAAATAAATTAATCTTATACAAGATTTGGCACATCATAGTACTACGAATCTGGATATACTAGGATGTGTCACATTCCGTACGAGGTTGGTTTATTTTGGGACGGAGGGAGGGAGTATCTCGG (((((.((..(((((((.(((((((((((((((((((((.(((..(((.(((((((((.((((((((......)))...))))).))))))))).)))..))).))))))))))))))))))))).))))))))).))).))... 7425321 7425425 CCCAAAATAAATTAATCTTATACAAGATTTGGCACATCATAGTACTACGAATCTGGATATACTAGGATGTGTCACATTCCGTACGAGGTTGGTTTATTTTGGGAC (((((((((((((((((((.(((..(((.(((((((((.((((((((......)))...))))).))))))))).)))..))).))))))))))))))))))).. Oru-miR1862c 7425321 7425344 TACGAGGTTGGTTTATTTTGGGAC Oru-miR1862c* 7425405 7425425 CCCAAAATAAATTAATCTTAT 3 Oru-MIR1862d PmiREN016163 MIR1862 Oryza rufipogon Oru-HG417175.1 2340378 2340490 + TACTAGTGTGTATTTCCTTCATCCCAAAATGAAAAAATCTAGTACATTATGTGTTTGACATATCCTGTACTAGATTTGTTTATTTTGGGACGGAGGGAGTATCCAGTAGTAGT .....................((((((((((((.((((((((((((..((((((...))))))..)))))))))))).))))))))))))....................... 2340398 2340470 ATCCCAAAATGAAAAAATCTAGTACATTATGTGTTTGACATATCCTGTACTAGATTTGTTTATTTTGGGACGG .((((((((((((.((((((((((((..((((((...))))))..)))))))))))).))))))))))))... Oru-miR1862d 2340447 2340470 CTAGATTTGTTTATTTTGGGACGG Oru-miR1862d* 2340398 2340418 ATCCCAAAATGAAAAAATCTA 3 Oru-MIR1866 PmiREN013947 MIR1866 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 6132510 6132614 + GTACCAGGCCTCCTTTTGCACGGAGGGATTTTGCGGGAATTTCACGGGAATTGAGTTGATTCCTGAAATTCCTGTAAAATTCTTGTGTTCCAAAGGAGCCCTTGA .....(((.(((((((.(.(((.(((((((((((((((((((((..((((((.....))))))))))))))))))))))))))).))).).))))))).)))... 6132530 6132594 GAGGGATTTTGCGGGAATTTCACGGGAATTGAGTTGATTCCTGAAATTCCTGTAAAATTCTTGTG .(((((((((((((((((((((..((((((.....))))))))))))))))))))))))))).)) Oru-miR1866 6132571 6132594 TGAAATTCCTGTAAAATTCTTGTG Oru-miR1866* 6132530 6132550 GAGGGATTTTGCGGGAATTTC 3 Oru-MIR1874 PmiREN013948 MIR1874 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 7733386 7733518 - TTAGTACAGTGGTGAAGACATAGGGCTACTACACCATCCATAAGGGTTCGAATCTTCGATGTGCCTAGATAGGGTACAGTTGGATCCCATATGGATGGAGGTGTAACCCGATGCCTTTTACAAATAGATGGTT ..................(((.(((.(((.((.(((((((((.(((.((.(((......(((((((.....)))))))))).)).))).)))))))))..))))).))).))).................... 7733406 7733498 TAGGGCTACTACACCATCCATAAGGGTTCGAATCTTCGATGTGCCTAGATAGGGTACAGTTGGATCCCATATGGATGGAGGTGTAACCCGATG (.(((.(((.((.(((((((((.(((.((.(((......(((((((.....)))))))))).)).))).)))))))))..))))).))).).. Oru-miR1874 7733406 7733429 TATGGATGGAGGTGTAACCCGATG Oru-miR1874* 7733478 7733498 TAGGGCTACTACACCATCCAT 3 Oru-MIR1876 PmiREN013949 MIR1876 Oryza rufipogon Oru-HG417174.1 4521628 4521760 + TTCTATTGGAATGCAAGTGGGCTGGCTTTTGAACCCATTTATGGGCTATTCAAGTGGGTAAACCATAGGTTGGTCCACTTAAATGGCCTATAAGTGGGTTTGTGGGCTGGCCCTCTTGTATCCTGATAGTTTA ..(((((((.(((((((.((((((((((.(((((((((((((((((((((.(((((((..((((...))))..))))))).))))))))))))))))))))).)))))))))).))))))).))))))).... 4521648 4521740 GCTGGCTTTTGAACCCATTTATGGGCTATTCAAGTGGGTAAACCATAGGTTGGTCCACTTAAATGGCCTATAAGTGGGTTTGTGGGCTGGCCC ((((((((.(((((((((((((((((((((.(((((((..((((...))))..))))))).))))))))))))))))))))).)))))))).. Oru-miR1876 4521717 4521740 ATAAGTGGGTTTGTGGGCTGGCCC Oru-miR1876* 4521648 4521668 GCTGGCTTTTGAACCCATTTA 3 Oru-MIR2118a PmiREN013950 MIR2118 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 17707892 17708139 - TGAGATTTGGTTTCCTTGTTTTCCTGATGCCTCCCATGCCTATTGTTCTCAGATGCTCCTTCCTCTTCCTTTTGGTTCGCACAATATTTTAGTGGAGGGAGTGAAAAATATCCAAACATATTCATGTGTCTAGATAATGAGGATTTGGGGCTTTGGGCCTTGACAGTGAGTCAGGAAGAGGAAGAAAAGAGAGTCTAAGAGCAGCAGGCATGGGAACATGGAGGAAAAAACATATATAGTTTTCTTCC .((((.(((.........(((((((.(((..((((((((((.(((((((.((((.(((((((((((((((...(((((((...........(((...(((..........)))...))).(((((...........)))))...((((((((...))))))))..)))))))))))))))))))....))).)))).))))))).)))))))))).)))..)))))))........))).)))).... 17707912 17708119 TTCCTGATGCCTCCCATGCCTATTGTTCTCAGATGCTCCTTCCTCTTCCTTTTGGTTCGCACAATATTTTAGTGGAGGGAGTGAAAAATATCCAAACATATTCATGTGTCTAGATAATGAGGATTTGGGGCTTTGGGCCTTGACAGTGAGTCAGGAAGAGGAAGAAAAGAGAGTCTAAGAGCAGCAGGCATGGGAACATGGAGGAAAA (((((.(((..((((((((((.(((((((.((((.(((((((((((((((...(((((((...........(((...(((..........)))...))).(((((...........)))))...((((((((...))))))))..)))))))))))))))))))....))).)))).))))))).)))))))))).)))..))))).. Oru-miR2118a 17708098 17708119 TTCCTGATGCCTCCCATGCCTA Oru-miR2118a* 17707912 17707932 GCATGGGAACATGGAGGAAAA 3 Oru-MIR2118b PmiREN013951 MIR2118 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 17721727 17721948 - TGGAAATTTGGTTTGGTTTTTTCCCGATGCCTCCCATTCCTATCGTTCTTAAGCACTTCTTCCTCTTCCTTTCAGCTCGCACGATTACTTTAATGGAGAAATTAGAACACATATTTTGGATAGCTTGAGATCTTCGAAGGCGGGATCGGAAGAGGAAGAAAAGAGGGCCAAGGAGCAGTGGGCATGGGGACATGAAGGAATGCTTAAGCCCCTCTCCAATCC .........((((((((...((((..(((.(.(((((.(((((.((((((..((.((((((((((((((..((((((..((.(((...((((((......))))))......))).))...))).)))(((((.((....)))))))))))))))))))....)).))..)))))).))))).)))))).)))...)))).)).))))))............ 17721747 17721928 TTCCCGATGCCTCCCATTCCTATCGTTCTTAAGCACTTCTTCCTCTTCCTTTCAGCTCGCACGATTACTTTAATGGAGAAATTAGAACACATATTTTGGATAGCTTGAGATCTTCGAAGGCGGGATCGGAAGAGGAAGAAAAGAGGGCCAAGGAGCAGTGGGCATGGGGACATGAAGGAATG ((((..(((.(.(((((.(((((.((((((..((.((((((((((((((..((((((..((.(((...((((((......))))))......))).))...))).)))(((((.((....)))))))))))))))))))....)).))..)))))).))))).)))))).)))...)))).. Oru-miR2118b 17721907 17721928 TTCCCGATGCCTCCCATTCCTA Oru-miR2118b* 17721747 17721767 GCATGGGGACATGAAGGAATG 3 Oru-MIR2118c PmiREN013952 MIR2118 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 17708153 17708380 - AGCTAGAGATTTGCTCAGTTTTCCCGATGCCTCCTATTCCTACCAATCTTAGGTACTCCTTCCTCTTCCTTTTAGCTCATGCTACTATTTTAAGGGAGAAAAACAGAAGTGCCAATGCATAGGTTTAGATGATGAGTCATTGGAAGTGGATCAGGAAGAGGAAGAAAAGAGGGTCTGAGAGCGGTGGGCATGGGAACATGGAGGAAAGCCCAAACTCTTCTTCGCCTC ((..((((.((((....((((((((.(((..((((((.((((((..(((((((..(((((((((((((((..((((....))))(((((((....((......((.....(((........))).....)).....))....)))))))...))))))))))))....)))..)))))))..)))))).)))))).))).).))))))).)))))))).))....... 17708173 17708360 TTCCCGATGCCTCCTATTCCTACCAATCTTAGGTACTCCTTCCTCTTCCTTTTAGCTCATGCTACTATTTTAAGGGAGAAAAACAGAAGTGCCAATGCATAGGTTTAGATGATGAGTCATTGGAAGTGGATCAGGAAGAGGAAGAAAAGAGGGTCTGAGAGCGGTGGGCATGGGAACATGGAGGAAAG (((((.(((..((((((.((((((..(((((((..(((((((((((((((..((((....))))(((((((....((......((.....(((........))).....)).....))....)))))))...))))))))))))....)))..)))))))..)))))).)))))).))).).)))).. Oru-miR2118c 17708339 17708360 TTCCCGATGCCTCCTATTCCTA Oru-miR2118c* 17708173 17708193 GCATGGGAACATGGAGGAAAG 3 Oru-MIR2118d PmiREN013953 MIR2118 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 17705512 17705735 - GGATATTTGTCTCAGTATTTTTCCCGATGCCTCCCATTCCTATCGTTCTTAGGTGCTCCTTCCTCTTCCTTTCAGCTCATAGAGATATTTTAGTTGAGAAAAATATATTAATGTTTAGGTTTGGATGATGAGATTGAGAGAGTGGGTCAGGAAGAGGAAGAATAGAGCACCTAAGAGCAGTGGGCATGGGAACATGGAGGAAAGCTCAAACTCTTCTGTCCCTC ..................(((((((.(((..((((((.(((((.((((((((((((((((((((((((((.((.((((.....(((......(((.(((.((((((....))))))...))).)))......)))....)))).))..))))))))))))....)))))))))))))).))))).)))))).))).).)))))).................... 17705532 17705715 TTCCCGATGCCTCCCATTCCTATCGTTCTTAGGTGCTCCTTCCTCTTCCTTTCAGCTCATAGAGATATTTTAGTTGAGAAAAATATATTAATGTTTAGGTTTGGATGATGAGATTGAGAGAGTGGGTCAGGAAGAGGAAGAATAGAGCACCTAAGAGCAGTGGGCATGGGAACATGGAGGAAAG (((((.(((..((((((.(((((.((((((((((((((((((((((((((.((.((((.....(((......(((.(((.((((((....))))))...))).)))......)))....)))).))..))))))))))))....)))))))))))))).))))).)))))).))).).)))).. Oru-miR2118d 17705694 17705715 TTCCCGATGCCTCCCATTCCTA Oru-miR2118d* 17705532 17705552 GCATGGGAACATGGAGGAAAG 3 Oru-MIR2118e PmiREN013954 MIR2118 Oryza rufipogon Oru-HG417175.1 6919418 6919645 - AGCTAAATTTTCTCTGCGTTTTCCCGATGCCTCCTATTCCTACCGATCTTAGGTACTCCTTCCTCTTCCTTTAAGCTCATGCTATTATTTTAAGGGGAGAGAAACAGAAGTACCAATGCATAGGTTTAGATAATGATGTGTTGGAAGCGAATCAGGAAGAGGAAGAAAAGAGGGTCTGAGAGCAGTGGGCATGGGACATGGAGGAATGCCCAAGCTCTTTTCTGCCTC ((((..........((.((.(((((.(((..((((((.(((((.(.(((((((..(((((((((((((((...(((....)))..((((((...............))))))(((((((((..(((.....))).))))))))).........))))))))))))....)))..))))))).).))))).))))))))).).)))).)).))))))............ 6919438 6919625 TTCCCGATGCCTCCTATTCCTACCGATCTTAGGTACTCCTTCCTCTTCCTTTAAGCTCATGCTATTATTTTAAGGGGAGAGAAACAGAAGTACCAATGCATAGGTTTAGATAATGATGTGTTGGAAGCGAATCAGGAAGAGGAAGAAAAGAGGGTCTGAGAGCAGTGGGCATGGGACATGGAGGAATG (((((.(((..((((((.(((((.(.(((((((..(((((((((((((((...(((....)))..((((((...............))))))(((((((((..(((.....))).))))))))).........))))))))))))....)))..))))))).).))))).))))))))).).)))).. Oru-miR2118e 6919604 6919625 TTCCCGATGCCTCCTATTCCTA Oru-miR2118e* 6919438 6919458 GGCATGGGACATGGAGGAATG 3 Oru-MIR2275a PmiREN013955 MIR2275 Oryza rufipogon Oru-HG417171.1 14346863 14346960 - TATATGTGCCATTTGAAATGAGGATTAGAGGGAACTGAACCTTTGATGAAGATCAGAAGGTTCAGTTTCCATATCTCACCTTGAATGGCCCATCTGGA .......(((((((((..(((((..((..((((((((((((((((((....))))).))))))))))))).)))))))..)))))))))......... 14346883 14346940 AGGATTAGAGGGAACTGAACCTTTGATGAAGATCAGAAGGTTCAGTTTCCATATCTCA (((..((..((((((((((((((((((....))))).))))))))))))).))))).. Oru-miR2275a 14346920 14346940 AGGATTAGAGGGAACTGAACC Oru-miR2275a* 14346883 14346903 AGGTTCAGTTTCCATATCTCA 3 Oru-MIR2275b PmiREN013956 MIR2275 Oryza rufipogon Oru-HG417171.1 14347034 14347164 - TTGTTCAGGCACTGGAAGTGAGAATTGGAGGAAAACAAACTGATTGCTGGTTGATGCTTGCAACAGTGTGGCAAACAATTAATATTCAGATTGTTTTTCTCCAATATCTCACCTTCAGGTTGATTGCTTGA ..............((((((((((((((((((((((((.((((.((.((((((.((((.((....))..))))..)))))).)).)))).))))))))))))))).))))).))))............... 14347054 14347144 AGAATTGGAGGAAAACAAACTGATTGCTGGTTGATGCTTGCAACAGTGTGGCAAACAATTAATATTCAGATTGTTTTTCTCCAATATCTCA ((((((((((((((((((.((((.((.((((((.((((.((....))..))))..)))))).)).)))).))))))))))))))).))).. Oru-miR2275b 14347124 14347144 AGAATTGGAGGAAAACAAACT Oru-miR2275b* 14347054 14347074 TTGTTTTTCTCCAATATCTCA 3 Oru-MIR2275c PmiREN013957 MIR2275 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 3397858 3397984 - TTGTTCAGGCACTGGAAGTGAGAATTGGAGGAAAACAAACTGATTGCTGGTTGTTGTTTGCAACAGTGTGGCAAACAATGTTCAGCTTGTTTTTCTCCAATATCTCACCTTCAGGTTGATTGCTTGA ............((((.(((((((((((((((((((((.......(((((.((((((((((.((...)).)))))))))).)))))))))))))))))))).)))))).)))).............. 3397878 3397964 AGAATTGGAGGAAAACAAACTGATTGCTGGTTGTTGTTTGCAACAGTGTGGCAAACAATGTTCAGCTTGTTTTTCTCCAATATCTCA ((((((((((((((((((.......(((((.((((((((((.((...)).)))))))))).)))))))))))))))))))).))).. Oru-miR2275c 3397944 3397964 AGAATTGGAGGAAAACAAACT Oru-miR2275c* 3397878 3397898 TTGTTTTTCTCCAATATCTCA 3 Oru-MIR2275d PmiREN013958 MIR2275 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 3397681 3397784 - TATATGTGCCATTTGAAATGAGGATTAGAGGGAACTGAACCATTTTGATGAATATCAGAAGGTTCAGTTTCCTCTAATATCTCGCCTTGAATGGCCCATCCGGA ...(((.(((((((((..(((((((((((((((((((((((.(((((((....))))))))))))))))))))))))).)))))..))))))))).)))..... 3397701 3397764 AGGATTAGAGGGAACTGAACCATTTTGATGAATATCAGAAGGTTCAGTTTCCTCTAATATCTCG (((((((((((((((((((((.(((((((....))))))))))))))))))))))))).))).. Oru-miR2275d 3397744 3397764 AGGATTAGAGGGAACTGAACC Oru-miR2275d* 3397701 3397721 TCAGTTTCCTCTAATATCTCG 3 Oru-MIR2863 PmiREN013959 MIR2863 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 3838574 3838694 - CGTGGATACTCTTTTACCCACACTAGTTCAACTAAATGAACTAAATTTCACTTTTAGAATCACAAAAAATGAAATGTAGTTCGTTTATTTGGACTAGAGTGGGTCAATTAGTACCTATGGG (((((.((((..((.((((((.(((((((((.(((((((((((.((((((.((((.(.....).)))).)))))).))))))))))).))))))))).)))))).))..)))).))))).. 3838594 3838674 CACTAGTTCAACTAAATGAACTAAATTTCACTTTTAGAATCACAAAAAATGAAATGTAGTTCGTTTATTTGGACTAGAGTG (.(((((((((.(((((((((((.((((((.((((.(.....).)))).)))))).))))))))))).))))))))).).. Oru-miR2863 3838594 3838614 TCGTTTATTTGGACTAGAGTG Oru-miR2863* 3838654 3838674 CACTAGTTCAACTAAATGAAC 3 Oru-MIR2867 PmiREN013960 MIR2867 Oryza rufipogon Oru-HG417175.1 16094919 16095033 + TGATCAATTGACGGCGTGTGCCATCCCACACATCCCGATCATGGCGTGTGACACAACTGGATGTGCGTGCCACGACCAGGACGTGTGGGATGGCACATGTTGTCAACCAATCATG ((((...((((((((((((((((((((((((.(((.(.((.((((((((.(((........))))))))))).)).).))).))))))))))))))))))))))))...)))).. 16094939 16095013 CCATCCCACACATCCCGATCATGGCGTGTGACACAACTGGATGTGCGTGCCACGACCAGGACGTGTGGGATGGCA (((((((((((.(((.(.((.((((((((.(((........))))))))))).)).).))).))))))))))).. Oru-miR2867 16094994 16095013 CCAGGACGTGTGGGATGGCA Oru-miR2867* 16094939 16094959 CCATCCCACACATCCCGATCA 3 Oru-MIR2871 PmiREN016164 MIR2871 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 6628917 6629064 + TGATGGCTGCCCACCATGGTGACCGTAGAAACTAACATAGAAAAAGAGGTAGATATCTCAAGTGACTTTGTTCATTTACGTTGGAATAGACAAGTAACTACCTTTTCTATTTTAGTTTCTATGGTCACTATGGTGGCAGCCATGATAG ....................(((((((((((((((.((((((...(((((((.(((...........(((((.((((......)))).)))))))).))))))))))))).)))))))))))))))...................... 6628937 6629044 GACCGTAGAAACTAACATAGAAAAAGAGGTAGATATCTCAAGTGACTTTGTTCATTTACGTTGGAATAGACAAGTAACTACCTTTTCTATTTTAGTTTCTATGGTCAC (((((((((((((((.((((((...(((((((.(((...........(((((.((((......)))).)))))))).))))))))))))).))))))))))))))).. Oru-miR2871 6629024 6629044 TATTTTAGTTTCTATGGTCAC Oru-miR2871* 6628937 6628957 GACCGTAGAAACTAACATAGA 3 Oru-MIR2873a PmiREN013961 MIR2873 Oryza rufipogon Oru-HG417175.1 27677877 27678004 - GCAGATATGAAATATATTCTTACCAAATTTCAAGTTCAAACTCAACTTTATTTGTGAGAATTTTTGTTTCTCTCAAATGAAGCTAAGTTTGGACTTAAATTTGGTAACAATGTATTTCATATCTACAC (.((((((((((((((((.(((((((((((.(((((((((((...(((((((((.(((((.......))))).)))))))))...)))))))))))))))))))))).)))))))))))))))).).. 27677897 27677984 TACCAAATTTCAAGTTCAAACTCAACTTTATTTGTGAGAATTTTTGTTTCTCTCAAATGAAGCTAAGTTTGGACTTAAATTTGGTAAC ((((((((((.(((((((((((...(((((((((.(((((.......))))).)))))))))...))))))))))))))))))))).. Oru-miR2873a 27677897 27677920 AAGTTTGGACTTAAATTTGGTAAC Oru-miR2873a* 27677964 27677984 TACCAAATTTCAAGTTCAAAC 3 Oru-MIR2873b PmiREN013962 MIR2873 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 31267854 31268011 - ATAGACATGAAATACATTCATACCAAATCTCAAGTCCAAACTCAACTTCATTTGAGAGAAACAAAAAAGACAAATTTGAGGTGAATAGTGTTTTTTTTCTCTCAAATGAAGTTGAGTTTGGACTTGAGATTTGGTATGAATGTATTTCATGCCTATAC ((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....(((((((...((......))...))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))).. 31267874 31267991 TACCAAATCTCAAGTCCAAACTCAACTTCATTTGAGAGAAACAAAAAAGACAAATTTGAGGTGAATAGTGTTTTTTTTCTCTCAAATGAAGTTGAGTTTGGACTTGAGATTTGGTATG (((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....(((((((...((......))...)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).. Oru-miR2873b 31267874 31267894 TTGGACTTGAGATTTGGTATG Oru-miR2873b* 31267971 31267991 TACCAAATCTCAAGTCCAAAC 3 Oru-MIR3979 PmiREN013976 MIR3979 Oryza rufipogon Oru-HG417175.1 19779894 19780026 + TAAACGGCACGGTTTTCTTGGATCTCTCTCTCCCTTGAAGGCTATCTCATGGAGGTTTGATGTACACCATTGTTGCCTAAGAAACTGAGAAAGCCTTCGGGGGAGGAGAGAAGCCAAGCAAGCCACAGTGTCT .....((((((((((.(((((.((((((.((((((((((((((.((((((..((((.(((((.....)))))..))))..)....))))).))))))))))))))))))))..))))).)))))...))))). 19779914 19780006 ATCTCTCTCTCCCTTGAAGGCTATCTCATGGAGGTTTGATGTACACCATTGTTGCCTAAGAAACTGAGAAAGCCTTCGGGGGAGGAGAGAAGC .((((((.((((((((((((((.((((((..((((.(((((.....)))))..))))..)....))))).))))))))))))))))))))..) Oru-miR3979 19779987 19780006 CTTCGGGGGAGGAGAGAAGC Oru-miR3979* 19779914 19779934 ATCTCTCTCTCCCTTGAAGGC 3 Oru-MIR5504 PmiREN013992 MIR5504 Oryza rufipogon Oru-HG417174.1 15062918 15063023 - AATTGCTGAATTTTGTTCGTTGGAGCTTGTTCTGTTATTTTATTTGCACTGCCGTAGGAAATACACAGTGACGGGAGGACTGCAAGGTTCTTCAGCTTTTTCTGGA ....((((((....(..(.(((.((.((.((((((((((.(((((.(((....)).).)))))...)))))))))).)))).))).)..))))))).......... 15062938 15063003 TGGAGCTTGTTCTGTTATTTTATTTGCACTGCCGTAGGAAATACACAGTGACGGGAGGACTGCAAG ((.((.((.((((((((((.(((((.(((....)).).)))))...)))))))))).)))).)).. Oru-miR5504 15062938 15062957 AGTGACGGGAGGACTGCAAG Oru-miR5504* 15062983 15063003 TGGAGCTTGTTCTGTTATTTT 3 Oru-MIR5827 PmiREN013993 MIR5827 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 25542721 25542918 - TTGGGCTAGGTATTTTCACCTTTGTTGCAATTTGGACTACCCTAAACCACTTCTTCAGCACATCAATTCCAGCCCACCGGTGAACTCCTCCACCTCTTTGCAGATTCATATCTTTGCTGGAGGAGAGGCCAGACATGGCTAGGGAAGAGAGTTGAGGTGGTCCAAAGTGCAACAAAGTAAAAAATACCTGGTCCAAAG ((((((((((((((((...((((((((((.(((((((((((.....................((((((((..(((.........((((((((.......(((((........))))))))))))).(((((....))))).)))..).)))))))))))))))))).))))))))))...)))))))))))))))).. 25542741 25542898 TTTGTTGCAATTTGGACTACCCTAAACCACTTCTTCAGCACATCAATTCCAGCCCACCGGTGAACTCCTCCACCTCTTTGCAGATTCATATCTTTGCTGGAGGAGAGGCCAGACATGGCTAGGGAAGAGAGTTGAGGTGGTCCAAAGTGCAACAAAGT (((((((((.(((((((((((.....................((((((((..(((.........((((((((.......(((((........))))))))))))).(((((....))))).)))..).)))))))))))))))))).))))))))).. Oru-miR5827 25542878 25542898 TTTGTTGCAATTTGGACTACC Oru-miR5827* 25542741 25542761 TGGTCCAAAGTGCAACAAAGT 3 Oru-MIR5828 PmiREN013994 MIR5828 Oryza rufipogon Oru-HG417174.1 13801407 13801562 + AAAACAAAAGTAAAGTAAATTGTTACGGCATTAAAAGTAAATCTATTATAGGGGTAAAAATATAAGTCTATCTAGAAATTAGATTTAATCAACATATCACAGTTACCCCACAACGGATTTACTTCTAATGTCGTGACAAGTTACTTTCCTTCTGTT ..((((.(((.(((((((.((((((((((((((.((((((((((......(((((((.....((((((((.........))))))))...............))))))).....)))))))))).)))))))))))))).))))))).))).)))) 13801427 13801542 TTACGGCATTAAAAGTAAATCTATTATAGGGGTAAAAATATAAGTCTATCTAGAAATTAGATTTAATCAACATATCACAGTTACCCCACAACGGATTTACTTCTAATGTCGTGACA (((((((((((.((((((((((......(((((((.....((((((((.........))))))))...............))))))).....)))))))))).))))))))))))) Oru-miR5828 13801427 13801447 TTACGGCATTAAAAGTAAATC Oru-miR5828* 13801522 13801542 TTTACTTCTAATGTCGTGACA 3 Oru-MIR6251 PmiREN013995 MIR6251 Oryza rufipogon Oru-HG417173.1 13532049 13532283 + CTGCAGCTGACATGGCATGCCATGTGTAGCCACATTGTAAGGGAGTCCTTGTGCACATGGTCAATCTCGCAGAAAGCCCACTGCAATCCAAATCTTCTTCACGATTGTTCCTATTCACCAAATCACCCGTCTTCTCGAATGACCGCCCACCATTTCCCTCTGTTGCTGTTGCTAACATCCATGGCCCAGGGACCCACTTGCAGCGTGGCTACATGTGGCATGCCACGTTAGCTGG ...((((((((.(((((((((((((((((((((.(((((((((.(((((((.((.(((((........((((........))))......((((........))))................(((..((......))..)))..................((((((....)).)))).))))))).))))))))).))))))).))))))))))))))))))))).)))))))). 13532069 13532263 TGTGTAGCCACATTGTAAGGGAGTCCTTGTGCACATGGTCAATCTCGCAGAAAGCCCACTGCAATCCAAATCTTCTTCACGATTGTTCCTATTCACCAAATCACCCGTCTTCTCGAATGACCGCCCACCATTTCCCTCTGTTGCTGTTGCTAACATCCATGGCCCAGGGACCCACTTGCAGCGTGGCTACATGTG (((((((((((.(((((((((.(((((((.((.(((((........((((........))))......((((........))))................(((..((......))..)))..................((((((....)).)))).))))))).))))))))).))))))).))))))))))))) Oru-miR6251 13532069 13532089 TGTGTAGCCACATTGTAAGGG Oru-miR6251* 13532243 13532263 CTTGCAGCGTGGCTACATGTG 3 Oru-MIR9777 PmiREN013998 MIR9777 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 1680920 1681080 - TTTGTGGTTTTGGTGGATTGTGCCGTGATGATTGCTCGCTTATTTCTGACACCTCTTGTATGAGAAGTTGTTCTTTCCTCTTCCTTGGGGATGAGGAGGAGCACTTCGCTGAGCAGATTGTAGCAAATATATCTGAGCACACGCATCCTCGCTCATTAAAA ((.(((((...((((...(((((((.((((.(((((.((.....((((....(((..((....(((((.((((((.((((.(((....))).))))))))))))))))).)))))))..)))))))...)))))).)))))..))))...)).))).)).. 1680940 1681060 TGCCGTGATGATTGCTCGCTTATTTCTGACACCTCTTGTATGAGAAGTTGTTCTTTCCTCTTCCTTGGGGATGAGGAGGAGCACTTCGCTGAGCAGATTGTAGCAAATATATCTGAGCACA (((((.((((.(((((.((.....((((....(((..((....(((((.((((((.((((.(((....))).))))))))))))))))).)))))))..)))))))...)))))).))).. Oru-miR9777 1680940 1680961 GTAGCAAATATATCTGAGCACA Oru-miR9777* 1681040 1681060 TGCCGTGATGATTGCTCGCTT 3 Oru-MIRN221a PmiREN014040 MIRN221 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 20849405 20849663 + TCTAACCACTGAGTTAAGTAGGCAATTTATCACCACAAAGGAAGACCCTTTACTTCGATCGATTATAGATCGAATCCTTTTTATAAGCAAATACCGCTTCGTTATTGGTATGTTATTATAGTAAACAGATCAAAGGATATCCTCTACTATTAGAGAATATTTATCTTGACAAGAAATTCTCTATATATTAAGATATCTCTGACAAGGGCTATAGCTCAGTTCGGTAGAGCAAGTCATTTACACGTGCGCC ((((.((((((((((..((((.(.............(((((.....)))))...((((((.......))))))(((((((((((((....((((((.........))))))....))))))..........)))))))...........(((((((.....((((((((..(((.....))).....)))))))))))))))....).))))))))))))..))))))(((.((.......)).)))... 20849425 20849643 CCACTGAGTTAAGTAGGCAATTTATCACCACAAAGGAAGACCCTTTACTTCGATCGATTATAGATCGAATCCTTTTTATAAGCAAATACCGCTTCGTTATTGGTATGTTATTATAGTAAACAGATCAAAGGATATCCTCTACTATTAGAGAATATTTATCTTGACAAGAAATTCTCTATATATTAAGATATCTCTGACAAGGGCTATAGCTCAGTTCGG ((((((((((..((((.(.............(((((.....)))))...((((((.......))))))(((((((((((((....((((((.........))))))....))))))..........)))))))...........(((((((.....((((((((..(((.....))).....)))))))))))))))....).))))))))))))..)) Oru-miRN221a 20849624 20849643 AGGGCTATAGCTCAGTTCGG Oru-miRN221a* 20849425 20849445 CCACTGAGTTAAGTAGGCAAT 3 Oru-MIRN221b PmiREN014045 MIRN221 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 998740 998998 - TCTAACCATTGAGTTAAGTAGGCAATTTATCACCACAAAGGAAGACCCTTTACTTCGATCGATTATAGATCGAATCCTTTTTATAAGCAAATACCGCTTCGTTATTGGTATGTTATTATAGTAAACAGATCAAAGGATATCCTCTACTATTAGAGAATATTCATCTTGCCAAGAAATTCTCTATATATTAAGATATCTCTGACAAGGGCTATAGCTCAGTTCGGTAGAGCAACTAGTTTACACGTGCGCC ((((.((((((((((..((((.(.............(((((.....)))))..(((((((.......)))))))......((((((....((((((.........))))))....))))))........(((..(((((((.........((((((((.(((..........)))))))))))........))))))).)))....).))))))))))))..))))))(((.............)))... 998760 998978 CCATTGAGTTAAGTAGGCAATTTATCACCACAAAGGAAGACCCTTTACTTCGATCGATTATAGATCGAATCCTTTTTATAAGCAAATACCGCTTCGTTATTGGTATGTTATTATAGTAAACAGATCAAAGGATATCCTCTACTATTAGAGAATATTCATCTTGCCAAGAAATTCTCTATATATTAAGATATCTCTGACAAGGGCTATAGCTCAGTTCGG ((((((((((..((((.(.............(((((.....)))))..(((((((.......)))))))......((((((....((((((.........))))))....))))))........(((..(((((((.........((((((((.(((..........)))))))))))........))))))).)))....).))))))))))))..)) Oru-miRN221b 998760 998779 AGGGCTATAGCTCAGTTCGG Oru-miRN221b* 998958 998978 CCATTGAGTTAAGTAGGCAAT 3 Oru-MIRN789 PmiREN014010 MIRN789 Oryza rufipogon Oru-HG417169.1 17593982 17594098 - GTGGAGGAAGGGTACTCCCTCCATTCCAAAATGTAAGTATTTTTATTTATGAATTGTCCAGATTCATAGCTAAAAATTGCTATGTTTTGGGACGGAGGTAGTAGTTAATTAGGTCGG .........((.((((.(((((.((((((((((((.(((((((((.(((((((((.....))))))))).)))))).))))))))))))))).))))).)))).))........... 17594002 17594078 CCATTCCAAAATGTAAGTATTTTTATTTATGAATTGTCCAGATTCATAGCTAAAAATTGCTATGTTTTGGGACGGAG ((.((((((((((((.(((((((((.(((((((((.....))))))))).)))))).))))))))))))))).)).. Oru-miRN789 17594002 17594022 TTGCTATGTTTTGGGACGGAG Oru-miRN789* 17594058 17594078 CCATTCCAAAATGTAAGTATT 3 Oru-MIRN1147 PmiREN014027 MIRN1147 Oryza rufipogon Oru-HG417174.1 6536078 6536333 + GCCGAGTCGGACGCTGCTCCCTGATGATGATCTTCCGTACACACGGCAAGTGTTCAGATGGATTCAGTGACGACCAAATAACCTCGCCGCCGATTAGATTAATCCGGCGATACTAGATTAATTTCGGCCGTTTAGCCGAAACTTGGATTTGACGAAACGGTAGCTACTTGATTAAACGAAATTCGGCCGTGATATAGCCGATTAGATCGTTCCCCAGCGGAGTCGCCAAAAATCGTGTTGGCAACTTTTT (((((..(((..((.((((((((..((((((((((.((...((((((.....(((.....((((.((((.(.(((........((((((..(((((...)))))))))))...((((((..(((((((......)))))))....)))))).......))).).)))).))))....))).....)))))).....)).))..))))))))...))).))))).))......)))..)))))........ .-69. 6536098 6536313 GCTGCTCCCTGATGATGATCTTCCGTACACACGGCAAGTGTTCAGATGGATTCAGTGACGACCAAATAACCTCGCCGCCGATTAGATTAATCCGGCGATACTAGATTAATTTCGGCCGTTTAGCCGAAACTTGGATTTGACGAAACGGTAGCTACTTGATTAAACGAAATTCGGCCGTGATATAGCCGATTAGATCGTTCCCCAGCGGAGTCGCCA ((.((((((((..((((((((((.((...((((((.....(((.....((((.((((.(.(((........((((((..(((((...)))))))))))...((((((..(((((((......)))))))....)))))).......))).).)))).))))....))).....)))))).....)).))..))))))))...))).))))).)).. Oru-miRN1147 6536293 6536313 CGTTCCCCAGCGGAGTCGCCA Oru-miRN1147* 6536098 6536118 GCTGCTCCCTGATGATGATCT 3 Oru-MIRN2170 PmiREN014002 MIRN2170 Oryza rufipogon Oru-HG417176.1 15919816 15919961 - GTGCAATTTGGTTGGCTCAAAGGCTGATCCACTCCAGAGGAGGTTTCGTAGGACAGATCCCCTCGATTCATTGTCACTCGTTCATGGATCATCCCGATGAACATCCTCAGGAGTGGATTGGGCTTCAAGACAGCAAATTATACTTC ....((((((.(((.((..(((.((((((((((((.(((((.(((.(((.(((..(((((...(((...........))).....))))).)))..)))))).))))).)))))))))))).)))..)).)))))))))....... 15919836 15919941 AGGCTGATCCACTCCAGAGGAGGTTTCGTAGGACAGATCCCCTCGATTCATTGTCACTCGTTCATGGATCATCCCGATGAACATCCTCAGGAGTGGATTGGGCTTC ((.((((((((((((.(((((.(((.(((.(((..(((((...(((...........))).....))))).)))..)))))).))))).)))))))))))).)).. Oru-miRN2170 15919836 15919856 CTCAGGAGTGGATTGGGCTTC Oru-miRN2170* 15919921 15919941 AGGCTGATCCACTCCAGAGGA 3 Oru-MIRN2180a PmiREN014032 MIRN2180 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 7858879 7859034 - TTCCAAATGTATGATTGATGCTTCCTAGTTGACCAACATACCACCAAAGACTATGAAGCCTGGTTACCACTGCTAATAACGCTGGTACACAGGCTGAACTGCAGTTTTCGGTGGTATGTTGGCAATGTAGGAAGTCTGAGTGATATATCTGCAAG ...((.((((((.(((.(.((((((((((((.(((((((((((((.((((((....((((((..(((((..((.......)))))))..)))))).......)))))).))))))))))))))))).)))))))).).))).)))))).)).... 7858899 7859014 CTTCCTAGTTGACCAACATACCACCAAAGACTATGAAGCCTGGTTACCACTGCTAATAACGCTGGTACACAGGCTGAACTGCAGTTTTCGGTGGTATGTTGGCAATGTAGGAAGTC (((((((((((.(((((((((((((.((((((....((((((..(((((..((.......)))))))..)))))).......)))))).))))))))))))))))).))))))).. Oru-miRN2180a 7858899 7858919 ATGTTGGCAATGTAGGAAGTC Oru-miRN2180a* 7858994 7859014 CTTCCTAGTTGACCAACATAC 3 Oru-MIRN2180b PmiREN014034 MIRN2180 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 7858265 7858492 - GGGTTGCAGTTTTATGTGGTATGTTGGCAATGTAGGAAGTCTGAATCGTATATTTGCAAGGTTGTCCAAACATACTTGTCTGTAGGCAATTTCTCAGCTAAAAAAATTGAAGTCTTGAAATTATCTATAATTTTGTCCTCTATATGTGCTTAAAACTTGCTGAGTTCACATGCCAGTTTTTTATGAAAGCTCCCTCGTGCCAACAACAAGGCAAATGAATTAGTTTGC ..................((.((((((((.((.(((.((.((...(((((.....(((((..(((....)))..))))).((((((.((((((...(((...........)))...)))))).))))))......................((((((.((((......)).)).)))))).))))).)))).)))))))))))))))...((((((......)))))) 7858285 7858472 ATGTTGGCAATGTAGGAAGTCTGAATCGTATATTTGCAAGGTTGTCCAAACATACTTGTCTGTAGGCAATTTCTCAGCTAAAAAAATTGAAGTCTTGAAATTATCTATAATTTTGTCCTCTATATGTGCTTAAAACTTGCTGAGTTCACATGCCAGTTTTTTATGAAAGCTCCCTCGTGCCAACAACA .((((((((.((.(((.((.((...(((((.....(((((..(((....)))..))))).((((((.((((((...(((...........)))...)))))).))))))......................((((((.((((......)).)).)))))).))))).)))).)))))))))))))... Oru-miRN2180b 7858452 7858472 ATGTTGGCAATGTAGGAAGTC Oru-miRN2180b* 7858285 7858305 AGCTCCCTCGTGCCAACAACA 3 Oru-MIRN2180c PmiREN014035 MIRN2180 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 7856966 7857192 - AGGTTGTAATTTTCTGTGGTATGTTGGCAATGTAGGAAGTCTGAATGGTATATCTGCAAGGTTGTCCAGATGTACTGGGCTGTAGGCAATTCTGGCTTGCCAGCTGAAAATGTAGAAGGCTTGATCTAATATATGATTTTGTCCTTTGTACTGTCCTTGCTTGAAACTTCTAATTCACATGCCGATTTTCTTTACATGCAAACTCACCCTTTCTTAAAACTTCTAAT (........).......(((..(((.(((.(((((((((((.....(((((....((((((....((((.....))))(((((((((.......))))).)))).......(((((((((..((((........))))..).))))).)))...)))))).((((........)))).)))))))))))))..)))))).)))..)))................... 7856986 7857172 ATGTTGGCAATGTAGGAAGTCTGAATGGTATATCTGCAAGGTTGTCCAGATGTACTGGGCTGTAGGCAATTCTGGCTTGCCAGCTGAAAATGTAGAAGGCTTGATCTAATATATGATTTTGTCCTTTGTACTGTCCTTGCTTGAAACTTCTAATTCACATGCCGATTTTCTTTACATGCAAACTCAC ..(((.(((.(((((((((((.....(((((....((((((....((((.....))))(((((((((.......))))).)))).......(((((((((..((((........))))..).))))).)))...)))))).((((........)))).)))))))))))))..)))))).))).... Oru-miRN2180c 7857152 7857172 ATGTTGGCAATGTAGGAAGTC Oru-miRN2180c* 7856986 7857006 TTTCTTTACATGCAAACTCAC 3 Oru-MIRN2181a PmiREN014062 MIRN2181 Oryza rufipogon Oru-HG417171.1 15702649 15702759 + CTTGGCAAATTCACAGGCCCTATCTTGTGGTATGAACTGAGAACGCGATGATTTATGGTGCGTATTGGGGGCCGGCTTACCATAAGATAATGTCGTGAATTCGCCAAGCAT ((((((.(((((((.(((..((((((((((((....(((.(..(.(((((............))))).)..))))..))))))))))))..)))))))))).))))))... 15702669 15702739 TATCTTGTGGTATGAACTGAGAACGCGATGATTTATGGTGCGTATTGGGGGCCGGCTTACCATAAGATAAT ((((((((((((....(((.(..(.(((((............))))).)..))))..)))))))))))).. Oru-miRN2181a 15702669 15702689 TATCTTGTGGTATGAACTGAG Oru-miRN2181a* 15702719 15702739 GCCGGCTTACCATAAGATAAT 3 Oru-MIRN2181b PmiREN014063 MIRN2181 Oryza rufipogon Oru-HG417174.1 3630637 3630743 + CTTTGCGAATTCACAGGCCCTATCTTGTGGTATGAACTGAGTACGCGATGATTTATGGCGCATATTGGGGGCTTACCAAAAGATAATGCTGTGAATTTGCAAAGCGC ((((((((((((((((.(..((((((.(((((.(..((.(((((((.(((...))).)))..)))).))..).))))).))))))..)))))))))))))))))... 3630657 3630723 TATCTTGTGGTATGAACTGAGTACGCGATGATTTATGGCGCATATTGGGGGCTTACCAAAAGATAAT ((((((.(((((.(..((.(((((((.(((...))).)))..)))).))..).))))).)))))).. Oru-miRN2181b 3630657 3630677 TATCTTGTGGTATGAACTGAG Oru-miRN2181b* 3630703 3630723 GGGGGCTTACCAAAAGATAAT 3 Oru-MIRN2196 PmiREN014026 MIRN2196 Oryza rufipogon Oru-HG417174.1 8069880 8070012 - GAAGAGAAGCTGAACCCAGAGGAGTGGTACTGAGAACACAGGTGCCAATACAATGTATGGTGAGCTACTGTATAATGGAGTAATTCTGTAACTGTGTTCTCAGGTCACCCCTTTGGGTTTCTTCTCATGATTC .....((((..(((((((((((.((((..((((((((((((..((((.(((...)))))))(((.((((.((...)).)))).))).....)))))))))))).)))).)))))))))))))))......... 8069900 8069992 GGAGTGGTACTGAGAACACAGGTGCCAATACAATGTATGGTGAGCTACTGTATAATGGAGTAATTCTGTAACTGTGTTCTCAGGTCACCCCTT ((.((((..((((((((((((..((((.(((...)))))))(((.((((.((...)).)))).))).....)))))))))))).)))).)).. Oru-miRN2196 8069971 8069992 GGAGTGGTACTGAGAACACAGG Oru-miRN2196* 8069900 8069920 TGTGTTCTCAGGTCACCCCTT 3 Oru-MIRN2205 PmiREN016175 MIRN2205 Oryza rufipogon Oru-HG417169.1 3570003 3570150 + GTGATGGCTGCCCACCATGGTGACCGTAGAAACTAGCATAGAAAAAAGTAGATATCTCAAGTGACTTTGTTCATTTACGTTGGGATAGACAAGTAACTACCTTTTCTATTTTAGTTTCTATGGTCACTTTGGTGGCAGCCATGATAGA ....................((((((((((((((((.((((((((..((((.((((((((((((..........)))).)))))))).........)))).)))))))).))))))))))))))))...................... 3570023 3570130 TGACCGTAGAAACTAGCATAGAAAAAAGTAGATATCTCAAGTGACTTTGTTCATTTACGTTGGGATAGACAAGTAACTACCTTTTCTATTTTAGTTTCTATGGTCACT ((((((((((((((((.((((((((..((((.((((((((((((..........)))).)))))))).........)))).)))))))).)))))))))))))))).. Oru-miRN2205 3570023 3570043 TGACCGTAGAAACTAGCATAG Oru-miRN2205* 3570110 3570130 ATTTTAGTTTCTATGGTCACT 3 Oru-MIRN2213 PmiREN014054 MIRN2213 Oryza rufipogon Oru-HG417171.1 13412779 13412895 - CAAAGAACAGGAAGACATGGCATGGTATTGACTTGGCTCATCTCAGCAACAGCAAACTGCATGCAGCGCTGGAGGTGAGCCGAGCCAATATCACTTCATGTCCTCTTTTGTTCTGTG ...(((((((((.(((((((..((((((((.(((((((((((((.....((((...(((....))).))))))))))))))))).))))))))..))))))).)))..))))))... 13412799 13412875 CATGGTATTGACTTGGCTCATCTCAGCAACAGCAAACTGCATGCAGCGCTGGAGGTGAGCCGAGCCAATATCACTTC ..((((((((.(((((((((((((.....((((...(((....))).))))))))))))))))).)))))))).... Oru-miRN2213 13412854 13412875 CATGGTATTGACTTGGCTCATC Oru-miRN2213* 13412799 13412819 GAGCCGAGCCAATATCACTTC 3 Oru-MIRN2219 PmiREN016174 MIRN2219 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 8148338 8148506 + GCCGGCGGCCTGACATTGGGATCGGAGGCCATGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGATCGATCGATCTATCTATGAAGCTAAGCTAGCTGGCCATGGATCCATCCATCAATTGGCAAGTTGTTCTTGGCTACATCTTGGCCCCTGCTCCTCATGTAAGGCCGGCCTGTG .......................((.(((((.((((.(((((((((((((((((((((.(((.(((..(((((((.(((((...)))))...)))))))..))).))).))))))))))))))))))))).)))).))))))).......................... 8148358 8148486 ATCGGAGGCCATGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGATCGATCGATCTATCTATGAAGCTAAGCTAGCTGGCCATGGATCCATCCATCAATTGGCAAGTTGTTCTTGGCTACATCTTGGCCCCTGCTCC ...((.(((((.((((.(((((((((((((((((((((.(((.(((..(((((((.(((((...)))))...)))))))..))).))).))))))))))))))))))))).)))).)))))))...... Oru-miRN2219 8148358 8148378 ATCGGAGGCCATGGTGCAGCC Oru-miRN2219* 8148466 8148486 CTACATCTTGGCCCCTGCTCC 3 Oru-MIRN2225 PmiREN014005 MIRN2225 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 9115260 9115379 - GAGAGGAAGTGGTAGGATGCAGCTGCCGGTTCATGGATACCTCTAAAGTGCAGGGCAAATAGTCCTACCCTTTCATGGGTTTGCATGACTCGGGAGATGAACCTGCCATTGTCTTCCTCT .(((((((((((((((.(.((.((.((((.(((((.(.((((..((((.(.(((((.....))))).).))))...)))).).))))).)))).)).))).)))))))....)))))))) 9115280 9115359 AGCTGCCGGTTCATGGATACCTCTAAAGTGCAGGGCAAATAGTCCTACCCTTTCATGGGTTTGCATGACTCGGGAGATGA (.((.((((.(((((.(.((((..((((.(.(((((.....))))).).))))...)))).).))))).)))).)).).. Oru-miRN2225 9115339 9115359 AGCTGCCGGTTCATGGATACC Oru-miRN2225* 9115280 9115300 TTTGCATGACTCGGGAGATGA 3 Oru-MIRN2226a PmiREN013999 MIRN2226 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 18678041 18678251 - AAAAAGACAAACCCTGGGTTTCCGTGTTCAACGTTTGACTGTATGTCTTATATAAATTTTTTTTATAATTAGTATTTTTATTGTTGTTAGATGATAAAACATAATTAATACTTTATGCGTGACTTATTTTTTTAATTTGTTTTATATTTTTTTCAAATAAGACGGGTGGTCAAATGTTGGACACGGAAACCTATGTATTTTTTTTTGACGG (((((((...((..((((((((((((((((((((((((((...(((((((((((((.....))))).........((((((((((....))))))))))(((((........)))))...(((..(((.....)))..)))...............))))))))...)))))))))))))))))))))))))).))...)))))))..... 18678061 18678231 TTCCGTGTTCAACGTTTGACTGTATGTCTTATATAAATTTTTTTTATAATTAGTATTTTTATTGTTGTTAGATGATAAAACATAATTAATACTTTATGCGTGACTTATTTTTTTAATTTGTTTTATATTTTTTTCAAATAAGACGGGTGGTCAAATGTTGGACACGGAAAC (((((((((((((((((((((...(((((((((((((.....))))).........((((((((((....))))))))))(((((........)))))...(((..(((.....)))..)))...............))))))))...))))))))))))))))))))).. Oru-miRN2226a 18678211 18678231 TTCCGTGTTCAACGTTTGACT Oru-miRN2226a* 18678061 18678081 TCAAATGTTGGACACGGAAAC 3 Oru-MIRN2226b PmiREN014000 MIRN2226 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 25330174 25330383 + AAAAAGACAAACCCTGGGTTTCCGTGTTCAACGTTTGACTGTCCGTCTTATATGAAATTTTTTTATAATTAGTATTTTCATTGTTGTTAGATGATAAAACATGATTAATACTTTATGCGTGATTTATATTTTTAATTTTTTCATATTTTTTTTAAATAAGACGGATGGTCAAACATTGGACACGGAAAGGTTTGTCTTTTTTTTTTAGAC (((((((((((((.....(((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((..................))))))....((((((..(((((.((((..(((....)))..)))).)))))...))))))...................))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))......... 25330194 25330363 TTCCGTGTTCAACGTTTGACTGTCCGTCTTATATGAAATTTTTTTATAATTAGTATTTTCATTGTTGTTAGATGATAAAACATGATTAATACTTTATGCGTGATTTATATTTTTAATTTTTTCATATTTTTTTTAAATAAGACGGATGGTCAAACATTGGACACGGAAAG ((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((..................))))))....((((((..(((((.((((..(((....)))..)))).)))))...))))))...................))))))))))))))))))).)))))))))))))) Oru-miRN2226b 25330194 25330214 TTCCGTGTTCAACGTTTGACT Oru-miRN2226b* 25330343 25330363 TCAAACATTGGACACGGAAAG 3 Oru-MIRN2226c PmiREN014008 MIRN2226 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 28576924 28577093 - AAAAAGACAAACCCTGAGTTTCCGTGTTCAACGTTTGACTGTCTGTCGTATATAAATTTTTTTTATAATTAGTATTTTAATTGTTGTTAGATGATAAAACATGATTAATACTTTATGTGTGACTACGGTCAAATGTTGGACACGAAAACCCAGGGTTTATCTTTTTTTTT (((((((.((((((((.((((.((((((((((((((((((((..(((((((((((...............((((((.....((((............)))).....))))))))))))))))).)))))))))))))))))))).)))).)))))))).))))))).... 28576944 28577073 TTCCGTGTTCAACGTTTGACTGTCTGTCGTATATAAATTTTTTTTATAATTAGTATTTTAATTGTTGTTAGATGATAAAACATGATTAATACTTTATGTGTGACTACGGTCAAATGTTGGACACGAAAAC ((.((((((((((((((((((((..(((((((((((...............((((((.....((((............)))).....))))))))))))))))).)))))))))))))))))))).)).. Oru-miRN2226c 28577053 28577073 TTCCGTGTTCAACGTTTGACT Oru-miRN2226c* 28576944 28576964 TCAAATGTTGGACACGAAAAC 3 Oru-MIRN2227a PmiREN014001 MIRN2227 Oryza rufipogon Oru-HG417175.1 6307090 6307262 + CGATTAAACCGATTCCATAACCCCTAGGCTATTTTGTGAGACGAATCTAATGATGTATATTAATCCATATTTAGTGGCTGATTACTGTAGCATCACTGTAGCAAATCATGGATTAATATACCTCGTTAGATTCGTCTCGCAAAATAGCCTAGGGGTTATGGAATGGGTTTTGT ..((.(((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((.......))))..))))).....))).)))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))).)) 6307110 6307242 CCTAGGCTATTTTGTGAGACGAATCTAATGATGTATATTAATCCATATTTAGTGGCTGATTACTGTAGCATCACTGTAGCAAATCATGGATTAATATACCTCGTTAGATTCGTCTCGCAAAATAGCCTAGGGG (((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((.......))))..))))).....))).)))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))) Oru-miRN2227a 6307110 6307130 CCTAGGCTATTTTGTGAGACG Oru-miRN2227a* 6307222 6307242 TCTCGCAAAATAGCCTAGGGG 3 Oru-MIRN2227b PmiREN014033 MIRN2227 Oryza rufipogon Oru-HG417169.1 21652863 21653024 - ACAGAACCTATTCCATGATCCCTAGGCTATTTTGTGAGACGAATCTAACGAGGTATATTAATCCATGATTTGCTACAGTAATCAGTCGTTAATCATGGATTAATATACATCATTAGATTTGTCTCGCAAAATAGCCTAGGGGTTATAGAATCGGTTTTGTCG ((((((((.((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((.((.((((((((((((((((((.((.((........)).)).)))))))))))))))))).)).)))))))))))))))))))))))))))))))))).)))).)))))))).. 21652883 21653004 CCTAGGCTATTTTGTGAGACGAATCTAACGAGGTATATTAATCCATGATTTGCTACAGTAATCAGTCGTTAATCATGGATTAATATACATCATTAGATTTGTCTCGCAAAATAGCCTAGGGG ((((((((((((((((((((((((((((.((.((((((((((((((((((.((.((........)).)).)))))))))))))))))).)).)))))))))))))))))))))))))))).. Oru-miRN2227b 21652984 21653004 CCTAGGCTATTTTGTGAGACG Oru-miRN2227b* 21652883 21652903 TCTCGCAAAATAGCCTAGGGG 3 Oru-MIRN2227c PmiREN014061 MIRN2227 Oryza rufipogon Oru-HG417171.1 16935945 16936117 + CGACAAAACCGATTCCATAACCCCTAGGCTATTTTGTGAGACGAATCTAATGATGTATATTAATCAATGATTAACGGCTGATTACTGTAGCATCACTGTAGCAAATCATGGATTAATATACCTCGTTAGATTCGTCTCGCAAAATAGCCTAGGGATTATGGAATGAGTTTTAT ..(.(((((..(((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.((((((.((((.((((.........))))))))....)))))).))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))..))))).) 16935965 16936097 CCTAGGCTATTTTGTGAGACGAATCTAATGATGTATATTAATCAATGATTAACGGCTGATTACTGTAGCATCACTGTAGCAAATCATGGATTAATATACCTCGTTAGATTCGTCTCGCAAAATAGCCTAGGGA (((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.((((((.((((.((((.........))))))))....)))))).))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))). Oru-miRN2227c 16935965 16935985 CCTAGGCTATTTTGTGAGACG Oru-miRN2227c* 16936077 16936097 TCTCGCAAAATAGCCTAGGGA 3 Oru-MIRN2228a PmiREN014003 MIRN2228 Oryza rufipogon Oru-HG417176.1 14755260 14755412 + ATACTGTGAGATACTCCCTCCATTCCAAAATATAGCAACTTTTGGTTAGATGGGATGTATCCCAGTACTACGAATCTGGACACGTAGTACTAGGATACGTCCCATCTAAGCAAAAGTTACTATATTTTAGGACGGAGGGAGTAGACTATAAGG ...........((((((((((..((((((((((((.((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((..........))))))))).))))))))))))))))).)))))))).))))))))).))).)))))))))).......... 14755280 14755392 TTCCAAAATATAGCAACTTTTGGTTAGATGGGATGTATCCCAGTACTACGAATCTGGACACGTAGTACTAGGATACGTCCCATCTAAGCAAAAGTTACTATATTTTAGGACGG .((((((((((((.((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((..........))))))))).))))))))))))))))).)))))))).))))))))).))).)) Oru-miRN2228a 14755280 14755300 TTCCAAAATATAGCAACTTTT Oru-miRN2228a* 14755372 14755392 AGTTACTATATTTTAGGACGG 3 Oru-MIRN2228b PmiREN014024 MIRN2228 Oryza rufipogon Oru-HG417169.1 2277011 2277134 + ATCAAGTTATCTACTACCTCCGTTCCAAAATATAGCAACTTTTGGCTATGAATCTAGACACACAGTTGTCCAGATTCATAGCTAAAAATGTTTATATTTTGGGACGGAGGAAGTAGTTTTATTA ..........(((((.(((((((((((((((((((((..((((((((((((((((.((((......)))).)))))))))))))))).)).))))))))))))))))))).)))))........ 2277031 2277114 TTCCAAAATATAGCAACTTTTGGCTATGAATCTAGACACACAGTTGTCCAGATTCATAGCTAAAAATGTTTATATTTTGGGACG (((((((((((((((..((((((((((((((((.((((......)))).)))))))))))))))).)).))))))))))))))) Oru-miRN2228b 2277031 2277051 TTCCAAAATATAGCAACTTTT Oru-miRN2228b* 2277094 2277114 AAATGTTTATATTTTGGGACG 3 Oru-MIRN2228c PmiREN014043 MIRN2228 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 26142761 26142929 - ATTGATACCTACTCCCTCCGTTCCAAAATATAGCAACTTTTGCTTGGATGGGATGTATCATAGTACTACGAATCTGGCCAGGAGACTTGTCCAGATTCGTAGTACTATGATACGTCTCATCCAACCAAAAATTGCTATATTTTGGGACGGAGGGAGTATCTGAGAGAGC .........(((((((((((((((((((((((((((.(((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((...)))).)))))))))))))))))))))))))))))))))).))))).)))))))))))))))))))))))))))........... 26142781 26142909 TTCCAAAATATAGCAACTTTTGCTTGGATGGGATGTATCATAGTACTACGAATCTGGCCAGGAGACTTGTCCAGATTCGTAGTACTATGATACGTCTCATCCAACCAAAAATTGCTATATTTTGGGACG ((((((((((((((((.(((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((...)))).)))))))))))))))))))))))))))))))))).))))).)))))))))))))))).. Oru-miRN2228c 26142889 26142909 TTCCAAAATATAGCAACTTTT Oru-miRN2228c* 26142781 26142801 AAATTGCTATATTTTGGGACG 3 Oru-MIRN2228d PmiREN014064 MIRN2228 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 4031422 4031548 - CATGGAACCTCCTCCCTCCATTCCAAAATATAGCAACTTTTGCTTTGTCTAGATTCGTAGTACTAGAATACGTCCCATCTAAGCAAAAGTTGCTATATTTTGGGACGGAGCGAGTATCATGTGTTAC ...........(((.((((.((((((((((((((((((((((((.....(((((.((((.........))))....))))))))))))))))))))))))))))).)))).)))............. 4031442 4031528 TTCCAAAATATAGCAACTTTTGCTTTGTCTAGATTCGTAGTACTAGAATACGTCCCATCTAAGCAAAAGTTGCTATATTTTGGGACG ((((((((((((((((((((((((.....(((((.((((.........))))....))))))))))))))))))))))))))))).. Oru-miRN2228d 4031508 4031528 TTCCAAAATATAGCAACTTTT Oru-miRN2228d* 4031442 4031462 AAGTTGCTATATTTTGGGACG 3 Oru-MIRN2229a PmiREN014004 MIRN2229 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 13490391 13490573 - TTTGTTCAGTGCCAAATCATCTGGCGCTGAACTTAGACACCTCAGCGCCACGTCGACTGGCGCTGAATGTCGTGCCACTGCGGACAGGAGGCTAAGTCAACATGCCAACGAACATTCAGCGCCACGCTATTTGGCGCTGAGGTGTCTAAGTTCAGCGTCACACGATTTGGTGCTGAACAAAAG ((((((((((((((((((...(((((((((((((((((((((((((((((.((.(..(((((((((((((((((.((.((..(((((....))..)))..)))).).))).)))))))))))))..).)).)))))))))))))))))))))))))))))...)))))))))))))))))).. 13490411 13490553 CTGGCGCTGAACTTAGACACCTCAGCGCCACGTCGACTGGCGCTGAATGTCGTGCCACTGCGGACAGGAGGCTAAGTCAACATGCCAACGAACATTCAGCGCCACGCTATTTGGCGCTGAGGTGTCTAAGTTCAGCGTCACAC .(((((((((((((((((((((((((((((.((.(..(((((((((((((((((.((.((..(((((....))..)))..)))).).))).)))))))))))))..).)).)))))))))))))))))))))))))))))... Oru-miRN2229a 13490533 13490553 CTGGCGCTGAACTTAGACACC Oru-miRN2229a* 13490411 13490431 TGTCTAAGTTCAGCGTCACAC 3 Oru-MIRN2229b PmiREN014009 MIRN2229 Oryza rufipogon Oru-HG417169.1 6678133 6678315 - TTTTTTCAGCGCCAAATCATCTGGCGCTGAACTTAGACACCTCAGTGTCACGTCAACTGGCGCTGAATACCGTGCCACCGTGGATGGGAGGCTAAGTCAGCGTGCCAACGCACATTCAACACCATGCTATTTAGCGCTGAGGTGTCTAAGTTTAGTGCCACACGATTTGGCGCTGAACAAAAG (((.((((((((((((((...(((((((((((((((((((((((((.((.((((.((((((((........))))))..)).)))).)).(((((((.((((((..................))))))))))))))))))))))))))))))))))))))...)))))))))))))).))).. 6678153 6678295 CTGGCGCTGAACTTAGACACCTCAGTGTCACGTCAACTGGCGCTGAATACCGTGCCACCGTGGATGGGAGGCTAAGTCAGCGTGCCAACGCACATTCAACACCATGCTATTTAGCGCTGAGGTGTCTAAGTTTAGTGCCACAC .(((((((((((((((((((((((((.((.((((.((((((((........))))))..)).)))).)).(((((((.((((((..................))))))))))))))))))))))))))))))))))))))... Oru-miRN2229b 6678275 6678295 CTGGCGCTGAACTTAGACACC Oru-miRN2229b* 6678153 6678173 TGTCTAAGTTTAGTGCCACAC 3 Oru-MIRN2229c PmiREN014014 MIRN2229 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 658548 658731 + CTTTTGGTCAGCGCCAAATCACCTGGCGCTGAACTTAGACACCTTAGCTCCATATCAACTGGCGCTGAATGCCGTGCCACCGCGGATAGGAGACTAAGTCAGCGTGCCAACGCATATTCAGCGCCACGCTATTTGGCGCTGAGGTGTCTAAGTTCGGCGCCAAGGGTTATTTTTGAAATAAGTT ..((((((....))))))...(((((((((((((((((((((((((((.(((.......(((((((((((((((((....)))))......(((...))).((((....)))).)))))))))))).......))).)))))))))))))))))))))))).)))................... 658568 658711 CTGGCGCTGAACTTAGACACCTTAGCTCCATATCAACTGGCGCTGAATGCCGTGCCACCGCGGATAGGAGACTAAGTCAGCGTGCCAACGCATATTCAGCGCCACGCTATTTGGCGCTGAGGTGTCTAAGTTCGGCGCCAAGGG ((((((((((((((((((((((((((.(((.......(((((((((((((((((....)))))......(((...))).((((....)))).)))))))))))).......))).)))))))))))))))))))))))).))). Oru-miRN2229c 658568 658588 CTGGCGCTGAACTTAGACACC Oru-miRN2229c* 658691 658711 GTCTAAGTTCGGCGCCAAGGG 3 Oru-MIRN2230 PmiREN014006 MIRN2230 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 4409304 4409514 + TATAAGTGCAGCTATTGTTTTCCGCGTCCAACTTTGACCGTCCGTCTTATTTGAAAAATTTTTGAAAAAAATTAAAAACATAAGTCACGAGTAAAGTATTATTCATGTTTTATCATCTCATAACAACGAAAATACTAATTATAAAAAAATTTCAAATAAGACGAACGATCAAAGTTAGACGCGGAAACTTATGGTTGCACTTATAATAGGA (((((((((((((((...((((((((((.((((((((.(((.((((((((((((((..(((((((......)))))))................((((((.(((.((((............))))..))))))))).............)))))))))))))).))).)))))))).))))))))))...)))))))))))))))...... 4409324 4409494 TTTCCGCGTCCAACTTTGACCGTCCGTCTTATTTGAAAAATTTTTGAAAAAAATTAAAAACATAAGTCACGAGTAAAGTATTATTCATGTTTTATCATCTCATAACAACGAAAATACTAATTATAAAAAAATTTCAAATAAGACGAACGATCAAAGTTAGACGCGGAAACT ((((((((((.((((((((.(((.((((((((((((((..(((((((......)))))))................((((((.(((.((((............))))..))))))))).............)))))))))))))).))).)))))))).)))))))))).. Oru-miRN2230 4409324 4409345 TTTCCGCGTCCAACTTTGACCG Oru-miRN2230* 4409474 4409494 TCAAAGTTAGACGCGGAAACT 3 Oru-MIRN2231 PmiREN014007 MIRN2231 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 6913400 6913518 - TGGTTAATTTGACCCTTTTTCTCTAGTTTGTGTTCAGCATCTATGTCAACTATGACGCTGAACACAAACTGACACAGATGCTGAGCACAAACTAGAGAAAAAGGGTCATATTAACCATG ((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((....((........)).....))))).))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))).. 6913420 6913498 CTCTAGTTTGTGTTCAGCATCTATGTCAACTATGACGCTGAACACAAACTGACACAGATGCTGAGCACAAACTAGAGAA ((((((((((((((((((((((.(((((....((........)).....))))).)))))))))))))))))))))).. Oru-miRN2231 6913420 6913440 TGCTGAGCACAAACTAGAGAA Oru-miRN2231* 6913478 6913498 CTCTAGTTTGTGTTCAGCATC 3 Oru-MIRN2232a PmiREN014011 MIRN2232 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 5376285 5376393 - GTACCAGTATCTCATGGTACCACGTTTTCGATTATTGGATATAGCTAGACAGGATGGGCATTGTTAGATCCAACGATCGGAAATGATTTGGTACCGTGAGGTACCGGTA .((((.(((((((((((((((((((((((((((.((((((.((((.................)))).)))))).)))))))))))...)))))))))))))))).)))) 5376305 5376373 CACGTTTTCGATTATTGGATATAGCTAGACAGGATGGGCATTGTTAGATCCAACGATCGGAAATGATTT .((((((((((((.((((((.((((.................)))).)))))).)))))))))))...) Oru-miRN2232a 5376305 5376325 TCCAACGATCGGAAATGATTT Oru-miRN2232a* 5376353 5376373 CACGTTTTCGATTATTGGATA 3 Oru-MIRN2232b PmiREN014012 MIRN2232 Oryza rufipogon Oru-HG417171.1 21150522 21150630 - TACCTCGATCATAATACTAAATCGTTTTTATTCGTTGGATCTAGTTAGACAGAATGGGTATTGTTATATCCAACGATCGGAAATGATTTGATACCATGAGGTATCATTA ..................(((((((((((..(((((((((.(((....((.......))....))).)))))))))..)))))))))))((((((....)))))).... 21150542 21150610 ATCGTTTTTATTCGTTGGATCTAGTTAGACAGAATGGGTATTGTTATATCCAACGATCGGAAATGATTT (((((((((..(((((((((.(((....((.......))....))).)))))))))..))))))))).. Oru-miRN2232b 21150542 21150562 TCCAACGATCGGAAATGATTT Oru-miRN2232b* 21150590 21150610 ATCGTTTTTATTCGTTGGATC 3 Oru-MIRN2232c PmiREN014015 MIRN2232 Oryza rufipogon Oru-HG417173.1 5667494 5667602 - ATTTCCTCTAATCCAACAAAATCGTTTCCGATTGTTGGATCTAACAATACCCATCCTGTCTAGCTAGGTCCAACGATCGGAAATGATTTAGTACCATGAGGTACCGATA ..................((((((((((((((((((((((((((((..........))).....))))))))))))))))))))))))).(((((....)))))..... 5667514 5667582 ATCGTTTCCGATTGTTGGATCTAACAATACCCATCCTGTCTAGCTAGGTCCAACGATCGGAAATGATTT ((((((((((((((((((((((((((..........))).....))))))))))))))))))))))).. Oru-miRN2232c 5667514 5667534 TCCAACGATCGGAAATGATTT Oru-miRN2232c* 5667562 5667582 ATCGTTTCCGATTGTTGGATC 3 Oru-MIRN2232d PmiREN014016 MIRN2232 Oryza rufipogon Oru-HG417174.1 12182109 12182217 - CCAGTACCTCACGGTATCAAATCGTTTCTAATTGTTGGATCTAGCTGGGCAGGATGGACATTGTTAGATCCAACGATCGGAAATGATTTGGAACCGACCGGTACCTCGA ...(((((...((((.(((((((((((((.(((((((((((((((((..((...))..))..))))))))))))))).))))))))))))).))))...)))))..... 12182129 12182197 ATCGTTTCTAATTGTTGGATCTAGCTGGGCAGGATGGACATTGTTAGATCCAACGATCGGAAATGATTT (((((((((.(((((((((((((((((..((...))..))..))))))))))))))).))))))))).. Oru-miRN2232d 12182129 12182149 TCCAACGATCGGAAATGATTT Oru-miRN2232d* 12182177 12182197 ATCGTTTCTAATTGTTGGATC 3 Oru-MIRN2232e PmiREN014017 MIRN2232 Oryza rufipogon Oru-HG417175.1 17435888 17435996 - CCGGTATCTTGCGGTACTAAATCGTTTTTAATCGTTGGATCTAGTTGGACAGGATGAACATTGTTAGATCCAACGATCGGAAATGATTTGGTATCGTGAGGTACCGGTA (((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((.((..((...))..))...)))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))).. 17435908 17435976 ATCGTTTTTAATCGTTGGATCTAGTTGGACAGGATGAACATTGTTAGATCCAACGATCGGAAATGATTT (((((((((.((((((((((((((.((..((...))..))...)))))))))))))).))))))))).. Oru-miRN2232e 17435908 17435928 TCCAACGATCGGAAATGATTT Oru-miRN2232e* 17435956 17435976 ATCGTTTTTAATCGTTGGATC 3 Oru-MIRN2232f PmiREN016166 MIRN2232 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 26107308 26107416 + CCGGTACCTCACGGTACCAAATTGTTTCTGTTCATTGGATCTAATTGGATGGGATGGACATTGTTAGATCCAACGATCGGAAATGATTTGGTATCGTAAGATACCGGTA ....................((((((((((.((.(((((((((((..((((.......))))))))))))))).)).))))))))))...................... 26107328 26107396 ATTGTTTCTGTTCATTGGATCTAATTGGATGGGATGGACATTGTTAGATCCAACGATCGGAAATGATTT ((((((((((.((.(((((((((((..((((.......))))))))))))))).)).)))))))))).. Oru-miRN2232f 26107376 26107396 TCCAACGATCGGAAATGATTT Oru-miRN2232f* 26107328 26107348 ATTGTTTCTGTTCATTGGATC 3 Oru-MIRN2232g PmiREN016168 MIRN2232 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 7304974 7305082 + CCGATACCTCACGGTACCAAATCGTTTCTGATCGTTGGATCTCGCTAGGTAGGATGAATATTGTTAGATCCAACGATCGGAAATGATTTTGTACTGTGAGGTACCGGTA ....................((((((((((((((((((((((.((..((((.......)))))).))))))))))))))))))))))...................... 7304994 7305062 ATCGTTTCTGATCGTTGGATCTCGCTAGGTAGGATGAATATTGTTAGATCCAACGATCGGAAATGATTT ((((((((((((((((((((((.((..((((.......)))))).)))))))))))))))))))))).. Oru-miRN2232g 7305042 7305062 TCCAACGATCGGAAATGATTT Oru-miRN2232g* 7304994 7305014 ATCGTTTCTGATCGTTGGATC 3 Oru-MIRN2232h PmiREN016170 MIRN2232 Oryza rufipogon Oru-HG417174.1 11660565 11660673 + CCTGTACCTTACAATACCAAATAATTTCCGATTGTTGAATCGAACAATGCCCATCCTATCCAACTAGATCCAACGATCGGAAATGATTTGGTACCGTGAGGTACCGGTA .......................((((((((((((((.(((.........................))).))))))))))))))......................... 11660585 11660653 ATAATTTCCGATTGTTGAATCGAACAATGCCCATCCTATCCAACTAGATCCAACGATCGGAAATGATTT ...((((((((((((((.(((.........................))).))))))))))))))..... Oru-miRN2232h 11660633 11660653 TCCAACGATCGGAAATGATTT Oru-miRN2232h* 11660585 11660605 ATAATTTCCGATTGTTGAATC 3 Oru-MIRN2233a PmiREN014013 MIRN2233 Oryza rufipogon Oru-HG417171.1 18429243 18429415 - ACAAAACCCATTCCATAACCCCTAAGCTATTTTGCGAGACGAATCTAACGAGGTATATTAATCCATGATTTGCTACAGTTATGCTACAGTAATCATCCGCTAGTCATGGATTAATATACCTCGTTAGATTCGTCTCGCAAAATAGCCTAGAGGTTATGGAATGAGTTTTGTCA (((((((.((((((((((((.(((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((....(((((......))))).....)).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))).)))))))))))).))))))).. 18429263 18429395 CCTAAGCTATTTTGCGAGACGAATCTAACGAGGTATATTAATCCATGATTTGCTACAGTTATGCTACAGTAATCATCCGCTAGTCATGGATTAATATACCTCGTTAGATTCGTCTCGCAAAATAGCCTAGAGG .(((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((....(((((......))))).....)).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))... Oru-miRN2233a 18429263 18429283 TCTCGCAAAATAGCCTAGAGG Oru-miRN2233a* 18429375 18429395 CCTAAGCTATTTTGCGAGACG 3 Oru-MIRN2233b PmiREN016165 MIRN2233 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 25806067 25806228 + ACAAAACACATTTCATAATCCCTAGGCTATTTTGCGAGACGAATCTAACGAGGTATATTAATCCATAATTAGCGGATGATTACTGTAGCAAATCATGGATTAATATATCTCGTTAGATTCGTCTCGCAAAATAGCCTAGAGGTTATGGAATGGGTTTTGTCG .....................(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((.((..............)).))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))....................... 25806087 25806208 CCTAGGCTATTTTGCGAGACGAATCTAACGAGGTATATTAATCCATAATTAGCGGATGATTACTGTAGCAAATCATGGATTAATATATCTCGTTAGATTCGTCTCGCAAAATAGCCTAGAGG .(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((.((..............)).))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))... Oru-miRN2233b 25806188 25806208 TCTCGCAAAATAGCCTAGAGG Oru-miRN2233b* 25806087 25806107 CCTAGGCTATTTTGCGAGACG 3 Oru-MIRN2233c PmiREN016167 MIRN2233 Oryza rufipogon Oru-HG417169.1 13699947 13700119 + ACAAAACCGATTTTATAACCCCTAAACTATTTTGCGAGACGAATTTAATGATGTATATTAATCCATGATTAGTGGATGATTACTGTAGCATCACTGTAGCAAATCATGGATTAATATACCTCGTTAGATTCGTCTCGCAAAATAGCCTAGAGGTTATAGAATGGGTTTTGTCA .....................(((..(((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((.(((..........))))))))......))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))..)))....................... 13699967 13700099 CCTAAACTATTTTGCGAGACGAATTTAATGATGTATATTAATCCATGATTAGTGGATGATTACTGTAGCATCACTGTAGCAAATCATGGATTAATATACCTCGTTAGATTCGTCTCGCAAAATAGCCTAGAGG .(((..(((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((.(((..........))))))))......))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))..)))... Oru-miRN2233c 13700079 13700099 TCTCGCAAAATAGCCTAGAGG Oru-miRN2233c* 13699967 13699987 CCTAAACTATTTTGCGAGACG 3 Oru-MIRN2234a PmiREN014018 MIRN2234 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 30089820 30089939 - CTCCGTTTCACAATGTAAGTCATTCTAGCATTTCCCACATTTATATTGATGCATCTAGATTCATTAACATCAATATGAATGTGGGAAATGCTAGAATGTCTAGATTCATTCACATCAATA ...((((....))))..((.(((((((((((((((((((((((((((((((................))))))))))))))))))))))))))))))).))................... 30089840 30089919 CATTCTAGCATTTCCCACATTTATATTGATGCATCTAGATTCATTAACATCAATATGAATGTGGGAAATGCTAGAATGTC (((((((((((((((((((((((((((((((................))))))))))))))))))))))))))))))).. Oru-miRN2234a 30089840 30089860 TGTGGGAAATGCTAGAATGTC Oru-miRN2234a* 30089899 30089919 CATTCTAGCATTTCCCACATT 3 Oru-MIRN2234b PmiREN014019 MIRN2234 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 28198430 28198567 - TTCCGTTTTATAATGTAAGTCATTCTAGCATTTCCCACATTCATATTGATGTTAATGAATCTAGATATCTATCTAGATTCATTAACATCAATATGAATGTGGGAAATGCTAGAATGTCTTACATTATGAAACGGAGAG (((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))).. 28198450 28198547 CATTCTAGCATTTCCCACATTCATATTGATGTTAATGAATCTAGATATCTATCTAGATTCATTAACATCAATATGAATGTGGGAAATGCTAGAATGTC ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).. Oru-miRN2234b 28198450 28198470 TGTGGGAAATGCTAGAATGTC Oru-miRN2234b* 28198527 28198547 CATTCTAGCATTTCCCACATT 3 Oru-MIRN2234c PmiREN014021 MIRN2234 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 5423785 5423900 - CTCCGTTTCACAATGTAAGTCATTCTAGTATTTCCCACATTCATATTGATGTTAATAAATCTAGATAGATATGAATGTGGGAAATGCTAGAATGTCTTACATTATGAAACGGGGGA ((((((((((.((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((........)))......))))))))))))))))))))))))))).)))))))).)))))))))).. 5423805 5423880 CATTCTAGTATTTCCCACATTCATATTGATGTTAATAAATCTAGATAGATATGAATGTGGGAAATGCTAGAATGTC ((((((((((((((((((((((((((((((........)))......))))))))))))))))))))))))))).. Oru-miRN2234c 5423805 5423825 TGTGGGAAATGCTAGAATGTC Oru-miRN2234c* 5423860 5423880 CATTCTAGTATTTCCCACATT 3 Oru-MIRN2235a PmiREN014020 MIRN2235 Oryza rufipogon Oru-HG417171.1 9087517 9087624 - CGGCTTGGTTTTTTTCAAAGGTGTCAGTTCCGTTGAAAAACCGACACCTATACTATAGGTGTCAATTTTTTTAATAGAACCGACACCTATACTTGTATTACAGGTGTC (.....)...........(((((((.((((.(((((((((..(((((((((...)))))))))...))))))))).)))).)))))))((((((((...)))))))). 9087537 9087604 GTGTCAGTTCCGTTGAAAAACCGACACCTATACTATAGGTGTCAATTTTTTTAATAGAACCGACACCT (((((.((((.(((((((((..(((((((((...)))))))))...))))))))).)))).))))).. Oru-miRN2235a 9087537 9087557 TTTTTAATAGAACCGACACCT Oru-miRN2235a* 9087584 9087604 GTGTCAGTTCCGTTGAAAAAC 3 Oru-MIRN2235b PmiREN014022 MIRN2235 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 12726015 12726158 + CAATACTGTAAGTAGTGGTTTTTTAATAGAACCGACACCTACGCTTATATTATAGTTGTCGGTTCTAGAGAAAAAACCAGCACATATAATATAAGCATAGGTGTCGGCTCTGTTGAAAAACCGGCACCTATTAAAAAATACAGA ....((((....))))((((((((((((((.((((((((((.((((((((((((..(((.((((..........)))).)))..)))))))))))).)))))))))).))))))))))))))...................... 12726035 12726138 TTTTTTAATAGAACCGACACCTACGCTTATATTATAGTTGTCGGTTCTAGAGAAAAAACCAGCACATATAATATAAGCATAGGTGTCGGCTCTGTTGAAAAACC ((((((((((((.((((((((((.((((((((((((..(((.((((..........)))).)))..)))))))))))).)))))))))).)))))))))))))) Oru-miRN2235b 12726035 12726055 TTTTTTAATAGAACCGACACC Oru-miRN2235b* 12726118 12726138 TGTCGGCTCTGTTGAAAAACC 3 Oru-MIRN2235c PmiREN014023 MIRN2235 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 17936501 17936683 - CAATAATATAGGTGCCGGTTTTTTAATAGAACCGACACCTATACTTATATTATAGGTGTCGGTTTTAAAGAAAAACCAGCACCTCTAGTATTGGTGCTGGTTTTTTTAATCTAGAACCGACACCTATAATATAAGTATAGGTGTCGGCTCTATTAAAAACCGGCACCTACTTAAAAAAACCAG ........(((((((((((((((.((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((.........)))))))))))))))....)))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))).............. 17936521 17936663 TTTTTTAATAGAACCGACACCTATACTTATATTATAGGTGTCGGTTTTAAAGAAAAACCAGCACCTCTAGTATTGGTGCTGGTTTTTTTAATCTAGAACCGACACCTATAATATAAGTATAGGTGTCGGCTCTATTAAAAACC (((((.((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((.........)))))))))))))))....)))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))).. Oru-miRN2235c 17936643 17936663 TTTTTTAATAGAACCGACACC Oru-miRN2235c* 17936521 17936541 GTGTCGGCTCTATTAAAAACC 3 Oru-MIRN2235d PmiREN016171 MIRN2235 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 13631108 13631213 + GACACCTTTAAACATTATAGGTGTCAGTCCTATTAAAAAAGCGGCAACTATGCTATAGGTGCCGGTTTTTAATAGAACCGACACCTATACTTATATTATAGGTGTC ....................(((((.((.((((((((((..(((((.((((...)))).))))).)))))))))).)).)))))...................... 13631128 13631193 GTGTCAGTCCTATTAAAAAAGCGGCAACTATGCTATAGGTGCCGGTTTTTAATAGAACCGACACCT (((((.((.((((((((((..(((((.((((...)))).))))).)))))))))).)).))))).. Oru-miRN2235d 13631173 13631193 TTTTTAATAGAACCGACACCT Oru-miRN2235d* 13631128 13631148 GTGTCAGTCCTATTAAAAAAG 3 Oru-MIRN2235e PmiREN016172 MIRN2235 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 18080006 18080110 + ACACCTTTAAACACTATAGGTTTCGGTTCTATTAAAAAACTAGCAACTATACTATAGGTGTCGGTTTTTTAATAGAACCGACACCTATACTTATATTATAGGTGT ......................(((((((((((((((((((.(((.((((...)))).))).)))))))))))))))))))........................ 18080026 18080090 TTTCGGTTCTATTAAAAAACTAGCAACTATACTATAGGTGTCGGTTTTTTAATAGAACCGACACC ..(((((((((((((((((((.(((.((((...)))).))).))))))))))))))))))).... Oru-miRN2235e 18080070 18080090 TTTTTTAATAGAACCGACACC Oru-miRN2235e* 18080026 18080046 TTTCGGTTCTATTAAAAAACT 3 Oru-MIRN2235f PmiREN016173 MIRN2235 Oryza rufipogon Oru-HG417176.1 11002881 11002985 + GCACCTTTAAATATTATAGGTGTCGGTTCTGTTAAAAAACCAGTAATTATTCTATAGGTATCGGTTTTTTAATAGAACCGACACCTATACTTATATTATAGGTAT ....................(((((((((((((((((((((.(((.((((...)))).))).)))))))))))))))))))))...................... 11002901 11002965 TGTCGGTTCTGTTAAAAAACCAGTAATTATTCTATAGGTATCGGTTTTTTAATAGAACCGACACC (((((((((((((((((((((.(((.((((...)))).))).))))))))))))))))))))).. Oru-miRN2235f 11002945 11002965 TTTTTTAATAGAACCGACACC Oru-miRN2235f* 11002901 11002921 TGTCGGTTCTGTTAAAAAACC 3 Oru-MIRN2236 PmiREN014025 MIRN2236 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 18536665 18536770 + ACCGGCACCTCACAGTACTAAATTGTTTCCGATCGTTGGATCTAGCTGGACAGAGGTATTGTTAAATTCAACGATCGGAAACGATTTGGTACCATGAGATATTGGT ........((((..(((((((((((((((((((((((((((.((((...((....))...)))).)))))))))))))))))))))))))))..))))........ 18536685 18536750 ATTGTTTCCGATCGTTGGATCTAGCTGGACAGAGGTATTGTTAAATTCAACGATCGGAAACGATTT ((((((((((((((((((((.((((...((....))...)))).)))))))))))))))))))))) Oru-miRN2236 18536730 18536750 TTCAACGATCGGAAACGATTT Oru-miRN2236* 18536685 18536705 ATTGTTTCCGATCGTTGGATC 3 Oru-MIRN2237 PmiREN014028 MIRN2237 Oryza rufipogon Oru-HG417174.1 18976287 18976373 + ACATATTGAAGAAAGAAAAGCTAGAAATACCCAATATCTTGCTGAAAGCAAGATATTGGGTATTTCTTTTTTTTATTTTGAATCTTT ...........(((((((((..(((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))..)))).........))))) 18976307 18976353 AGAAATACCCAATATCTTGCTGAAAGCAAGATATTGGGTATTTCTTT (((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))).. Oru-miRN2237 18976307 18976328 AGAAATACCCAATATCTTGCTG Oru-miRN2237* 18976333 18976353 CAAGATATTGGGTATTTCTTT 3 Oru-MIRN2238 PmiREN014029 MIRN2238 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 25537690 25537925 + ATTTTTTTTTTTTTTTGCGGGGATGATCTGATTGTTTATTGTAGCCTCATTTGGAGGATATGATGAGAATGGCTACTTCGTTGGATACAATGGACTGGAGGTGCACCCTACAGTAAGTGATCAACTAGCATACTTTATCAAGTATGGTATATGCCTTTTCTACAGTATTTACAAGTGGTTCTATCTAAAATCGAAACAATGGTGCACTCAGTACATCTCTGTGGTGGCATGGTGGT ................(((((((((..((((.((((((((((..((((.....))))....(((.(((((.(((...((((((....))))))((((.(((.....))).)))).(((.....)))..(((((((....)))))))(((.((((..........)))).))).))).))))))))..........))))))).))).))))..)))))))))...(.((...)).) 25537710 25537905 ATGATCTGATTGTTTATTGTAGCCTCATTTGGAGGATATGATGAGAATGGCTACTTCGTTGGATACAATGGACTGGAGGTGCACCCTACAGTAAGTGATCAACTAGCATACTTTATCAAGTATGGTATATGCCTTTTCTACAGTATTTACAAGTGGTTCTATCTAAAATCGAAACAATGGTGCACTCAGTACATCT (((..((((.((((((((((..((((.....))))....(((.(((((.(((...((((((....))))))((((.(((.....))).)))).(((.....)))..(((((((....)))))))(((.((((..........)))).))).))).))))))))..........))))))).))).))))..))))) Oru-miRN2238 25537710 25537731 ATGATCTGATTGTTTATTGTAG Oru-miRN2238* 25537885 25537905 AATGGTGCACTCAGTACATCT 3 Oru-MIRN2239 PmiREN014030 MIRN2239 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 34741709 34741945 - AATGTGACGGAGCTCGTGGCTCCTCACCGGGAGACCGCGCAGGCCCCCCTTTGCCGGTTCGGCCGGGGGCTTAGGGTGAGATCTCAAGCTCTCGCTGTGTGTGGAAAGATCGCGTACCAGGAAGAAACGCGAGACACGGACGATGTATACAGGTTCGGGCCGCTGGGAAGCGTAATACCCTACTCCTGTGTTTTTGTGGATTTGTGTGTGGAGGAGCTACAAAGTGTCAGCCGACCT ...............((((((((((((((.(((.(((((.((((((((....((((...)))).))))))))..(((((((........)))))))((.((((......((((((..(.....)..))))))..)))).)).....(((((((...(((.((((....)))).....)))....)))))))...))))).))).)).)).))))))))))..((.(((....))))) 34741729 34741925 TCCTCACCGGGAGACCGCGCAGGCCCCCCTTTGCCGGTTCGGCCGGGGGCTTAGGGTGAGATCTCAAGCTCTCGCTGTGTGTGGAAAGATCGCGTACCAGGAAGAAACGCGAGACACGGACGATGTATACAGGTTCGGGCCGCTGGGAAGCGTAATACCCTACTCCTGTGTTTTTGTGGATTTGTGTGTGGAGGAGC (((((((((.(((.(((((.((((((((....((((...)))).))))))))..(((((((........)))))))((.((((......((((((..(.....)..))))))..)))).)).....(((((((...(((.((((....)))).....)))....)))))))...))))).))).)).)).))))).. Oru-miRN2239 34741729 34741749 TGGATTTGTGTGTGGAGGAGC Oru-miRN2239* 34741905 34741925 TCCTCACCGGGAGACCGCGCA 3 Oru-MIRN2240 PmiREN014031 MIRN2240 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 5986471 5986722 + ACGCCGCACTGCCGATTTCCCCCTCGGGCGAGCCATCGGAGCGGGGGCCGTTGGCTCCCAAAGCAGACGCGAGAATTCACTGAAATTACCGCGCCATCTTATCTCCGCAAGTTGAAGAATATAATTCGGGCGCAGTAATTTTTAGTGAATTCATGTGTCTACTACTACATATGTCTGCTTGGGAGCCAACCGCGTTTCGATGGCTCGCCTGAGGGGAAATCGGCGGGAGGCGTTTGGTCAGCTTTGCTGG (((((...((((((((((((((.((((((((((((((((((((.((....(((((((((((.((((((....(((((((((((((((((.(((((...((((.((..((...))..))..))))....))))).)))).)))))))))))))((((((........))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))..))))).....((((...)))). . 5986491 5986702 CGATTTCCCCCTCGGGCGAGCCATCGGAGCGGGGGCCGTTGGCTCCCAAAGCAGACGCGAGAATTCACTGAAATTACCGCGCCATCTTATCTCCGCAAGTTGAAGAATATAATTCGGGCGCAGTAATTTTTAGTGAATTCATGTGTCTACTACTACATATGTCTGCTTGGGAGCCAACCGCGTTTCGATGGCTCGCCTGAGGGGAAATCGGC ((((((((((.((((((((((((((((((((.((....(((((((((((.((((((....(((((((((((((((((.(((((...((((.((..((...))..))..))))....))))).)))).)))))))))))))((((((........))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))).. Oru-miRN2240 5986682 5986702 CTCGCCTGAGGGGAAATCGGC Oru-miRN2240* 5986491 5986511 CGATTTCCCCCTCGGGCGAGC 3 Oru-MIRN2241 PmiREN014036 MIRN2241 Oryza rufipogon Oru-HG417166.1 13959047 13959144 - TGACATTTCTTTTGATTTATAGTCTGCATTGCATCATATGTACAACAACTTGCAGGGTGAGTGCAAGTGTGGAACTTGAGATTTGCTCGTTTGTGTCA ((((((.......(((((..(((((((((((((((((.((((........))))..)))).))).))))))).)))..))))).........)))))) 13959067 13959124 AGTCTGCATTGCATCATATGTACAACAACTTGCAGGGTGAGTGCAAGTGTGGAACTTG (((((((((((((((((.((((........))))..)))).))).))))))).))).. Oru-miRN2241 13959067 13959087 TGAGTGCAAGTGTGGAACTTG Oru-miRN2241* 13959104 13959124 AGTCTGCATTGCATCATATGT 3 Oru-MIRN2242 PmiREN014037 MIRN2242 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 32273571 32273755 + GATCATTCTGTTAGGATAGTCATTATTCTTCAGTCCGTTGTCCTTTGTGATAACATATCTGTACTTATACGTTTGTTCATTTAGGATAGACAAGGCTCAAAGCCACGCTAGCTGACATTAGCCGGATATGTTATAACAAAGGACAACAGACTGAAGAATAATGACTATCCTATATCTTTTCTGCC ............(((((((((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((((((.........((((((((.....))))))))..((((...))))..(((((......))))))))))))))))).)))))))))))).))))))))))))))))))))))).............. 32273591 32273735 CATTATTCTTCAGTCCGTTGTCCTTTGTGATAACATATCTGTACTTATACGTTTGTTCATTTAGGATAGACAAGGCTCAAAGCCACGCTAGCTGACATTAGCCGGATATGTTATAACAAAGGACAACAGACTGAAGAATAATGAC (((((((((((((((.((((((((((((.((((((((((((.........((((((((.....))))))))..((((...))))..(((((......))))))))))))))))).)))))))))))).))))))))))))))).. Oru-miRN2242 32273715 32273735 AACAGACTGAAGAATAATGAC Oru-miRN2242* 32273591 32273611 CATTATTCTTCAGTCCGTTGT 3 Oru-MIRN2243 PmiREN014038 MIRN2243 Oryza rufipogon Oru-HG417167.1 11590902 11591062 - TTTCCTGACAGACTTCAATCGTCTTTTCACATTGACGGAGCTCGTGGCTCCTCACCGGGAGACCGCGCAGGCCCCCCTTTGCCAGTTCGGCCGGGGGCTTAGGGTGAGATCTCAAGCTCTCTCTGTGTGTGGAAAGATCGCGTGCCAGGAAGAAACGCGAG ..(((((.((.........(((((((((((((.((.((((((((((((((((....))))).))))).((((((((....(((.....))).)))))))).(((......))).)))))).))...))))))))))).))..)).)))))........... 11590922 11591042 GTCTTTTCACATTGACGGAGCTCGTGGCTCCTCACCGGGAGACCGCGCAGGCCCCCCTTTGCCAGTTCGGCCGGGGGCTTAGGGTGAGATCTCAAGCTCTCTCTGTGTGTGGAAAGATCGC ((((((((((((.((.((((((((((((((((....))))).))))).((((((((....(((.....))).)))))))).(((......))).)))))).))...))))))))))).).. Oru-miRN2243 11590922 11590943 TCTCTGTGTGTGGAAAGATCGC Oru-miRN2243* 11591022 11591042 GTCTTTTCACATTGACGGAGC 3 Oru-MIRN2244a PmiREN014039 MIRN2244 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 18458910 18459110 - ACCAGCTAGGTAGTACTCCCCATTTTAGATTATAAGTTGTTTTAACCTTAGTTTGACTAAGTTTATATACAAAATATAATAATATTTAAAAATGTTACTACTTTTTTTTTCTATAAATTTGGTTAAACTTGAAGTAGTTTGACTTTGACCAAAATCAAAATGACTTATAATCTGAAACGGAGGGAGTACTATATAAAGCAG ....(((..((((((((((((.(((((((((((((((((((((......((((((((((((((((((...((((..((.(((((((....))))))).))..)))).....)))))))))))))))))).(((((......)))))..........)))))))))))))))))))))..).)))))))))))....))).. 18458930 18459090 CATTTTAGATTATAAGTTGTTTTAACCTTAGTTTGACTAAGTTTATATACAAAATATAATAATATTTAAAAATGTTACTACTTTTTTTTTCTATAAATTTGGTTAAACTTGAAGTAGTTTGACTTTGACCAAAATCAAAATGACTTATAATCTGAAACGGA (.(((((((((((((((((((((......((((((((((((((((((...((((..((.(((((((....))))))).))..)))).....)))))))))))))))))).(((((......)))))..........)))))))))))))))))))))..). Oru-miRN2244a 18458930 18458950 TGACTTATAATCTGAAACGGA Oru-miRN2244a* 18459070 18459090 CATTTTAGATTATAAGTTGTT 3 Oru-MIRN2244b PmiREN014042 MIRN2244 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 3491340 3491576 + TCTTCCTGGTAAATAAAAGTACCACTGCATTCGTTTCATATTATAAGTTATTTTGACTTTAGTAATATTATAACATCAAATTATTTTCATTAAATCTATAATTGAATATATTTTTATAATATAGTTATCTTGTGTTGAATATATTACTATTTTTTTCTACAAATTTAGTTTAATTTGGAGTACGTTTTTCTTTAACCAAAGTCAAAATGACTTATAATCTGAAACGGATGGAGTATT ....................(..(((.(((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((..((((((..((((((......((((..((((......))))..))))....)))))).....))))))...)))))))))..........((((((......)))))).....................)))))))))))))))))))).))))))))))).)))..) 3491360 3491556 CGTTTCATATTATAAGTTATTTTGACTTTAGTAATATTATAACATCAAATTATTTTCATTAAATCTATAATTGAATATATTTTTATAATATAGTTATCTTGTGTTGAATATATTACTATTTTTTTCTACAAATTTAGTTTAATTTGGAGTACGTTTTTCTTTAACCAAAGTCAAAATGACTTATAATCTGAAACGGA (((((((.(((((((((((((((((((((((((((((..((((((..((((((......((((..((((......))))..))))....)))))).....))))))...)))))))))..........((((((......)))))).....................)))))))))))))))))))).))))))))) Oru-miRN2244b 3491536 3491556 TGACTTATAATCTGAAACGGA Oru-miRN2244b* 3491360 3491380 CGTTTCATATTATAAGTTATT 3 Oru-MIRN2244c PmiREN014049 MIRN2244 Oryza rufipogon Oru-HG417173.1 8158089 8158351 + CTATCCGTTTCATATCATAAGTCGTTTGACTTTTTTCTAGTCAAGTTTAACCAAGCTTATAGAAAAATTTAGCAACACCTAAAATACCAAACTAGTTTCATAAAATCTAACATTGAATATATTTTGATAATATGTTTGTTTTGTGTTAAAAATACTAATATATTTTTCTATAAACTTAATCAAACTTTATTAGGAAAAAATATCAAATGACTTATAATCTGAAACGGAGAGAGTACCAAATACCAAGACA ((.(((((((((.((.(((((((((((((.(((((((((((.((((((....(((.((((((((((((.((...........(((((.(((((((...........))).....(((((((((.....))))))))))))).)))))...........)).)))))))))))).)))....)))))).)))))))))))...))))))))))))).)).))))))))).))................... 8158109 8158331 CGTTTCATATCATAAGTCGTTTGACTTTTTTCTAGTCAAGTTTAACCAAGCTTATAGAAAAATTTAGCAACACCTAAAATACCAAACTAGTTTCATAAAATCTAACATTGAATATATTTTGATAATATGTTTGTTTTGTGTTAAAAATACTAATATATTTTTCTATAAACTTAATCAAACTTTATTAGGAAAAAATATCAAATGACTTATAATCTGAAACGGA (((((((.((.(((((((((((((.(((((((((((.((((((....(((.((((((((((((.((...........(((((.(((((((...........))).....(((((((((.....))))))))))))).)))))...........)).)))))))))))).)))....)))))).)))))))))))...))))))))))))).)).))))))))) Oru-miRN2244c 8158311 8158331 TGACTTATAATCTGAAACGGA Oru-miRN2244c* 8158109 8158129 CGTTTCATATCATAAGTCGTT 3 Oru-MIRN2245a PmiREN014041 MIRN2245 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 23892182 23892305 - ATCAGTTGTAGTGAGTCGTGCAACAGAAGGTTATTTTTGGGAACTAATGCCGATGGACAGCACTGCTGCTTGGAGACGGTATGTGGAAATGGCTTTTGAACGGTCATGGCCCCTCGTTATATTT ..............(((((((....((((((((((((((.(.(((....(((..((.((((...)))))))))....))).).)))))))))))))).....).)))))).............. 23892202 23892285 CAACAGAAGGTTATTTTTGGGAACTAATGCCGATGGACAGCACTGCTGCTTGGAGACGGTATGTGGAAATGGCTTTTGAACGGT (....((((((((((((((.(.(((....(((..((.((((...)))))))))....))).).)))))))))))))).....). Oru-miRN2245a 23892202 23892222 TGGAAATGGCTTTTGAACGGT Oru-miRN2245a* 23892265 23892285 CAACAGAAGGTTATTTTTGGG 3 Oru-MIRN2245b PmiREN014046 MIRN2245 Oryza rufipogon Oru-HG417171.1 25113715 25113838 - ATCTGTTGTAGTGAGTCGTGCAATAGAAGGTTATTTTTGGGAACTAATGCCGATGGACAGCATTGCTGCTTGGAGACGGTATGTGGAAATGGCTTTTGAACGGTCATGGCCCCTCGTTATATTT ..............(((((((....((((((((((((((.(.(((....(((..((.((((...)))))))))....))).).)))))))))))))).....).)))))).............. 25113735 25113818 CAATAGAAGGTTATTTTTGGGAACTAATGCCGATGGACAGCATTGCTGCTTGGAGACGGTATGTGGAAATGGCTTTTGAACGGT (....((((((((((((((.(.(((....(((..((.((((...)))))))))....))).).)))))))))))))).....). Oru-miRN2245b 25113735 25113755 TGGAAATGGCTTTTGAACGGT Oru-miRN2245b* 25113798 25113818 CAATAGAAGGTTATTTTTGGG 3 Oru-MIRN2246 PmiREN014044 MIRN2246 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 9045689 9045796 - ACGGCTCGAGCGCCGATTGGTTTGGAGAAAAATCGGACGCACCCGATTTACGTGCAAAACTATTTTAAACTGATTTTTCTCTTAAATTACTTATCCAAATCATGATTC .((((......))))..(((((((((((((((((((..((((.........))))..............)))))))))))).)))))))................... 9045709 9045776 TTTGGAGAAAAATCGGACGCACCCGATTTACGTGCAAAACTATTTTAAACTGATTTTTCTCTTAAATT ((((((((((((((((..((((.........))))..............)))))))))))).)))).. Oru-miRN2246 9045757 9045776 TTTGGAGAAAAATCGGACGC Oru-miRN2246* 9045709 9045729 AACTGATTTTTCTCTTAAATT 3 Oru-MIRN2247 PmiREN014047 MIRN2247 Oryza rufipogon Oru-HG417173.1 9504123 9504324 - TTCTTTGTCTTACTTTCATATGTTAGCTAATCCAGTTAAAAAAAAGGGGCAATTTCGTTTCTACCCCTACTTTGATGTCTAATATTGATTTTACCCCTACTTTTTAGGGTTTTCGTTTTTACCCTCACTTTTTTGAACTGAATGTTTGTTTTGCCCCTACTTTGGATGGTGAAGTTAACGGTGTTAAGTAATTGATAAAATA ...((((((((((((.(((.((((((((...(((.(((((....((((((((....................(((.(((.......))).))).(((((.....))))).........................((((.....))))...))))))))..))))).)))...)))))))))))..))))))..))))))... 9504143 9504304 TGTTAGCTAATCCAGTTAAAAAAAAGGGGCAATTTCGTTTCTACCCCTACTTTGATGTCTAATATTGATTTTACCCCTACTTTTTAGGGTTTTCGTTTTTACCCTCACTTTTTTGAACTGAATGTTTGTTTTGCCCCTACTTTGGATGGTGAAGTTAACGGT ((((((((...(((.(((((....((((((((....................(((.(((.......))).))).(((((.....))))).........................((((.....))))...))))))))..))))).)))...)))))))).. Oru-miRN2247 9504143 9504163 TTGGATGGTGAAGTTAACGGT Oru-miRN2247* 9504284 9504304 TGTTAGCTAATCCAGTTAAAA 3 Oru-MIRN2248 PmiREN014048 MIRN2248 Oryza rufipogon Oru-HG417173.1 358391 358509 - CAAGAAGAAGAAGATGGAGGCACCAGCCCAAGGAAACACAGACATTGACACGCAATTCAAGGAGAAGATTGCGTCCTACTTTTTCCTTGGGAAGGTGGTTTCTCTTCTGGATGAAGAGC ........((((((.((((.((((..((((((((((...((........((((((((.........))))))))....)).))))))))))..)))).))))))))))........... 358411 358489 CACCAGCCCAAGGAAACACAGACATTGACACGCAATTCAAGGAGAAGATTGCGTCCTACTTTTTCCTTGGGAAGGTGGT ((((..((((((((((...((........((((((((.........))))))))....)).))))))))))..)))).. Oru-miRN2248 358411 358431 CTTTTTCCTTGGGAAGGTGGT Oru-miRN2248* 358469 358489 CACCAGCCCAAGGAAACACAG 3 Oru-MIRN2249 PmiREN014050 MIRN2249 Oryza rufipogon Oru-HG417175.1 621030 621236 + CCTGTCATGGATGACACCTATTTGTGACGGGCCGTAGTTTAGGCCCGATTGAGATATGGTATGTTATCTCAATCGGGCCTAAACTACGGCCCATCACGGATGACCATCATCTGTGACGGACGCCAACATAAGGCTTGATTGAGATAACAATCATATCTCAATCGGGCCTAAACTACGGCCCGTCACGGATTACATTCATCGGTGACG .....(((.(((((.....(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((.......(((((.((((((((((...)))))))))).))..)))......)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).....))))).)))... 621050 621216 TGTGACGGGCCGTAGTTTAGGCCCGATTGAGATATGGTATGTTATCTCAATCGGGCCTAAACTACGGCCCATCACGGATGACCATCATCTGTGACGGACGCCAACATAAGGCTTGATTGAGATAACAATCATATCTCAATCGGGCCTAAACTACGGCCCGTCACGGA ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((.......(((((.((((((((((...)))))))))).))..)))......))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))) Oru-miRN2249 621050 621070 TGTGACGGGCCGTAGTTTAGG Oru-miRN2249* 621196 621216 TAAACTACGGCCCGTCACGGA 3 Oru-MIRN2250a PmiREN014051 MIRN2250 Oryza rufipogon Oru-HG417170.1 18127705 18127900 - GGGGAGAGATTTTCTTCGGTCCAAAAAAAAGTACCACGAGGTACTGGTACCTTAGGGTACTGAATCGTTTCCGATCATTGGATCTAGGTGGGCAGCGTAAGCATTGTTTAAATCCAACAATAAAAAACGATTTGGTACTGTAAGGTACCAGTCTCTCGAGATACTTTTTATTGAACCAGAGCAAATCTCCTCCGAG ((((.(((((((.(((.(((.(((.((((((((.(.(((((.((((((((((((.(((((((((((((((...((..((((((.....((((((((....))..)))))).))))))..))...))))))))))))))).)))))))))))).))))).).)))))))).))).))).))).)))))))))))... 18127725 18127880 CCAAAAAAAAGTACCACGAGGTACTGGTACCTTAGGGTACTGAATCGTTTCCGATCATTGGATCTAGGTGGGCAGCGTAAGCATTGTTTAAATCCAACAATAAAAAACGATTTGGTACTGTAAGGTACCAGTCTCTCGAGATACTTTTTATTGAAC .(((.((((((((.(.(((((.((((((((((((.(((((((((((((((...((..((((((.....((((((((....))..)))))).))))))..))...))))))))))))))).)))))))))))).))))).).)))))))).)))... Oru-miRN2250a 18127725 18127745 TCGAGATACTTTTTATTGAAC Oru-miRN2250a* 18127860 18127880 CCAAAAAAAAGTACCACGAGG 3 Oru-MIRN2250b PmiREN016169 MIRN2250 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 17288199 17288392 + AATAAGATATTTGCTCCAGTCTAGCAAAAAGTACATCGAGGTATTAGTACCTTACGGTACCAAATCGTTTTCGGTCATTGGATCTAGCTAGACAGAATGTGCATTGTTAGATCCAATGATCGGAACAATTTGATACTGTGAGGTACCGGTACCTCGAGATACTTTTTATTGAACCGGAGCAAATCTCTACAAAT .........................((((((((..((((((((((.(((((((((((((.(((((.((((.(((((((((((((((((...(((...))).....))))))))))))))))))))).))))).))))))))))))).))))))))))..))))))))........................... 17288219 17288372 CTAGCAAAAAGTACATCGAGGTATTAGTACCTTACGGTACCAAATCGTTTTCGGTCATTGGATCTAGCTAGACAGAATGTGCATTGTTAGATCCAATGATCGGAACAATTTGATACTGTGAGGTACCGGTACCTCGAGATACTTTTTATTGAAC .....((((((((..((((((((((.(((((((((((((.(((((.((((.(((((((((((((((((...(((...))).....))))))))))))))))))))).))))).))))))))))))).))))))))))..))))))))....... Oru-miRN2250b 17288352 17288372 TCGAGATACTTTTTATTGAAC Oru-miRN2250b* 17288219 17288239 CTAGCAAAAAGTACATCGAGG 3 Oru-MIRN2251a PmiREN014052 MIRN2251 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 5263480 5263577 + TTGCATATTCTTAGGCCTGGTCTTGTGGCAAGAACTGAGTAGTTCGTTAACTCGCTACGCGGTTCTTGTCACAAGACCGAGTCTGTGAATATGCAAAG ((((((((((.(((((.((((((((((((((((((((.(((((..........))))).)))))))))))))))))))).))))).)))))))))).. 5263500 5263557 TCTTGTGGCAAGAACTGAGTAGTTCGTTAACTCGCTACGCGGTTCTTGTCACAAGACC (((((((((((((((((.(((((..........))))).))))))))))))))))).. Oru-miRN2251a 5263500 5263520 TCTTGTGGCAAGAACTGAGTA Oru-miRN2251a* 5263537 5263557 CGCGGTTCTTGTCACAAGACC 3 Oru-MIRN2251b PmiREN014053 MIRN2251 Oryza rufipogon Oru-HG417169.1 16036549 16036646 + TTGCATATTCTTAGGCCCAGTCTTGTGGCAAGAACTGAGTAGTTCGTTAACTCGCTACATGGTTCTTGTCACAAGATCGAGCCTGTGAATATGCAAAG ....((((((.(((((.(.((((((((((((((((((.(((((..........))))).)))))))))))))))))).).))))).))))))...... 16036569 16036626 TCTTGTGGCAAGAACTGAGTAGTTCGTTAACTCGCTACATGGTTCTTGTCACAAGATC (((((((((((((((((.(((((..........))))).))))))))))))))))).. Oru-miRN2251b 16036569 16036589 TCTTGTGGCAAGAACTGAGTA Oru-miRN2251b* 16036606 16036626 CATGGTTCTTGTCACAAGATC 3 Oru-MIRN2251c PmiREN014055 MIRN2251 Oryza rufipogon Oru-HG417171.1 10227212 10227309 - GTTCATATTCTTAGGCCCGATCTTGTGGCAAGAACTGAGTAGTTCGTTAACTCGCTACGCGGTTCTTGTCACAAGATCAAGCCTGTGAATATGCAAAG ...(((((((.(((((..(((((((((((((((((((.(((((..........))))).)))))))))))))))))))..))))).)))))))..... 10227232 10227289 TCTTGTGGCAAGAACTGAGTAGTTCGTTAACTCGCTACGCGGTTCTTGTCACAAGATC (((((((((((((((((.(((((..........))))).))))))))))))))))).. Oru-miRN2251c 10227269 10227289 TCTTGTGGCAAGAACTGAGTA Oru-miRN2251c* 10227232 10227252 CGCGGTTCTTGTCACAAGATC 3 Oru-MIRN2251d PmiREN014056 MIRN2251 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 13345611 13345708 - TTGCATATTCTTAGGCCCGGTCTTGTGGCAAGAACTGAGTAGTTCGTTAACTCGCTACGCGGTTCTTGTCACAAGACCGAGTCTGTGAATATGCAAAG .(((((((((.(((((.((((((((((((((((((((.(((((..........))))).)))))))))))))))))))).))))).)))))))))... 13345631 13345688 TCTTGTGGCAAGAACTGAGTAGTTCGTTAACTCGCTACGCGGTTCTTGTCACAAGACC (((((((((((((((((.(((((..........))))).))))))))))))))))).. Oru-miRN2251d 13345668 13345688 TCTTGTGGCAAGAACTGAGTA Oru-miRN2251d* 13345631 13345651 CGCGGTTCTTGTCACAAGACC 3 Oru-MIRN2251e PmiREN014057 MIRN2251 Oryza rufipogon Oru-HG417173.1 11525227 11525324 + TTGCATATTCTTAGGCCCGGTCTTGTGGCAAGAACTGAGTAGTTCGTTAACTCGTTACCCGGTTCTTGTCACAAGACCGAGTATATGAATATGCAAAG ((((((((((.((.((.((((((((((((((((((((.((((..((......)))))).)))))))))))))))))))).)).)).)))))))))).. 11525247 11525304 TCTTGTGGCAAGAACTGAGTAGTTCGTTAACTCGTTACCCGGTTCTTGTCACAAGACC (((((((((((((((((.((((..((......)))))).))))))))))))))))).. Oru-miRN2251e 11525247 11525267 TCTTGTGGCAAGAACTGAGTA Oru-miRN2251e* 11525284 11525304 CCCGGTTCTTGTCACAAGACC 3 Oru-MIRN2252 PmiREN014059 MIRN2252 Oryza rufipogon Oru-HG417165.1 618694 618810 - ATGAGCTTGTGGGAGTTGTAGGAATGGATGCGTAGAGAAAGAAATGAAATCTGAACCAGATTTGTGATTTGATTCTTTCCTATGACGTCCATTCCAATGATTTCCAGTCGCTCCTTC ..((((...((((((((((.(((((((((((((((.(((((((.(.(((((..............))))).))))))))))))).)))))))))).))))))))))...)))).... 618714 618790 GGAATGGATGCGTAGAGAAAGAAATGAAATCTGAACCAGATTTGTGATTTGATTCTTTCCTATGACGTCCATTCCAA (((((((((((((((.(((((((.(.(((((..............))))).))))))))))))).)))))))))).. Oru-miRN2252 618769 618790 GGAATGGATGCGTAGAGAAAGA Oru-miRN2252* 618714 618734 TTCCTATGACGTCCATTCCAA 3 Oru-MIRN2253 PmiREN014060 MIRN2253 Oryza rufipogon Oru-HG417168.1 7957064 7957199 - GTGAGCTAATTTTCATGACCAGGTCACTGCTTGCCTTTGCAGTACCATTATGGGTTACCGTGCCAGATTGAGGGAAGGAATGAAAAGGGTAAAGCAAAGGCAAGCAGCGACTCTGGTCATGGAATTGGAGCCATGA ..........(((((((((((((((.((((((((((((((..((((.......(((.((.(.((.......)).).)))))......))))..)))))))))))))).))).))))))))))))............ 7957084 7957179 AGGTCACTGCTTGCCTTTGCAGTACCATTATGGGTTACCGTGCCAGATTGAGGGAAGGAATGAAAAGGGTAAAGCAAAGGCAAGCAGCGACTCTGG (((((.((((((((((((((..((((.......(((.((.(.((.......)).).)))))......))))..)))))))))))))).))).)).. Oru-miRN2253 7957084 7957105 CAAAGGCAAGCAGCGACTCTGG Oru-miRN2253* 7957159 7957179 AGGTCACTGCTTGCCTTTGCA 3 Oru-MIRN2254 PmiREN016176 MIRN2254 Oryza rufipogon Oru-HG417172.1 627123 627257 + GCAGATCAATATGTACTCCTCCCGTCCCAAAAGAACTCAGCCTAGGATAGGATGGATTTGTTGTCCTAGGATATGTCACATCCTATCCTTACGCTGAGTTATTTTGGGACGGAAGGAGTAGTATACTATAGCAGC .....................(((((((((((.((((((((..((((((((((((((.((((.......)))).))).)))))))))))...)))))))).)))))))))))....................... 627143 627237 CCCGTCCCAAAAGAACTCAGCCTAGGATAGGATGGATTTGTTGTCCTAGGATATGTCACATCCTATCCTTACGCTGAGTTATTTTGGGACGGAAG .(((((((((((.((((((((..((((((((((((((.((((.......)))).))).)))))))))))...)))))))).)))))))))))... Oru-miRN2254 627143 627163 CCCGTCCCAAAAGAACTCAGC Oru-miRN2254* 627217 627237 TGAGTTATTTTGGGACGGAAG 3