miRNA_locus_ID	miRNA_locus_accession	miRNA_family	Organism	Chromosome	Start	End	Strand	Stem_loop_with_extended_20bp_seq	Stem_loop_with_extended_20bp_structure	Stem_loop_start	Stem_loop_end	Stem_loop_seq	Stem_loop_seq_structure	mature_miRNA	mature_start	mature_end	mature_seq	star_miRNA	star_start	star_end	star_seq	Confidence_level
Ccl-MIR156a	PmiREN004363	MIR156	Citrus clementina	Ccl-scaffold_1	25708431	25708559	+	GTAAAAAGGGTAAGAGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTATTTTCTTGCATGCTTTGAGATCCTGCTTGAAGCTATGCGTGCTCACTCTCTATCTGTCACCCCAACCCCCCCGCCCCCCAA	...............((.((((((((((((((((((((((.((((((...(((..(((.............)))..))))))))).))))))))))))).)))))))))))..................	25708451	25708539	TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTATTTTCTTGCATGCTTTGAGATCCTGCTTGAAGCTATGCGTGCTCACTCTCTATCTGTCACC	((((((((((((((((((((.((((((...(((..(((.............)))..))))))))).))))))))))))).)))))))..	Ccl-miR156a	25708451	25708470	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Ccl-miR156a*	25708519	25708539	GCTCACTCTCTATCTGTCACC		3
Ccl-MIR156b	PmiREN004364	MIR156	Citrus clementina	Ccl-scaffold_1	28593466	28593586	-	AAACATAACGAGAGAGCTACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGCAGGTAATTGTATTAGAAAATATCTTTGCAGGTGCGTGCTCGCTCCTCTTCTGTCAGCGTCATTTTTGCAAGTGTTTT	((((((..((((((.(...(((((((((((((((((((((.(((..((((..(((((....)))))..))))..))).))))))))).))))))))))))...).))))))...)))))).	28593486	28593566	TGACAGAAGAGAGTGAGCACACGCAGGTAATTGTATTAGAAAATATCTTTGCAGGTGCGTGCTCGCTCCTCTTCTGTCAGC	((((((((((((((((((((.(((..((((..(((((....)))))..))))..))).))))))))).)))))))))))..	Ccl-miR156b	28593547	28593566	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Ccl-miR156b*	28593486	28593506	GCTCGCTCCTCTTCTGTCAGC		3
Ccl-MIR156c	PmiREN004365	MIR156	Citrus clementina	Ccl-scaffold_1	1110803	1110925	-	AATTCTTGGAACATTGAAATTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGAGGCAGTTGTATAATTGTATACATGTTGCTTTTGCGTGCTCACTGCTCTTTCTGTCAGCTTCCAGTACCGGAATCTGAC	.(((((.((.((...(((.(((((((((((((((((((((.(((((((((.((((((....))))))..))))))))).))))))))).))).))))))))).)))..)).))))))).....	1110823	1110905	TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGAGGCAGTTGTATAATTGTATACATGTTGCTTTTGCGTGCTCACTGCTCTTTCTGTCAGC	((((((((((((((((((((.(((((((((.((((((....))))))..))))))))).))))))))).))).))))))))..	Ccl-miR156c	1110886	1110905	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Ccl-miR156c*	1110823	1110843	CTCACTGCTCTTTCTGTCAGC		3
Ccl-MIR156d	PmiREN004366	MIR156	Citrus clementina	Ccl-scaffold_1	23475312	23475437	+	TTAACTAATAGCTTGGTTTGATGACAGAAGAGAGAGAGTACAACCCGCCATTAGCTAAAGAGTCTTTGCTTTTGTTGGGAGTGTGCTCTCTCTTCTCCTGTCATTGAGTTATTTTTATTTGTCATT	......((((((((.....((((((((.((((((((((((((.((((.((..(((.((((...)))))))..)).))))..))))))))))).))).)))))))))))))))).............	23475332	23475417	ATGACAGAAGAGAGAGAGTACAACCCGCCATTAGCTAAAGAGTCTTTGCTTTTGTTGGGAGTGTGCTCTCTCTTCTCCTGTCATTG	(((((((.((((((((((((((.((((.((..(((.((((...)))))))..)).))))..))))))))))).))).)))))))..	Ccl-miR156d	23475332	23475352	ATGACAGAAGAGAGAGAGTAC	Ccl-miR156d*	23475397	23475417	CTCTCTCTTCTCCTGTCATTG		3
Ccl-MIR157a	PmiREN004367	MIR157	Citrus clementina	Ccl-scaffold_6	22903925	22904047	-	AGGCATTGTCGATGATGCTGTTGACGGAAGATAGAGAGCACAGATGATGAAATGCGTGGAGCTTGCATCTCACTCCTTTGTGCTCTCTATTCTTCTGTCATCATCTTCAGCCTCTCCCTTTAC	((((..((..(((((......(((((((((((((((((((((((.(((((.(((((.......))))).))).)).))))))))))))).)))))))))))))))..))))))..........	22903945	22904027	TTGACGGAAGATAGAGAGCACAGATGATGAAATGCGTGGAGCTTGCATCTCACTCCTTTGTGCTCTCTATTCTTCTGTCATCA	.(((((((((((((((((((((((.(((((.(((((.......))))).))).)).))))))))))))).))))))))))...	Ccl-miR157a	22904007	22904027	TTGACGGAAGATAGAGAGCAC	Ccl-miR157a*	22903945	22903965	CTCTCTATTCTTCTGTCATCA		3
Ccl-MIR157b	PmiREN004368	MIR157	Citrus clementina	Ccl-scaffold_1	15209059	15209185	-	GAGGGAAATGGGTGATGCTGGTGACAGAAGATAGAGAGCGCAGATGATGATATGCTCTAATGGAGTTTGTATATCACTCCTTTGTGCTCTCTGTGCTTCTGTCATCAGGCCAATTCAGTCCCTCCCC	((((((..(((((....(((((((((((((((((((((((((((.((((((((((.............)))))))).)).)))))))))))))).)))))))))))))....))))).))))))...	15209079	15209165	GTGACAGAAGATAGAGAGCGCAGATGATGATATGCTCTAATGGAGTTTGTATATCACTCCTTTGTGCTCTCTGTGCTTCTGTCATCA	((((((((((((((((((((((((.((((((((((.............)))))))).)).)))))))))))))).))))))))))..	Ccl-miR157b	15209145	15209165	GTGACAGAAGATAGAGAGCGC	Ccl-miR157b*	15209079	15209099	CTCTCTGTGCTTCTGTCATCA		3
Ccl-MIR159a	PmiREN004369	MIR159	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	42897070	42897299	-	GGTAAGAGGGTTAAGGAGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAAAAGAGGTTCTAGCAAGGGTAAATTGAGCTGCTGAGCTATGGATCCCACAGTCCTATGTATCAGATTTTAGGGTTTGTTTCTGATGATGGTGATGATAGGTTTGTGGCTTGCATATTTCTGGAGCTTCATTACCCCTTAAGTTTTACCCTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACCTCTCTACACACTACTCAC	((((.(((((.......((((((((((((..(((((((((((((....((((((((..(((.(((((.(.(((.((((.(..((((((.(((((.(((((.(((((((((.....)))))).)))..)))))))))).))))))..).)))).))).).))))).)))..)))))..)))....)))))))))))))..)))))))))))))))))))).).........	42897090	42897279	GAGCTCCTTGAAGTCCAAAAGAGGTTCTAGCAAGGGTAAATTGAGCTGCTGAGCTATGGATCCCACAGTCCTATGTATCAGATTTTAGGGTTTGTTTCTGATGATGGTGATGATAGGTTTGTGGCTTGCATATTTCTGGAGCTTCATTACCCCTTAAGTTTTACCCTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA	(((((((((..(((((((((((((....((((((((..(((.(((((.(.(((.((((.(..((((((.(((((.(((((.(((((((((.....)))))).)))..)))))))))).))))))..).)))).))).).))))).)))..)))))..)))....)))))))))))))..)))))))))..	Ccl-miR159a	42897090	42897110	TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA	Ccl-miR159a*	42897259	42897279	GAGCTCCTTGAAGTCCAAAAG		3
Ccl-MIR159b	PmiREN004370	MIR159	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	48492241	48492447	-	TGCAATTAGGGTTTTAATGGAGCTCTCTGAACTCCAAGTCTGAAAGGAGGTGATGGTAGGCCACGGCTGCTAGTCCATGAACACCCGTGGTTGCGCAGACTCAATACTGTGGCGCAGTCTAAGGGTTTGCATGAACTGGGAGACGAGGCTACCTTGATCTTTTTGGTATTGGAGTGAAGGGAGCTCCATTCATGGACATCTCATTAT	...............(((((((((((((..(((((((..(((((((((......(((((.((.((.((.(((((.((((...((((.(((((((((..((........)).)))))).))).))))...)))).))))).)).)).)))))))....)))))))))..)))))))..))))))))))))).................	48492261	48492427	AGCTCTCTGAACTCCAAGTCTGAAAGGAGGTGATGGTAGGCCACGGCTGCTAGTCCATGAACACCCGTGGTTGCGCAGACTCAATACTGTGGCGCAGTCTAAGGGTTTGCATGAACTGGGAGACGAGGCTACCTTGATCTTTTTGGTATTGGAGTGAAGGGAGCTCC	((((((((..(((((((..(((((((((......(((((.((.((.((.(((((.((((...((((.(((((((((..((........)).)))))).))).))))...)))).))))).)).)).)))))))....)))))))))..)))))))..))))))))..	Ccl-miR159b	48492261	48492280	ATTGGAGTGAAGGGAGCTCC	Ccl-miR159b*	48492407	48492427	AGCTCTCTGAACTCCAAGTCT		3
Ccl-MIR160a	PmiREN004371	MIR160	Citrus clementina	Ccl-scaffold_6	10448467	10448588	+	TTGACGATTGATATATAGTATGCCTGGCTCCCTGTATGCTTTTTGCAAAGCCCATCAGAAGATTGGTGGTCTTGGCGGATAGCGTGCGAGGAGCCATGCATGCTAAATTTAGTGTCAAAAGC	......(((((....((((((((.(((((((.((((((((.(((((.(((.((((((......)))))).))).))))).)))))))).))))))).))))))))...))))).........	10448487	10448568	TGCCTGGCTCCCTGTATGCTTTTTGCAAAGCCCATCAGAAGATTGGTGGTCTTGGCGGATAGCGTGCGAGGAGCCATGCATG	(((.(((((((.((((((((.(((((.(((.((((((......)))))).))).))))).)))))))).))))))).)))..	Ccl-miR160a	10448487	10448507	TGCCTGGCTCCCTGTATGCTT	Ccl-miR160a*	10448548	10448568	GCGTGCGAGGAGCCATGCATG		3
Ccl-MIR160b	PmiREN004372	MIR160	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	30834777	30834899	-	AAGGTGAAATTAATGGGTTATGCCTGGCTCCCTGTATGCCGCAAGCAGACGACAATCTGCCGGAGATTGGCCGTTGCTGGTGGCGTACGAGGAGCCAAGCATACTATTCTTCCTTCCCTTTCT	((((.((.....((((..(((((.(((((((.((((((((((.(((((.((.((((((.....))))))..))))))).)))))))))).))))))).)))))))))))..))))........	30834797	30834879	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCGCAAGCAGACGACAATCTGCCGGAGATTGGCCGTTGCTGGTGGCGTACGAGGAGCCAAGCATA	(((.(((((((.((((((((((.(((((.((.((((((.....))))))..))))))).)))))))))).))))))).)))..	Ccl-miR160b	30834797	30834817	GCGTACGAGGAGCCAAGCATA	Ccl-miR160b*	30834859	30834879	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCG		3
Ccl-MIR160c	PmiREN004373	MIR160	Citrus clementina	Ccl-scaffold_4	3991038	3991159	+	TCTATATATTTATAATTATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCAGAGTCAATCGAAACATCGATGGCCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCATGCATATTCCATGTATAATATATACC	..((((((((((((...((((((.(((((((.((((((((((((((.((((((.((((....))))))).))).)))))))))))))).))))))).))))))....)))).))))))))..	3991058	3991139	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCAGAGTCAATCGAAACATCGATGGCCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCATGCATA	(((.(((((((.((((((((((((((.((((((.((((....))))))).))).)))))))))))))).))))))).)))..	Ccl-miR160c	3991058	3991078	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA	Ccl-miR160c*	3991119	3991139	GCGTATGAGGAGCCATGCATA		3
Ccl-MIR162	PmiREN004374	MIR162	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	8951074	8951204	-	ATAGAGAGAGTGAAGTCACTGGAGGCAGCGGTTCATCGATCACTTTGTGCAAATTTTGTTGTGAAAAATAACACAAAATACATGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAGCGCTCACTCCAACTCTATTC	((((((.((((((.(.(.(((((.((((.((((.(((((((..((((((...(((((((.((........))))))))).))))))..))))))).)))).)))).))))).))))))))...))))))..	8951094	8951184	GGAGGCAGCGGTTCATCGATCACTTTGTGCAAATTTTGTTGTGAAAAATAACACAAAATACATGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAG	(((.((((.((((.(((((((..((((((...(((((((.((........))))))))).))))))..))))))).)))).)))).)))..	Ccl-miR162	8951094	8951114	TCGATAAACCTCTGCATCCAG	Ccl-miR162*	8951164	8951184	GGAGGCAGCGGTTCATCGATC		3
Ccl-MIR164a	PmiREN004375	MIR164	Citrus clementina	Ccl-scaffold_7	7665822	7665937	+	AGAGGGAGAATGAGCCAAGCTGGAGAAGCAGGGCACATGCTAAATCCATCAGTTGTGAGGATTTTTGGAGTGTTGCATGTGCCCTAGCTCTCCAGCTAGGACTTTCCCCTTAAAAG	.(((((.((..(((((.(((((((((.(((((((((((((....((((..((((.....))))..)))).....))))))))))).))))))))))).)).)))))))))).....	7665842	7665917	TGGAGAAGCAGGGCACATGCTAAATCCATCAGTTGTGAGGATTTTTGGAGTGTTGCATGTGCCCTAGCTCTCCAGC	((((((.(((((((((((((....((((..((((.....))))..)))).....))))))))))).))))))))..	Ccl-miR164a	7665842	7665862	TGGAGAAGCAGGGCACATGCT	Ccl-miR164a*	7665897	7665917	CATGTGCCCTAGCTCTCCAGC		3
Ccl-MIR164b	PmiREN004376	MIR164	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	45856321	45856451	-	TTGGGTGAGTAGCTCCTTGCTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAACACCACTTTGGCTCCTTTCGGTTTCAGAATTGCCACTAAATCCTTTGCACGCGCTCCCCTTCTCCAACATGGGTTCCTCACCTTTCCT	..(((((((.(((.((.((.((((((((..((((.((((((((........((((....(((.......)))..))))........)))))))).))))..)))))))).)).))))).))))))).....	45856341	45856431	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAACACCACTTTGGCTCCTTTCGGTTTCAGAATTGCCACTAAATCCTTTGCACGCGCTCCCCTTCTCCAAC	((((((((..((((.((((((((........((((....(((.......)))..))))........)))))))).))))..))))))))..	Ccl-miR164b	45856411	45856431	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA	Ccl-miR164b*	45856341	45856361	CACGCGCTCCCCTTCTCCAAC		3
Ccl-MIR164c	PmiREN004377	MIR164	Citrus clementina	Ccl-scaffold_5	33408132	33408253	+	CATGGGTGGGTAGCTCTTGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAATTCACATGCGTAGATCATATGATATCTTACAAGACTTTGCACGCGCTCCCCTTCTCCAACACGTGTTTCTCGCCCTCAAT	...(((((((.(((.(.(((((((((((..((((.(((((((.............(((....))).............))))))).))))..))))))))))).).))).))))))).....	33408152	33408233	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAATTCACATGCGTAGATCATATGATATCTTACAAGACTTTGCACGCGCTCCCCTTCTCCAAC	((((((((..((((.(((((((.............(((....))).............))))))).))))..))))))))..	Ccl-miR164c	33408152	33408172	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA	Ccl-miR164c*	33408213	33408233	CACGCGCTCCCCTTCTCCAAC		3
Ccl-MIR164d	PmiREN004378	MIR164	Citrus clementina	Ccl-scaffold_6	17209516	17209725	+	AAGGTGTGTGTAGAGCAAGATGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTAACTCAACCGCACATACATCTACTAACAAAAATTAATTAATCCACACATTTTGAAGAAACCAAATCAAGAAGCAGCATGCTCTTTCTGTTGTTATAGCTCAGTCATGAGTTGAGTTATTTCTTCATGTGCCCTTCTTCCCCATCATGACCGCGGCACCTTGTGT	((((((((((.....((.(((((.((((.((((((((((......(((((((..........................................((((((..........))))))(((((((.........)))))))...(((((....))))))))))))......)))))))))).)))).))))).))..))).)))))))....	17209536	17209705	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTAACTCAACCGCACATACATCTACTAACAAAAATTAATTAATCCACACATTTTGAAGAAACCAAATCAAGAAGCAGCATGCTCTTTCTGTTGTTATAGCTCAGTCATGAGTTGAGTTATTTCTTCATGTGCCCTTCTTCCCCATC	(((.((((.((((((((((......(((((((..........................................((((((..........))))))(((((((.........)))))))...(((((....))))))))))))......)))))))))).)))).)))..	Ccl-miR164d	17209536	17209556	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA	Ccl-miR164d*	17209685	17209705	CATGTGCCCTTCTTCCCCATC		3
Ccl-MIR166a	PmiREN004379	MIR166	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	13055738	13055885	+	GAAGCTGTTCTTTTGAGGGGACTGTTGTCTGGTTCAAGGCCATCAATTAATTATAACTTTGATTCAGGTGTGTGTGTGTATGTATATATATATATGTGTGTGTGTGTTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTTAATTACTGCTTCCATT	(((((.((....(((((((((.((..(((((((((.(((.(((.((((((........))))))((.((((((((((((....)))))))))))).)).....))).))).)))))))))..)).)))))))))..)).)))))....	13055758	13055865	ACTGTTGTCTGGTTCAAGGCCATCAATTAATTATAACTTTGATTCAGGTGTGTGTGTGTATGTATATATATATATGTGTGTGTGTGTTCTCGGACCAGGCTTCATTCC	(.((..(((((((((.(((.(((.((((((........))))))((.((((((((((((....)))))))))))).)).....))).))).)))))))))..)).)..	Ccl-miR166a	13055845	13055865	TCTCGGACCAGGCTTCATTCC	Ccl-miR166a*	13055758	13055778	ACTGTTGTCTGGTTCAAGGCC		3
Ccl-MIR166b	PmiREN004380	MIR166	Citrus clementina	Ccl-scaffold_5	9961654	9961815	-	GAGAGGTTATGGTTGATGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGGTCATCTAGGTTTTCAAAATTTTCTCGGACTTTCTTTCTTGCTTTTATTTTTCCAGGAAAATTATGTTATTTGCCTATGTGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCGTCAACCGACGGTTTCTCT	.(((((...(((((((((((((((..((((((.((((((.((((.(((((...((.((((((((.(((......................))).)))))))).))......))))).)))))))))).))))))..)))))))))))))))......)))))	9961674	9961795	AATGTTGTTTGGCTCGAGGGTCATCTAGGTTTTCAAAATTTTCTCGGACTTTCTTTCTTGCTTTTATTTTTCCAGGAAAATTATGTTATTTGCCTATGTGATCTCGGACCAGGCTTCATTCC	((((..((((((.((((((.((((.(((((...((.((((((((.(((......................))).)))))))).))......))))).)))))))))).))))))..))))..	Ccl-miR166b	9961674	9961694	TCTCGGACCAGGCTTCATTCC	Ccl-miR166b*	9961775	9961795	AATGTTGTTTGGCTCGAGGGT		3
Ccl-MIR166c	PmiREN004381	MIR166	Citrus clementina	Ccl-scaffold_9	4741033	4741147	-	TTTCTCTCATAGTTGAGGGGAATGCTGTCTGGTTCGAGACCATTCATTTGAAGAATAGAAAATCATCTGAATGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACAAGGTGTGTTTTA	...........((((.((((((((..(((((((((((((.((((((..(((...........)))..)))))).)))))))))))))..)))))))).)))).............	4741053	4741127	AATGCTGTCTGGTTCGAGACCATTCATTTGAAGAATAGAAAATCATCTGAATGATCTCGGACCAGGCTTCATTCC	((((..(((((((((((((.((((((..(((...........)))..)))))).)))))))))))))..))))..	Ccl-miR166c	4741053	4741073	TCTCGGACCAGGCTTCATTCC	Ccl-miR166c*	4741107	4741127	AATGCTGTCTGGTTCGAGACC		3
Ccl-MIR166d	PmiREN004382	MIR166	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	43731627	43731755	+	TCATACATGAACGGTTGAGGGGAATGTTGTCTGGTTCGAGATCACTCGTGGACGAATTAATTAATAACTTATTGTCTTTTGAATGATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACTCAGTTTAATTGCTC	.((....((((((((((.((((((((..((((((((((((((((.(((.((((((................))))))..))).))))))))))))))))..)))))))).)))))..)))))..))...	43731647	43731735	GGAATGTTGTCTGGTTCGAGATCACTCGTGGACGAATTAATTAATAACTTATTGTCTTTTGAATGATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	((((((..((((((((((((((((.(((.((((((................))))))..))).))))))))))))))))..))))))..	Ccl-miR166d	43731715	43731735	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Ccl-miR166d*	43731647	43731667	GGAATGTTGTCTGGTTCGAGA		3
Ccl-MIR166e	PmiREN004383	MIR166	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	47795058	47795235	-	GGGAGCTTTTTGTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACACTGCTTGTTGATCCATTAATTTTACGTATTCTCTCATAGATCTAGCATCTGAATGGTGGATAACAATATACGGATTCAGCTTATTTGGCGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATATATTGCTTCCATGG	((((((....(((.(((.((((((((..((((((.((((.(((.((....((((((((...........((((..........(((((.(((....))).)))))......))))))).)))))......)).))).)))).))))))..)))))))).))).)))..))))))....	47795078	47795215	GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACACTGCTTGTTGATCCATTAATTTTACGTATTCTCTCATAGATCTAGCATCTGAATGGTGGATAACAATATACGGATTCAGCTTATTTGGCGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	((((((..((((((.((((.(((.((....((((((((...........((((..........(((((.(((....))).)))))......))))))).)))))......)).))).)))).))))))..))))))..	Ccl-miR166e	47795078	47795098	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Ccl-miR166e*	47795195	47795215	GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG		3
Ccl-MIR166f	PmiREN004384	MIR166	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	439820	440021	-	GGAAGCTTTTTCTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGCCACTAACTAGATCTTTGATTTAATCTCAGTTGATCATATATTTGTTTCATTTTTCTTCCATAAAATTTAATTATATTGAGATACCCATCATTGATCTTAAGATAATTAAGTTAGTGACGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCCAATAATTGCTTCTATCT	((((((..((......(.((((((((..((((((.((((.(.(((((((((((((..((((...((((((((((((..((.((((...................)))).)))))).))))))))....))))..)))))...........)))))))).).)))).))))))..))))))))).....))..))))))....	439840	440001	GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGCCACTAACTAGATCTTTGATTTAATCTCAGTTGATCATATATTTGTTTCATTTTTCTTCCATAAAATTTAATTATATTGAGATACCCATCATTGATCTTAAGATAATTAAGTTAGTGACGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	((((((..((((((.((((.(.(((((((((((((..((((...((((((((((((..((.((((...................)))).)))))).))))))))....))))..)))))...........)))))))).).)))).))))))..))))))..	Ccl-miR166f	439840	439860	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Ccl-miR166f*	439981	440001	GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG		3
Ccl-MIR166g	PmiREN004385	MIR166	Citrus clementina	Ccl-scaffold_5	9961827	9961959	-	AAAAATGATTGTTTCTGAGGGGACTGTTGTCTGGCTCGATGCATTAATAATAATTATAATTATATAATTATAATTATCATGAAAAAAGGGTATCGGACCAGGCTTCATTCCCTTCAGAATCAAATTCATTGTT	...((((((((.(((((((((((.((..((((((.(((((((....((.((((((((((((....)))))))))))).)).........))))))).))))))..)).))))))))))).)))..)))))...	9961847	9961939	GGACTGTTGTCTGGCTCGATGCATTAATAATAATTATAATTATATAATTATAATTATCATGAAAAAAGGGTATCGGACCAGGCTTCATTCCCT	(((.((..((((((.(((((((....((.((((((((((((....)))))))))))).)).........))))))).))))))..)).)))..	Ccl-miR166g	9961847	9961867	TCGGACCAGGCTTCATTCCCT	Ccl-miR166g*	9961919	9961939	GGACTGTTGTCTGGCTCGATG		3
Ccl-MIR166h	PmiREN004386	MIR166	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	41560505	41560741	-	GAAGGAAAAGTGGTGTTTGGAATGAAGTTTGATCCAAGATCATATTGTCACTCTATTTACTATTAATTTCTTTTATGCGTGTGTGTTTTTTTCTTTTCAAGATAGAGAGTAAGCGCTTGATACGATGACCACTTTCGAGCTTTCTTGAATCATATGATTGTTTGAGAGTTTTCTTGAGAAATTAAGGTAAGTAGGGGTCTGGAATGAAGCCCGATCCAAGATCCTTGTGTCTCTTCC	((((((.....((..((((((.((..((((.(((((.(((..........(((((((((((.((((((((((.....(((((((((((((((((.........)))))).))))))...)))))..((..((((((((((..((...........))..))))))))))..))..))))))))))))))))))))))))))).)).)))).)).))))))..)).....)).)))).	41560525	41560721	AATGAAGTTTGATCCAAGATCATATTGTCACTCTATTTACTATTAATTTCTTTTATGCGTGTGTGTTTTTTTCTTTTCAAGATAGAGAGTAAGCGCTTGATACGATGACCACTTTCGAGCTTTCTTGAATCATATGATTGTTTGAGAGTTTTCTTGAGAAATTAAGGTAAGTAGGGGTCTGGAATGAAGCCCGATCC	(.((..((((.(((((.(((..........(((((((((((.((((((((((.....(((((((((((((((((.........)))))).))))))...)))))..((..((((((((((..((...........))..))))))))))..))..))))))))))))))))))))))))))).)).)))).)).)..	Ccl-miR166h	41560701	41560721	AATGAAGTTTGATCCAAGATC	Ccl-miR166h*	41560525	41560545	GTCTGGAATGAAGCCCGATCC		3
Ccl-MIR166i	PmiREN004387	MIR166	Citrus clementina	Ccl-scaffold_7	15726273	15726415	+	AAAATATGTTGGAGTTGAGGGGAATGGTGGCTGGTTCAAGGCTTCAAAAGAGAGTTTCTTAAGAAATAAGAAACAATTATTAATCTCTCTCTAAAGATAGCTTTGGACCAGGCTTCCTTCCTCTCAAAATTAAACACCTATCT	...............(((((((((.((.(((((((((((((((((...(((((((((((((.....)))))))).............)))))...)).)))))))))))).))).))))))))))).................	15726293	15726395	GGAATGGTGGCTGGTTCAAGGCTTCAAAAGAGAGTTTCTTAAGAAATAAGAAACAATTATTAATCTCTCTCTAAAGATAGCTTTGGACCAGGCTTCCTTCCTC	((((.((.(((((((((((((((((...(((((((((((((.....)))))))).............)))))...)).)))))))))))).))).))))))..	Ccl-miR166i	15726374	15726395	TTTGGACCAGGCTTCCTTCCTC	Ccl-miR166i*	15726293	15726313	GGAATGGTGGCTGGTTCAAGG		3
Ccl-MIR166j	PmiREN004388	MIR166	Citrus clementina	Ccl-scaffold_7	15646327	15646471	+	ATAATGTGTTGGAGTTGAGAGGAATGGCGGCTGGTTCAAAGCTTCAAAAGAAAGTTTCTTAAGAAATAAGAAACAAGTATGAATCTTTCTCTCTAAAGATAGCTTTGGACCAGGCTTCATTCCTCTCAAAATTAAACACCTATCT	..............(((((((((((((.(.(((((((((((((..........((((((((.....))))))))........((((((......))))))))))))))))))).).)))))))))))))................	15646347	15646451	GGAATGGCGGCTGGTTCAAAGCTTCAAAAGAAAGTTTCTTAAGAAATAAGAAACAAGTATGAATCTTTCTCTCTAAAGATAGCTTTGGACCAGGCTTCATTCCTC	(((((((.(.(((((((((((((..........((((((((.....))))))))........((((((......))))))))))))))))))).).)))))))..	Ccl-miR166j	15646431	15646451	TTGGACCAGGCTTCATTCCTC	Ccl-miR166j*	15646347	15646367	GGAATGGCGGCTGGTTCAAAG		3
Ccl-MIR167a	PmiREN004389	MIR167	Citrus clementina	Ccl-scaffold_5	29592219	29592334	-	ATTCGTGCACTAGTAGTAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGAACTTTCCTTGACCTCCATCTCTAGGGAAAGGCCAGATCATCTGGCAGTTTCACCTATTGATGGTAGCATGGCCA	...(((((((((.((((((.((((((((((((.((((((((..((((((((((........)).))))))))..)))))))))))))))))))).)))))).)))).)))))....	29592239	29592314	TGAAGCTGCCAGCATGATCTGAACTTTCCTTGACCTCCATCTCTAGGGAAAGGCCAGATCATCTGGCAGTTTCACC	((((((((((((.((((((((..((((((((((........)).))))))))..))))))))))))))))))))..	Ccl-miR167a	29592294	29592314	TGAAGCTGCCAGCATGATCTG	Ccl-miR167a*	29592239	29592259	AGATCATCTGGCAGTTTCACC		3
Ccl-MIR167b	PmiREN004390	MIR167	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	44075358	44075504	-	CAGTCTACAAGGGGAAAAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTATCTAGCGCATTTGGTTAGTGAAAGTAATAAATAAAGAAGCAAGTACGATACTAACCCTAGCTAGGTCATGCTCTGACAGCCTCACTCCTTCCTACTTGCGGACCCA	..((((.(((((((((..(((((.(((((.(((((((((((.((((.......((((((((...(((.................)))..)))))))))))).)))))))))))..).)))).)))))..))))).)))).))))...	44075378	44075484	TGAAGCTGCCAGCATGATCTATCTAGCGCATTTGGTTAGTGAAAGTAATAAATAAAGAAGCAAGTACGATACTAACCCTAGCTAGGTCATGCTCTGACAGCCTCACT	(((.(((((.(((((((((((.((((.......((((((((...(((.................)))..)))))))))))).)))))))))))..).)))).)))..	Ccl-miR167b	44075464	44075484	TGAAGCTGCCAGCATGATCTA	Ccl-miR167b*	44075378	44075398	TCATGCTCTGACAGCCTCACT		3
Ccl-MIR167c	PmiREN004391	MIR167	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	44072076	44072184	-	TATCGTGAACCAGCAGCAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTCCTTCACTGTCAAGGATAGATCGGATCATGTGGTAGCTTCACCTGTTGATCGGATCACGAATT	..((((((.((.(((((((.(((((((((((.((((((((...(((((((.......))))).))...))))))))))))))))))).)))))).).)).))))))...	44072096	44072164	TGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTCCTTCACTGTCAAGGATAGATCGGATCATGTGGTAGCTTCACC	(((((((((((.((((((((...(((((((.......))))).))...)))))))))))))))))))..	Ccl-miR167c	44072144	44072164	TGAAGCTGCCAGCATGATCTA	Ccl-miR167c*	44072096	44072116	GGATCATGTGGTAGCTTCACC		3
Ccl-MIR167d	PmiREN004392	MIR167	Citrus clementina	Ccl-scaffold_9	4164059	4164170	+	TATCGGGCACCACTATCAGATGAAGCTGCCAGCATGATCTTAACTTTCCTCCTTTGCTCGAGGAATGATACAGATCATGCGGCAGTTTCACCTGTTCGTTGGTTGCACGAAA	..(((.(((((((...(((.((((((((((.(((((((((((.(.((((((........)))))).).)).))))))))))))))))))).)))...).))).))).)))..	4164079	4164150	TGAAGCTGCCAGCATGATCTTAACTTTCCTCCTTTGCTCGAGGAATGATACAGATCATGCGGCAGTTTCACC	((((((((((.(((((((((((.(.((((((........)))))).).)).)))))))))))))))))))..	Ccl-miR167d	4164079	4164100	TGAAGCTGCCAGCATGATCTTA	Ccl-miR167d*	4164130	4164150	AGATCATGCGGCAGTTTCACC		3
Ccl-MIR168	PmiREN004393	MIR168	Citrus clementina	Ccl-scaffold_5	29173061	29173243	-	AGTTACCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTGGCTAGTTTTTTTTTTGAAATTTTTTGACAGCGAGGTGGCGTGTTGTAATTGGTCGTAACGTTTAAATTAATGATTGAAAAAATGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGACCGAGGTGAGAGAT	..(((((..((((((((.(((((.((((((((((.(((((.((((((.((..((((((((..............((((((.(....).))))))....((((((.............)))))))))))))))).)))))).))))).)))))))))).))))).)))))))).))))).....	29173081	29173223	TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTGGCTAGTTTTTTTTTTGAAATTTTTTGACAGCGAGGTGGCGTGTTGTAATTGGTCGTAACGTTTAAATTAATGATTGAAAAAATGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAAT	(((.((((((((((.(((((.((((((.((..((((((((..............((((((.(....).))))))....((((((.............)))))))))))))))).)))))).))))).)))))))))).)))..	Ccl-miR168	29173203	29173223	TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA	Ccl-miR168*	29173081	29173101	CCCGCCTTGCATCAACTGAAT		3
Ccl-MIR169a	PmiREN004394	MIR169	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	12521673	12521808	-	AGAAAAGAGTGCTAGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGATCTCTCCTAAGTGGTTTCAAAACGTTGAATATTTAAACCCTCGGGTGGGTACCAGGCAGTCTCCTTGGCTAACTTGACAGCCTCTCTTCTTTCA	((((.((((.(((.(((.((((((((((((.((((.(((((..(((.(((.((.((((((((....)))).......)))))).))).)))...)))))))))))))))))).))).)))))))))).))))....	12521693	12521788	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGATCTCTCCTAAGTGGTTTCAAAACGTTGAATATTTAAACCCTCGGGTGGGTACCAGGCAGTCTCCTTGGCTAACT	((((((((((.((((.(((((..(((.(((.((.((((((((....)))).......)))))).))).)))...)))))))))))))))))).)..	Ccl-miR169a	12521768	12521788	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Ccl-miR169a*	12521693	12521713	AGGCAGTCTCCTTGGCTAACT		3
Ccl-MIR169b	PmiREN004395	MIR169	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	12521392	12521534	-	GAAGATAAGAATACTATTTGGTAGCCAGGGATGACTTGCCTGCGGCTTCCAATATTGCTAGCTAGGTTTCACCATCATCAATTAAAGCTGCTGTAGACAGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAGCTGACAGCCTCTTCTCTCTCA	(((((.((((...........((((((((((.((((.(((((.((((..((....))..)))).(((...)))................((((....)))))))))))))))))))))))...........)))).))).)).	12521412	12521514	GTAGCCAGGGATGACTTGCCTGCGGCTTCCAATATTGCTAGCTAGGTTTCACCATCATCAATTAAAGCTGCTGTAGACAGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAGC	.((((((((((.((((.(((((.((((..((....))..)))).(((...)))................((((....)))))))))))))))))))))))...	Ccl-miR169b	12521494	12521514	GTAGCCAGGGATGACTTGCCT	Ccl-miR169b*	12521412	12521431	GGCAGTCTCCTTGGCTAAGC		3
Ccl-MIR169c	PmiREN004396	MIR169	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	12476693	12476922	-	AAAGCCCTTGTGTGGTAGCAGGCAATCTCATTGACTAATTTGACAGACTCTTTTCTTTCATGCTAGCCTTCCTTTTCTTCAACAAGTCATAAGCAATTGGACAAGCAATGCTGCTTAATTAGAAGAATACTATGTCGTAAGATTAATCAAGATGGGAGGGTCTTACATGCAGATAACAGTATTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGGCTTGCGATATTATTCAG	.......((((..(((.((((((((((((.(((.(((....((((((((.((.(((..((((..(((((((((..((((.....((((.((((((((((......))))..))))))..........(((......))).))))....)))).))))))).))..)))).))).)).))).)))))...))).))).)).)).)))))))).))).))))..........	12476713	12476902	GGCAATCTCATTGACTAATTTGACAGACTCTTTTCTTTCATGCTAGCCTTCCTTTTCTTCAACAAGTCATAAGCAATTGGACAAGCAATGCTGCTTAATTAGAAGAATACTATGTCGTAAGATTAATCAAGATGGGAGGGTCTTACATGCAGATAACAGTATTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTG	(((((((((.(((.(((....((((((((.((.(((..((((..(((((((((..((((.....((((.((((((((((......))))..))))))..........(((......))).))))....)))).))))))).))..)))).))).)).))).)))))...))).))).)).)).)))))..	Ccl-miR169c	12476713	12476733	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Ccl-miR169c*	12476882	12476902	GGCAATCTCATTGACTAATTT		3
Ccl-MIR169d	PmiREN004397	MIR169	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	12475070	12475205	-	AAGAGAGGAGAAATGTTTGTTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGTCATGCAAGAGGGTTTCGAGTAGCTATAGAAAAGCTCTACTGTTTGGTTGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAGCTGACAGCCTCTTCTCTTTCA	((((((((((...((((.((((((((((((.((((.(((((((.((.(((..(((((((....((....))...)))))))..))).))..)).)))))))))))))))))).))).))))..))))))))))...	12475090	12475185	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGTCATGCAAGAGGGTTTCGAGTAGCTATAGAAAAGCTCTACTGTTTGGTTGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAGC	((((((((((.((((.(((((((.((.(((..(((((((....((....))...)))))))..))).))..)).)))))))))))))))))).)..	Ccl-miR169d	12475165	12475185	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Ccl-miR169d*	12475090	12475110	AGGCAGTCTCCTTGGCTAAGC		3
Ccl-MIR169e	PmiREN004398	MIR169	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	12454726	12454869	-	TGAATATAATAGCATTGTTTGCTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGCCTTGATTGCAAGACGAGGGTTTCAAGTGGCTGGAAGCCTCTCTTGTTTGGTTGCCAGGCGGTCTCCTTGGCTAAGCTGACAGGCTCTTATCTTTCATG	((((.((((.(((.(((((.((((((((((((.((((.(((((.((.......((((((.((((.(((((......))))).))))))))))......)))))))))))))))))))).))).)))))))).))))..))))..	12454746	12454849	GCTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGCCTTGATTGCAAGACGAGGGTTTCAAGTGGCTGGAAGCCTCTCTTGTTTGGTTGCCAGGCGGTCTCCTTGGCTAAGCTG	((((((((((((.((((.(((((.((.......((((((.((((.(((((......))))).))))))))))......)))))))))))))))))))).)))..	Ccl-miR169e	12454828	12454849	GCTAGCCAAGGATGACTTGCCT	Ccl-miR169e*	12454746	12454766	GCGGTCTCCTTGGCTAAGCTG		3
Ccl-MIR169f	PmiREN004399	MIR169	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	12415376	12415532	-	AAAATGAGAGTCTAGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGATTCTTCCAATTAAGCGGTTTCAGATTAATCATATTGATTAATTAGTTTTTTAAATGAAGCCATTGATGGGTTACCAGGCAGTCACCTTGGCTAACTTGACAGTCTCTTGTCTCTC	....................(((((((((.(((((.(((((.....((((.((((..((((((((((((((((...)))))))))...........))))))).))))))))....)))))))))))))))))))....(((((....)))))....	12415396	12415512	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGATTCTTCCAATTAAGCGGTTTCAGATTAATCATATTGATTAATTAGTTTTTTAAATGAAGCCATTGATGGGTTACCAGGCAGTCACCTTGGCTAAC	(((((((((.(((((.(((((.....((((.((((..((((((((((((((((...)))))))))...........))))))).))))))))....)))))))))))))))))))..	Ccl-miR169f	12415492	12415512	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Ccl-miR169f*	12415396	12415416	CAGGCAGTCACCTTGGCTAAC		3
Ccl-MIR169g	PmiREN004400	MIR169	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	12415126	12415258	-	AAGATAAGAGTAATTTTTGTTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGGCTTGCAATATAATTAGGTTTCAAGCTTTGAAGCCTTTTGTTTGGTTGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAGCTGACAGCTTCTTCTCTTTC	((((....(((..((....(((((((((((.((((.((((((((((.((((.......(((((((((...))))))))).))))..))))).))))))))))))))))))))...))..))))))).......	12415146	12415238	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGGCTTGCAATATAATTAGGTTTCAAGCTTTGAAGCCTTTTGTTTGGTTGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAG	((((((((((.((((.((((((((((.((((.......(((((((((...))))))))).))))..))))).)))))))))))))))))))..	Ccl-miR169g	12415218	12415238	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Ccl-miR169g*	12415146	12415166	CAGGCAGTCTCCTTGGCTAAG		3
Ccl-MIR169h	PmiREN004401	MIR169	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	12410788	12410926	-	AATATAATATCATTGTTTGTTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCACCTTGATTGCAAGACGAGGGTTTCAAGTGGCTGGAAGCCTCTCTTGTTTGGTTGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAGTCACAGGCTCTTATCTTTCA	((.((((.....((((...(((((((((((.((((.(((((((((......((((((.((((.(((((......))))).))))))))))..)).)).))))))))))))))))))))...))))....))))..))..	12410808	12410906	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCACCTTGATTGCAAGACGAGGGTTTCAAGTGGCTGGAAGCCTCTCTTGTTTGGTTGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAG	((((((((((.((((.(((((((((......((((((.((((.(((((......))))).))))))))))..)).)).)))))))))))))))))))..	Ccl-miR169h	12410886	12410906	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Ccl-miR169h*	12410808	12410828	CAGGCAGTCTCCTTGGCTAAG		3
Ccl-MIR169i	PmiREN004402	MIR169	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	9780554	9780790	-	CCTTTGATTGTTGAATACCAGGCAGTCTCCTCGGCTAACTTGACAGTCCCTTATCTCTCATGCCAGGCCTTCTATTTTTCACCAACCAAGATCTCTCAAAAACTAGATATAAGCAATTGCATTGCGCTGGTTAATTGAAGCATAAATAAATATCTAAGGAAGAGGGTTCTTACATGAAGATAAGAGTAACGTTTGTTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGGCTGTCAATATCATTAGG	(...((((.(((((...((((((((((((((.(((((((..(((...(.(((((((.(((((..(((((((((.((((............((((.((((.((((((......((....))......))))))..)))))).))............)))).)))))).)))..)))))))))))).)....))).))))))).)))).))).)))))).)....)))))))))...).	9780574	9780770	GGCAGTCTCCTCGGCTAACTTGACAGTCCCTTATCTCTCATGCCAGGCCTTCTATTTTTCACCAACCAAGATCTCTCAAAAACTAGATATAAGCAATTGCATTGCGCTGGTTAATTGAAGCATAAATAAATATCTAAGGAAGAGGGTTCTTACATGAAGATAAGAGTAACGTTTGTTAGCCAAGGATGACTTGCCTG	(((((((((((.(((((((..(((...(.(((((((.(((((..(((((((((.((((............((((.((((.((((((......((....))......))))))..)))))).))............)))).)))))).)))..)))))))))))).)....))).))))))).)))).))).))))..	Ccl-miR169i	9780574	9780594	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Ccl-miR169i*	9780750	9780770	GGCAGTCTCCTCGGCTAACTT		3
Ccl-MIR169j	PmiREN004403	MIR169	Citrus clementina	Ccl-scaffold_4	24490865	24491089	+	AGGTAAAGGTTCTCGTTTTGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGGAGCCCCTCAACGGTATTCTTACTTATTTATCATTTCTCAAAATATACGAGTTAATTAACATAAAATCAGATCACGAAGTAGAGTAGTGCTTACATTCTACTTCAAGAAAATGAAAGGACTGTAGTATCTTTGAGTGGTTTGCAGGCCATCTCCTTGGCTAGCAAGATGGCTCTTATCTCTCAC	............((((((((((((((((((.((...((((((((((.(((((.(((((...(((...(((.(((((((((.........)))........................((((((((((.((....))))))))))))....)))))).)))...)))))))).))))).))))).)))))..))))))))))).)))))))))..............	24490885	24491069	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGGAGCCCCTCAACGGTATTCTTACTTATTTATCATTTCTCAAAATATACGAGTTAATTAACATAAAATCAGATCACGAAGTAGAGTAGTGCTTACATTCTACTTCAAGAAAATGAAAGGACTGTAGTATCTTTGAGTGGTTTGCAGGCCATCTCCTTGGCTAGCA	((((((((((.((...((((((((((.(((((.(((((...(((...(((.(((((((((.........)))........................((((((((((.((....))))))))))))....)))))).)))...)))))))).))))).))))).)))))..))))))))))).)..	Ccl-miR169j	24490885	24490905	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Ccl-miR169j*	24491049	24491069	AGGCCATCTCCTTGGCTAGCA		3
Ccl-MIR169k	PmiREN004404	MIR169	Citrus clementina	Ccl-scaffold_4	13659399	13659543	+	GAGATGAAGAGCTTTGCTTTGCTAGCCAAGGATGACTTGCCTACGTCCATCATTGAGGGTTTTCAAAATAAAAAGAATGAGAATCCTTTTGTGGGTTATGTTGAGCAAGCATCCTGGGCTAATTGAGTGGCTCTTATCTTTCATG	(((((((.(((((..((((...(((((.((((((.((((((.((((...((((.(((((((((((............)))))))))))..))))...)))).).))))))))))).)))))...)))))))))))))))).....	13659419	13659523	GCTAGCCAAGGATGACTTGCCTACGTCCATCATTGAGGGTTTTCAAAATAAAAAGAATGAGAATCCTTTTGTGGGTTATGTTGAGCAAGCATCCTGGGCTAATTG	..(((((.((((((.((((((.((((...((((.(((((((((((............)))))))))))..))))...)))).).))))))))))).)))))....	Ccl-miR169k	13659419	13659440	GCTAGCCAAGGATGACTTGCCT	Ccl-miR169k*	13659503	13659523	GCAAGCATCCTGGGCTAATTG		3
Ccl-MIR169l	PmiREN004405	MIR169	Citrus clementina	Ccl-scaffold_4	13696125	13696269	+	AAGATGAAGAGCTTTGCTTTGCTAGCCAAGGATGACTTGCCTACGTCCACCATTGAGGGTTTTCCAAATCAGAAGAATGAGAGCCCCTATGTGGGTTATGTTTGGCAAGTGTCCTAGGCTAATTGAGTGGCTCTTATCTTGCACA	(((((((.(((((..((((...(((((.(((((.(((((((.((((...((((...((((((((....((....))..))))))))....))))...))))..)))))))))))).)))))...)))))))))))))))).....	13696145	13696249	GCTAGCCAAGGATGACTTGCCTACGTCCACCATTGAGGGTTTTCCAAATCAGAAGAATGAGAGCCCCTATGTGGGTTATGTTTGGCAAGTGTCCTAGGCTAATTG	..(((((.(((((.(((((((.((((...((((...((((((((....((....))..))))))))....))))...))))..)))))))))))).)))))....	Ccl-miR169l	13696145	13696166	GCTAGCCAAGGATGACTTGCCT	Ccl-miR169l*	13696229	13696249	GCAAGTGTCCTAGGCTAATTG		3
Ccl-MIR170a	PmiREN004406	MIR170	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	22316407	22316530	-	GTTGTAAAATGAAATCATCAAGGTATTGGCGCGCCTCAATTTAAAGACGTGGTTAAGTGGGCATGATTAGCCATGTATTTTCATTGAGCCGCGTCAATATCTCCTTAATTATTTTGTAACTCTC	((((((((((((........(((((((((((((.((((((..(((.((((((((((..........)))))))))).)))..)))))).)))))))))))))......))))))))))))....	22316427	22316510	AGGTATTGGCGCGCCTCAATTTAAAGACGTGGTTAAGTGGGCATGATTAGCCATGTATTTTCATTGAGCCGCGTCAATATCTCC	(((((((((((((.((((((..(((.((((((((((..........)))))))))).)))..)))))).)))))))))))))..	Ccl-miR170a	22316427	22316447	TTGAGCCGCGTCAATATCTCC	Ccl-miR170a*	22316490	22316510	AGGTATTGGCGCGCCTCAATT		3
Ccl-MIR170b	PmiREN004407	MIR170	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	12772954	12773090	-	ATTGGAGAAGTAGACATGGTGTGATATTGGTTCGGCTCATCTTAATTAATAGATTCATATTTCAGCCCTTAAGGTTCTTACATGTATATATCTAGACGAGCCGAATCAATATCACTCTTGTATGCTTCTTTCTTTTG	......((((((.(((.((.((((((((((((((((((.(((........((((..((((...((((.....)))).......))))..))))))).)))))))))))))))))).))))).))))))...(....)	12772974	12773070	GTGATATTGGTTCGGCTCATCTTAATTAATAGATTCATATTTCAGCCCTTAAGGTTCTTACATGTATATATCTAGACGAGCCGAATCAATATCACTC	((((((((((((((((((.(((........((((..((((...((((.....)))).......))))..))))))).))))))))))))))))))..	Ccl-miR170b	12772974	12772994	CGAGCCGAATCAATATCACTC	Ccl-miR170b*	12773050	12773070	GTGATATTGGTTCGGCTCATC		3
Ccl-MIR171a	PmiREN004408	MIR171	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	22195322	22195437	-	GATGGATGGGTACAACGGGATATTGGTGCGGTTCAATAAGAAAACGGTGCTCAATACTTTTTGAGCTCCGCTTTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACGTGCCACTCGCTCTCTAA	..............(((.(((((((((((((((((((.(((((.(((.((((((......)))))).))).))))).))))))))))))))))))).)))................	22195342	22195417	TATTGGTGCGGTTCAATAAGAAAACGGTGCTCAATACTTTTTGAGCTCCGCTTTTTGATTGAGCCGTGCCAATATC	(((((((((((((((((.(((((.(((.((((((......)))))).))).))))).)))))))))))))))))..	Ccl-miR171a	22195342	22195362	TGATTGAGCCGTGCCAATATC	Ccl-miR171a*	22195397	22195417	TATTGGTGCGGTTCAATAAGA		3
Ccl-MIR171b	PmiREN004409	MIR171	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	35379150	35379267	-	ATTCCACAAAGCATACGAGATATTGGCGCGGTTCAATCTGAGAGCAGTGCTCAAAGTCTAAGAAGAGCCCTGTTATTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACGTCACGTGCAATCAATTC	..........(((((((.((((((((((((((((((((....(((((.((((............)))).)))))....)))))))))))))))))))).)))...)))).........	35379170	35379247	TATTGGCGCGGTTCAATCTGAGAGCAGTGCTCAAAGTCTAAGAAGAGCCCTGTTATTTGATTGAGCCGTGCCAATATC	((((((((((((((((((....(((((.((((............)))).)))))....))))))))))))))))))..	Ccl-miR171b	35379170	35379190	TGATTGAGCCGTGCCAATATC	Ccl-miR171b*	35379227	35379247	TATTGGCGCGGTTCAATCTGA		3
Ccl-MIR171c	PmiREN004410	MIR171	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	13369235	13369349	-	GTGGTAGGAGTAAAGTTTGATGTTGGCATAGCTCAATCCGATCAAAATTCTCAGTGCAGCTGAGTCCTTTATTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCACATTCATTCTCTCTATCAT	((((((((((...(((.((((((((((((.((((((((.((..(((...((((((...))))))...)))..)).)))))))).)))))))))))).)))....))).)))))))	13369255	13369329	TGTTGGCATAGCTCAATCCGATCAAAATTCTCAGTGCAGCTGAGTCCTTTATTCTGATTGAGCCGTGCCAATATC	(((((((((.((((((((.((..(((...((((((...))))))...)))..)).)))))))).)))))))))..	Ccl-miR171c	13369255	13369275	TGATTGAGCCGTGCCAATATC	Ccl-miR171c*	13369309	13369329	TGTTGGCATAGCTCAATCCGA		3
Ccl-MIR171d	PmiREN004411	MIR171	Citrus clementina	Ccl-scaffold_4	12466822	12466939	+	GTTGAAATTTAAAACGGAGATGTTGGAACGGCTCAATCAAATCAAATATCCTATGAAATCAATTGGGTCCTTTAATTTGATTGAGCCGTGCCAATATCTCCTCTCGTCTTCTTTCGCT	...............(((((((((((.(((((((((((((((.(((...((((..........))))...))).))))))))))))))).))))))))))).................	12466842	12466919	TGTTGGAACGGCTCAATCAAATCAAATATCCTATGAAATCAATTGGGTCCTTTAATTTGATTGAGCCGTGCCAATATC	((((((.(((((((((((((((.(((...((((..........))))...))).))))))))))))))).))))))..	Ccl-miR171d	12466899	12466919	TGATTGAGCCGTGCCAATATC	Ccl-miR171d*	12466842	12466862	TGTTGGAACGGCTCAATCAAA		3
Ccl-MIR171e	PmiREN004412	MIR171	Citrus clementina	Ccl-scaffold_7	477846	477983	-	ATATGAAAGGGTAGCCGTGATATTGGCCTGGTTCACTCAGACAAACCGGTTTATTTGCTTTTATTAGAGCAAAATTCCAGGTTTTTTTGTTTTGGTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCTCGTTTCTCTTTCATTTTTC	..(((((((((.(((.(.(((((((((.(((((((.(((((((((((((....((((((((....))))))))...)).)))))..........)))))).))))))).))))))))).)))).))))))))).....	477866	477963	TATTGGCCTGGTTCACTCAGACAAACCGGTTTATTTGCTTTTATTAGAGCAAAATTCCAGGTTTTTTTGTTTTGGTTTGATTGAGCCGTGCCAATATC	(((((((.(((((((.(((((((((((((....((((((((....))))))))...)).)))))..........)))))).))))))).)))))))..	Ccl-miR171e	477866	477886	TGATTGAGCCGTGCCAATATC	Ccl-miR171e*	477943	477963	TATTGGCCTGGTTCACTCAGA		3
Ccl-MIR171f	PmiREN004413	MIR171	Citrus clementina	Ccl-scaffold_1	25748190	25748315	+	AGCAAGAAAAAAAACGAAAGCGATATTGGTGAGGTTCAATCCGAAGACGGATTTACACATTGAAGTTGTAAAAGACGATCTCAGATTGAGCCGCGCCAATATCACTTAATTTATAAAAATGAATAT	.................(((.((((((((((.(((((((((.((.((((..(((((((......).))))))...)).)))).))))))))).)))))))))).))).((((((....))))))..	25748210	25748295	CGATATTGGTGAGGTTCAATCCGAAGACGGATTTACACATTGAAGTTGTAAAAGACGATCTCAGATTGAGCCGCGCCAATATCACT	.((((((((((.(((((((((.((.((((..(((((((......).))))))...)).)))).))))))))).))))))))))...	Ccl-miR171f	25748275	25748295	TTGAGCCGCGCCAATATCACT	Ccl-miR171f*	25748210	25748230	CGATATTGGTGAGGTTCAATC		3
Ccl-MIR171g	PmiREN004414	MIR171	Citrus clementina	Ccl-scaffold_5	42334840	42334958	-	TACTGAAATAGTCACTGCGATATTGGCCCGGTTCATTCAGAGCTTAAGCGTTTAAGCTGAATGCTTGCTGGTGGACTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCTTAGTGCTTACTTCAAACAC	...((((.(((.(((((.(((((((((.(((((((.((((((((((((((((((...)))))))))).....)).)))))).))))))).))))))))).))))).))).)))).....	42334860	42334938	TATTGGCCCGGTTCATTCAGAGCTTAAGCGTTTAAGCTGAATGCTTGCTGGTGGACTTTGATTGAGCCGTGCCAATATC	(((((((.(((((((.((((((((((((((((((...)))))))))).....)).)))))).))))))).)))))))..	Ccl-miR171g	42334860	42334880	TGATTGAGCCGTGCCAATATC	Ccl-miR171g*	42334918	42334938	TATTGGCCCGGTTCATTCAGA		3
Ccl-MIR172a	PmiREN004415	MIR172	Citrus clementina	Ccl-scaffold_7	1319450	1319594	+	AACAGTCGTTGCTCGCTGTAGCAGCGTCCTCAAGATTCACATGCAGTCTAAAGGCAAAAGCAGCAATTTTTCTTCATTTTTGCTTGCCTTGGTTTTTGTCAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCAACGGCGATTAATGACTAGCTA	...((((((((.(((((((.((((((((.(((((((((.(((((((....((((((..(((((.(((........))).))))))))))).....))))..))).))))))))).)))))))).))))))).)))))))).....	1319470	1319574	GCAGCGTCCTCAAGATTCACATGCAGTCTAAAGGCAAAAGCAGCAATTTTTCTTCATTTTTGCTTGCCTTGGTTTTTGTCAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCAA	((((((((.(((((((((.(((((((....((((((..(((((.(((........))).))))))))))).....))))..))).))))))))).))))))))..	Ccl-miR172a	1319554	1319574	AGAATCTTGATGATGCTGCAA	Ccl-miR172a*	1319470	1319490	GCAGCGTCCTCAAGATTCACA		3
Ccl-MIR172b	PmiREN004416	MIR172	Citrus clementina	Ccl-scaffold_4	6541990	6542158	-	ACAGTCATCGTTTGCAGATGCAGCATCATCAAGATTCACATGTATATATATATATATATATATATATATAGATATAGATATATGCTAATGGTGGAAAGATGTTTATCTTTTTGCTTTATTGCCTTCATGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCGATAAATGACTAATC	..((((((...((((.(((((((((((((((((((((.((((((((((((((((....)))))))))))).............((....(((((((((((....))))))))))).....))...)))).))))))))))))))))))))).))))...))))))....	6542010	6542138	CAGCATCATCAAGATTCACATGTATATATATATATATATATATATATATAGATATAGATATATGCTAATGGTGGAAAGATGTTTATCTTTTTGCTTTATTGCCTTCATGAGAATCTTGATGATGCTGCA	(((((((((((((((((.((((((((((((((((....)))))))))))).............((....(((((((((((....))))))))))).....))...)))).)))))))))))))))))..	Ccl-miR172b	6542010	6542029	AGAATCTTGATGATGCTGCA	Ccl-miR172b*	6542118	6542138	CAGCATCATCAAGATTCACAT		3
Ccl-MIR172c	PmiREN004417	MIR172	Citrus clementina	Ccl-scaffold_8	21551637	21551760	+	ACAGTCGCTGTTTGCGGGTGTAGCATCATCAAGATTCACATGCAAATACACGGCAGTGATGTGATAATCTCTTGCGAAGCACTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCAATAAGCGGCTTAAA	..(((((((..((((.(((((((((((((((((((((.(((((.........((((.(((......)))..))))...))).)).))))))))))))))))))))).))))..)))))))....	21551657	21551740	TAGCATCATCAAGATTCACATGCAAATACACGGCAGTGATGTGATAATCTCTTGCGAAGCACTGAGAATCTTGATGATGCTGCA	(((((((((((((((((.(((((.........((((.(((......)))..))))...))).)).)))))))))))))))))..	Ccl-miR172c	21551721	21551740	AGAATCTTGATGATGCTGCA	Ccl-miR172c*	21551657	21551677	TAGCATCATCAAGATTCACAT		3
Ccl-MIR319a	PmiREN004422	MIR319	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	1238952	1239158	+	GTTGATTTTGATTAAGCTGGGAGCTTTCTTCGGTCCACTTATGGGTGGCAATAGGATTTAATTAGCTGCTGACTCATTCATCCAAATACTGAGTAAAGGGTCGAAATGGATACCCAGTAAATGAGTGAATGATGCGGGAGACAAATTGAATCTTAAGCTTCCTGTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCATTGCTCGCTAATCTTATCC	..............(((((((((((((((((((((((..((((((.(((..((((((((((((.(((.(((..((((((((.((..(((((.((.....(((......))))).)))))..)).))))))))..))).)).).)))))))))))).))).))))))..))))))))))))))))))))..)))..............	1238972	1239138	GAGCTTTCTTCGGTCCACTTATGGGTGGCAATAGGATTTAATTAGCTGCTGACTCATTCATCCAAATACTGAGTAAAGGGTCGAAATGGATACCCAGTAAATGAGTGAATGATGCGGGAGACAAATTGAATCTTAAGCTTCCTGTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCC	(((((((((((((((((..((((((.(((..((((((((((((.(((.(((..((((((((.((..(((((.((.....(((......))))).)))))..)).))))))))..))).)).).)))))))))))).))).))))))..)))))))))))))))))..	Ccl-miR319a	1239119	1239138	TTGGACTGAAGGGAGCTCCC	Ccl-miR319a*	1238972	1238992	GAGCTTTCTTCGGTCCACTTA		3
Ccl-MIR319b	PmiREN004423	MIR319	Citrus clementina	Ccl-scaffold_4	2444837	2445048	+	GATGAAGAAATGGTGTGAGGGAGCTTCCTTCAGCCCACTCATGGATGGGAAAAAGGGGACGAACTAGCTGCCGACTCATTCATTCAAGCACTCAGTAGACGTGCTTTTTTTGTCGCTACTGTGATTGTGTGAATGATGCGGGAGATAATTTCCCTCCTCTCTTTTTCTGTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCTTCGTTCTATTCCTTTCATTC	((..(((.(((((..((((((((((((((((((.(((..((((((.((((...(((((..(((.((.((.(((..((((((((.(((.(((..(((((.((.((.......)))))))))))).))).))))))))..))).)).)).)))..))))).))))..))))))..))).))))))))))))))))))..))))).)))))....	2444857	2445028	GAGCTTCCTTCAGCCCACTCATGGATGGGAAAAAGGGGACGAACTAGCTGCCGACTCATTCATTCAAGCACTCAGTAGACGTGCTTTTTTTGTCGCTACTGTGATTGTGTGAATGATGCGGGAGATAATTTCCCTCCTCTCTTTTTCTGTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCT	(((((((((((((.(((..((((((.((((...(((((..(((.((.((.(((..((((((((.(((.(((..(((((.((.((.......)))))))))))).))).))))))))..))).)).)).)))..))))).))))..))))))..))).)))))))))))))..	Ccl-miR319b	2445008	2445028	CTTGGACTGAAGGGAGCTCCT	Ccl-miR319b*	2444857	2444877	GAGCTTCCTTCAGCCCACTCA		3
Ccl-MIR319c	PmiREN004424	MIR319	Citrus clementina	Ccl-scaffold_5	14995158	14995370	+	CTTAAATAAATAATTTAAGAGAGCTTTCTTCAGTCCACTCATGGATGAGGCAAGGGTTTGGATTAGCTGCCGACTCATTCATTCAAACACAGTAGAAAGAGGAGCATTTTGGTTATCCTATTGTGAATGTGTGAATGAAGCGGGAGATAATATTCATCCTTTCTTTTCTGTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCTTTTTGTTATCTGTTTACGGT	((((((((.(((((..(((.(((((((((((((((((..((((((.((((.((((((....((((.((.(((..((((((((.((..((((((((...((.((.((...)).)).))))))))))..)).))))))))..))).)).))))....)))))))))).))))))..))))))))))))))))))))...))))).)))))).)).	14995178	14995350	GAGCTTTCTTCAGTCCACTCATGGATGAGGCAAGGGTTTGGATTAGCTGCCGACTCATTCATTCAAACACAGTAGAAAGAGGAGCATTTTGGTTATCCTATTGTGAATGTGTGAATGAAGCGGGAGATAATATTCATCCTTTCTTTTCTGTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCT	(((((((((((((((((..((((((.((((.((((((....((((.((.(((..((((((((.((..((((((((...((.((.((...)).)).))))))))))..)).))))))))..))).)).))))....)))))))))).))))))..)))))))))))))))))..	Ccl-miR319c	14995330	14995350	CTTGGACTGAAGGGAGCTCCT	Ccl-miR319c*	14995178	14995198	GAGCTTTCTTCAGTCCACTCA		3
Ccl-MIR319d	PmiREN004425	MIR319	Citrus clementina	Ccl-scaffold_1	4702931	4703042	-	TGCGAAAATGGTAGAAATAGGGGTTCCTTGCGGCCCAAAACAGTTGGCTAACTCTGCTCTTCTCTCTATGTTTTGGACTGAAGGGAGCTCCTAATTCTTCTCTTTTCCTTCC	...(((((.((.((((.((((((((((((.(((.((((((((...(((.......)))..........)))))))).))).)))))))))))).)))).)).))))).....	4702951	4703022	GGGTTCCTTGCGGCCCAAAACAGTTGGCTAACTCTGCTCTTCTCTCTATGTTTTGGACTGAAGGGAGCTCCT	(((((((((.(((.((((((((...(((.......)))..........)))))))).))).)))))))))..	Ccl-miR319d	4702951	4702971	TTTGGACTGAAGGGAGCTCCT	Ccl-miR319d*	4703002	4703022	GGGTTCCTTGCGGCCCAAAAC		3
Ccl-MIR319e	PmiREN004426	MIR319	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	9860383	9860598	+	CAATGAATGAATACAATTAGGAGCTCCTTTCAGGCCAATACCGAGGGCTGAGTTGCGGCAAGAGCTGCCATCTCATGCACGGGGTTACGCTTAATACTTTGGCAACGTAACAGGTGTTAAGTTTAGCCGAGTGCATGGTGTGGGAGCAACTCCTTCCGCTTTGCTTTGTCCACCAATTGGACTGAAGGGAGCTCCTGCTTAACTGAAAGCATTTTG	..................(((((((((((((((.(((((.....((((.((((.((((.(((.(((.((((.((((((((..(((((.(((((((((((.(.........)))))))))))).)))))..)))))))).)))).))).....)))))))...)))).))))....))))).)))))))))))))))((((......))))......	9860403	9860578	GAGCTCCTTTCAGGCCAATACCGAGGGCTGAGTTGCGGCAAGAGCTGCCATCTCATGCACGGGGTTACGCTTAATACTTTGGCAACGTAACAGGTGTTAAGTTTAGCCGAGTGCATGGTGTGGGAGCAACTCCTTCCGCTTTGCTTTGTCCACCAATTGGACTGAAGGGAGCTCCT	(((((((((((((.(((((.....((((.((((.((((.(((.(((.((((.((((((((..(((((.(((((((((((.(.........)))))))))))).)))))..)))))))).)))).))).....)))))))...)))).))))....))))).)))))))))))))..	Ccl-miR319e	9860559	9860578	TTGGACTGAAGGGAGCTCCT	Ccl-miR319e*	9860403	9860423	GAGCTCCTTTCAGGCCAATAC		3
Ccl-MIR390a	PmiREN004429	MIR390	Citrus clementina	Ccl-scaffold_6	16983867	16984005	+	AAAGTAAAGAAGAATCTGTTAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGGTGCCATGAATATGGGAATGATCTAGGGTTTCATGATAAATAATGGGCACTGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCATGGCTTCTTCTTACTCTCTC	......((((((((.((((.((((((((((.(((((((((((...(((((............((((.........))))...........)))))))))))))))).)))))))))).)))).))))))))........	16983887	16983985	AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGGTGCCATGAATATGGGAATGATCTAGGGTTTCATGATAAATAATGGGCACTGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCA	((((((((((.(((((((((((...(((((............((((.........))))...........)))))))))))))))).))))))))))..	Ccl-miR390a	16983887	16983907	AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC	Ccl-miR390a*	16983965	16983985	CGCTATCCATCCTGAGTTTCA		3
Ccl-MIR390b	PmiREN004430	MIR390	Citrus clementina	Ccl-scaffold_8	24878581	24878723	+	TCAAGTATGGAGAATCTGTAAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGATAATATTCTTTTTTAATTAATTAATTAATTAATTCCTTGATCAATTAGCGGCGCTGGCGCTATCTATCCTGAGTTTTCCGGATTCTTCTTGCTAGTTT	........((((((((((.(((((((((((.(((((((((((((.....(((..((...((((((((....))))))))....))..)))......)).))))))))))).))))))))))).))))))))))..........	24878601	24878703	AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGATAATATTCTTTTTTAATTAATTAATTAATTAATTCCTTGATCAATTAGCGGCGCTGGCGCTATCTATCCTGAGTTTTC	((((((((((.(((((((((((((.....(((..((...((((((((....))))))))....))..)))......)).))))))))))).))))))))))..	Ccl-miR390b	24878601	24878621	AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC	Ccl-miR390b*	24878683	24878703	CGCTATCTATCCTGAGTTTTC		3
Ccl-MIR391	PmiREN004431	MIR391	Citrus clementina	Ccl-scaffold_8	22284625	22284743	-	CAACATCAATATGTTTGCCATGCAGGTGAGATGATACCGTCACCGCTGCTCTCTTGTTTCCGACAGGGGCTTGGCTGCCGGAATCATTTCTCCCGCGTGAGAAACCTTTTGCTGTGTTT	..(((.(((...((((..(((((.((.((((((((.(((.(((((..(((((..((((...))))))))).))).)).))).)))))))).)).)))))..))))...))).)))....	22284645	22284723	TGCAGGTGAGATGATACCGTCACCGCTGCTCTCTTGTTTCCGACAGGGGCTTGGCTGCCGGAATCATTTCTCCCGCGTG	(((.((.((((((((.(((.(((((..(((((..((((...))))))))).))).)).))).)))))))).)).)))..	Ccl-miR391	22284645	22284666	CCGGAATCATTTCTCCCGCGTG	Ccl-miR391*	22284703	22284723	TGCAGGTGAGATGATACCGTC		3
Ccl-MIR393a	PmiREN004432	MIR393	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	8325001	8325123	+	TTCTGCAACTAGAGGATAAATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAAGCCTTAATTATAATTCTCATACTTAATATTCATTAGGACGATGCTATCCCTCTGGATTCCTCCTTCGGTAGCTCATAT	....((.(((.(((((..((((((.((((((.((((((.((((((......((((.............)))).....)))))))))))).)))))).))))))..))))).))).))......	8325021	8325103	TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAAGCCTTAATTATAATTCTCATACTTAATATTCATTAGGACGATGCTATCCCTCTGGATT	((((.((((((.((((((.((((((......((((.............)))).....)))))))))))).)))))).))))..	Ccl-miR393a	8325021	8325042	TCCAAAGGGATCGCATTGATCC	Ccl-miR393a*	8325083	8325103	ACGATGCTATCCCTCTGGATT		3
Ccl-MIR393b	PmiREN004433	MIR393	Citrus clementina	Ccl-scaffold_4	274435	274557	-	TTCTGCAACTAGAGGATAAATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAAGCCTTAATTATAATTCTCATACTTAATGTTCATGAGGATCATGCTATCCCTTTGGATTCCTCCTTCGGTAGCTCATAT	...........(((((...((((((((((((.((((.((((((..((.((((.(((.......))).)))).)).....)))))))))).)))))))))))))))))................	274455	274537	TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAAGCCTTAATTATAATTCTCATACTTAATGTTCATGAGGATCATGCTATCCCTTTGGATT	(((((((((((.((((.((((((..((.((((.(((.......))).)))).)).....)))))))))).)))))))))))..	Ccl-miR393b	274516	274537	TCCAAAGGGATCGCATTGATCC	Ccl-miR393b*	274455	274475	ATCATGCTATCCCTTTGGATT		3
Ccl-MIR393c	PmiREN004434	MIR393	Citrus clementina	Ccl-scaffold_9	29029129	29029282	-	TGATTAGTGCAGGTGGAGAGTTCCAAAGGGATCGCATTGATCTGATGATAACATTAAATTAATCACTCAAACGGGTTGATTTTATTATATATATGATTTCTTTCATTTTTAGATCATGCGATCCCTTCGGAATTCCCCATCTATGGCTCTAAAT	...((((.((((((((.(((((((.((((((((((((.(((((((((((((.....((((((((.(......))))))))))))))))....((((......))))...)))))))))))))))))).))))))).))))))...)).))))..	29029149	29029262	TTCCAAAGGGATCGCATTGATCTGATGATAACATTAAATTAATCACTCAAACGGGTTGATTTTATTATATATATGATTTCTTTCATTTTTAGATCATGCGATCCCTTCGGAATT	((((.((((((((((((.(((((((((((((.....((((((((.(......))))))))))))))))....((((......))))...)))))))))))))))))).))))..	Ccl-miR393c	29029241	29029262	TTCCAAAGGGATCGCATTGATC	Ccl-miR393c*	29029149	29029169	TCATGCGATCCCTTCGGAATT		3
Ccl-MIR394a	PmiREN004435	MIR394	Citrus clementina	Ccl-scaffold_5	42405327	42405477	+	AGTGCTTCTTACAGAGTTTATTGGCATTCTGTCCACCTCCGTTCCCCATCGATTGAATCTGAAAGCCTTTTTCTTTTCTTGTTTTTGTGCTTCTCTCTTTCATGCTCATGGAGGTGGGCATACTGCCAACTGAGCTCTGTTGGCTTCTCTT	((.(...((.((((((((((((((((...(((((((((((((....(((.((..((....(((((((...................).)))).))))..)))))...)))))))))))))...)))))).)))))))))).))...).)).	42405347	42405457	TTGGCATTCTGTCCACCTCCGTTCCCCATCGATTGAATCTGAAAGCCTTTTTCTTTTCTTGTTTTTGTGCTTCTCTCTTTCATGCTCATGGAGGTGGGCATACTGCCAACT	((((((...(((((((((((((....(((.((..((....(((((((...................).)))).))))..)))))...)))))))))))))...))))))..	Ccl-miR394a	42405347	42405366	TTGGCATTCTGTCCACCTCC	Ccl-miR394a*	42405437	42405457	GAGGTGGGCATACTGCCAACT		3
Ccl-MIR394b	PmiREN004436	MIR394	Citrus clementina	Ccl-scaffold_5	11402287	11402409	+	GGCCTTGTTGCAGAGTCATTTTGGCATTCTGTCCACCTCCGTTAATTCTTTTCTTTTTTGCCCACTTGAAATCTTAGATTTGGAGGTGGCTAGCATGCCTAACAGGCTCTGTGAATTTCTCTC	.......((((((((((.....(((((.(((.(((((((((........((((..............)))).........))))))))).))).))))).....)))))))))).........	11402307	11402389	TTGGCATTCTGTCCACCTCCGTTAATTCTTTTCTTTTTTGCCCACTTGAAATCTTAGATTTGGAGGTGGCTAGCATGCCTAAC	..(((((.(((.(((((((((........((((..............)))).........))))))))).))).)))))....	Ccl-miR394b	11402307	11402326	TTGGCATTCTGTCCACCTCC	Ccl-miR394b*	11402369	11402389	GAGGTGGCTAGCATGCCTAAC		3
Ccl-MIR395a	PmiREN004437	MIR395	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	38273173	38273281	+	GAGTCAGTTGGTTCCTGGAGTTCCTCCGAGCACTTCATTGGGGTCATTCAGAGAAAAGTCGTCACCCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTGGTTGCCACCTGACATTA	..(((((.((((..(((((((((((((((((((((((.((((((......((......))...)))))).)))))))))))))))))))))))..)))).)))))....	38273193	38273261	TTCCTCCGAGCACTTCATTGGGGTCATTCAGAGAAAAGTCGTCACCCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACT	(((((((((((((((((.((((((......((......))...)))))).)))))))))))))))))..	Ccl-miR395a	38273242	38273261	CTGAAGTGTTTGGGGGAACT	Ccl-miR395a*	38273193	38273213	TTCCTCCGAGCACTTCATTGG		3
Ccl-MIR395b	PmiREN004438	MIR395	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	38297915	38298033	+	TCAGTCAGTTGTCTCCGGGAGTTCCTCCGATCACTTCATTGGGGCTATATGATCATTTAGAGAAAATTTGTCACCCCACTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTGGGTGCCACCTGACATCAC	...(((((.((.(.((.(((((((((((((.(((((((.(((((.....((((.((((.....))))..))))))))).))))))).))))))))))))).)).).)).))))).....	38297935	38298013	GTTCCTCCGATCACTTCATTGGGGCTATATGATCATTTAGAGAAAATTTGTCACCCCACTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	((((((((((.(((((((.(((((.....((((.((((.....))))..))))))))).))))))).))))))))))..	Ccl-miR395b	38297993	38298013	CTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Ccl-miR395b*	38297935	38297955	GTTCCTCCGATCACTTCATTG		3
Ccl-MIR395c	PmiREN004439	MIR395	Citrus clementina	Ccl-scaffold_4	23647677	23647777	+	TGCATCAGGTGTCCCCTAGAGTTCCCCTGAACACTTCATTGGGGACTCCTTTTAACCCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTCCTGGAGTCATTTGATATTAC	...((((((((.(.((..((((((((((((((((((((.(((((...........))))).))))))))))))))))))))..)).).)))))))).....	23647697	23647757	GTTCCCCTGAACACTTCATTGGGGACTCCTTTTAACCCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	((((((((((((((((((.(((((...........))))).))))))))))))))))))..	Ccl-miR395c	23647737	23647757	CTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Ccl-miR395c*	23647697	23647716	GTTCCCCTGAACACTTCATT		3
Ccl-MIR395d	PmiREN004440	MIR395	Citrus clementina	Ccl-scaffold_4	23644939	23645062	-	ATCGTCATCTGTCCCCTGGAGTTCCCCTAACCACTTCACTAATCACTAGAGTGGGGATCTTTGCTACCGGGCCTCTACATATATTGAAGTGTTTGGAGGAACTCTGGGTGCCACTTGACAATTA	((.((((..((.(.(((((((((((.((((.(((((((........((((((.((...........)).)..))))).......))))))).)))).))))))))))).).))..)))).))..	23644959	23645042	GTTCCCCTAACCACTTCACTAATCACTAGAGTGGGGATCTTTGCTACCGGGCCTCTACATATATTGAAGTGTTTGGAGGAACTC	(((((.((((.(((((((........((((((.((...........)).)..))))).......))))))).)))).)))))..	Ccl-miR395d	23644959	23644979	TTGAAGTGTTTGGAGGAACTC	Ccl-miR395d*	23645022	23645042	GTTCCCCTAACCACTTCACTA		3
Ccl-MIR396a	PmiREN004446	MIR396	Citrus clementina	Ccl-scaffold_1	25779179	25779330	+	ATTAAGTCCTGGTCATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCCACTGTTTGCTGATTAATACACGGCTCTTGCTAGCTAGGCGCCGTATGTAGACACCGCGCGCCATGGGAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAGAACATGGCACACCTTCAGGAT	.....((((((((((((.(((((((((((((((((((.((((((..((.(((((.((.(((.(((((.((((.....)))).))))).))).))))..))).))..)))))).))))))))))))))))))).)))))).......))))))	25779199	25779310	TTCCACAGCTTTCTTGAACTTCCACTGTTTGCTGATTAATACACGGCTCTTGCTAGCTAGGCGCCGTATGTAGACACCGCGCGCCATGGGAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAGA	(((((((((((((((((.((((((..((.(((((.((.(((.(((((.((((.....)))).))))).))).))))..))).))..)))))).)))))))))))))))))..	Ccl-miR396a	25779199	25779219	TTCCACAGCTTTCTTGAACTT	Ccl-miR396a*	25779290	25779310	GCTCAAGAAAGCTGTGGGAGA		3
Ccl-MIR396b	PmiREN004447	MIR396	Citrus clementina	Ccl-scaffold_4	18510621	18510770	-	TAAAGGTCTTTTGCATGCTTTTCCACGGCTTTCTTGAACTTAATTAGTACGGTTAATTTTTTTGTGCTATTAACAAGCAATTAATATGCAAATCTTTAATCAGTGCAAAGCTCAAGAATGCCGTGGGAAAACATGAAAGGTTTTTGTCGT	((((((.(((((.((((.(((((((((((.(((((((.(((.....((((((((((....((((((.((((((.......))))))))))))...)))))).)))).))).))))))).))))))))))).)))))))))))))))....	18510641	18510750	TTCCACGGCTTTCTTGAACTTAATTAGTACGGTTAATTTTTTTGTGCTATTAACAAGCAATTAATATGCAAATCTTTAATCAGTGCAAAGCTCAAGAATGCCGTGGGAAA	(((((((((.(((((((.(((.....((((((((((....((((((.((((((.......))))))))))))...)))))).)))).))).))))))).)))))))))..	Ccl-miR396b	18510730	18510750	TTCCACGGCTTTCTTGAACTT	Ccl-miR396b*	18510641	18510661	GCTCAAGAATGCCGTGGGAAA		3
Ccl-MIR396c	PmiREN004448	MIR396	Citrus clementina	Ccl-scaffold_1	25784781	25784908	-	TTATGATCCTCTTTGTATTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCATCTTTGCATGAGGCCACAGACTTGGCATGGCATTTGTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAAACAGGTTCAATAAA	...(((.(((.(((((((((((((((((((((.((((((((((.((....(((.....((((......))))...)))..)).)))))))))).))))))))))))))))))))).))).))).....	25784801	25784888	TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCATCTTTGCATGAGGCCACAGACTTGGCATGGCATTTGTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAG	((((((((((((.((((((((((.((....(((.....((((......))))...)))..)).)))))))))).))))))))))))..	Ccl-miR396c	25784868	25784888	TTCCACAGCTTTCTTGAACTG	Ccl-miR396c*	25784801	25784821	GTTCAATAAAGCTGTGGGAAG		3
Ccl-MIR396d	PmiREN004449	MIR396	Citrus clementina	Ccl-scaffold_1	1677646	1677774	+	CGAAGGTCCTCTTTGTGATCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGTCTTGAATTTTCCGATCGATACCGGTGCATGATTAATTCCCAACACAATTCAAGAAAGCTGTGGAAAACTACTAAGAGGATTTGGTCA	...((((((((((.(((...((((((((((((((((((.(((...(((((.((..((((....))))....))..))))).....))).))))))))))))))))))...))).)))))))))).....	1677666	1677754	TTCCACAGCTTTCTTGAACTGTCTTGAATTTTCCGATCGATACCGGTGCATGATTAATTCCCAACACAATTCAAGAAAGCTGTGGAAAA	((((((((((((((((((.(((...(((((.((..((((....))))....))..))))).....))).))))))))))))))))))..	Ccl-miR396d	1677666	1677686	TTCCACAGCTTTCTTGAACTG	Ccl-miR396d*	1677734	1677754	ATTCAAGAAAGCTGTGGAAAA		3
Ccl-MIR396e	PmiREN004450	MIR396	Citrus clementina	Ccl-scaffold_7	379011	379148	-	AAATGGATCAGCTCTTATTTTTCCACGGCTTTCTTGAACGTAAAAGTGCTTCCGCCGGTTTGCATATATAATTAAGCTGTTCAAGCACCATTAATTACGTTCAAGAAGCTGTGGAAAAATACGCGTTGATTCAGTGCA	....((((((((.(.((((((((((((((((.(((((((((((..((((((....(((((((..........)))))))...))))))......))))))))))))))))))))))))))).).))))))))......	379031	379128	TTCCACGGCTTTCTTGAACGTAAAAGTGCTTCCGCCGGTTTGCATATATAATTAAGCTGTTCAAGCACCATTAATTACGTTCAAGAAGCTGTGGAAAA	(((((((((((.(((((((((((..((((((....(((((((..........)))))))...))))))......))))))))))))))))))))))..	Ccl-miR396e	379108	379128	TTCCACGGCTTTCTTGAACGT	Ccl-miR396e*	379031	379051	CGTTCAAGAAGCTGTGGAAAA		3
Ccl-MIR396f	PmiREN004451	MIR396	Citrus clementina	Ccl-scaffold_7	11659068	11659263	+	TGCAAGTTCCTGTCATGTTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTTCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTAATAATAGGCTACGATTTGATGTGGCTAGCTGCAGCTATTAGAAGTTCAAGAAATCTGTGGGAAGAAATGGCAAATAAGGACTTA	...((((((.((((((.(((((((((((.((((((((((((((..................................................................(((....)))(((((........)))))((((....))))..)))))))))))))).))))))))))).)))))).....)))))).	11659088	11659243	TTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTTCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTAATAATAGGCTACGATTTGATGTGGCTAGCTGCAGCTATTAGAAGTTCAAGAAATCTGTGGGAAG	((((((((.((((((((((((((..................................................................(((....)))(((((........)))))((((....))))..)))))))))))))).))))))))..	Ccl-miR396f	11659088	11659108	TTCCACAGCTTTCTTGAACTT	Ccl-miR396f*	11659223	11659243	GTTCAAGAAATCTGTGGGAAG		3
Ccl-MIR397	PmiREN004452	MIR397	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	32706496	32706630	+	TTCCCAGATTGAAAAAAACATCATTGAGTGCAGCGTTGATGAATATTTGTCGGTGCTTTGCCAATATTTCTCTATACTAGCCAGGATTCTTTCACCAGCGCTGCACTCGATCATGTTTTTTAGCTCTGCTGGTTC	............(((((((((.((((((((((((((((.((((.....(((...(((.....................)))...)))...)))).)))))))))))))))).)))))))))..............	32706516	32706610	TCATTGAGTGCAGCGTTGATGAATATTTGTCGGTGCTTTGCCAATATTTCTCTATACTAGCCAGGATTCTTTCACCAGCGCTGCACTCGATCATG	(.((((((((((((((((.((((.....(((...(((.....................)))...)))...)))).)))))))))))))))).)..	Ccl-miR397	32706516	32706536	TCATTGAGTGCAGCGTTGATG	Ccl-miR397*	32706590	32706610	CCAGCGCTGCACTCGATCATG		3
Ccl-MIR399a	PmiREN004453	MIR399	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	34388553	34388663	-	AAGTGTTTACATGCATTACTGGGCAATTCTCTATTGGCAGTTGGCTGCAGGGAGAAGCAACCTAGCTCACTGCCAAAGGAGATTTGCCCGGCAATTCATCTGTGCAATCAT	.(((((......))))).((((((((.(((((.((((((((.((((..(((.........))))))).)))))))).))))).))))))))....................	34388573	34388643	GGGCAATTCTCTATTGGCAGTTGGCTGCAGGGAGAAGCAACCTAGCTCACTGCCAAAGGAGATTTGCCCGG	((((((.(((((.((((((((.((((..(((.........))))))).)))))))).))))).))))))..	Ccl-miR399a	34388573	34388593	TGCCAAAGGAGATTTGCCCGG	Ccl-miR399a*	34388623	34388643	GGGCAATTCTCTATTGGCAGT		3
Ccl-MIR399b	PmiREN004454	MIR399	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	34395805	34395954	+	GCGGGTAGAGGAGAATTCCAGGGCAATTCTCCTTTGGCAGAAAATATTGCGCTTGTACGTACACGCACGGTGTAGTACTTGCACAGGCGCTATAATATATAATATTTGCCGCCAAAGGAGAATTGCCCTGCCATTCAACTACTACCATAT	...(((((((..((((..((((((((((((((((((((.(.(((((((((((((((..((((((((...)))).))))....))))))))..........))))))).).))))))))))))))))))))..))))..)).)))))....	34395825	34395934	GGGCAATTCTCCTTTGGCAGAAAATATTGCGCTTGTACGTACACGCACGGTGTAGTACTTGCACAGGCGCTATAATATATAATATTTGCCGCCAAAGGAGAATTGCCCTG	((((((((((((((((((.(.(((((((((((((((..((((((((...)))).))))....))))))))..........))))))).).))))))))))))))))))..	Ccl-miR399b	34395914	34395934	CGCCAAAGGAGAATTGCCCTG	Ccl-miR399b*	34395825	34395845	GGGCAATTCTCCTTTGGCAGA		3
Ccl-MIR399c	PmiREN004455	MIR399	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	6735368	6735528	-	CAGTAAGCGATTTAGTTGTAGGGCTTCTCTCCTTTGGCAGGTGATGGCCAAGGGCAAAGATCATATAATATATATTTATATGGTGCCTATTCTAATTATTGTTCTATTTTTTCAATGACCTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTATAACTGCTTCAGCTTTTAAA	....((((((..((((((((((((..((((((((((((((((.........(((((....((((((((.......)))))))))))))........(((((...........)))))))))))))))))))))..))))))))))))..)).)))).....	6735388	6735508	GGGCTTCTCTCCTTTGGCAGGTGATGGCCAAGGGCAAAGATCATATAATATATATTTATATGGTGCCTATTCTAATTATTGTTCTATTTTTTCAATGACCTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTA	((((..((((((((((((((((.........(((((....((((((((.......)))))))))))))........(((((...........)))))))))))))))))))))..))))..	Ccl-miR399c	6735388	6735408	TGCCAAAGGAGAGTTGCCCTA	Ccl-miR399c*	6735488	6735508	GGGCTTCTCTCCTTTGGCAGG		3
Ccl-MIR399d	PmiREN004456	MIR399	Citrus clementina	Ccl-scaffold_9	27832325	27832472	+	TCATAAGCAAAGCAGTTTTAGGGCACCTCTTACTTGGCATGCAATGGTGATTTATTGGTGCAATAATCAGCATTATATTGGTTAATTCTATACCAATCCCACTGATATGCCAAAGGAGAGTTGCCCTGTGACTGCTTCAGCTTAATAT	...(((((.((((((((.(((((((.(((((..((((((((((.(((.(((....((((((........))))))...((((.........)))))))))).)).))))))))..))))).))))))).))))))))..)))))....	27832345	27832452	GGGCACCTCTTACTTGGCATGCAATGGTGATTTATTGGTGCAATAATCAGCATTATATTGGTTAATTCTATACCAATCCCACTGATATGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG	(((((.(((((..((((((((((.(((.(((....((((((........))))))...((((.........)))))))))).)).))))))))..))))).)))))..	Ccl-miR399d	27832432	27832452	TGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG	Ccl-miR399d*	27832345	27832365	GGGCACCTCTTACTTGGCATG		3
Ccl-MIR403a	PmiREN004457	MIR403	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	46661837	46661983	-	TCAAGGAGAGGCATGTTTCGGGTTTGTGCGTGAATTTAATAAAATAACCGCTTCTTTTAATCTCGTTCCCCCATTTTTTGTTAGTAACAAATTTTTGCCGTCAGTGTTAGATTCACGCACAAACTCGTGATGTGTCTTTTCTTTTAC	..(((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((.....((.((.........................((((((...)))))).....)).))...))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))....	46661857	46661963	GGTTTGTGCGTGAATTTAATAAAATAACCGCTTCTTTTAATCTCGTTCCCCCATTTTTTGTTAGTAACAAATTTTTGCCGTCAGTGTTAGATTCACGCACAAACTCG	(((((((((((((((((((((.....((.((.........................((((((...)))))).....)).))...)))))))))))))))))))))..	Ccl-miR403a	46661857	46661877	TTAGATTCACGCACAAACTCG	Ccl-miR403a*	46661943	46661963	GGTTTGTGCGTGAATTTAATA		3
Ccl-MIR403b	PmiREN004458	MIR403	Citrus clementina	Ccl-scaffold_9	741530	741651	+	GGGGGGGGGGGCACATCTCAAGTTTGTGCGTGAATCTAACCCCATCACAGCCGTCCGCTTTCCCGCTCTCATCCGATGGTGTTAGATTCACGCACAAACTCGCGATCTGTCCATCGATATAC	........(((((.(((.(.((((((((((((((((((((.(((((..........((......))........))))).)))))))))))))))))))).).))).)))))..........	741550	741631	AGTTTGTGCGTGAATCTAACCCCATCACAGCCGTCCGCTTTCCCGCTCTCATCCGATGGTGTTAGATTCACGCACAAACTCG	((((((((((((((((((((.(((((..........((......))........))))).))))))))))))))))))))..	Ccl-miR403b	741611	741631	TTAGATTCACGCACAAACTCG	Ccl-miR403b*	741550	741570	AGTTTGTGCGTGAATCTAACC		3
Ccl-MIR477a	PmiREN004459	MIR477	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	9802814	9802966	+	ATTAAGCAGTATCGTCGTTCACTCTCCCTCAAGGGCTTCTCTTCAATCCATATATTGAACTCTCTCTATATACATATGCTCAAATAATAATCAATGAGAGGAGGATTGACGCCGTAGCCCTCAGGTAGAGTGATCGACTCCTGTTTTATTTAA	((.((((((....((((.(((((((.(((..((((((...(.(((((((..........(((((..........(((......))).........)))))..))))))).)....)))))).))).))))))).))))..)))))).))....	9802834	9802946	ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTCTTCAATCCATATATTGAACTCTCTCTATATACATATGCTCAAATAATAATCAATGAGAGGAGGATTGACGCCGTAGCCCTCAGGTAGAGTGA	(((((.(((..((((((...(.(((((((..........(((((..........(((......))).........)))))..))))))).)....)))))).))).)))))..	Ccl-miR477a	9802834	9802854	ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTC	Ccl-miR477a*	9802926	9802946	CGTAGCCCTCAGGTAGAGTGA		3
Ccl-MIR477b	PmiREN004460	MIR477	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	1033329	1033457	-	CATTAAGGCGTTGGTTGCTCACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGGCGTTAATTAATGACAATTATTAATGCTTGCAGCTGCCTGCCAGGCCTGAGGCCGTTGGGGAGAGTGGACAAAAGTTGTCTTCGTAAC	....((((((.(..(((.((((((((((.(((.((((((.(((....((((((((...)))))))).((.((((....)))).))))).)))))).))))))))))))).)))..).))))))......	1033349	1033437	ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGGCGTTAATTAATGACAATTATTAATGCTTGCAGCTGCCTGCCAGGCCTGAGGCCGTTGGGGAGAGTGG	((((((((.(((.((((((.(((....((((((((...)))))))).((.((((....)))).))))).)))))).)))))))))))..	Ccl-miR477b	1033416	1033437	ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGG	Ccl-miR477b*	1033349	1033369	TGAGGCCGTTGGGGAGAGTGG		3
Ccl-MIR477c	PmiREN004461	MIR477	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	1033117	1033234	-	ATTAATGGCACTCATTGCTCACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGAACTGGCCTTGTTCACCTTCAATTAAAGGCCTAGACTGAGGTTCTTGGGGAGAGTAGATAATGCTGGCTATTTCTTC	...((((((...(((((((.((((((((.((((((((((......((((((...............))))))......)))))))))))))))))))).)))))...)))))).....	1033137	1033214	ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGAACTGGCCTTGTTCACCTTCAATTAAAGGCCTAGACTGAGGTTCTTGGGGAGAGTAG	((((((((.((((((((((......((((((...............))))))......))))))))))))))))))..	Ccl-miR477c	1033193	1033214	ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGA	Ccl-miR477c*	1033137	1033157	TGAGGTTCTTGGGGAGAGTAG		3
Ccl-MIR477d	PmiREN004462	MIR477	Citrus clementina	Ccl-scaffold_4	14416225	14416350	+	TAAAAATGGAGAAGCTTCCAACCTCCCTCGAAGGCTTCCAATATACCATGCTTCCTCAAATTGGCCTTGTAAGCATGGGAATGTTGGAAACCCTAGGGGGAGGTCGAAAGCTTATGACTCCATTTA	....(((((((((((((.(.(((((((((...((.(((((((((.((((((((((.......))......))))))))..))))))))).))...))))))))).).))))))....)))))))..	14416245	14416330	ACCTCCCTCGAAGGCTTCCAATATACCATGCTTCCTCAAATTGGCCTTGTAAGCATGGGAATGTTGGAAACCCTAGGGGGAGGTCG	(((((((((...((.(((((((((.((((((((((.......))......))))))))..))))))))).))...)))))))))..	Ccl-miR477d	14416310	14416330	GGAAACCCTAGGGGGAGGTCG	Ccl-miR477d*	14416245	14416265	ACCTCCCTCGAAGGCTTCCAA		3
Ccl-MIR477e	PmiREN004463	MIR477	Citrus clementina	Ccl-scaffold_4	19101797	19101918	-	CCAAAGCAGTAGAGTCGTTCACTCTCCCTCAAGGGCTTCGCCCAATCCAAATCATGCTGAAGAGGTGGGTGGGTTGATGCTGAAGTCCTTGGGGTTGAGTGATCGACGCCTGTTTTTTAACT	..(((((((....((((.((((((..(((((((((((((((.(((((((..((((.((....)))))).)))))))..)).)))))))))))))..)))))).))))..)))))))......	19101817	19101898	ACTCTCCCTCAAGGGCTTCGCCCAATCCAAATCATGCTGAAGAGGTGGGTGGGTTGATGCTGAAGTCCTTGGGGTTGAGTGA	((((..(((((((((((((((.(((((((..((((.((....)))))).)))))))..)).)))))))))))))..))))..	Ccl-miR477e	19101878	19101898	ACTCTCCCTCAAGGGCTTCGC	Ccl-miR477e*	19101817	19101837	GAAGTCCTTGGGGTTGAGTGA		3
Ccl-MIR477f	PmiREN004464	MIR477	Citrus clementina	Ccl-scaffold_4	19101981	19102116	-	TACAAAAGCAATCGTCGTTCACTCTCCCTCAAGGGCTTCTCTTCGATCCATATATAACGTACATATGCTCAAATGAGTGGTGATGGATCGACGCTGAAGCCCTTAGGGCAGAGTGATCGACTCCGGCTTTCTCATT	.............((((.(((((((((((.(((((((((.(.(((((((((..........(((..((((....)))).)))))))))))).)..))))))))))))).))))))).))))...............	19102001	19102096	ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTCTTCGATCCATATATAACGTACATATGCTCAAATGAGTGGTGATGGATCGACGCTGAAGCCCTTAGGGCAGAGTGA	(((((((((.(((((((((.(.(((((((((..........(((..((((....)))).)))))))))))).)..))))))))))))).)))))..	Ccl-miR477f	19102076	19102096	ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTC	Ccl-miR477f*	19102001	19102021	GAAGCCCTTAGGGCAGAGTGA		3
Ccl-MIR482a	PmiREN004465	MIR482	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	28637496	28637638	-	GAGGCCCGTAAGACATTTTCGGTCATGGGAGGATTGGCGAGAAAATCTTTCAATTTTACCATAAAGTATATAAGATGACGATGATGATTAAATGAAATCTTTTGCCAACTCCTCCCATGCCGATGATTTCTTATGGTTTCAAT	((((((.((((((.(((.((((.(((((((((((((((((((..(((((...((((((...))))))....))))).........((((......))))))))))))).)))))))))))))).))).))))))))))))...	28637516	28637618	GGTCATGGGAGGATTGGCGAGAAAATCTTTCAATTTTACCATAAAGTATATAAGATGACGATGATGATTAAATGAAATCTTTTGCCAACTCCTCCCATGCCGA	((.(((((((((((((((((((..(((((...((((((...))))))....))))).........((((......))))))))))))).))))))))))))..	Ccl-miR482a	28637516	28637537	TTGCCAACTCCTCCCATGCCGA	Ccl-miR482a*	28637598	28637618	GGTCATGGGAGGATTGGCGAG		3
Ccl-MIR482b	PmiREN004466	MIR482	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	28632304	28632429	-	AGAAGTGAGGAAATTTCTGGAATGGGAGGCTTGGCAAGAAGCGATCTATTTTTCTTGTTCAATAAAAAAGATAAAGAAAATTTTTCTTGCCCACCCCTCCCATTCCTTGGATTTCCTGCATTTCCT	.(((((((((((((((..(((((((((((...(((((((((........(((((((..((.........))..)))))))..)))))))))....)))))))))))..))))))))).))))))..	28632324	28632409	AATGGGAGGCTTGGCAAGAAGCGATCTATTTTTCTTGTTCAATAAAAAAGATAAAGAAAATTTTTCTTGCCCACCCCTCCCATTCC	(((((((((...(((((((((........(((((((..((.........))..)))))))..)))))))))....)))))))))..	Ccl-miR482b	28632324	28632345	TCTTGCCCACCCCTCCCATTCC	Ccl-miR482b*	28632389	28632409	AATGGGAGGCTTGGCAAGAAG		3
Ccl-MIR482c	PmiREN004467	MIR482	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	28622236	28622381	-	TGAAGCGAGGAAGTTTTGGGAGTGGGAGCGTGGGGTAAGAAGTGAAGAAAACGTATAATTTTTCTTTTCTTTTTCAATTGAGAAAGAAAATTACAAATTCAATTTCTTCCCTATGCCTCCCATTCCTATGATTTCCTGCAGTTCCT	.......((((((((.(((((((((((((((((((.(((((((((((((((........)))))(((((((((((....))))))))))).......))).)))))))))))))).)))))))))))).)))))))).........	28622256	28622361	AGTGGGAGCGTGGGGTAAGAAGTGAAGAAAACGTATAATTTTTCTTTTCTTTTTCAATTGAGAAAGAAAATTACAAATTCAATTTCTTCCCTATGCCTCCCATTCC	(((((((((((((((.(((((((((((((((........)))))(((((((((((....))))))))))).......))).)))))))))))))).))))))))..	Ccl-miR482c	28622256	28622277	TCTTCCCTATGCCTCCCATTCC	Ccl-miR482c*	28622341	28622361	AGTGGGAGCGTGGGGTAAGAA		3
Ccl-MIR482d	PmiREN004468	MIR482	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	28603067	28603177	-	GGACTGGGGGAAGTCTTGGAGATGGGTGAGTTGGGAAAATAATAACTTTCTTCACGAAAGAAAGCAATTTTTTTCCCACACCTCCCATCCCTAAGATTTTCTTCAGTTCCT	(((((((((((((((((((.((((((.(.((((((((((.(((..(((((((.....)))))))..))).)))))))).))).)))))).)))))))))))))))))))..	28603087	28603157	GATGGGTGAGTTGGGAAAATAATAACTTTCTTCACGAAAGAAAGCAATTTTTTTCCCACACCTCCCATCCC	((((((.(.((((((((((.(((..(((((((.....)))))))..))).)))))))).))).))))))..	Ccl-miR482d	28603087	28603108	TTTTTCCCACACCTCCCATCCC	Ccl-miR482d*	28603137	28603157	GATGGGTGAGTTGGGAAAATA		3
Ccl-MIR482e	PmiREN004469	MIR482	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	28637302	28637419	-	GAGGATGCTGTAAAATTTTTGGAATTGGGTGCTAGGGAAGGTTTTGTTTGACTTGTCTGTCATAACTAAATTAATTTTCCCTAGTCCCCCTATTCCTATGATTTTCAGCTTCTAATCT	(((((.((((.((((((...(((((.(((.(((((((((((((..(((((((......)))).)))......))))))))))))).)))..)))))...)))))))))).)))..)).	28637322	28637399	GGAATTGGGTGCTAGGGAAGGTTTTGTTTGACTTGTCTGTCATAACTAAATTAATTTTCCCTAGTCCCCCTATTCCTA	(((((.(((.(((((((((((((..(((((((......)))).)))......))))))))))))).)))..)))))..	Ccl-miR482e	28637322	28637343	TTCCCTAGTCCCCCTATTCCTA	Ccl-miR482e*	28637379	28637399	GGAATTGGGTGCTAGGGAAGG		3
Ccl-MIR482f	PmiREN004470	MIR482	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	28618987	28619097	-	AGAAGAGGGGAAATTTCGGGAATGGGTGCATGGGCAAGAGAAGGAGAAAAAGAAAATATATACTTCCTTTCTTACCTATGCCACCCATTCCTTTGATTTCCTTCACTTCCT	.....((((((((((..(((((((((((((((((.((((((.((((.................)))))))))).)))))).)))))))))))..))))))).......)))	28619007	28619077	AATGGGTGCATGGGCAAGAGAAGGAGAAAAAGAAAATATATACTTCCTTTCTTACCTATGCCACCCATTCC	((((((((((((((.((((((.((((.................)))))))))).)))))).))))))))..	Ccl-miR482f	28619007	28619028	TCTTACCTATGCCACCCATTCC	Ccl-miR482f*	28619057	28619077	AATGGGTGCATGGGCAAGAGA		3
Ccl-MIR482g	PmiREN004471	MIR482	Citrus clementina	Ccl-scaffold_8	16726730	16726882	+	GAAGGATATTGGGAAGGTTTTGGTATGGGTGAGTAGGGAAGATAATTTAACTAAGTAATAATAATATCACTTTTTTCATTATTACTATTTACTTAAGGAATTTGTATATCTTCCCTACTCCACCCATGCCATAGGTTTCCCATTATTCCTCCC	((.(((((.(((((((.((.((((((((((((((((((((((((((((...(((((((((.(((((.............))))).)).)))))))..)))).....))))))))))))).))))))))))).)).))))))).))))).))..	16726750	16726862	TGGTATGGGTGAGTAGGGAAGATAATTTAACTAAGTAATAATAATATCACTTTTTTCATTATTACTATTTACTTAAGGAATTTGTATATCTTCCCTACTCCACCCATGCCATA	((((((((((((((((((((((((((((...(((((((((.(((((.............))))).)).)))))))..)))).....))))))))))))).)))))))))))..	Ccl-miR482g	16726841	16726862	TCCCTACTCCACCCATGCCATA	Ccl-miR482g*	16726750	16726770	TGGTATGGGTGAGTAGGGAAG		3
Ccl-MIR530	PmiREN004472	MIR530	Citrus clementina	Ccl-scaffold_8	21439566	21439711	+	ACTGAGATGTCGCATTTTTCTGCATTTGCACCTGCACCTTGCTGTGCTGTTATCTGGGTTGACGAAGATCATCATGATGATCAGCTTCAAAACTCGAAAGCATGAAGGTGCAGCTGTATATGCAGGTGAATGCCATTTTAGCCATT	.((((((((..((((((.(((((((.((((.(((((((((...(((((......((((((((.(..((((((....))))))..).)))..)))))..))))).))))))))).)))).))))))).)))))))))))))).....	21439586	21439691	TGCATTTGCACCTGCACCTTGCTGTGCTGTTATCTGGGTTGACGAAGATCATCATGATGATCAGCTTCAAAACTCGAAAGCATGAAGGTGCAGCTGTATATGCAGG	(((((.((((.(((((((((...(((((......((((((((.(..((((((....))))))..).)))..)))))..))))).))))))))).)))).)))))..	Ccl-miR530	21439586	21439606	TGCATTTGCACCTGCACCTTG	Ccl-miR530*	21439671	21439691	AGGTGCAGCTGTATATGCAGG		3
Ccl-MIR535a	PmiREN004473	MIR535	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	25552284	25552404	+	AGACTCGAGACAACTTTGTTTGACAATGAGAGAGAGCACACCCGTCAGCATTCGTGCAAATGGCAAGGCTGTCTACTAGCGTGCTCTCTACCATTGTCATACGATTTGCTTAACGCAGTTG	...............((((.((((((((..(((((((((.(..((((((.....(((.....)))..))))...))..).)))))))))..)))))))).)))).................	25552304	25552384	TGACAATGAGAGAGAGCACACCCGTCAGCATTCGTGCAAATGGCAAGGCTGTCTACTAGCGTGCTCTCTACCATTGTCATA	((((((((..(((((((((.(..((((((.....(((.....)))..))))...))..).)))))))))..))))))))..	Ccl-miR535a	25552304	25552324	TGACAATGAGAGAGAGCACAC	Ccl-miR535a*	25552364	25552384	GTGCTCTCTACCATTGTCATA		3
Ccl-MIR535b	PmiREN004474	MIR535	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	25566906	25567026	+	AGACTCAATACAAATTTGCTTGACAATGAGAGAGAGCACACCTGTCAGCATTCGTGCAAATGGCAAGGCTGTCTACTAGCGTGCTCTCTACCATTGTCATAAAATTTGCTTAAAGCAGTTG	...........((((((...((((((((..(((((((((.(..((((((.....(((.....)))..))))...))..).)))))))))..))))))))..))))))..............	25566926	25567006	TGACAATGAGAGAGAGCACACCTGTCAGCATTCGTGCAAATGGCAAGGCTGTCTACTAGCGTGCTCTCTACCATTGTCATA	((((((((..(((((((((.(..((((((.....(((.....)))..))))...))..).)))))))))..))))))))..	Ccl-miR535b	25566926	25566946	TGACAATGAGAGAGAGCACAC	Ccl-miR535b*	25566986	25567006	GTGCTCTCTACCATTGTCATA		3
Ccl-MIR535c	PmiREN004475	MIR535	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	25591088	25591208	+	AAACTCAAGACAACTTTGTTTGACAATGAGAGAGAGCACACCCGTCAGCATTCGTGCAAATGGCAAGGCTGTCTACTAGCTTGCTCTCTACCATTGTCATACGATTTGCTTAATGCAGTTG	...............((((.((((((((..(((((((....((((..(((....)))..))))..((((((.....)))))))))))))..)))))))).)))).................	25591108	25591188	TGACAATGAGAGAGAGCACACCCGTCAGCATTCGTGCAAATGGCAAGGCTGTCTACTAGCTTGCTCTCTACCATTGTCATA	((((((((..(((((((....((((..(((....)))..))))..((((((.....)))))))))))))..))))))))..	Ccl-miR535c	25591108	25591128	TGACAATGAGAGAGAGCACAC	Ccl-miR535c*	25591168	25591188	TTGCTCTCTACCATTGTCATA		3
Ccl-MIR535d	PmiREN004476	MIR535	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	25618077	25618197	+	AGACTCAATACAAATTTGCTTGACAATGAGAGAGAGCACACCTGTCAGCATTCGTGCAAATGGCAAGGCTGTCTACTAGCGTGCTCTCTACCATTGTCATAAAATTTGCTTAAAGCAGTTG	..........(((((((...((((((((..(((((((((.(..((((((.....(((.....)))..))))...))..).)))))))))..))))))))..))))))).............	25618097	25618177	TGACAATGAGAGAGAGCACACCTGTCAGCATTCGTGCAAATGGCAAGGCTGTCTACTAGCGTGCTCTCTACCATTGTCATA	((((((((..(((((((((.(..((((((.....(((.....)))..))))...))..).)))))))))..))))))))..	Ccl-miR535d	25618097	25618117	TGACAATGAGAGAGAGCACAC	Ccl-miR535d*	25618157	25618177	GTGCTCTCTACCATTGTCATA		3
Ccl-MIR1446	PmiREN004362	MIR1446	Citrus clementina	Ccl-scaffold_4	14417452	14417575	+	TTTGAGAGCTAACGTTCTCCGAACTCTCTCCCTCAACGGCTCCTCTTGGCTTTGCAAATCATTCCTTCTGATACAGAAGGCGCCGTTGAGGTAGGGCAGTTCGGAAAATATAGGCTCTTAGCTG	..((((((((...(((.((((((((((((.((((((((((.((....))..............(((((((...))))))).)))))))))).)))).)))))))).)))...))))))))....	14417472	14417555	GAACTCTCTCCCTCAACGGCTCCTCTTGGCTTTGCAAATCATTCCTTCTGATACAGAAGGCGCCGTTGAGGTAGGGCAGTTCGG	(((((((((.((((((((((.((....))..............(((((((...))))))).)))))))))).)))).)))))..	Ccl-miR1446	14417472	14417492	GAACTCTCTCCCTCAACGGCT	Ccl-miR1446*	14417535	14417555	CGTTGAGGTAGGGCAGTTCGG		3
Ccl-MIR2111	PmiREN004418	MIR2111	Citrus clementina	Ccl-scaffold_6	15052179	15052287	-	CCATATTGGTGAGGATCAGGTAATCTGCATCCTGAGGTTTGGATCAGCATGTACGTTTGTTGTATCTAGTCCTCAGGATACGGATTACCTTATCCTTACTGACAATATA	.......(((((((((.((((((((((.(((((((((.(((((((((((........))))).)))))).))))))))).)))))))))).))))))))).........	15052199	15052267	TAATCTGCATCCTGAGGTTTGGATCAGCATGTACGTTTGTTGTATCTAGTCCTCAGGATACGGATTACC	(((((((.(((((((((.(((((((((((........))))).)))))).))))))))).)))))))..	Ccl-miR2111	15052199	15052219	GTCCTCAGGATACGGATTACC	Ccl-miR2111*	15052247	15052267	TAATCTGCATCCTGAGGTTTG		3
Ccl-MIR2118	PmiREN004419	MIR2118	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	8422949	8423107	-	AATGGGTTTTAGAACCAGTGGAAATGGCTGGCTGGGACTGATCTTCATTTTAATTAACAAATAAAAATTTTTGTTAATCTTGATGGGGGTTTTTGTTTTTGTTTCTTTAGTGGGTTCGTTCCCATGCCACCCATTTCTATTGTTTCTGGAAGCATATCC	....(.((((((((.((((((((((((.(((((((((.(((.((.((((......(((((((((((((((((((((....))))))))))))))))..))))).....)))))).))).))))).)))).)))))))))))).)))))))).)......	8422969	8423087	GAAATGGCTGGCTGGGACTGATCTTCATTTTAATTAACAAATAAAAATTTTTGTTAATCTTGATGGGGGTTTTTGTTTTTGTTTCTTTAGTGGGTTCGTTCCCATGCCACCCATTTCTA	(((((((.(((((((((.(((.((.((((......(((((((((((((((((((((....))))))))))))))))..))))).....)))))).))).))))).)))).)))))))..	Ccl-miR2118	8422969	8422990	GTTCCCATGCCACCCATTTCTA	Ccl-miR2118*	8423067	8423087	GAAATGGCTGGCTGGGACTGA		3
Ccl-MIR2275a	PmiREN004420	MIR2275	Citrus clementina	Ccl-scaffold_6	24755613	24755725	+	GCATTTCTAAGTTGTATGTAAGAATTGGATGGAACTAAACAGATTAGTAAGATCAAAATATTCAGTTGCTGTTTAGTTTCCTCCAATATCTTATCTCCAGCTTCTAAACTATA	........((((((...((((((((((((.((((((((((((..........................)))))))))))).)))))).))))))...))))))..........	24755633	24755705	AGAATTGGATGGAACTAAACAGATTAGTAAGATCAAAATATTCAGTTGCTGTTTAGTTTCCTCCAATATCTTA	(((((((((.((((((((((((..........................)))))))))))).)))))).)))..	Ccl-miR2275a	24755633	24755653	AGAATTGGATGGAACTAAACA	Ccl-miR2275a*	24755685	24755705	TTAGTTTCCTCCAATATCTTA		3
Ccl-MIR2275b	PmiREN004421	MIR2275	Citrus clementina	Ccl-scaffold_9	14731644	14731767	-	TTCTTTATCAGTTGTATGTAAGAATTGGATGGAACTAAACAGATTAACTAGTAAATAGTAAGATCGAAATATTCTTTTTCTGTTTAGTTTCCTCCAATATTTTATCTCCAACTTCTAAACTATA	..............(((((((((((((((.(((((((((((((...((((.....))))((((.........))))..))))))))))))).)))))).))))))................)))	14731664	14731747	AGAATTGGATGGAACTAAACAGATTAACTAGTAAATAGTAAGATCGAAATATTCTTTTTCTGTTTAGTTTCCTCCAATATTTTA	(((((((((.(((((((((((((...((((.....))))((((.........))))..))))))))))))).)))))).)))..	Ccl-miR2275b	14731727	14731747	AGAATTGGATGGAACTAAACA	Ccl-miR2275b*	14731664	14731684	TTAGTTTCCTCCAATATTTTA		3
Ccl-MIR3627a	PmiREN004427	MIR3627	Citrus clementina	Ccl-scaffold_6	24427072	24427188	+	TAAAAGAAGTTCAGGGACTCTTGTCGCAGGAGCGGTGGCACCTGCACCGGCCGCCGTGTGTATGTGGTGTCGCAAGTGCCAGCATCCTGTGACAAGAAGCCCTAAAACTTCTTCGCT	...((((((((.((((..(((((((((((((..(.((((((.(((....(((((.........)))))...))).)))))).).)))))))))))))..))))..))))))))....	24427092	24427168	TTGTCGCAGGAGCGGTGGCACCTGCACCGGCCGCCGTGTGTATGTGGTGTCGCAAGTGCCAGCATCCTGTGACAAGA	(((((((((((..(.((((((.(((....(((((.........)))))...))).)))))).).)))))))))))..	Ccl-miR3627a	24427092	24427113	TTGTCGCAGGAGCGGTGGCACC	Ccl-miR3627a*	24427148	24427168	TGCCAGCATCCTGTGACAAGA		3
Ccl-MIR3627b	PmiREN004428	MIR3627	Citrus clementina	Ccl-scaffold_6	24423175	24423307	-	GAGAGGGGCTACAGGGATTCTTGTCGCCGGAGAGATAGCACCTACTGCCTCTTAATTGCATTAACTAAGTTGTGCATAAATAACGCCGTAAGCGCCATCTCCCGGTGACAAGACTCCCTCCATCCTCTATATA	...(((((....(((((.((((((((((((.(((((.((.(.(((.((........(((((.(((...))))))))........)).))).).)).))))))))))))))))).)))))....))))).....	24423195	24423287	TTGTCGCCGGAGAGATAGCACCTACTGCCTCTTAATTGCATTAACTAAGTTGTGCATAAATAACGCCGTAAGCGCCATCTCCCGGTGACAAGA	((((((((((.(((((.((.(.(((.((........(((((.(((...))))))))........)).))).).)).)))))))))))))))..	Ccl-miR3627b	24423266	24423287	TTGTCGCCGGAGAGATAGCACC	Ccl-miR3627b*	24423195	24423215	CGCCATCTCCCGGTGACAAGA		3
Ccl-MIR3951	PmiREN004441	MIR3951	Citrus clementina	Ccl-scaffold_1	20961010	20961158	+	CATAAGAGGAGTGCTTGGCATAGATAAAGATGAGAGAAAAATATGAGAGAAAGACGAGAGAAATTTGTTCCCTCTCCACCCACCCACTCTCTCTTCTCTTTTCTTCTTTTTCTCTTATCGTTATCTGTGCTTAGCATTTTTCTTCGATA	...((((((((((((.(((((((((((.(((((((((((((...((((((((((.((((((..........................)))))).))).))))))).))))))))))))).))))))))))).)))))))))))).....	20961030	20961138	TAGATAAAGATGAGAGAAAAATATGAGAGAAAGACGAGAGAAATTTGTTCCCTCTCCACCCACCCACTCTCTCTTCTCTTTTCTTCTTTTTCTCTTATCGTTATCTGTG	(((((((.(((((((((((((...((((((((((.((((((..........................)))))).))).))))))).))))))))))))).)))))))..	Ccl-miR3951	20961030	20961050	TAGATAAAGATGAGAGAAAAA	Ccl-miR3951*	20961118	20961138	TTTCTCTTATCGTTATCTGTG		3
Ccl-MIR3952a	PmiREN004442	MIR3952	Citrus clementina	Ccl-scaffold_8	17214731	17214916	+	TTATGCATATTCTTTCATGTGCTGTAGAAAGTCCCTTCACCCTCGGAAACGTCACCATGGACTGGAACTGGGGGCGAAGAAAGTGAGATCTGATGGTTGGCATTGAAGGTGGCAAGCTGCAGAAGAAAGATGGCGTTTTCAAAGTTGAAGGGCCTTTCTAGAGCACTGGAATCCATTCATAATTAA	............(((((.(((((.(((((((.((((((((((((((...((((......))).)...)))))))..............((((..(.(((.((((...)))).))).)..)))).(((((......))))).....))))))).))))))).))))))))))...............	17214751	17214896	GCTGTAGAAAGTCCCTTCACCCTCGGAAACGTCACCATGGACTGGAACTGGGGGCGAAGAAAGTGAGATCTGATGGTTGGCATTGAAGGTGGCAAGCTGCAGAAGAAAGATGGCGTTTTCAAAGTTGAAGGGCCTTTCTAGAGCAC	(((.(((((((.((((((((((((((...((((......))).)...)))))))..............((((..(.(((.((((...)))).))).)..)))).(((((......))))).....))))))).))))))).)))..	Ccl-miR3952a	17214876	17214896	TGAAGGGCCTTTCTAGAGCAC	Ccl-miR3952a*	17214751	17214771	GCTGTAGAAAGTCCCTTCACC		3
Ccl-MIR3952b	PmiREN004443	MIR3952	Citrus clementina	Ccl-scaffold_8	17325247	17325426	+	TTATGCATATTCTTTCATGTGCTGTAGATAGGCCCTTCAACCTCGGAAACCTCACCATGGACTGGGAGCGAAGGAAGTGGGATCTGATGGTTGGCATTGTAGGTGGCAAGCTGCAAAAGAAAGATGACGTTTTCAAAGTTGAAGGGCCTTTCTAGAGCACTGGAATCCATTCATACTTCA	............(((((.(((((.((((.((((((((((((...((((((.(((((((...((........))...))))((((....))))....((((((.(....).))))))........))).))))))...)))))))))))).)))).))))))))))...............	17325267	17325406	GCTGTAGATAGGCCCTTCAACCTCGGAAACCTCACCATGGACTGGGAGCGAAGGAAGTGGGATCTGATGGTTGGCATTGTAGGTGGCAAGCTGCAAAAGAAAGATGACGTTTTCAAAGTTGAAGGGCCTTTCTAGAGCAC	(((.((((.((((((((((((...((((((.(((((((...((........))...))))((((....))))....((((((.(....).))))))........))).))))))...)))))))))))).)))).)))..	Ccl-miR3952b	17325386	17325406	TGAAGGGCCTTTCTAGAGCAC	Ccl-miR3952b*	17325267	17325287	GCTGTAGATAGGCCCTTCAAC		3
Ccl-MIR3952c	PmiREN004444	MIR3952	Citrus clementina	Ccl-scaffold_8	17131571	17131756	+	TTATGCATATTCTTTCATGTGCTGTAGAAAGTCCCTTCACCCTCGGAAACGTCACCATGGACTGGAACTGGGAGCGAAGAAAGCGAGATCTGATGGTTGGCATTGAAGGTGGCAAGCTGCAGAAGAAAGATGACGTTTTCAAAGTTGAAGGGCCTTTCTAGAGCACTGGAATCCATTCATAATTAA	............(((((.(((((.(((((((.(((((((.(...(((((((((((((.(........))))..((.......))....((((..(.(((.((((...)))).))).)..)))).......))))))))))...).))))))).))))))).))))))))))...............	17131591	17131736	GCTGTAGAAAGTCCCTTCACCCTCGGAAACGTCACCATGGACTGGAACTGGGAGCGAAGAAAGCGAGATCTGATGGTTGGCATTGAAGGTGGCAAGCTGCAGAAGAAAGATGACGTTTTCAAAGTTGAAGGGCCTTTCTAGAGCAC	(((.(((((((.(((((((.(...(((((((((((((.(........))))..((.......))....((((..(.(((.((((...)))).))).)..)))).......))))))))))...).))))))).))))))).)))..	Ccl-miR3952c	17131716	17131736	TGAAGGGCCTTTCTAGAGCAC	Ccl-miR3952c*	17131591	17131611	GCTGTAGAAAGTCCCTTCACC		3
Ccl-MIR3954	PmiREN004445	MIR3954	Citrus clementina	Ccl-scaffold_9	5038099	5038254	+	AAATGATCGATTATATTTGTTTGGACAGAGAAATCACGGTCATGAGATGAGTTTTCTAATCTGTACTGTAATCTGTATACGGTGATGGTGAATATTGACGACGGATTCTCTTTCTACCGTGTTTCTCTGCCCAATCAGATATATTTGATCTTCATT	....((((((.((((((((.((((.((((((((.((((((...((((.(((..(((..(((..(((((((.......)))))))..))).............)))..))))))).)))))))))))))).)))).)))))))).))))))......	5038119	5038234	TTGGACAGAGAAATCACGGTCATGAGATGAGTTTTCTAATCTGTACTGTAATCTGTATACGGTGATGGTGAATATTGACGACGGATTCTCTTTCTACCGTGTTTCTCTGCCCAATC	((((.((((((((.((((((...((((.(((..(((..(((..(((((((.......)))))))..))).............)))..))))))).)))))))))))))).))))..	Ccl-miR3954	5038119	5038140	TTGGACAGAGAAATCACGGTCA	Ccl-miR3954*	5038214	5038234	ACCGTGTTTCTCTGCCCAATC		3
Ccl-MIR9560	PmiREN004477	MIR9560	Citrus clementina	Ccl-scaffold_5	33719350	33719450	-	CAAGGTGTGATTCTGAATGCACAGGAGGTGGAACAAATATGAAATTTTCATTGAAATTCATATTTGCTCCACCACCTGTGGATTCAAATTCAGCCTTAGAG	((((((.(((...(((((.((((((.((((((.((((((((((.(((.....))).)))))))))).)))))).)))))).)))))...)))))))).)..	33719370	33719430	ACAGGAGGTGGAACAAATATGAAATTTTCATTGAAATTCATATTTGCTCCACCACCTGTGG	(((((.((((((.((((((((((.(((.....))).)))))))))).)))))).)))))..	Ccl-miR9560	33719407	33719430	ACAGGAGGTGGAACAAATATGAAA	Ccl-miR9560*	33719370	33719390	TATTTGCTCCACCACCTGTGG		3
Ccl-MIR12106	PmiREN004358	MIR12106	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	32135447	32135568	+	TTTGGAAAAGCTTAAGTCCTGTTTAGGACCGCTGCTGCCAAACCTACATTATAGGAGAGATTCTCTCCTAAAATACAGGTTTGGGGCAGCTGTCCTAAACGGGCCTATAGTCTAGCAACTCA	.........(((..((.((((((((((((.((((((.((((((((..(((.((((((((...)))))))).)))..)))))))))))))).)))))))))))).))..)))...........	32135467	32135548	GTTTAGGACCGCTGCTGCCAAACCTACATTATAGGAGAGATTCTCTCCTAAAATACAGGTTTGGGGCAGCTGTCCTAAACGG	(((((((((.((((((.((((((((..(((.((((((((...)))))))).)))..)))))))))))))).)))))))))..	Ccl-miR12106	32135467	32135488	GTTTAGGACCGCTGCTGCCAAA	Ccl-miR12106*	32135528	32135548	TGGGGCAGCTGTCCTAAACGG		3
Ccl-MIR12107	PmiREN004359	MIR12107	Citrus clementina	Ccl-scaffold_1	27997599	27997739	-	TTATTTTGAGAGTGTTTTTACTGATGAGAGAGCGAATGATAAACCTTAAATCTTTCTCAATTTATAAACAATTGGGAGATTCCAAAAAAAATCAAATTTATCATTCGCGCTCTCATCATTATGAACGCCTTCAAATCCTGA	....((((((.((((((.((.(((((((((.((((((((((((...........((((((((.......))))))))((((........))))...)))))))))))).))))))))).)).)))))).))))))......	27997619	27997719	CTGATGAGAGAGCGAATGATAAACCTTAAATCTTTCTCAATTTATAAACAATTGGGAGATTCCAAAAAAAATCAAATTTATCATTCGCGCTCTCATCATTA	.(((((((((.((((((((((((...........((((((((.......))))))))((((........))))...)))))))))))).)))))))))...	Ccl-miR12107	27997699	27997719	CTGATGAGAGAGCGAATGATA	Ccl-miR12107*	27997619	27997639	TCATTCGCGCTCTCATCATTA		3
Ccl-MIR12108	PmiREN004360	MIR12108	Citrus clementina	Ccl-scaffold_7	19096799	19096972	+	ATGTAAGGATTCTCATGTGCAGACGTTCGCACTTTTTAAAATGCAGATTTATGTTAGTTCATGCTAATTAGCTCAAATTTAACATTCTTATTCATGTTAATTAGCTCAAAGTTAACATTTTCATATCTGCATTTTAAAACGTGCGGATGTCTGCACTAAAGAATGATTATATAT	((((((..(((((...((((((((((((((((.(((((((((((((((..(((((((.....((((((((((.......................))))))))))......)))))))......))))))))))))))).))))))))))))))))...)))))..))))))..	19096819	19096952	AGACGTTCGCACTTTTTAAAATGCAGATTTATGTTAGTTCATGCTAATTAGCTCAAATTTAACATTCTTATTCATGTTAATTAGCTCAAAGTTAACATTTTCATATCTGCATTTTAAAACGTGCGGATGTCTGC	((((((((((((.(((((((((((((((..(((((((.....((((((((((.......................))))))))))......)))))))......))))))))))))))).))))))))))))..	Ccl-miR12108	19096929	19096952	ATTTTAAAACGTGCGGATGTCTGC	Ccl-miR12108*	19096819	19096839	AGACGTTCGCACTTTTTAAAA		3
Ccl-MIR12110	PmiREN004361	MIR12110	Citrus clementina	Ccl-scaffold_9	30065171	30065289	+	TAAATGGGAGATAGATAGTTCTGGGGAGTTGCACCCGGAGTAATTTCTTCAGCTTCTTTTTAGCGTTTTATATTTACCCCGAGTCACAGCTCCCTGGACCGATCTATCTCACATGCATA	...(((.(((((((((.(.((((((((((((.((.(((.((((........(((.......))).........)))).))).))..)))))))))))).).))))))))).))).....	30065191	30065269	CTGGGGAGTTGCACCCGGAGTAATTTCTTCAGCTTCTTTTTAGCGTTTTATATTTACCCCGAGTCACAGCTCCCTGGAC	(((((((((((.((.(((.((((........(((.......))).........)))).))).))..)))))))))))..	Ccl-miR12110	30065248	30065269	CCCGAGTCACAGCTCCCTGGAC	Ccl-miR12110*	30065191	30065211	CTGGGGAGTTGCACCCGGAGT		3
Ccl-MIRN34	PmiREN004503	MIRN34	Citrus clementina	Ccl-scaffold_6	9341991	9342190	-	GCGGAGTCGGGGCAAGCGAGGGGGGCACGGGTTAACTAGATTTGCAGTGCACATGCTGATGGGTGCGACCACACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCATGCTTGGGCGAGAGCAGTACTAAAATGGGTGACCTCTTTGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCTTTTTATCTTTTCAGCCGG	.................((((((((((((((...(((.((((((..(((((..(((((.(((((...))).)).)))))....)))))))))))(((..(((..(((.((....((..(((((......)))))...))....)).).))..))).))).))).))))))))...))))))...................	9342011	9342170	GGGGGCACGGGTTAACTAGATTTGCAGTGCACATGCTGATGGGTGCGACCACACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCATGCTTGGGCGAGAGCAGTACTAAAATGGGTGACCTCTTTGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCT	(((((((((((...(((.((((((..(((((..(((((.(((((...))).)).)))))....)))))))))))(((..(((..(((.((....((..(((((......)))))...))....)).).))..))).))).))).))))))))...)))..	Ccl-miRN34	9342011	9342031	AAGTCCTCGTGTTGCACCCCT	Ccl-miRN34*	9342150	9342170	GGGGGCACGGGTTAACTAGAT		3
Ccl-MIRN831	PmiREN004479	MIRN831	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	25587976	25588095	+	TTTGTGCAGCTTTGAATTTGCTTGTTGATTGTCATCTAATCATTTTCTTTTTCATCCTAGAATTTGAATGATTATATGGTTAGATGACCATCAACAAACATGTTCATGGTATTGCATGGA	(((((((((((.(((((.((.((((((((.(((((((((((((.......((((..........)))).......))))))))))))).)))))))).)).))))).)))..))))))))	25587996	25588075	CTTGTTGATTGTCATCTAATCATTTTCTTTTTCATCCTAGAATTTGAATGATTATATGGTTAGATGACCATCAACAAACA	.((((((((.(((((((((((((.......((((..........)))).......))))))))))))).))))))))...	Ccl-miRN831	25587996	25588016	CTTGTTGATTGTCATCTAATC	Ccl-miRN831*	25588055	25588075	TTAGATGACCATCAACAAACA		3
Ccl-MIRN832	PmiREN004481	MIRN832	Citrus clementina	Ccl-scaffold_1	9128927	9129022	-	AATAAAAGGCTCTTCATCATCATCAACATCTTCATCTTCATCTTCAGAGGAATCTGCAGCTGAGGACTTTGATCGTGAAGCGAGGAGCTGTTCCAT	........(((((((.((((.(((((..((((((.((.((..(((....)))..)).)).))))))..))))).))))...)))))))........	9128947	9129002	CATCAACATCTTCATCTTCATCTTCAGAGGAATCTGCAGCTGAGGACTTTGATCGT	.(((((..((((((.((.((..(((....)))..)).)).))))))..)))))...	Ccl-miRN832	9128947	9128968	TGCAGCTGAGGACTTTGATCGT	Ccl-miRN832*	9128982	9129002	CATCAACATCTTCATCTTCAT		3
Ccl-MIRN833	PmiREN004484	MIRN833	Citrus clementina	Ccl-scaffold_2	10643639	10643858	+	GATCTATCGTCTGCAGTAAGCTAGCAAAAGTATCCCAAATCAAAAAAATTGAATCACGTTGTCGGCAAAGGGCGTGTGAGTGACGTCAGTGGAGAGAAACTGAGAGAGAGTGAGACTATAGTGAAATGCAGTCGACACTGCCGTCACTCACACACCTTCCGCCGATTCAATGTTTTTGATTTAGGATACTTTGGCTAGCTCA	..................(((((((.(((((((((.((((((((((.(((((........((((((..((((.(((((((((((((((((........))))).....((((.((((.((......)).))))..))))..)))))))))))).))))..))))))))))).)))))))))).))))))))).)))))))..	10643659	10643838	CTAGCAAAAGTATCCCAAATCAAAAAAATTGAATCACGTTGTCGGCAAAGGGCGTGTGAGTGACGTCAGTGGAGAGAAACTGAGAGAGAGTGAGACTATAGTGAAATGCAGTCGACACTGCCGTCACTCACACACCTTCCGCCGATTCAATGTTTTTGATTTAGGATACTTTGGCTAGCT	(((((.(((((((((.((((((((((.(((((........((((((..((((.(((((((((((((((((........))))).....((((.((((.((......)).))))..))))..)))))))))))).))))..))))))))))).)))))))))).))))))))).)))))..	Ccl-miRN833	10643818	10643838	TTTAGGATACTTTGGCTAGCT	Ccl-miRN833*	10643659	10643679	CTAGCAAAAGTATCCCAAATC		3
Ccl-MIRN834	PmiREN004487	MIRN834	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	48441297	48441425	-	AAGTGACATGACCCTCCAACTAGAAGTTCCAACGGGTCGGGTTTCATGTATTTCAGGTTTTTTTAAAAAAATTTATTTCAATGAAACCCGACCCGTTAGAACTTTGAATTGGGGGGTCATGTCAACGGA	...((((((((((((((((...(((((((.(((((((((((((((((.......((((((((....))))))))......))))))))))))))))).)))))))...)))))))))))))))).....	48441317	48441405	TAGAAGTTCCAACGGGTCGGGTTTCATGTATTTCAGGTTTTTTTAAAAAAATTTATTTCAATGAAACCCGACCCGTTAGAACTTTGAAT	..(((((((.(((((((((((((((((.......((((((((....))))))))......))))))))))))))))).)))))))....	Ccl-miRN834	48441317	48441337	CGACCCGTTAGAACTTTGAAT	Ccl-miRN834*	48441385	48441405	TAGAAGTTCCAACGGGTCGGG		3
Ccl-MIRN835a	PmiREN004489	MIRN835	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	33172771	33172899	+	ATGTGTGCCGCACTCCGACACCGTTTCATCTTGTCCTCCAGAACCATCACAATGAAGCCGATGTGTGCCGCGGATTCTTGATGGCTCTGGAAGACAAGATCAAACGGTGCCGGAGTGCGGAGGATTTGT	((((.(.((((((((((.((((((((.((((((((.((((((.((((((....(((.(((.((.....))))).))).)))))).)))))).)))))))).)))))))).)))))))))).).))..))	33172791	33172879	CCGTTTCATCTTGTCCTCCAGAACCATCACAATGAAGCCGATGTGTGCCGCGGATTCTTGATGGCTCTGGAAGACAAGATCAAACGGTG	((((((.((((((((.((((((.((((((....(((.(((.((.....))))).))).)))))).)))))).)))))))).))))))..	Ccl-miRN835a	33172791	33172811	CCGTTTCATCTTGTCCTCCAG	Ccl-miRN835a*	33172859	33172879	GGAAGACAAGATCAAACGGTG		3
Ccl-MIRN835b	PmiREN004500	MIRN835	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	33183539	33183667	+	ATGTGTGCCGCACTCCGACACCGTTTCATCTTGTCCTCCAGAACCATCACAATGAAGCCAATGTGTGCCGCGGATTCTTGATGGCTCTGGAAGACAAGATCAAACGGTGCCGGAGTGCGGAGGATTTGT	((((.(.((((((((((.((((((((.((((((((.((((((.((((((....(((.((...(((...))))).))).)))))).)))))).)))))))).)))))))).)))))))))).).))..))	33183559	33183647	CCGTTTCATCTTGTCCTCCAGAACCATCACAATGAAGCCAATGTGTGCCGCGGATTCTTGATGGCTCTGGAAGACAAGATCAAACGGTG	((((((.((((((((.((((((.((((((....(((.((...(((...))))).))).)))))).)))))).)))))))).))))))..	Ccl-miRN835b	33183559	33183579	CCGTTTCATCTTGTCCTCCAG	Ccl-miRN835b*	33183627	33183647	GGAAGACAAGATCAAACGGTG		3
Ccl-MIRN836	PmiREN004491	MIRN836	Citrus clementina	Ccl-scaffold_6	18431143	18431261	+	TTTTTAATTTTCTGTTATGTAGCTTGAGTCTTGCTGAAAGTACATGTTTAAAAGTTTGGATTTTATTTTTTCCAAGTACTTTCAGCAGCCTCCGGCGTCATAGCAGAGAGTGAAATTAT	......(((((((((((((..(((.(((.((.(((((((((((............(((((..........)))))))))))))))))).))).)))..)))))))))))))........	18431163	18431241	AGCTTGAGTCTTGCTGAAAGTACATGTTTAAAAGTTTGGATTTTATTTTTTCCAAGTACTTTCAGCAGCCTCCGGCGTC	.(((.(((.((.(((((((((((............(((((..........)))))))))))))))))).))).)))...	Ccl-miRN836	18431221	18431241	CTTTCAGCAGCCTCCGGCGTC	Ccl-miRN836*	18431163	18431183	AGCTTGAGTCTTGCTGAAAGT		3
Ccl-MIRN837a	PmiREN004492	MIRN837	Citrus clementina	Ccl-scaffold_7	12071425	12071691	-	TACCCAAATCACACAATCAAAGTTGGTTGGACTCTCGAGAAATTTATTGTTGATATAGGTCAATAGTGTAGTTTTACCAACACCGCCCATACCATATAGGCCAATGATTCCCGCTGATTCTTCTGCAAGACATCTCCAGACTTGTTCAAGTTGTGATTGCAAGCCTACTACTGTTCGCTCGGTAGGTCTTTCATCTGCTACAGGCTCTGGAGCTCTCTCAGGCACCACCTCGGCAGCCACCGCCTCAA	....................((.((((.((.((.((((((((((((((((((((....)))))))))).)))))..........(((.(((...))).)))....((.((.....)).)).((((..(((...((((((((((((...(((.((((..(...(((((((...........))))))))..))))..)))))))).))))))).)))..))))......))))).)))))))).))...	12071445	12071671	AGTTGGTTGGACTCTCGAGAAATTTATTGTTGATATAGGTCAATAGTGTAGTTTTACCAACACCGCCCATACCATATAGGCCAATGATTCCCGCTGATTCTTCTGCAAGACATCTCCAGACTTGTTCAAGTTGTGATTGCAAGCCTACTACTGTTCGCTCGGTAGGTCTTTCATCTGCTACAGGCTCTGGAGCTCTCTCAGGCACCACCTCGGCAGCCACCGCCTCA	((.((((.((.((.((((((((((((((((((((....)))))))))).)))))..........(((.(((...))).)))....((.((.....)).)).((((..(((...((((((((((((...(((.((((..(...(((((((...........))))))))..))))..)))))))).))))))).)))..))))......))))).)))))))).))..	Ccl-miRN837a	12071651	12071671	AGTTGGTTGGACTCTCGAGAA	Ccl-miRN837a*	12071445	12071465	ACCTCGGCAGCCACCGCCTCA		3
Ccl-MIRN837b	PmiREN004493	MIRN837	Citrus clementina	Ccl-scaffold_7	11721654	11721920	-	TACCCAAATCACACAATCAAAGTTGGTTGGACTCTCGAGAAATTTATTGTTGATATGGGTCAATAGTGTAGTTTTACCAACACCGCCCATACCATATAGGCCAATGATTCCCGCTGATTCTTCTGCAAGACATCTCCAGACTTGTTCAAGTTGTGATTGCAAGCCTACTACTGTTCGCTCGGTAGGTCTTTCATCTGCTACAGGCTCCGGAGCTCTCTCAGGCACCACCTCGATAGCCACCGCCTCAA	....................((.((((.((.((.((((((((((((((((((((....)))))))))).)))))..........(((.(((...))).)))....((.((.....)).)).((((..(((...((((.(((((((...(((.((((..(...(((((((...........))))))))..))))..)))))))).)).)))).)))..))))......))))).)))))))).))...	11721674	11721900	AGTTGGTTGGACTCTCGAGAAATTTATTGTTGATATGGGTCAATAGTGTAGTTTTACCAACACCGCCCATACCATATAGGCCAATGATTCCCGCTGATTCTTCTGCAAGACATCTCCAGACTTGTTCAAGTTGTGATTGCAAGCCTACTACTGTTCGCTCGGTAGGTCTTTCATCTGCTACAGGCTCCGGAGCTCTCTCAGGCACCACCTCGATAGCCACCGCCTCA	((.((((.((.((.((((((((((((((((((((....)))))))))).)))))..........(((.(((...))).)))....((.((.....)).)).((((..(((...((((.(((((((...(((.((((..(...(((((((...........))))))))..))))..)))))))).)).)))).)))..))))......))))).)))))))).))..	Ccl-miRN837b	11721880	11721900	AGTTGGTTGGACTCTCGAGAA	Ccl-miRN837b*	11721674	11721694	ACCTCGATAGCCACCGCCTCA		3
Ccl-MIRN838	PmiREN004494	MIRN838	Citrus clementina	Ccl-scaffold_8	17444239	17444435	+	TGTAGAAGGCTCCTCTTGTACTGTAGAAGGCTCCTGTGACCTCAAAGACGTCACCATGGAATGGAATCATGCTGAAGACTTATCCGATGGTTGGCATAGAAGGTGGCAAGTTACTTGTAATAGGCAAGCTGCAGAAGAAAGATGACGTTTTCAAGGTCGCAGGAGCTTTCTACGGTTGGGGAAAATTTTTCCATGCT	..........(((((....(((((((((((((((((((((((..((((((((((((((((...((.((........)).)).))).))))(((.(((.....))).)))((..(((((.....)))))..))..........)))))))))..))))))))))))))))))))))).)))))...............	17444259	17444415	CTGTAGAAGGCTCCTGTGACCTCAAAGACGTCACCATGGAATGGAATCATGCTGAAGACTTATCCGATGGTTGGCATAGAAGGTGGCAAGTTACTTGTAATAGGCAAGCTGCAGAAGAAAGATGACGTTTTCAAGGTCGCAGGAGCTTTCTACGGTT	((((((((((((((((((((((..((((((((((((((((...((.((........)).)).))).))))(((.(((.....))).)))((..(((((.....)))))..))..........)))))))))..))))))))))))))))))))))..	Ccl-miRN838	17444259	17444279	CTGTAGAAGGCTCCTGTGACC	Ccl-miRN838*	17444395	17444415	TCGCAGGAGCTTTCTACGGTT		3
Ccl-MIRN839	PmiREN004495	MIRN839	Citrus clementina	Ccl-scaffold_9	5534444	5534594	+	CAAAAGTGAAACCCGCAAGCCTTTGAACTCCTCGAAGCCTGCAAAAATGGAGCAAACCGAGGTTAGAGGTGGAGCTGGCGGTGGCTGACGATTTTTCCTCCATTTTTGCTGGCTTCGAGGAGTTCAAAGGCTCATGGGTTTTTCTTTTGTT	((((((.((((((((..((((((((((((((((((((((.((((((((((((.(((.....(((((.(.((.......)).)..)))))....))).)))))))))))).))))))))))))))))))))))..)))))))).))))))..	5534464	5534574	CTTTGAACTCCTCGAAGCCTGCAAAAATGGAGCAAACCGAGGTTAGAGGTGGAGCTGGCGGTGGCTGACGATTTTTCCTCCATTTTTGCTGGCTTCGAGGAGTTCAAAGGC	(((((((((((((((((((.((((((((((((.(((.....(((((.(.((.......)).)..)))))....))).)))))))))))).)))))))))))))))))))..	Ccl-miRN839	5534464	5534483	CTTTGAACTCCTCGAAGCCT	Ccl-miRN839*	5534554	5534574	GGCTTCGAGGAGTTCAAAGGC		3
Ccl-MIRN840	PmiREN004496	MIRN840	Citrus clementina	Ccl-scaffold_1	6553921	6554164	-	GAAATGCTTGCATGATTTACTTGGATCCGAGAGCTTTACAAGGGAAAATGTTTACAGCTTTGAAGAAAGGGAAAATTACAAGACATGAATAGCTTCCTTGATGTCTTGATCCGGATTTCCCAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAAAATTTTTCGTATCACAAAAAACTCTGCCTCTAAATGTTACATAGCTTTGAATTTAAAACCACTGAAGCTTGAACTGTAGCGAGTCTGTAGCTTCAACTGT	(((..(((.(((.(((((.(((((.((...((((((((...((......(((((.((((.((......((((((....((((((((.((........)).)))))))).......))))))((((..((((...((((((......)))))).............))))..))))........)).)))).)))))......))..)))))))))).))).)).))))))))))))))......	6553941	6554144	TTGGATCCGAGAGCTTTACAAGGGAAAATGTTTACAGCTTTGAAGAAAGGGAAAATTACAAGACATGAATAGCTTCCTTGATGTCTTGATCCGGATTTCCCAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAAAATTTTTCGTATCACAAAAAACTCTGCCTCTAAATGTTACATAGCTTTGAATTTAAAACCACTGAAGCTTGAACTGTAGC	((((.((...((((((((...((......(((((.((((.((......((((((....((((((((.((........)).)))))))).......))))))((((..((((...((((((......)))))).............))))..))))........)).)))).)))))......))..)))))))))).))).)..	Ccl-miRN840	6554124	6554144	TTGGATCCGAGAGCTTTACAA	Ccl-miRN840*	6553941	6553961	CACTGAAGCTTGAACTGTAGC		3
Ccl-MIRN841	PmiREN004499	MIRN841	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	21172003	21172086	+	GGGTGATTTTCAACAGAATCTCTAGAAATTTTGAAGGTTCTTGCTTCCTTGAAAATGTTAGAGAAGAATCACAAAAGCCGGGAG	..................(((((((..(((((.((((.........)))).))))).)))))))....................	21172023	21172066	TCTAGAAATTTTGAAGGTTCTTGCTTCCTTGAAAATGTTAGAGA	(((((..(((((.((((.........)))).))))).)))))..	Ccl-miRN841	21172023	21172043	TCTAGAAATTTTGAAGGTTCT	Ccl-miRN841*	21172046	21172066	CTTCCTTGAAAATGTTAGAGA		3
Ccl-MIRN842	PmiREN004505	MIRN842	Citrus clementina	Ccl-scaffold_7	5838562	5838793	-	GAAGGTGCTGGTTGCTTCACAATTCCAACTCGTCGATTTGCATCATTTTTGCGTGCAATGATCCCGAATTTGCTCTCTTACTCAACTTTCTTTTTAATTTACAAATATTCATGTTTATTGGTTTGAAAAATAGGAAAAAAAAATTCTAATTTTTGTTAACGGGGATCTGGATCATTCACGCAAAAATGATTTGACTCGTGAGTTGGCCTTGTG	.................(((((..((((((((.(((.(((.((((((((((((((.((((((((.((......(((((....(((.((((...(((((..(((........)))..)))))...))))..(((((........)))))....))).....))))))).)))))))))))))))))))))).))).)))))))))))..)))))	5838582	5838773	AATTCCAACTCGTCGATTTGCATCATTTTTGCGTGCAATGATCCCGAATTTGCTCTCTTACTCAACTTTCTTTTTAATTTACAAATATTCATGTTTATTGGTTTGAAAAATAGGAAAAAAAAATTCTAATTTTTGTTAACGGGGATCTGGATCATTCACGCAAAAATGATTTGACTCGTGAGTTGGCCTTGT	((..((((((((.(((.(((.((((((((((((((.((((((((.((......(((((....(((.((((...(((((..(((........)))..)))))...))))..(((((........)))))....))).....))))))).)))))))))))))))))))))).))).)))))))))))..))..	Ccl-miRN842	5838582	5838602	TGACTCGTGAGTTGGCCTTGT	Ccl-miRN842*	5838753	5838773	AATTCCAACTCGTCGATTTGC		3
Ccl-MIRN843	PmiREN004507	MIRN843	Citrus clementina	Ccl-scaffold_8	17461857	17462097	-	AAGTTAACCAACCAAATTAATCACTACTTTCAATCTCGGTCGGATTTCAACAAGAGCTTTTATATTTCTGTTTACATGTTCAATTTCAACAAACAATGTACTATATCCCCAGAGTTTTGTCGGAGCAGTTTTCAGGCAACTTTATTTGGCTGATCACCACACAAGTCCGTATAGAAAATAGATTGTTTGTTGGAATTTAATTGAGATTGAAAGTAGTGATTAGTTTGGTTAGTTATCTCAC	.((.((((.(((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((....(((((.(((((((.((((((((...........))).)))))....................((((...((..((((.(((......))).))))..))........)))).))))))))))))...))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))).)))).))...	17461877	17462077	TCACTACTTTCAATCTCGGTCGGATTTCAACAAGAGCTTTTATATTTCTGTTTACATGTTCAATTTCAACAAACAATGTACTATATCCCCAGAGTTTTGTCGGAGCAGTTTTCAGGCAACTTTATTTGGCTGATCACCACACAAGTCCGTATAGAAAATAGATTGTTTGTTGGAATTTAATTGAGATTGAAAGTAGTGATT	((((((((((((((((((((.(((((((((((((....(((((.(((((((.((((((((...........))).)))))....................((((...((..((((.(((......))).))))..))........)))).))))))))))))...))))))))))))).))))))))))))))))))))..	Ccl-miRN843	17461877	17461897	TTGAGATTGAAAGTAGTGATT	Ccl-miRN843*	17462057	17462077	TCACTACTTTCAATCTCGGTC		3
Ccl-MIRN844	PmiREN004511	MIRN844	Citrus clementina	Ccl-scaffold_3	5404528	5404756	+	ATTAAGCAAGCAAGCGGAGGGTACGGTGATTGATTGACGTTGTTTCTGCAAACAGATGGTCTTTGATTGCGGGGAGACTTCCAGGACGAACAGATAATGAAATTAAGAACTACTGGAATTCTCATTTGAGCAAGAAAATAAATCACAAGCAGAAAACACCGCAGCAGCCTCAGCAGCCTGCAACTACACGACTAACAGTTCCTGAAAACACCTCGGAGATTGCTCCCGT	....(((((.....(.((((((.(((.(((((.(((..(((((((((((.....(((....(((..((((...((((.((((((............................)))))).))))......))))..)))...)))....))))))......(((((.((....)).).))))......))))))))))))).)))...)).)))).)...))))).....	5404548	5404736	GTACGGTGATTGATTGACGTTGTTTCTGCAAACAGATGGTCTTTGATTGCGGGGAGACTTCCAGGACGAACAGATAATGAAATTAAGAACTACTGGAATTCTCATTTGAGCAAGAAAATAAATCACAAGCAGAAAACACCGCAGCAGCCTCAGCAGCCTGCAACTACACGACTAACAGTTCCTGAAAAC	((.(((.(((((.(((..(((((((((((.....(((....(((..((((...((((.((((((............................)))))).))))......))))..)))...)))....))))))......(((((.((....)).).))))......))))))))))))).)))...))	Ccl-miRN844	5404716	5404736	CGACTAACAGTTCCTGAAAAC	Ccl-miRN844*	5404548	5404568	GTACGGTGATTGATTGACGTT		3
