miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Bol-MIR156 PmiREN002317 MIR156 Brassica oleracea Bol-C03 54389745 54389867 - AGAAATGCAACAGAGAAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACTTGCAAGGCACTGTTATGTGTCAATAACTTTGCGTGTGCGTGCTCACCTCTCTTTCTGTCAGTTGCCTGACTTCTCGCTTTCT ((..(.(((.........((((((((((((((((((((((.((((..(((..(((((......)))))..))).)))).))))))).))))).))))))))))))).)..))........... 54389765 54389847 TGACAGAAGAGAGTGAGCACTTGCAAGGCACTGTTATGTGTCAATAACTTTGCGTGTGCGTGCTCACCTCTCTTTCTGTCAGT ((((((((((((((((((((.((((..(((..(((((......)))))..))).)))).))))))).))))).)))))))).. 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Bol-miRN301 48121447 48121466 AAGCTGTGGATGAGTTTCTG Bol-miRN301* 48121363 48121383 AATAATTCAGCCACTGCTTTT 3 Bol-MIRN302 PmiREN002358 MIRN302 Brassica oleracea Bol-C03 13482214 13482322 + AAGGCCCAGCCGTGACCTATGGAGGAGAGAGAGTCGGCGGCCAAGATCCTAGTTTGGCCAAGACTTCAAGTTTTCTTTTTCTCTGTTTTAGATGTTTTCCTATTTCCTG (.(((...))).)...(((....((((((((((..((((((((((.......)))))))..........)))..))))))))))....))).................. 13482234 13482302 GGAGGAGAGAGAGTCGGCGGCCAAGATCCTAGTTTGGCCAAGACTTCAAGTTTTCTTTTTCTCTGTTTT ...((((((((((..((((((((((.......)))))))..........)))..))))))))))..... Bol-miRN302 13482234 13482253 GGAGGAGAGAGAGTCGGCGG Bol-miRN302* 13482282 13482302 AGTTTTCTTTTTCTCTGTTTT 3 Bol-MIRN303 PmiREN002359 MIRN303 Brassica oleracea Bol-C03 25031035 25031280 + AAATCTAGTGGATAATATTAACTTGAGAGAATGGATGGTGTAGATGAGATCGGTCTTCTTGTAATATCTGAAGTGTTGGGAGGATAAGGTTGGCGCCCACTTTAATTCAAACCATAGCAAGCTGGCTCCTTGCTTGTGATTGGCTCTCCTTAGGCTCCCCCTAATCTAGGTATCTCATGACAAGAAGAAGATGATGAAAGAACCTCACCCTCCACCTCTTGATATGATGCCACACACTCTCACTCT .......((((....(((((..(((((((..((((.((((..(.....((((.(((((((((.(((((((.......(((((..(((((..((.(((...................((((((.........))))))....))).)))))))..))))).......)))))))......)))))))))...)))).......)..)))).)))).)))))))..)))))))))............. 25031055 25031260 ACTTGAGAGAATGGATGGTGTAGATGAGATCGGTCTTCTTGTAATATCTGAAGTGTTGGGAGGATAAGGTTGGCGCCCACTTTAATTCAAACCATAGCAAGCTGGCTCCTTGCTTGTGATTGGCTCTCCTTAGGCTCCCCCTAATCTAGGTATCTCATGACAAGAAGAAGATGATGAAAGAACCTCACCCTCCACCTCTTGATATG ..(((((((..((((.((((..(.....((((.(((((((((.(((((((.......(((((..(((((..((.(((...................((((((.........))))))....))).)))))))..))))).......)))))))......)))))))))...)))).......)..)))).)))).))))))).... 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Bol-miRN304a 36683346 36683365 GGGATGATTGGTTGTGGCTG Bol-miRN304a* 36683539 36683559 AGCATTTACTAGTCATTCCCC 3 Bol-MIRN304b PmiREN002362 MIRN304 Brassica oleracea Bol-C08 7303377 7303532 - GACCATAAAATTATTTACCAGTTCAACCAAATCTTTCTTAATTATGTGCCAAGAATGTTGGAAGAAAAGCACAGTCATTCCATCCGGTCCTGTAGCCTTTTCTGGGTGCATCATAGGGGATGATTGGTTGTGGCTGTAGATGCTCTGGACATCCAA ...........(((((((.(((((((((((.((.(((((.((.(((((((.((((...(((((((.........)).)))))...(((......)))..)))).))))))).)).))))).))))))))).)))))))))))...(((....))). 7303397 7303512 GTTCAACCAAATCTTTCTTAATTATGTGCCAAGAATGTTGGAAGAAAAGCACAGTCATTCCATCCGGTCCTGTAGCCTTTTCTGGGTGCATCATAGGGGATGATTGGTTGTGGCTG ((((((((((.((.(((((.((.(((((((.((((...(((((((.........)).)))))...(((......)))..)))).))))))).)).))))).))))))))).))).. 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Bol-miRN308 10734981 10735002 AGTGGTAAAGAGGTTGCGGCTG Bol-miRN308* 10735093 10735113 GCTGTAACTACCGCCACTTAG 3 Bol-MIRN309a PmiREN002368 MIRN309 Brassica oleracea Bol-C05 19991261 19991348 - ACTTGTCCTGGTTTCATCCGTCTTCCAACTGCTCTTTTGATTACATCTCGAGAGTGGTTGGAAAGATTGATGTTAGTGGGGCAATTGA ..((((((((.(..((((.(((((((((((((((((..(((...)))..)))))))))))).))))).))))..).)))))))).... 19991281 19991328 TCTTCCAACTGCTCTTTTGATTACATCTCGAGAGTGGTTGGAAAGATT ((((((((((((((((..(((...)))..)))))))))))).)))).. Bol-miRN309a 19991281 19991301 TCGAGAGTGGTTGGAAAGATT Bol-miRN309a* 19991308 19991328 TCTTCCAACTGCTCTTTTGAT 3 Bol-MIRN309b PmiREN002373 MIRN309 Brassica oleracea Bol-C07 3759085 3759172 + TCTTGGCCTGGTTTCATCTATCTTCCAGCTGCTCTTTTGATTACATCTCGAGAGTGGTTGGAAAGATTGATGTTAGCAGGGCAATGAA ..(((.((((.(..((((.(((((((((((((((((..(((...)))..)))))))))))).))))).))))..).)))).))).... 3759105 3759152 TCTTCCAGCTGCTCTTTTGATTACATCTCGAGAGTGGTTGGAAAGATT ((((((((((((((((..(((...)))..)))))))))))).)))).. Bol-miRN309b 3759132 3759152 TCGAGAGTGGTTGGAAAGATT Bol-miRN309b* 3759105 3759125 TCTTCCAGCTGCTCTTTTGAT 3 Bol-MIRN310a PmiREN002369 MIRN310 Brassica oleracea Bol-C07 1003664 1003790 - TGGTTCATACAAGGTGGAGTCAAATGGAGAATTGATTACAAAGATACTCTACATAATGACATGGTCAAACTCATAAAGATTAAGGTTGAATGGATCTTCCATGTGGCTGGATGTAAATCCCCAATGG .....(((.....))).(((((.((((((.(((.(((.(((...((.(((......((((...)))).........))).))...)))))).))).)))))).)))))((((....))))....... 1003684 1003770 CAAATGGAGAATTGATTACAAAGATACTCTACATAATGACATGGTCAAACTCATAAAGATTAAGGTTGAATGGATCTTCCATGTGGC ((.((((((.(((.(((.(((...((.(((......((((...)))).........))).))...)))))).))).)))))).)).. 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Bol-miRN310b 37507105 37507124 GAATGAGTCTTCCATGTGGC Bol-miRN310b* 37507074 37507094 GACATGGTCAGACTCATAAAG 3 Bol-MIRN311 PmiREN002370 MIRN311 Brassica oleracea Bol-C08 35728898 35729004 - AGATAGATACCTCAGTGGTGGTTAAGGAGGTAGTTATGGATAGTCCACAATTTGAAATCGGTTTCATGACCACACTTTCTCTGACCACATAAACGAAATTAAATGAA .................((((((((((((((.((((((((......................))))))))...))))))).)))))))................... 35728918 35728984 GTTAAGGAGGTAGTTATGGATAGTCCACAATTTGAAATCGGTTTCATGACCACACTTTCTCTGACCA (((((((((((.((((((((......................))))))))...))))))).)))).. Bol-miRN311 35728963 35728984 GTTAAGGAGGTAGTTATGGATA Bol-miRN311* 35728918 35728938 TGACCACACTTTCTCTGACCA 3 Bol-MIRN312 PmiREN002372 MIRN312 Brassica oleracea Bol-C09 10060562 10060790 + CAGACGTGAATCTTCATACGACAGGTAGAATTGTCGGCTGTAGAATCGTCTGTAATATTTCTCATAGTTGTAATAGCATAATTATCCAGCGTTAAAAAAAAAATGACATTAGATGTAAATATAATAAAAATTCAAGGGCAGAATCCAAAAATTTTAAAATATGATTCTGTTTTAATAGTATAGATGGTTTGGTCTGACTCTCCCTGTTTGGTCTGATTAAAAAGTAAGT (((((((((....))))..((((((.(((...(((((((...((((((((((((.((((....((((((((......))))))))....((((........))))((((...))))..................(((((((((((.................))))))))))))))).)))))))))))))).)))))))).))))))..))))).............. 10060582 10060770 ACAGGTAGAATTGTCGGCTGTAGAATCGTCTGTAATATTTCTCATAGTTGTAATAGCATAATTATCCAGCGTTAAAAAAAAAATGACATTAGATGTAAATATAATAAAAATTCAAGGGCAGAATCCAAAAATTTTAAAATATGATTCTGTTTTAATAGTATAGATGGTTTGGTCTGACTCTCCCTGTTT (((((.(((...(((((((...((((((((((((.((((....((((((((......))))))))....((((........))))((((...))))..................(((((((((((.................))))))))))))))).)))))))))))))).)))))))).))))).. 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