miRNA_locus_ID	miRNA_locus_accession	miRNA_family	Organism	Chromosome	Start	End	Strand	Stem_loop_with_extended_20bp_seq	Stem_loop_with_extended_20bp_structure	Stem_loop_start	Stem_loop_end	Stem_loop_seq	Stem_loop_seq_structure	mature_miRNA	mature_start	mature_end	mature_seq	star_miRNA	star_start	star_end	star_seq	Confidence_level
Aha-MIRN73	PmiREN000388	MIRN73	Arabidopsis halleri	Aha-Scaffold21697	9632	9857	+	AACCCAAACAAAAAAACCTTTAGCTTTAGCTAAGAACGAGTCGCCGAAATTTTTAGAGTATTGAGTACCTCGAATACACCAAGAGTTGGTTTGTAAGCAACTCGCGGTTAAGTGTATTGAGTAATTACTCGAGCAATCAAGTTGGCGCCGTTGCCGGTGACCAGTTGCGTTATCTAAGGATTTAGGATTAGTTTTTAGGCTAGAGCATTTTTATTTATTGCTAACT	......................(((((((((((((((.((((....(((((((((((...(((((((.((((((((((((..((((((.((...)).))))))..)))...)))).)))))....)))))))(((((.....((((((((....))))).))))))))....)))))))))))..)))).))))))).))))))))....(((........)))..	9652	9837	GCTTTAGCTAAGAACGAGTCGCCGAAATTTTTAGAGTATTGAGTACCTCGAATACACCAAGAGTTGGTTTGTAAGCAACTCGCGGTTAAGTGTATTGAGTAATTACTCGAGCAATCAAGTTGGCGCCGTTGCCGGTGACCAGTTGCGTTATCTAAGGATTTAGGATTAGTTTTTAGGCTAGAGCAT	(((((((((((((((.((((....(((((((((((...(((((((.((((((((((((..((((((.((...)).))))))..)))...)))).)))))....)))))))(((((.....((((((((....))))).))))))))....)))))))))))..)))).))))))).))))))))..	Aha-miRN73	9652	9671	GCTTTAGCTAAGAACGAGTC	Aha-miRN73*	9817	9837	TTAGTTTTTAGGCTAGAGCAT		3
Aha-MIRN74a	PmiREN000389	MIRN74	Arabidopsis halleri	Aha-Scaffold5185	15713	15811	+	GCACTTATCTTTTCGGTCAACTGTCCTGAGAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGAAAAGCTTTAGGATGGGTGACCTTCCGAGAAGTGATTG	..............(((((.((((((((((.....((((...(((((....)))))..)))).....)))))))))).))))).......((....)).	15733	15791	CTGTCCTGAGAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGAAAAGCTTTAGGATGGGT	((((((((((.....((((...(((((....)))))..)))).....))))))))))..	Aha-miRN74a	15733	15753	CTGTCCTGAGAGAACTCCACA	Aha-miRN74a*	15771	15791	TGGAAAAGCTTTAGGATGGGT		3
Aha-MIRN74b	PmiREN000390	MIRN74	Arabidopsis halleri	Aha-Scaffold7528	4561	4659	+	GTGCACATATCTTTTCGGTCAACTGTCCTGAGAGAACTCCACAGTTAATGATGCTTGAGCTGGAGCAATTTTAGGATGGGTAACCTTCCGGGAAGTGAT	................(((...(((((((((((...(((((...((((......))))..)))))...)))))))))))...)))........(....)	4581	4639	CTGTCCTGAGAGAACTCCACAGTTAATGATGCTTGAGCTGGAGCAATTTTAGGATGGGT	(((((((((((...(((((...((((......))))..)))))...)))))))))))..	Aha-miRN74b	4581	4601	CTGTCCTGAGAGAACTCCACA	Aha-miRN74b*	4619	4639	TGGAGCAATTTTAGGATGGGT		3
Aha-MIRN74c	PmiREN000391	MIRN74	Arabidopsis halleri	Aha-Scaffold7528	5038	5136	+	GTACACTTATCTTTTCGGTCAACTGTCCTGAGAGAACTCCACAGTTAAAGATGCTTGAGCTAGAGCAATTTCAGGATGGGTGACCTTCTGGGAAGTGAT	................(((((.(((((((((((...(((...((((.(((...))).)))).)))...))))))))))).)))))........(....)	5058	5116	CTGTCCTGAGAGAACTCCACAGTTAAAGATGCTTGAGCTAGAGCAATTTCAGGATGGGT	(((((((((((...(((...((((.(((...))).)))).)))...))))))))))).)	Aha-miRN74c	5058	5078	CTGTCCTGAGAGAACTCCACA	Aha-miRN74c*	5096	5116	TAGAGCAATTTCAGGATGGGT		3
Aha-MIRN74d	PmiREN000398	MIRN74	Arabidopsis halleri	Aha-Scaffold1416	48439	48537	-	GCACTTATCTTTTCGGTCAACTGTCCTGAGAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCTGGAGTAGTTTCAGGATGGGTGACCTTCCGAGAAGTGATTG	..............(((((.(((((((((((..((((((...(((((....)))))..))))))..))))))))))).))))).......((....)).	48459	48517	CTGTCCTGAGAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCTGGAGTAGTTTCAGGATGGGT	(((((((((((..((((((...(((((....)))))..))))))..)))))))))))..	Aha-miRN74d	48497	48517	CTGTCCTGAGAGAACTCCACA	Aha-miRN74d*	48459	48479	TGGAGTAGTTTCAGGATGGGT		3
Aha-MIRN74e	PmiREN000399	MIRN74	Arabidopsis halleri	Aha-Scaffold17156	45889	45987	-	GCACTTATCTTTTCGGTCAACTGTCCTGAGAGAACTCCACAGTTAAGGGTGCTTGAGCTGGAGCAATTTCAGGATGGTGACCTTCCGATAAGTGATTGT	..............(((((.(((((((((((...(((((...(((((....)))))..)))))...)))))))))))))))).....((((....))))	45909	45967	CTGTCCTGAGAGAACTCCACAGTTAAGGGTGCTTGAGCTGGAGCAATTTCAGGATGGTG	(((((((((((...(((((...(((((....)))))..)))))...)))))))))))..	Aha-miRN74e	45947	45967	CTGTCCTGAGAGAACTCCACA	Aha-miRN74e*	45909	45929	TGGAGCAATTTCAGGATGGTG		3
Aha-MIRN74f	PmiREN000400	MIRN74	Arabidopsis halleri	Aha-Scaffold17156	60	158	-	GCACTTATCTTTTCGGTCAACTGTCCTGAGAGAACTCCACAGTTAAGGGTGCTTGAGCTGGACTAATTTCAGGATGGGTGACCTTCCAGGAAGAGATTG	.((...(((((((((((((.(((((((((((....((((...(((((....)))))..))))....))))))))))).)))))......))))))))))	80	138	CTGTCCTGAGAGAACTCCACAGTTAAGGGTGCTTGAGCTGGACTAATTTCAGGATGGGT	(((((((((((....((((...(((((....)))))..))))....)))))))))))..	Aha-miRN74f	118	138	CTGTCCTGAGAGAACTCCACA	Aha-miRN74f*	80	100	TGGACTAATTTCAGGATGGGT		3
Aha-MIRN74g	PmiREN000401	MIRN74	Arabidopsis halleri	Aha-Scaffold25421	20944	21042	+	GTGCACTTATCTTTTTGGTCAACTGTCCTGAGAGAACTCCACAGTTAAGCGTGTTTGGGTTGGAGTAGTTTCAGGATGGGTGACCTTCCGGGAAGTGAT	................(((((.(((((((((((..((((((.(.((((......)))).)))))))..))))))))))).)))))..............	20964	21022	CTGTCCTGAGAGAACTCCACAGTTAAGCGTGTTTGGGTTGGAGTAGTTTCAGGATGGGT	(((((((((((..((((((.(.((((......)))).)))))))..))))))))))).)	Aha-miRN74g	20964	20984	CTGTCCTGAGAGAACTCCACA	Aha-miRN74g*	21002	21022	TGGAGTAGTTTCAGGATGGGT		3
Aha-MIRN74h	PmiREN000402	MIRN74	Arabidopsis halleri	Aha-Scaffold3811	17757	17855	+	GCACTTATCTTTTCGGTCAACTGTCCTGAGAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGTTGGAGTAGTTTAAGGATGGGTGACCTTATGGGAAGTGATTG	..............(((((.(((((((.(((..((((((.(.(((((....))))).)))))))..))).))))))).)))))................	17777	17835	CTGTCCTGAGAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGTTGGAGTAGTTTAAGGATGGGT	(((((((.(((..((((((.(.(((((....))))).)))))))..))).)))))))..	Aha-miRN74h	17777	17797	CTGTCCTGAGAGAACTCCACA	Aha-miRN74h*	17815	17835	TGGAGTAGTTTAAGGATGGGT		3
Aha-MIRN74i	PmiREN000403	MIRN74	Arabidopsis halleri	Aha-Scaffold4507	64493	64592	-	GCACTTATCTTTTCGGTCAACTGTCCTGAGAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCTGGAGTAGTTTCAGGATGAGTGACCTTCCGGGAAGTGATTGT	..............(((((.(((((((((((..((((((...(((((....)))))..))))))..))))))))).))))))).....(.((....)).)	64513	64572	CTGTCCTGAGAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCTGGAGTAGTTTCAGGATGAGTG	(((((((((((..((((((...(((((....)))))..))))))..))))))))).))..	Aha-miRN74i	64552	64572	CTGTCCTGAGAGAACTCCACA	Aha-miRN74i*	64513	64533	GGAGTAGTTTCAGGATGAGTG		3
Aha-MIRN75	PmiREN000392	MIRN75	Arabidopsis halleri	Aha-Scaffold3578	75981	76068	+	CAGAGTATCTCGCGAAGATCACGTCGATGGTGCTGCCGGTGTCGATTAGCAGTCGTGATACGTCGTGGTCTCCTATGGCCAGTGTGAT	...............((((((((.((((.(((((((.(((....))).)))).))).)).)).)))))))).................	76001	76048	ACGTCGATGGTGCTGCCGGTGTCGATTAGCAGTCGTGATACGTCGTGG	(((.((((.(((((((.(((....))).)))).))).)).)).)))..	Aha-miRN75	76001	76022	ACGTCGATGGTGCTGCCGGTGT	Aha-miRN75*	76028	76048	AGCAGTCGTGATACGTCGTGG		3
Aha-MIRN76	PmiREN000393	MIRN76	Arabidopsis halleri	Aha-Scaffold550	178979	179108	+	AGAAAACTAAGATCCGTTCGGATATTTTAAAACTCCGGGTTCGGGTCGGGTTTGGGTCGGGTTTGGGTCGGATATTTCGAGTTCGGATTCGGGTTTACCCGAAGTATCCAAATATTAAAAAATTTGTATC	...................(((((((((.((((.(((((((((((((((((((((.(((....))).))))))...)))).)))))))))))))))....))))))))).....................	178999	179088	GATATTTTAAAACTCCGGGTTCGGGTCGGGTTTGGGTCGGGTTTGGGTCGGATATTTCGAGTTCGGATTCGGGTTTACCCGAAGTATCCA	((((((((.((((.(((((((((((((((((((((.(((....))).))))))...)))).)))))))))))))))....))))))))..	Aha-miRN76	179069	179088	GGGTTTACCCGAAGTATCCA	Aha-miRN76*	178999	179019	GATATTTTAAAACTCCGGGTT		3
Aha-MIRN77	PmiREN000394	MIRN77	Arabidopsis halleri	Aha-Scaffold7828	23759	23857	+	GTTCGTGTAGCTAACGAGATATTTTTAAAGTCTGCATGTGTGACGATGTGATGACGTCTCGTTCGTGTAGCTGATAAACATTTTTCCTTCTAAATATGA	...............((((.((.((((.((.(((((((..(((.(((((....))))))))..)))))))))..)))).)).))))..((.......))	23779	23837	TTTTAAAGTCTGCATGTGTGACGATGTGATGACGTCTCGTTCGTGTAGCTGATAAACAT	.((((.((.(((((((..(((.(((((....))))))))..)))))))))..)))).))	Aha-miRN77	23779	23798	TTTTAAAGTCTGCATGTGTG	Aha-miRN77*	23817	23837	GTTCGTGTAGCTGATAAACAT		3
Aha-MIRN78	PmiREN000395	MIRN78	Arabidopsis halleri	Aha-Scaffold17305	5347	5591	+	CCACCATGGATGGCTAGGCATCGTTCTTCTGAGAAGTCTTCAAACACTTCTCCTGCTCCACCTAGCTTCTGAACTCCACCACAGTCAAGCTAATGACTGAAAACAAGCGCTTCGTAGGAGACAACCCACTGATATGTTTTTCGTTTTCTTTTTATTCTACTTTTGTGGATGTCGGATTCACACACTCAAGTATTTTTATTAAGTAGGAAAGATTACTCTTGAGGGACAAAAAATAATATGCAAAA	........((((......))))(((((((.(((.((((((..........(((((((.....(((((((((..........)))..))))))......(((((((((((..((((.((......)).)).))..)))))...)))))).........(((((..(((..((.......))..)))..))))).........))))))))))))).)))..)))))))..................	5367	5571	TTCTTCTGAGAAGTCTTCAAACACTTCTCCTGCTCCACCTAGCTTCTGAACTCCACCACAGTCAAGCTAATGACTGAAAACAAGCGCTTCGTAGGAGACAACCCACTGATATGTTTTTCGTTTTCTTTTTATTCTACTTTTGTGGATGTCGGATTCACACACTCAAGTATTTTTATTAAGTAGGAAAGATTACTCTTGAGGGACA	((((((.(((.((((((..........(((((((.....(((((((((..........)))..))))))......(((((((((((..((((.((......)).)).))..)))))...)))))).........(((((..(((..((.......))..)))..))))).........))))))))))))).)))..))))))).	Aha-miRN78	5552	5571	AAGATTACTCTTGAGGGACA	Aha-miRN78*	5367	5387	TTCTTCTGAGAAGTCTTCAAA		3
Aha-MIRN79	PmiREN000396	MIRN79	Arabidopsis halleri	Aha-Scaffold12632	74512	74670	-	ACTTTTGGCGGAAGAAAATACGGAATCACGTTTTTGGCGGAAAAATGTGGATCGCTTTTTGGCGAAAAAATGCGGAATCGCGTTTTTGGCGAGAAAATTGTGGAATTATGTTTTTGACGGGAAAATGTGAAATTGCGTTTTTGGTGGAACAATTACGGA	...(((.((.((((.....(((.((((((((((((..((.((((((((((.(((((((((.((..(((((((((....))))))))).)).)))))...))))..))))))))))..)).))))))))))..)).))))))).)).)))..........	74532	74650	CGGAATCACGTTTTTGGCGGAAAAATGTGGATCGCTTTTTGGCGAAAAAATGCGGAATCGCGTTTTTGGCGAGAAAATTGTGGAATTATGTTTTTGACGGGAAAATGTGAAATTGCGTT	((.((((((((((((..((.((((((((((.(((((((((.((..(((((((((....))))))))).)).)))))...))))..))))))))))..)).))))))))))..)).))..	Aha-miRN79	74631	74650	CGGAATCACGTTTTTGGCGG	Aha-miRN79*	74532	74552	GGGAAAATGTGAAATTGCGTT		3
Aha-MIRN80	PmiREN000397	MIRN80	Arabidopsis halleri	Aha-Scaffold4659	1221	1317	-	GAATTGGGTTTCAAATCGGTTTATTATTCTGGGTTTTGGTTTGGCATCGGGTTCGGCACAGTAAACCAATGATAAACCACGAAATTGGAATTTATGG	.................(((((((((((...((((((((((.(((.....))).))).))..))))))))))))))))...................	1241	1297	TTATTATTCTGGGTTTTGGTTTGGCATCGGGTTCGGCACAGTAAACCAATGATAAAC	((((((((...((((((((((.(((.....))).))).))..)))))))))))))..	Aha-miRN80	1241	1260	ACAGTAAACCAATGATAAAC	Aha-miRN80*	1277	1297	TTATTATTCTGGGTTTTGGTT		3
Aha-MIRN81	PmiREN000404	MIRN81	Arabidopsis halleri	Aha-Scaffold47895	874	1057	-	GCCAAAGAGCCGAAGACGAAGATCTGGATTTACTCGGGGATAACTTTGTTTTACCAGAGGGACGAAAACGGTTACCAATGCGTCAGGAGAGAGACTGTGGACGACAGAAAATTCGGAGAGTCCCATCAACCGCAGGGTCTTGTCTCAGTAAGTTGGAAGGTAGAATCGTCTTTTCACATGATGA	...........((((((((..((((.((((((((..(((((((((((((.......(((((((.....(((.......((((((.(.((.....)).).)))).))......)))....))))).))....)))))))..))))))))))))))...))))....))))))))...........	894	1037	GATCTGGATTTACTCGGGGATAACTTTGTTTTACCAGAGGGACGAAAACGGTTACCAATGCGTCAGGAGAGAGACTGTGGACGACAGAAAATTCGGAGAGTCCCATCAACCGCAGGGTCTTGTCTCAGTAAGTTGGAAGGTAGA	.((((.((((((((..(((((((((((((.......(((((((.....(((.......((((((.(.((.....)).).)))).))......)))....))))).))....)))))))..))))))))))))))...))))...	Aha-miRN81	1018	1037	GATCTGGATTTACTCGGGGA	Aha-miRN81*	894	914	CTCAGTAAGTTGGAAGGTAGA		3
Aha-MIRN82	PmiREN000879	MIRN82	Arabidopsis halleri	Aha-Scaffold25535	6946	7104	+	AATGACTTCAGAGGTACAAAAGATGTAAGTTTTATGGTAGTGATCGGTAACAGCTTTACAAAGCGGTACAAAACTTTACAAAACATACCGTTTTGATTGTTACCAATCACAAAAGCTTTATCAAAAGCGTTACAAACAGTTTTAGTACTCTTAGTTTTT	.......................((((((((((.((((((((((.((((((((.....((((((((((.................)))))))))).)))))))).)))))........)))))))))).))))).........................	6966	7084	AGATGTAAGTTTTATGGTAGTGATCGGTAACAGCTTTACAAAGCGGTACAAAACTTTACAAAACATACCGTTTTGATTGTTACCAATCACAAAAGCTTTATCAAAAGCGTTACAAACAG	...((((((((((.((((((((((.((((((((.....((((((((((.................)))))))))).)))))))).)))))........)))))))))).))))).....	Aha-miRN82	7063	7084	TTATCAAAAGCGTTACAAACAG	Aha-miRN82*	6966	6986	AGATGTAAGTTTTATGGTAGT		3
